Protein–RNA interactions for Protein: Q8NBT2

SPC24, Kinetochore protein Spc24, humanhuman

Predictions only

Length 197 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SPC24Q8NBT2 AC073111.5-206ENST00000642087 859 ntAPPRIS P1 BASIC25.39■■□□□ 1.66
SPC24Q8NBT2 ONECUT3-201ENST00000382349 8318 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.39■■□□□ 1.66
SPC24Q8NBT2 TNFRSF10B-202ENST00000347739 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
SPC24Q8NBT2 NSMCE4A-202ENST00000369023 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
SPC24Q8NBT2 SH2D3A-201ENST00000245908 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
SPC24Q8NBT2 ST3GAL5-231ENST00000639119 2131 ntTSL 5 BASIC25.39■■□□□ 1.65
SPC24Q8NBT2 NAAA-204ENST00000507187 1750 ntTSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
SPC24Q8NBT2 PDZRN4-202ENST00000402685 3347 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.39■■□□□ 1.65
SPC24Q8NBT2 FOXJ1-201ENST00000322957 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
SPC24Q8NBT2 ANKHD1-204ENST00000394722 2035 ntTSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
SPC24Q8NBT2 AL157400.5-201ENST00000507624 621 ntBASIC25.38■■□□□ 1.65
SPC24Q8NBT2 RALB-201ENST00000272519 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
SPC24Q8NBT2 MRPL38-201ENST00000309352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
SPC24Q8NBT2 BAZ1A-201ENST00000358716 5920 ntTSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
SPC24Q8NBT2 AOC3-207ENST00000617500 2392 ntTSL 4 BASIC25.38■■□□□ 1.65
SPC24Q8NBT2 LY6K-201ENST00000292430 2671 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
SPC24Q8NBT2 FOXO3B-201ENST00000395675 1928 ntBASIC25.37■■□□□ 1.65
SPC24Q8NBT2 SMG7-AS1-201ENST00000421703 2220 ntTSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
SPC24Q8NBT2 OLIG1-201ENST00000382348 2277 ntAPPRIS P1 BASIC25.37■■□□□ 1.65
SPC24Q8NBT2 AC025884.2-201ENST00000553429 711 ntBASIC25.37■■□□□ 1.65
SPC24Q8NBT2 MIR1-1HG-202ENST00000624914 1220 ntTSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
SPC24Q8NBT2 AC096541.1-201ENST00000445070 1807 ntTSL 2 BASIC25.37■■□□□ 1.65
SPC24Q8NBT2 VGLL3-201ENST00000383698 2475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
SPC24Q8NBT2 LURAP1L-201ENST00000319264 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
SPC24Q8NBT2 VGLL2-201ENST00000326274 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
SPC24Q8NBT2 LIMS2-202ENST00000355119 2045 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
SPC24Q8NBT2 NRXN2-204ENST00000377559 6413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
SPC24Q8NBT2 NRSN1-204ENST00000378491 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
SPC24Q8NBT2 EPS8L1-202ENST00000245618 2198 ntTSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
SPC24Q8NBT2 RUFY1-201ENST00000319449 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
SPC24Q8NBT2 RNF4-207ENST00000506706 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
SPC24Q8NBT2 SLC18A3-201ENST00000374115 2420 ntAPPRIS P1 BASIC25.36■■□□□ 1.65
SPC24Q8NBT2 MBLAC1-201ENST00000398075 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
SPC24Q8NBT2 DENND1B-204ENST00000367396 2177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
SPC24Q8NBT2 HSPB6-202ENST00000587965 711 ntTSL 2 BASIC25.35■■□□□ 1.65
SPC24Q8NBT2 LIMD2-205ENST00000578402 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
SPC24Q8NBT2 RILP-201ENST00000301336 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
SPC24Q8NBT2 PLK5-202ENST00000454744 1930 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.35■■□□□ 1.65
SPC24Q8NBT2 FRS3-202ENST00000373018 2174 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.35■■□□□ 1.65
SPC24Q8NBT2 CBWD2-201ENST00000259199 1812 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
SPC24Q8NBT2 PON2-202ENST00000433091 1726 ntTSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
SPC24Q8NBT2 AC092068.2-201ENST00000590491 1708 ntBASIC25.34■■□□□ 1.65
SPC24Q8NBT2 OSBPL5-208ENST00000478260 2653 ntTSL 2 BASIC25.34■■□□□ 1.65
SPC24Q8NBT2 HOXD-AS2-201ENST00000426965 927 ntTSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
SPC24Q8NBT2 LAPTM4B-203ENST00000521545 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
SPC24Q8NBT2 MTMR1-214ENST00000542156 1227 ntTSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
SPC24Q8NBT2 MIR3960-201ENST00000583311 91 ntBASIC25.34■■□□□ 1.65
SPC24Q8NBT2 TBX2-AS1-202ENST00000589814 539 ntTSL 3 BASIC25.34■■□□□ 1.65
SPC24Q8NBT2 CAPNS1-217ENST00000629983 799 ntTSL 5 BASIC25.34■■□□□ 1.65
