Protein–RNA interactions for Protein: Q8ND25

ZNRF1, E3 ubiquitin-protein ligase ZNRF1, humanhuman

Predictions only

Length 227 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZNRF1Q8ND25 RABGGTA-202ENST00000399409 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
ZNRF1Q8ND25 ADSSL1-201ENST00000330877 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
ZNRF1Q8ND25 CRLF1-201ENST00000392386 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
ZNRF1Q8ND25 CTDSPL-206ENST00000443503 4640 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
ZNRF1Q8ND25 FOSL1-202ENST00000448083 1427 ntTSL 2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
ZNRF1Q8ND25 TBL1X-201ENST00000217964 5871 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
ZNRF1Q8ND25 AC138207.2-201ENST00000583377 492 ntTSL 2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
ZNRF1Q8ND25 RUNDC3A-202ENST00000426726 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
ZNRF1Q8ND25 NAAA-204ENST00000507187 1750 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
ZNRF1Q8ND25 SMARCB1-201ENST00000263121 1690 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
ZNRF1Q8ND25 NECTIN2-202ENST00000252485 2112 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
ZNRF1Q8ND25 FAM193A-211ENST00000637812 4885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
ZNRF1Q8ND25 RNF223-201ENST00000453464 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
ZNRF1Q8ND25 R3HDM4-201ENST00000361574 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
ZNRF1Q8ND25 LSM7-203ENST00000585409 512 ntTSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
ZNRF1Q8ND25 SNX5-217ENST00000606557 1087 ntBASIC19.1■□□□□ 0.65
ZNRF1Q8ND25 AC119427.1-201ENST00000633182 556 ntTSL 4 BASIC19.1■□□□□ 0.65
ZNRF1Q8ND25 AC005551.1-201ENST00000641816 493 ntAPPRIS P1 BASIC19.1■□□□□ 0.65
ZNRF1Q8ND25 SLC10A4-201ENST00000273861 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
ZNRF1Q8ND25 LMTK3-201ENST00000270238 4972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
ZNRF1Q8ND25 GNAS-201ENST00000265620 1866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
ZNRF1Q8ND25 PSIP1-202ENST00000380716 1889 ntTSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
ZNRF1Q8ND25 LINC01578-209ENST00000557682 2683 ntTSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
ZNRF1Q8ND25 FAM107A-203ENST00000447756 1432 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
ZNRF1Q8ND25 PREB-201ENST00000260643 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
ZNRF1Q8ND25 ARMC10-208ENST00000441711 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
ZNRF1Q8ND25 C1QL2-201ENST00000272520 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
ZNRF1Q8ND25 SLC25A29-201ENST00000359232 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
ZNRF1Q8ND25 FOXP1-201ENST00000318779 843 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
ZNRF1Q8ND25 HMGA2-202ENST00000393577 611 ntTSL 3 BASIC19.09■□□□□ 0.65
ZNRF1Q8ND25 CLTA-204ENST00000433436 1235 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
ZNRF1Q8ND25 IGFBP7-203ENST00000514062 1251 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
ZNRF1Q8ND25 CLTA-209ENST00000538225 1181 ntTSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
ZNRF1Q8ND25 CLTA-210ENST00000540080 989 ntTSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
ZNRF1Q8ND25 STMN4-204ENST00000519997 1623 ntTSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
ZNRF1Q8ND25 PTX3-201ENST00000295927 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
ZNRF1Q8ND25 RNPEP-202ENST00000367286 2282 ntTSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
ZNRF1Q8ND25 EVX1-201ENST00000222761 1500 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
ZNRF1Q8ND25 LIMD2-205ENST00000578402 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
ZNRF1Q8ND25 RILP-201ENST00000301336 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
ZNRF1Q8ND25 LINC00092-201ENST00000412122 1726 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
ZNRF1Q8ND25 FAR2P4-203ENST00000560285 1739 ntTSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.65
ZNRF1Q8ND25 CTSF-201ENST00000310325 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
ZNRF1Q8ND25 TRIOBP-203ENST00000403663 2324 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
ZNRF1Q8ND25 BTBD2-201ENST00000255608 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
ZNRF1Q8ND25 PON2-217ENST00000633192 1876 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
ZNRF1Q8ND25 MMD-201ENST00000262065 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
ZNRF1Q8ND25 MTNR1B-201ENST00000257068 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
