Protein–RNA interactions for Protein: Q8NCU1

CCDC197, Putative uncharacterized protein CCDC197, humanhuman

Predictions only

Length 140 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC197Q8NCU1 RARA-AS1-201ENST00000581080 1790 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
CCDC197Q8NCU1 TSPAN4-207ENST00000397411 1025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
CCDC197Q8NCU1 TLX1-203ENST00000467928 1838 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
CCDC197Q8NCU1 LSM6-202ENST00000502781 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
CCDC197Q8NCU1 SLC22A31-201ENST00000562855 1909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
CCDC197Q8NCU1 ABCG4-204ENST00000615496 2459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
CCDC197Q8NCU1 KLHL36-201ENST00000258157 1974 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
CCDC197Q8NCU1 HOMER3-204ENST00000539827 1979 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
CCDC197Q8NCU1 DRAM2-201ENST00000286692 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
CCDC197Q8NCU1 PAOX-203ENST00000357296 1633 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
CCDC197Q8NCU1 C5orf49-201ENST00000399810 2385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
CCDC197Q8NCU1 PXK-201ENST00000302779 1974 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
CCDC197Q8NCU1 IGDCC4-201ENST00000352385 6508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
CCDC197Q8NCU1 MSL1-204ENST00000578648 2267 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
CCDC197Q8NCU1 ZSCAN18-202ENST00000421612 1488 ntTSL 4 BASIC22.71■■□□□ 1.23
CCDC197Q8NCU1 PTPN18-202ENST00000347849 2472 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
CCDC197Q8NCU1 HSPBP1-202ENST00000433386 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
CCDC197Q8NCU1 RBPJL-202ENST00000372741 1636 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
CCDC197Q8NCU1 SYT7-202ENST00000535826 1621 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
CCDC197Q8NCU1 CDKN2A-201ENST00000304494 1218 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
CCDC197Q8NCU1 KIF13A-207ENST00000502704 1330 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
CCDC197Q8NCU1 LIMD2-205ENST00000578402 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
CCDC197Q8NCU1 KAT2B-201ENST00000263754 4833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
CCDC197Q8NCU1 C7orf25-205ENST00000438029 1743 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
CCDC197Q8NCU1 MATK-202ENST00000395040 1907 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
CCDC197Q8NCU1 GRK4-201ENST00000345167 2013 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
CCDC197Q8NCU1 OLIG1-201ENST00000382348 2277 ntAPPRIS P1 BASIC22.7■■□□□ 1.22
CCDC197Q8NCU1 ANKHD1-221ENST00000616482 2064 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
CCDC197Q8NCU1 NFS1-204ENST00000397425 1956 ntTSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
CCDC197Q8NCU1 AC096541.1-201ENST00000445070 1807 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
CCDC197Q8NCU1 PLEK2-201ENST00000216446 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
CCDC197Q8NCU1 DGAT1-201ENST00000332324 1473 ntTSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
CCDC197Q8NCU1 LAGE3-201ENST00000357360 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
CCDC197Q8NCU1 LMO1-202ENST00000428101 1038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
CCDC197Q8NCU1 MSANTD2-203ENST00000524950 1109 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
CCDC197Q8NCU1 FPGS-204ENST00000393706 2230 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
CCDC197Q8NCU1 AL606970.3-201ENST00000446811 2246 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
CCDC197Q8NCU1 PPP3CC-202ENST00000289963 2135 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
CCDC197Q8NCU1 TMEM151B-202ENST00000451188 4895 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
CCDC197Q8NCU1 YWHAH-201ENST00000248975 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
CCDC197Q8NCU1 CMTM4-201ENST00000330687 3414 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
CCDC197Q8NCU1 CTCF-202ENST00000401394 2978 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
CCDC197Q8NCU1 FAM185A-202ENST00000413034 1179 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
CCDC197Q8NCU1 FMR1-201ENST00000218200 4333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
CCDC197Q8NCU1 FLOT1-201ENST00000376389 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
CCDC197Q8NCU1 SLC19A1-202ENST00000380010 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
CCDC197Q8NCU1 CNPY3-201ENST00000372836 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
CCDC197Q8NCU1 PON2-202ENST00000433091 1726 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
