Protein–RNA interactions for Protein: Q8NA29

MFSD2A, Sodium-dependent lysophosphatidylcholine symporter 1, humanhuman

Predictions only

Length 543 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MFSD2AQ8NA29 C21orf2-202ENST00000339818 2233 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
MFSD2AQ8NA29 AKT1S1-203ENST00000391831 2025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
MFSD2AQ8NA29 KRT72-202ENST00000354310 1764 ntTSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
MFSD2AQ8NA29 ZDHHC16-206ENST00000370854 1798 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
MFSD2AQ8NA29 HADH-203ENST00000505878 1719 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
MFSD2AQ8NA29 AC142381.3-201ENST00000568208 1670 ntBASIC22.93■■□□□ 1.26
MFSD2AQ8NA29 RABEP2-203ENST00000544477 1645 ntTSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
MFSD2AQ8NA29 SNF8-202ENST00000502492 2319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
MFSD2AQ8NA29 PEX7-201ENST00000318471 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
MFSD2AQ8NA29 SERINC5-203ENST00000509193 1441 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
MFSD2AQ8NA29 ZNF598-202ENST00000562103 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
MFSD2AQ8NA29 KRTAP5-4-201ENST00000399682 1181 ntAPPRIS P5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
MFSD2AQ8NA29 PABPN1-207ENST00000556821 1220 ntTSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
MFSD2AQ8NA29 HOXA11-AS1_1.1-201ENST00000613939 98 ntBASIC22.93■■□□□ 1.26
MFSD2AQ8NA29 ARRDC2-202ENST00000379656 2528 ntTSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
MFSD2AQ8NA29 FRMD8-203ENST00000416776 1818 ntTSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
MFSD2AQ8NA29 TMEM104-205ENST00000582773 1740 ntTSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
MFSD2AQ8NA29 HOMER3-205ENST00000542541 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
MFSD2AQ8NA29 MATK-204ENST00000585778 1994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
MFSD2AQ8NA29 TMEM179-204ENST00000556573 1430 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.92■■□□□ 1.26
MFSD2AQ8NA29 RAB11FIP1-203ENST00000522727 1866 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
MFSD2AQ8NA29 STMN4-201ENST00000265770 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
MFSD2AQ8NA29 YTHDF1-201ENST00000370334 747 ntTSL 3 BASIC22.92■■□□□ 1.26
MFSD2AQ8NA29 RPRD1A-207ENST00000588737 1264 ntTSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
MFSD2AQ8NA29 ST7-201ENST00000265437 2899 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
MFSD2AQ8NA29 TMEM150C-201ENST00000449862 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
MFSD2AQ8NA29 ATAD3A-203ENST00000378756 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
MFSD2AQ8NA29 BIN1-203ENST00000346226 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
MFSD2AQ8NA29 NKAIN3-202ENST00000523211 1988 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
MFSD2AQ8NA29 ATP5A1-220ENST00000593152 2258 ntTSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
MFSD2AQ8NA29 RRP9-201ENST00000232888 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
MFSD2AQ8NA29 PFKFB4-204ENST00000416568 1575 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
MFSD2AQ8NA29 AZIN2-201ENST00000294517 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
MFSD2AQ8NA29 TMEM121-202ENST00000431372 1519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
MFSD2AQ8NA29 SHISA5-201ENST00000296444 2369 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
MFSD2AQ8NA29 R3HDM4-203ENST00000587975 1765 ntTSL 3 BASIC22.91■■□□□ 1.26
MFSD2AQ8NA29 AC012123.1-201ENST00000426194 1661 ntTSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
MFSD2AQ8NA29 ZNRF1-201ENST00000320619 2479 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
MFSD2AQ8NA29 PREB-202ENST00000406567 1910 ntTSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
MFSD2AQ8NA29 NR2F6-201ENST00000291442 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
MFSD2AQ8NA29 PNCK-215ENST00000447676 1585 ntTSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
MFSD2AQ8NA29 ELOC-206ENST00000520242 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
MFSD2AQ8NA29 LTB4R2-205ENST00000543919 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
MFSD2AQ8NA29 SNX21-204ENST00000372542 1824 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
MFSD2AQ8NA29 RPUSD1-201ENST00000007264 2050 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
MFSD2AQ8NA29 AC106739.1-201ENST00000617035 715 ntBASIC22.9■■□□□ 1.26
MFSD2AQ8NA29 SRRM2-231ENST00000630499 1207 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
MFSD2AQ8NA29 RRAS2-201ENST00000256196 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