SPC24Q8NBT2 FPGS-204ENST00000393706 2230 ntTSL 2 BASIC25.34■■□□□ 1.65
SPC24Q8NBT2 ADD1-202ENST00000355842 4743 ntTSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
SPC24Q8NBT2 DLK2-202ENST00000372485 1572 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.34■■□□□ 1.65
SPC24Q8NBT2 SLC35A2-209ENST00000452555 1563 ntTSL 2 BASIC25.34■■□□□ 1.65
SPC24Q8NBT2 PPP5C-201ENST00000012443 2109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
SPC24Q8NBT2 HAR1A-201ENST00000433161 1882 ntTSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
SPC24Q8NBT2 LMLN-210ENST00000482695 2010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
SPC24Q8NBT2 TRIM3-214ENST00000536344 2704 ntTSL 2 BASIC25.34■■□□□ 1.65
SPC24Q8NBT2 NKIRAS2-206ENST00000393885 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
SPC24Q8NBT2 SH2B1-204ENST00000395532 2529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.33■■□□□ 1.65
SPC24Q8NBT2 SLC39A2-201ENST00000298681 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
SPC24Q8NBT2 CTCF-202ENST00000401394 2978 ntTSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
SPC24Q8NBT2 CTF1-201ENST00000279804 1664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
SPC24Q8NBT2 DPEP2-204ENST00000572888 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
SPC24Q8NBT2 SLCO3A1-202ENST00000424469 2705 ntTSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
SPC24Q8NBT2 EID2B-201ENST00000326282 1865 ntAPPRIS P1 BASIC25.33■■□□□ 1.65
SPC24Q8NBT2 BCS1L-210ENST00000431802 2015 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.33■■□□□ 1.65
SPC24Q8NBT2 AC096888.1-201ENST00000487097 565 ntTSL 4 BASIC25.33■■□□□ 1.65
SPC24Q8NBT2 DAZAP1-211ENST00000592522 2157 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.33■■□□□ 1.65
SPC24Q8NBT2 MOB2-207ENST00000614710 705 ntTSL 5 BASIC25.33■■□□□ 1.65
SPC24Q8NBT2 CACNB3-205ENST00000547392 2237 ntTSL 5 BASIC25.33■■□□□ 1.65
SPC24Q8NBT2 CPSF4-207ENST00000451876 1644 ntTSL 5 BASIC25.33■■□□□ 1.65
SPC24Q8NBT2 WDR38-202ENST00000613760 1323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.64
SPC24Q8NBT2 SLC39A3-201ENST00000269740 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
SPC24Q8NBT2 GAL3ST1-202ENST00000401975 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
SPC24Q8NBT2 GADD45G-201ENST00000252506 1065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
SPC24Q8NBT2 TRAM2-AS1-201ENST00000453216 664 ntTSL 3 BASIC25.32■■□□□ 1.64
SPC24Q8NBT2 DXO-201ENST00000337523 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
SPC24Q8NBT2 NBL1-202ENST00000375136 2172 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
SPC24Q8NBT2 TRIM67-203ENST00000449018 2166 ntTSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
SPC24Q8NBT2 SLC35A2-201ENST00000247138 1672 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
SPC24Q8NBT2 SMARCB1-201ENST00000263121 1690 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
SPC24Q8NBT2 STK32C-201ENST00000298630 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
SPC24Q8NBT2 ANKLE2-201ENST00000357997 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
SPC24Q8NBT2 HSPBP1-202ENST00000433386 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
SPC24Q8NBT2 SAP30L-201ENST00000297109 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
SPC24Q8NBT2 LRRC45-201ENST00000306688 2701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
SPC24Q8NBT2 SPAG16-202ENST00000331683 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
SPC24Q8NBT2 FAM83D-201ENST00000619304 2475 ntTSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
SPC24Q8NBT2 RPS20-211ENST00000524349 752 ntTSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
SPC24Q8NBT2 DGKQ-201ENST00000273814 4636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
SPC24Q8NBT2 ZNF174-202ENST00000344823 1557 ntTSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
SPC24Q8NBT2 AL024507.2-201ENST00000606070 2574 ntBASIC25.29■■□□□ 1.64
SPC24Q8NBT2 USP36-218ENST00000590546 1771 ntTSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
SPC24Q8NBT2 RAPH1-210ENST00000453034 2394 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
SPC24Q8NBT2 RAB6B-203ENST00000469959 500 ntTSL 3 BASIC25.29■■□□□ 1.64
SPC24Q8NBT2 LTC4S-205ENST00000486713 496 ntTSL 2 BASIC25.29■■□□□ 1.64
SPC24Q8NBT2 RNF166-209ENST00000567844 633 ntTSL 5 BASIC25.29■■□□□ 1.64
SPC24Q8NBT2 CAPNS1-207ENST00000589146 578 ntTSL 3 BASIC25.29■■□□□ 1.64
SPC24Q8NBT2 RPARP-AS1-205ENST00000596045 431 ntTSL 3 BASIC25.29■■□□□ 1.64
SPC24Q8NBT2 LRRC34-206ENST00000522526 1899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.2 ms