CCDC197Q8NCU1 MYB-221ENST00000527615 2381 ntTSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
CCDC197Q8NCU1 DNAJC25-201ENST00000313525 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
CCDC197Q8NCU1 PVT1-212ENST00000521951 1535 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
CCDC197Q8NCU1 TMEM121B-201ENST00000331437 4954 ntAPPRIS P3 BASIC22.67■■□□□ 1.22
CCDC197Q8NCU1 DNAJA4-202ENST00000394852 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
CCDC197Q8NCU1 IKZF1-207ENST00000413698 1808 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
CCDC197Q8NCU1 AC242852.2-201ENST00000615738 1807 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
CCDC197Q8NCU1 TCAM1P-201ENST00000463377 452 ntTSL 3 BASIC22.67■■□□□ 1.22
CCDC197Q8NCU1 AC148477.6-201ENST00000623746 465 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
CCDC197Q8NCU1 FRS3-202ENST00000373018 2174 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.67■■□□□ 1.22
CCDC197Q8NCU1 ARPP19-201ENST00000249822 5301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
CCDC197Q8NCU1 ACVRL1-201ENST00000388922 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
CCDC197Q8NCU1 SLCO3A1-202ENST00000424469 2705 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
CCDC197Q8NCU1 IQCJ-SCHIP1-202ENST00000460298 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
CCDC197Q8NCU1 P2RX4-211ENST00000543171 1777 ntTSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
CCDC197Q8NCU1 MSL1-203ENST00000577454 2081 ntTSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
CCDC197Q8NCU1 CAPNS1-207ENST00000589146 578 ntTSL 3 BASIC22.66■■□□□ 1.22
CCDC197Q8NCU1 KCNMA1-209ENST00000372443 5059 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
CCDC197Q8NCU1 TIGD5-201ENST00000504548 5390 ntAPPRIS P1 BASIC22.66■■□□□ 1.22
CCDC197Q8NCU1 CDC34-201ENST00000215574 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
CCDC197Q8NCU1 ADARB1-205ENST00000437626 5032 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
CCDC197Q8NCU1 AC243965.2-201ENST00000612576 2671 ntTSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
CCDC197Q8NCU1 MAF-202ENST00000393350 6384 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
CCDC197Q8NCU1 TMEFF1-201ENST00000374879 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
CCDC197Q8NCU1 UBALD2-201ENST00000327490 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
CCDC197Q8NCU1 POTEF-201ENST00000361163 1586 ntTSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
CCDC197Q8NCU1 SPHK1-201ENST00000323374 2138 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
CCDC197Q8NCU1 HDAC11-206ENST00000405025 576 ntTSL 4 BASIC22.65■■□□□ 1.22
CCDC197Q8NCU1 WAS-201ENST00000376701 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
CCDC197Q8NCU1 DMRT1-201ENST00000382276 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
CCDC197Q8NCU1 CDIPT-207ENST00000566113 1671 ntTSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
CCDC197Q8NCU1 GRK4-206ENST00000504933 1971 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
CCDC197Q8NCU1 MRPL9-201ENST00000368829 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
CCDC197Q8NCU1 AL589765.4-201ENST00000512280 382 ntTSL 3 BASIC22.64■■□□□ 1.21
CCDC197Q8NCU1 GRM6-201ENST00000231188 6143 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
CCDC197Q8NCU1 PSPH-202ENST00000395471 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
CCDC197Q8NCU1 SMURF1-201ENST00000361125 5737 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
CCDC197Q8NCU1 PHF2-201ENST00000359246 5569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
CCDC197Q8NCU1 PPP1R13B-201ENST00000202556 4958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
CCDC197Q8NCU1 ZFYVE9-201ENST00000287727 5194 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
CCDC197Q8NCU1 AQP1-203ENST00000409899 1009 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
CCDC197Q8NCU1 CMPK2-203ENST00000458098 1224 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
CCDC197Q8NCU1 AC008813.1-201ENST00000536597 885 ntBASIC22.63■■□□□ 1.21
CCDC197Q8NCU1 MIR3665-201ENST00000578708 105 ntBASIC22.63■■□□□ 1.21
CCDC197Q8NCU1 ZDHHC5-204ENST00000527985 2817 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
CCDC197Q8NCU1 FAM136A-201ENST00000037869 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
CCDC197Q8NCU1 WDR86-204ENST00000477459 1428 ntTSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
CCDC197Q8NCU1 LRP5-201ENST00000294304 5159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
CCDC197Q8NCU1 NAAA-204ENST00000507187 1750 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
CCDC197Q8NCU1 KCNMA1-252ENST00000639120 2308 ntTSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
CCDC197Q8NCU1 KCNIP2-207ENST00000358038 2489 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
CCDC197Q8NCU1 EDC4-201ENST00000358933 4800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 12.6 ms