MFSD2AQ8NA29 PTH1R-206ENST00000430002 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
MFSD2AQ8NA29 C6orf89-201ENST00000355190 1309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
MFSD2AQ8NA29 NOCT-201ENST00000280614 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
MFSD2AQ8NA29 PDPK1-204ENST00000441549 1729 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
MFSD2AQ8NA29 ERGIC1-202ENST00000393784 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
MFSD2AQ8NA29 DLK2-202ENST00000372485 1572 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
MFSD2AQ8NA29 MROH6-210ENST00000533679 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
MFSD2AQ8NA29 PSKH1-202ENST00000570631 1509 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
MFSD2AQ8NA29 PORCN-203ENST00000359882 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
MFSD2AQ8NA29 CBR3-201ENST00000290354 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
MFSD2AQ8NA29 PBX2P1-201ENST00000493219 1291 ntBASIC22.88■■□□□ 1.25
MFSD2AQ8NA29 C14orf80-204ENST00000392522 1630 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
MFSD2AQ8NA29 PTPMT1-205ENST00000534775 1611 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
MFSD2AQ8NA29 TMEM202-AS1-202ENST00000565181 2325 ntBASIC22.88■■□□□ 1.25
MFSD2AQ8NA29 RING1-201ENST00000374656 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
MFSD2AQ8NA29 SMOX-202ENST00000305958 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
MFSD2AQ8NA29 LDHB-203ENST00000396076 1538 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
MFSD2AQ8NA29 MED17-227ENST00000640521 2047 ntTSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
MFSD2AQ8NA29 AC005703.6-201ENST00000623265 1329 ntBASIC22.87■■□□□ 1.25
MFSD2AQ8NA29 RNPEP-202ENST00000367286 2282 ntTSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
MFSD2AQ8NA29 SRD5A1P1-201ENST00000442297 786 ntBASIC22.87■■□□□ 1.25
MFSD2AQ8NA29 AC019163.1-201ENST00000512634 610 ntTSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
MFSD2AQ8NA29 CCND3-223ENST00000616010 2047 ntTSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
MFSD2AQ8NA29 CUEDC1-202ENST00000407144 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
MFSD2AQ8NA29 FJX1-201ENST00000317811 2450 ntAPPRIS P1 BASIC22.87■■□□□ 1.25
MFSD2AQ8NA29 RABGGTA-202ENST00000399409 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
MFSD2AQ8NA29 AUH-201ENST00000303617 1490 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
MFSD2AQ8NA29 FZD9-201ENST00000344575 2338 ntAPPRIS P1 BASIC22.86■■□□□ 1.25
MFSD2AQ8NA29 ADAM22-209ENST00000439864 2576 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
MFSD2AQ8NA29 UBL7-202ENST00000395081 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
MFSD2AQ8NA29 P4HA3-201ENST00000331597 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
MFSD2AQ8NA29 LIN7B-202ENST00000391864 582 ntTSL 3 BASIC22.86■■□□□ 1.25
MFSD2AQ8NA29 CD63-202ENST00000420846 981 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
MFSD2AQ8NA29 NRL-205ENST00000560550 788 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
MFSD2AQ8NA29 C8orf58-201ENST00000289989 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
MFSD2AQ8NA29 EEF1D-201ENST00000317198 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
MFSD2AQ8NA29 PTPN2-202ENST00000327283 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
MFSD2AQ8NA29 TANGO2-204ENST00000401833 1920 ntTSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
MFSD2AQ8NA29 ZFPM1-201ENST00000319555 5380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
MFSD2AQ8NA29 UNC93B3-201ENST00000308076 687 ntBASIC22.85■■□□□ 1.25
MFSD2AQ8NA29 PRICKLE4-201ENST00000394259 939 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
MFSD2AQ8NA29 NDUFS3-206ENST00000528192 561 ntTSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
MFSD2AQ8NA29 SNHG12-212ENST00000531126 719 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
MFSD2AQ8NA29 AC009097.2-201ENST00000562763 465 ntTSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
MFSD2AQ8NA29 SHISA9-205ENST00000639941 1135 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
MFSD2AQ8NA29 MARCH2-201ENST00000215555 1376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
MFSD2AQ8NA29 AL139125.2-201ENST00000623134 1869 ntBASIC22.85■■□□□ 1.25
MFSD2AQ8NA29 CCDC106-202ENST00000586790 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
MFSD2AQ8NA29 NPEPL1-201ENST00000356091 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
MFSD2AQ8NA29 TMEM44-202ENST00000347147 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
MFSD2AQ8NA29 RARA-AS1-201ENST00000581080 1790 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
MFSD2AQ8NA29 GFRA4-201ENST00000290417 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 65.4 ms