Protein–RNA interactions for Protein: Q8ND23

CARMIL3, Capping protein, Arp2/3 and myosin-I linker protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 1,372 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CARMIL3Q8ND23 RFLNA-205ENST00000546355 2354 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.93■■■□□ 2.22
CARMIL3Q8ND23 GATA4-209ENST00000622443 1982 ntTSL 5 BASIC28.93■■■□□ 2.22
CARMIL3Q8ND23 ELOC-206ENST00000520242 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.92■■■□□ 2.22
CARMIL3Q8ND23 HERC2P4-206ENST00000568097 1062 ntTSL 5 BASIC28.92■■■□□ 2.22
CARMIL3Q8ND23 AC008764.7-201ENST00000593779 1081 ntBASIC28.92■■■□□ 2.22
CARMIL3Q8ND23 AC091982.4-201ENST00000623943 726 ntTSL 2 BASIC28.92■■■□□ 2.22
CARMIL3Q8ND23 RPUSD1-207ENST00000565809 1918 ntTSL 2 BASIC28.92■■■□□ 2.22
CARMIL3Q8ND23 RARA-AS1-201ENST00000581080 1790 ntTSL 1 (best) BASIC28.92■■■□□ 2.22
CARMIL3Q8ND23 PXK-201ENST00000302779 1974 ntTSL 1 (best) BASIC28.92■■■□□ 2.22
CARMIL3Q8ND23 TANGO2-204ENST00000401833 1920 ntTSL 5 BASIC28.92■■■□□ 2.22
CARMIL3Q8ND23 TSEN34-204ENST00000429671 1912 ntTSL 2 BASIC28.92■■■□□ 2.22
CARMIL3Q8ND23 SLC25A1-201ENST00000215882 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.91■■■□□ 2.22
CARMIL3Q8ND23 AC099791.1-201ENST00000416440 715 ntBASIC28.91■■■□□ 2.22
CARMIL3Q8ND23 AC068580.1-201ENST00000446489 252 ntTSL 3 BASIC28.91■■■□□ 2.22
CARMIL3Q8ND23 SEPT5-201ENST00000383045 1588 ntTSL 5 BASIC28.91■■■□□ 2.22
CARMIL3Q8ND23 HSPBP1-202ENST00000433386 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.91■■■□□ 2.22
CARMIL3Q8ND23 GLTPD2-201ENST00000331264 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.9■■■□□ 2.22
CARMIL3Q8ND23 FRMD8-208ENST00000531296 366 ntTSL 1 (best) BASIC28.9■■■□□ 2.22
CARMIL3Q8ND23 ORAI3-202ENST00000562699 628 ntTSL 2 BASIC28.9■■■□□ 2.22
CARMIL3Q8ND23 AC008105.3-201ENST00000586376 844 ntTSL 3 BASIC28.9■■■□□ 2.22
CARMIL3Q8ND23 C17orf82-201ENST00000623772 1530 ntBASIC28.9■■■□□ 2.22
CARMIL3Q8ND23 CACNG7-203ENST00000391767 2688 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.9■■■□□ 2.22
CARMIL3Q8ND23 AJAP1-201ENST00000378190 2383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.9■■■□□ 2.22
CARMIL3Q8ND23 RRAS2-201ENST00000256196 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.22
CARMIL3Q8ND23 CTAG2-202ENST00000369585 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.22
CARMIL3Q8ND23 SAP25-203ENST00000614631 987 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC28.89■■■□□ 2.22
CARMIL3Q8ND23 AC136469.2-201ENST00000623944 1028 ntBASIC28.89■■■□□ 2.22
CARMIL3Q8ND23 RTN2-208ENST00000590526 2357 ntTSL 5 BASIC28.89■■■□□ 2.22
CARMIL3Q8ND23 ABL2-203ENST00000392043 2140 ntTSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.22
CARMIL3Q8ND23 MYCBPAP-202ENST00000419930 1640 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.22
CARMIL3Q8ND23 FBXL20-203ENST00000577399 1620 ntTSL 5 BASIC28.89■■■□□ 2.22
CARMIL3Q8ND23 CCDC92-209ENST00000545891 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.89■■■□□ 2.21