ZNRF1Q8ND25 CENPX-202ENST00000392359 805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.64
ZNRF1Q8ND25 SYCE1-204ENST00000432597 1254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
ZNRF1Q8ND25 DUSP22-214ENST00000605315 867 ntTSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.64
ZNRF1Q8ND25 AC092028.1-203ENST00000608262 953 ntBASIC19.08■□□□□ 0.64
ZNRF1Q8ND25 NRL-202ENST00000396997 1517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
ZNRF1Q8ND25 ZFP91-CNTF-201ENST00000389919 2319 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.64
ZNRF1Q8ND25 CRIM1-201ENST00000280527 5912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
ZNRF1Q8ND25 P3H3-201ENST00000290510 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
ZNRF1Q8ND25 SNX18-201ENST00000326277 2063 ntTSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
ZNRF1Q8ND25 PNMT-201ENST00000269582 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
ZNRF1Q8ND25 IGFBP3-202ENST00000381083 1050 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
ZNRF1Q8ND25 GUCD1-202ENST00000402766 865 ntTSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
ZNRF1Q8ND25 OR2A1-AS1-204ENST00000470435 602 ntBASIC19.07■□□□□ 0.64
ZNRF1Q8ND25 PLD4-201ENST00000392593 6515 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
ZNRF1Q8ND25 RPP38-201ENST00000378197 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
ZNRF1Q8ND25 RBM42-206ENST00000592202 1469 ntTSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
ZNRF1Q8ND25 MADCAM1-206ENST00000617201 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
ZNRF1Q8ND25 MADCAM1-207ENST00000619333 1485 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
ZNRF1Q8ND25 MADCAM1-210ENST00000622462 1461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
ZNRF1Q8ND25 AK8-201ENST00000298545 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
ZNRF1Q8ND25 C6orf201-202ENST00000380175 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
ZNRF1Q8ND25 PPP2R2C-203ENST00000382599 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
ZNRF1Q8ND25 MARCH2-201ENST00000215555 1376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
ZNRF1Q8ND25 ARMC10-204ENST00000425331 2443 ntTSL 2 BASIC19.06■□□□□ 0.64
ZNRF1Q8ND25 C7orf49-203ENST00000430372 1579 ntTSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
ZNRF1Q8ND25 SNX10-207ENST00000446848 2613 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
ZNRF1Q8ND25 HSF4-225ENST00000584272 1549 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
ZNRF1Q8ND25 NPAS1-208ENST00000602212 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
ZNRF1Q8ND25 PCSK6-218ENST00000619160 3093 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
ZNRF1Q8ND25 ALDH1A3-203ENST00000557963 1670 ntBASIC19.06■□□□□ 0.64
ZNRF1Q8ND25 TMEM54-201ENST00000329151 871 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
ZNRF1Q8ND25 NPW-201ENST00000329610 498 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
ZNRF1Q8ND25 FEZ1-202ENST00000366139 1053 ntTSL 2 BASIC19.06■□□□□ 0.64
ZNRF1Q8ND25 NAA30-203ENST00000555166 1294 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.06■□□□□ 0.64
ZNRF1Q8ND25 TMEM170A-206ENST00000569276 609 ntTSL 2 BASIC19.06■□□□□ 0.64
ZNRF1Q8ND25 FAM173A-207ENST00000569529 1052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
ZNRF1Q8ND25 TLX1-203ENST00000467928 1838 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
ZNRF1Q8ND25 AF117829.1-207ENST00000504145 1572 ntTSL 3 BASIC19.06■□□□□ 0.64
ZNRF1Q8ND25 TMUB1-201ENST00000297533 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
ZNRF1Q8ND25 RAB11FIP1-203ENST00000522727 1866 ntTSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
ZNRF1Q8ND25 TMEM44-202ENST00000347147 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
ZNRF1Q8ND25 IKBIP-202ENST00000342502 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
ZNRF1Q8ND25 TST-201ENST00000249042 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
ZNRF1Q8ND25 C1QTNF12-201ENST00000330388 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
ZNRF1Q8ND25 HES6-204ENST00000409182 863 ntTSL 2 BASIC19.05■□□□□ 0.64
ZNRF1Q8ND25 MAGI2-AS3-201ENST00000414797 1072 ntTSL 2 BASIC19.05■□□□□ 0.64
ZNRF1Q8ND25 TSPY9P-201ENST00000440215 945 ntBASIC19.05■□□□□ 0.64
ZNRF1Q8ND25 TSPY11P-201ENST00000442607 1045 ntBASIC19.05■□□□□ 0.64
ZNRF1Q8ND25 C1orf35-201ENST00000272139 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
ZNRF1Q8ND25 NKX2-3-201ENST00000344586 2097 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.05■□□□□ 0.64
ZNRF1Q8ND25 CHST6-202ENST00000390664 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
ZNRF1Q8ND25 EI24-213ENST00000618552 1747 ntTSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.6 ms