Protein–RNA interactions for Protein: Q8ND07

BBOF1, Basal body-orientation factor 1, humanhuman

Predictions only

Length 529 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BBOF1Q8ND07 FBXO7-206ENST00000452138 1535 ntTSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
BBOF1Q8ND07 AF117829.1-207ENST00000504145 1572 ntTSL 3 BASIC23.48■■□□□ 1.35
BBOF1Q8ND07 CPSF4-204ENST00000436336 1738 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
BBOF1Q8ND07 PTPMT1-203ENST00000426530 1014 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
BBOF1Q8ND07 KMT2E-AS1-201ENST00000453677 736 ntTSL 3 BASIC23.48■■□□□ 1.35
BBOF1Q8ND07 MIR4449-201ENST00000578365 66 ntBASIC23.48■■□□□ 1.35
BBOF1Q8ND07 AC018755.3-202ENST00000596210 929 ntBASIC23.48■■□□□ 1.35
BBOF1Q8ND07 GALC-202ENST00000393568 2054 ntTSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
BBOF1Q8ND07 CDC16-206ENST00000375310 2156 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
BBOF1Q8ND07 RYK-209ENST00000623711 2934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
BBOF1Q8ND07 BAZ1A-201ENST00000358716 5920 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
BBOF1Q8ND07 LRRC34-206ENST00000522526 1899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
BBOF1Q8ND07 POLDIP2-201ENST00000540200 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
BBOF1Q8ND07 HIRA-202ENST00000340170 3395 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
BBOF1Q8ND07 KCNK13-201ENST00000282146 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
BBOF1Q8ND07 MRPL51-201ENST00000229238 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
BBOF1Q8ND07 FAM159A-204ENST00000517870 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
BBOF1Q8ND07 SOCS2-202ENST00000536696 1065 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
BBOF1Q8ND07 PPP4C-201ENST00000279387 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
BBOF1Q8ND07 AKT1-201ENST00000349310 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
BBOF1Q8ND07 BCL7B-202ENST00000411832 1458 ntTSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
BBOF1Q8ND07 UBXN2A-202ENST00000404924 1557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
BBOF1Q8ND07 LRRC24-202ENST00000533758 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
BBOF1Q8ND07 FMNL2-201ENST00000288670 5575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
BBOF1Q8ND07 AKT1S1-204ENST00000391832 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
BBOF1Q8ND07 TMEM185B-201ENST00000426077 2131 ntAPPRIS P1 BASIC23.47■■□□□ 1.35
BBOF1Q8ND07 PIGX-201ENST00000296333 953 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
BBOF1Q8ND07 IL17RE-201ENST00000383814 2704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
BBOF1Q8ND07 CMPK2-202ENST00000404168 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
BBOF1Q8ND07 ANXA8-204ENST00000583911 1874 ntTSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
BBOF1Q8ND07 MAPKAPK5-AS1-201ENST00000428207 2290 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
BBOF1Q8ND07 CNPY3-201ENST00000372836 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
BBOF1Q8ND07 WFDC1-201ENST00000219454 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
BBOF1Q8ND07 PARD3-209ENST00000374790 5825 ntTSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
BBOF1Q8ND07 FGF22-202ENST00000586042 1288 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
BBOF1Q8ND07 ARHGAP27-207ENST00000528273 2319 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
BBOF1Q8ND07 HACD1-202ENST00000361271 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
BBOF1Q8ND07 SPON2-222ENST00000617421 2156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
BBOF1Q8ND07 MATK-202ENST00000395040 1907 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
BBOF1Q8ND07 C6orf201-202ENST00000380175 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
BBOF1Q8ND07 DTNB-210ENST00000407186 2275 ntTSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
BBOF1Q8ND07 ZNF213-208ENST00000576416 2240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
BBOF1Q8ND07 NKIRAS2-206ENST00000393885 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
BBOF1Q8ND07 MPC1-201ENST00000341756 976 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
BBOF1Q8ND07 MPC1-206ENST00000621630 977 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
BBOF1Q8ND07 MPC1-207ENST00000621685 1192 ntTSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
BBOF1Q8ND07 AC233723.2-201ENST00000623798 2106 ntBASIC23.44■■□□□ 1.34
BBOF1Q8ND07 CCDC9-201ENST00000221922 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
BBOF1Q8ND07 FLOT1-201ENST00000376389 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