CARMIL3Q8ND23 EVX1-201ENST00000222761 1500 ntTSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.21
CARMIL3Q8ND23 IRS3P-201ENST00000223076 1006 ntBASIC28.88■■■□□ 2.21
CARMIL3Q8ND23 JTB-203ENST00000368589 1216 ntTSL 2 BASIC28.88■■■□□ 2.21
CARMIL3Q8ND23 LINC01678-201ENST00000411694 863 ntTSL 5 BASIC28.88■■■□□ 2.21
CARMIL3Q8ND23 EDA-209ENST00000525810 843 ntTSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
CARMIL3Q8ND23 RHOF-204ENST00000537265 699 ntTSL 2 BASIC28.88■■■□□ 2.21
CARMIL3Q8ND23 TMEM125-202ENST00000439858 1786 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.88■■■□□ 2.21
CARMIL3Q8ND23 CAMK1-201ENST00000256460 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
CARMIL3Q8ND23 CNN3-202ENST00000394202 1974 ntTSL 2 BASIC28.88■■■□□ 2.21
CARMIL3Q8ND23 KAZALD1-201ENST00000370200 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.87■■■□□ 2.21
CARMIL3Q8ND23 MROH6-210ENST00000533679 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.87■■■□□ 2.21
CARMIL3Q8ND23 HTRA1-201ENST00000368984 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.87■■■□□ 2.21
CARMIL3Q8ND23 ZDHHC16-206ENST00000370854 1798 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.87■■■□□ 2.21
CARMIL3Q8ND23 MIR6089-201ENST00000616698 64 ntBASIC28.87■■■□□ 2.21
CARMIL3Q8ND23 BTBD6-201ENST00000327471 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.87■■■□□ 2.21
CARMIL3Q8ND23 TBX1-203ENST00000359500 1538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
CARMIL3Q8ND23 PGR-AS1-202ENST00000632820 1545 ntTSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
CARMIL3Q8ND23 LEFTY1-201ENST00000272134 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
CARMIL3Q8ND23 C15orf61-202ENST00000557807 769 ntTSL 2 BASIC28.86■■■□□ 2.21
CARMIL3Q8ND23 HRH3-203ENST00000611492 900 ntTSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
CARMIL3Q8ND23 AC241377.3-202ENST00000626088 1088 ntBASIC28.86■■■□□ 2.21
CARMIL3Q8ND23 AC241585.3-202ENST00000628937 1088 ntBASIC28.86■■■□□ 2.21
CARMIL3Q8ND23 AC245100.8-202ENST00000629247 1058 ntBASIC28.86■■■□□ 2.21
CARMIL3Q8ND23 C14orf80-206ENST00000392527 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
CARMIL3Q8ND23 WTAP-201ENST00000337387 1622 ntTSL 1 (best) BASIC28.85■■■□□ 2.21
CARMIL3Q8ND23 FSD1-201ENST00000221856 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.85■■■□□ 2.21
CARMIL3Q8ND23 AC092803.2-201ENST00000564287 1899 ntBASIC28.85■■■□□ 2.21
CARMIL3Q8ND23 ARPC5L-201ENST00000259477 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.85■■■□□ 2.21
CARMIL3Q8ND23 HSD11B1L-203ENST00000342970 1620 ntTSL 1 (best) BASIC28.85■■■□□ 2.21
CARMIL3Q8ND23 KRT72-202ENST00000354310 1764 ntTSL 2 BASIC28.85■■■□□ 2.21
CARMIL3Q8ND23 CT47B1-201ENST00000371311 1328 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.85■■■□□ 2.21
CARMIL3Q8ND23 CCDC24-201ENST00000372318 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.85■■■□□ 2.21
CARMIL3Q8ND23 CDC37L1-202ENST00000381858 1244 ntTSL 5 BASIC28.85■■■□□ 2.21
CARMIL3Q8ND23 TSPY4-201ENST00000383008 1143 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.85■■■□□ 2.21
CARMIL3Q8ND23 HES6-206ENST00000409574 738 ntTSL 2 BASIC28.85■■■□□ 2.21
CARMIL3Q8ND23 CREB3L2-203ENST00000452463 1105 ntTSL 1 (best) BASIC28.85■■■□□ 2.21
CARMIL3Q8ND23 BICDL2-203ENST00000572449 1984 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.85■■■□□ 2.21
CARMIL3Q8ND23 UBE2Q2P2-204ENST00000618775 648 ntTSL 1 (best) BASIC28.85■■■□□ 2.21
CARMIL3Q8ND23 CREM-210ENST00000374721 2020 ntTSL 5 BASIC28.84■■■□□ 2.21
CARMIL3Q8ND23 VRK2-202ENST00000412104 1916 ntTSL 1 (best) BASIC28.84■■■□□ 2.21
CARMIL3Q8ND23 NGEF-203ENST00000409079 1022 ntTSL 1 (best) BASIC28.84■■■□□ 2.21
CARMIL3Q8ND23 AC007009.1-201ENST00000458624 429 ntTSL 2 BASIC28.84■■■□□ 2.21
CARMIL3Q8ND23 AC011446.1-201ENST00000591825 458 ntTSL 2 BASIC28.84■■■□□ 2.21
CARMIL3Q8ND23 PTPMT1-205ENST00000534775 1611 ntTSL 1 (best) BASIC28.83■■■□□ 2.21
CARMIL3Q8ND23 ATG16L2-205ENST00000534905 1614 ntTSL 1 (best) BASIC28.83■■■□□ 2.21
CARMIL3Q8ND23 RRP9-201ENST00000232888 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.83■■■□□ 2.21
CARMIL3Q8ND23 NDUFB2-201ENST00000247866 504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.83■■■□□ 2.21
CARMIL3Q8ND23 AC006455.2-201ENST00000429931 906 ntBASIC28.83■■■□□ 2.21
CARMIL3Q8ND23 ARFIP2-205ENST00000525235 852 ntTSL 2 BASIC28.83■■■□□ 2.21
CARMIL3Q8ND23 RGS19-201ENST00000332298 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.82■■■□□ 2.2
CARMIL3Q8ND23 E2F5-202ENST00000416274 1728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.82■■■□□ 2.2
CARMIL3Q8ND23 MSANTD2-201ENST00000239614 2495 ntTSL 2 BASIC28.82■■■□□ 2.2
CARMIL3Q8ND23 AL022069.1-201ENST00000568025 1636 ntBASIC28.82■■■□□ 2.2
CARMIL3Q8ND23 SIRT3-215ENST00000532956 1235 ntTSL 2 BASIC28.81■■■□□ 2.2
CARMIL3Q8ND23 IKBKGP1-201ENST00000612193 1073 ntBASIC28.81■■■□□ 2.2
CARMIL3Q8ND23 CSNK1G3-207ENST00000512718 1569 ntTSL 2 BASIC28.81■■■□□ 2.2
CARMIL3Q8ND23 AKAP17A-202ENST00000381261 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.81■■■□□ 2.2
CARMIL3Q8ND23 ST3GAL5-231ENST00000639119 2131 ntTSL 5 BASIC28.81■■■□□ 2.2
CARMIL3Q8ND23 PLPPR3-201ENST00000359894 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.81■■■□□ 2.2
CARMIL3Q8ND23 RCAN1-201ENST00000313806 2490 ntTSL 1 (best) BASIC28.8■■■□□ 2.2
CARMIL3Q8ND23 SYF2-201ENST00000236273 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.8■■■□□ 2.2
CARMIL3Q8ND23 RFNG-201ENST00000310496 1828 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.8■■■□□ 2.2
CARMIL3Q8ND23 LY6E-201ENST00000292494 1181 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.8■■■□□ 2.2
CARMIL3Q8ND23 GDNF-203ENST00000381826 778 ntTSL 1 (best) BASIC28.8■■■□□ 2.2
CARMIL3Q8ND23 GDNF-204ENST00000427982 856 ntTSL 1 (best) BASIC28.8■■■□□ 2.2
CARMIL3Q8ND23 MED14OS-201ENST00000456333 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.8■■■□□ 2.2
CARMIL3Q8ND23 SLC39A3-203ENST00000545664 1219 ntTSL 2 BASIC28.8■■■□□ 2.2
CARMIL3Q8ND23 UBFD1-208ENST00000567264 642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.8■■■□□ 2.2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.3 ms