BBOF1Q8ND07 PARD3-213ENST00000545260 5740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
BBOF1Q8ND07 CLDND1-226ENST00000513287 999 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
BBOF1Q8ND07 AC087393.1-201ENST00000582896 145 ntBASIC23.43■■□□□ 1.34
BBOF1Q8ND07 ST3GAL5-231ENST00000639119 2131 ntTSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
BBOF1Q8ND07 HOXA10-201ENST00000283921 2541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
BBOF1Q8ND07 NRG2-201ENST00000289409 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
BBOF1Q8ND07 LGR4-201ENST00000379214 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
BBOF1Q8ND07 PPM1J-201ENST00000309276 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
BBOF1Q8ND07 GAS2L1-201ENST00000406549 1803 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
BBOF1Q8ND07 SERINC5-203ENST00000509193 1441 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
BBOF1Q8ND07 PARD3-202ENST00000346874 5894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
BBOF1Q8ND07 PARD3-203ENST00000350537 5867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
BBOF1Q8ND07 C5orf49-201ENST00000399810 2385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
BBOF1Q8ND07 DONSON-202ENST00000303113 2028 ntTSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
BBOF1Q8ND07 AL022069.1-201ENST00000568025 1636 ntBASIC23.42■■□□□ 1.34
BBOF1Q8ND07 POU4F1-201ENST00000377208 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
BBOF1Q8ND07 TMEM191C-206ENST00000432134 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
BBOF1Q8ND07 UBE2E3-213ENST00000602959 909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
BBOF1Q8ND07 HMG20B-202ENST00000333651 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
BBOF1Q8ND07 C19orf12-207ENST00000592153 1504 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
BBOF1Q8ND07 SMARCD2-201ENST00000225742 1800 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
BBOF1Q8ND07 PPP1R1B-201ENST00000254079 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
BBOF1Q8ND07 GPIHBP1-201ENST00000622500 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
BBOF1Q8ND07 NIPSNAP1-201ENST00000216121 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
BBOF1Q8ND07 PSMG3-202ENST00000288607 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
BBOF1Q8ND07 NCK2-201ENST00000233154 2683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
BBOF1Q8ND07 MPST-203ENST00000401419 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
BBOF1Q8ND07 IKZF1-207ENST00000413698 1808 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
BBOF1Q8ND07 IGF2-AS-201ENST00000381361 2063 ntTSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
BBOF1Q8ND07 CENPV-201ENST00000299736 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
BBOF1Q8ND07 RPRML-201ENST00000322329 1093 ntAPPRIS P1 BASIC23.41■■□□□ 1.34
BBOF1Q8ND07 FKBP1A-211ENST00000618612 1518 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
BBOF1Q8ND07 REPS2-202ENST00000357277 7953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
BBOF1Q8ND07 MED22-201ENST00000343730 1437 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
BBOF1Q8ND07 ITM2C-202ENST00000326427 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
BBOF1Q8ND07 TSSK1B-201ENST00000390666 2478 ntAPPRIS P1 BASIC23.4■■□□□ 1.34
BBOF1Q8ND07 P2RX4-211ENST00000543171 1777 ntTSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
BBOF1Q8ND07 AC004691.2-201ENST00000509504 1531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
BBOF1Q8ND07 RPL13-202ENST00000393099 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
BBOF1Q8ND07 PXMP2-201ENST00000317479 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
BBOF1Q8ND07 OXLD1-203ENST00000571503 803 ntTSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
BBOF1Q8ND07 RBM42-205ENST00000589871 1487 ntTSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
BBOF1Q8ND07 ANKRD28-201ENST00000399451 6564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
BBOF1Q8ND07 UBE2E3-202ENST00000410062 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
BBOF1Q8ND07 ARX-201ENST00000379044 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
BBOF1Q8ND07 IFNGR2-202ENST00000381995 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.34
BBOF1Q8ND07 MTERF3-204ENST00000523821 1529 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
BBOF1Q8ND07 EID2B-201ENST00000326282 1865 ntAPPRIS P1 BASIC23.39■■□□□ 1.34
BBOF1Q8ND07 NKX2-4-201ENST00000351817 2238 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.34
BBOF1Q8ND07 NFU1-203ENST00000410022 1467 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
BBOF1Q8ND07 RPS2-201ENST00000343262 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 57 ms