Protein–RNA interactions for Protein: Q8N6G5

CSGALNACT2, Chondroitin sulfate N-acetylgalactosaminyltransferase 2, humanhuman

Predictions only

Length 542 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CSGALNACT2Q8N6G5 CD63-202ENST00000420846 981 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.35■■□□□ 1.65
CSGALNACT2Q8N6G5 THA1P-201ENST00000590384 1145 ntBASIC25.35■■□□□ 1.65
CSGALNACT2Q8N6G5 LIMD2-205ENST00000578402 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
CSGALNACT2Q8N6G5 PLEKHB1-201ENST00000227214 2016 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
CSGALNACT2Q8N6G5 AMZ2-202ENST00000359904 2402 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.35■■□□□ 1.65
CSGALNACT2Q8N6G5 BMP2K-204ENST00000502871 3195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
CSGALNACT2Q8N6G5 ACTR1B-201ENST00000289228 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
CSGALNACT2Q8N6G5 GADD45A-202ENST00000370986 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
CSGALNACT2Q8N6G5 ADSSL1-201ENST00000330877 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
CSGALNACT2Q8N6G5 ADAM22-209ENST00000439864 2576 ntTSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
CSGALNACT2Q8N6G5 IRX5-201ENST00000320990 2061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
CSGALNACT2Q8N6G5 OSCAR-206ENST00000391760 629 ntTSL 2 BASIC25.34■■□□□ 1.65
CSGALNACT2Q8N6G5 PNLIPRP2-205ENST00000611850 1407 ntTSL 5 BASIC25.34■■□□□ 1.65
CSGALNACT2Q8N6G5 CCDC24-201ENST00000372318 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
CSGALNACT2Q8N6G5 ATP5G2-201ENST00000338662 1792 ntTSL 2 BASIC25.33■■□□□ 1.65
CSGALNACT2Q8N6G5 DUSP8P5-201ENST00000422884 1815 ntBASIC25.33■■□□□ 1.65
CSGALNACT2Q8N6G5 TK2-216ENST00000564917 1156 ntTSL 3 BASIC25.33■■□□□ 1.65
CSGALNACT2Q8N6G5 CD37-213ENST00000598095 1598 ntTSL 2 BASIC25.33■■□□□ 1.65
CSGALNACT2Q8N6G5 AC011551.1-201ENST00000614101 683 ntBASIC25.33■■□□□ 1.65
CSGALNACT2Q8N6G5 CHST6-202ENST00000390664 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
CSGALNACT2Q8N6G5 PPP4C-214ENST00000627746 1301 ntTSL 5 BASIC25.33■■□□□ 1.64
CSGALNACT2Q8N6G5 SMARCB1-201ENST00000263121 1690 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
CSGALNACT2Q8N6G5 C7orf25-205ENST00000438029 1743 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.32■■□□□ 1.64
CSGALNACT2Q8N6G5 UBXN2A-202ENST00000404924 1557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.32■■□□□ 1.64
CSGALNACT2Q8N6G5 SOHLH1-202ENST00000425225 1411 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.32■■□□□ 1.64
CSGALNACT2Q8N6G5 KCNS1-202ENST00000537075 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
CSGALNACT2Q8N6G5 PRTG-204ENST00000561292 833 ntTSL 3 BASIC25.32■■□□□ 1.64
CSGALNACT2Q8N6G5 BTBD7-205ENST00000554565 2697 ntTSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
CSGALNACT2Q8N6G5 TANGO2-207ENST00000420290 1859 ntTSL 2 BASIC25.32■■□□□ 1.64
CSGALNACT2Q8N6G5 LRRC24-202ENST00000533758 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.32■■□□□ 1.64
CSGALNACT2Q8N6G5 CPOX-201ENST00000264193 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
CSGALNACT2Q8N6G5 BOD1-202ENST00000311086 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
CSGALNACT2Q8N6G5 NAAA-204ENST00000507187 1750 ntTSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
CSGALNACT2Q8N6G5 HMGA2-206ENST00000536545 1788 ntTSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
CSGALNACT2Q8N6G5 PHC2-202ENST00000373418 2550 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
CSGALNACT2Q8N6G5 PRELID1-201ENST00000303204 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
CSGALNACT2Q8N6G5 CTAG1B-201ENST00000328435 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
CSGALNACT2Q8N6G5 CTAG1A-202ENST00000599837 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
CSGALNACT2Q8N6G5 TMEM98-202ENST00000394642 1683 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.31■■□□□ 1.64
CSGALNACT2Q8N6G5 PPIL6-203ENST00000440797 1693 ntTSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
CSGALNACT2Q8N6G5 C18orf65-201ENST00000622985 2076 ntTSL 2 BASIC25.31■■□□□ 1.64
CSGALNACT2Q8N6G5 RARA-202ENST00000394081 2285 ntTSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
CSGALNACT2Q8N6G5 PKIB-205ENST00000368452 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
CSGALNACT2Q8N6G5 AL161729.1-201ENST00000604104 1402 ntBASIC25.3■■□□□ 1.64
CSGALNACT2Q8N6G5 CLIC3-203ENST00000494426 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
CSGALNACT2Q8N6G5 RAET1E-AS1-203ENST00000606915 1210 ntTSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
CSGALNACT2Q8N6G5 CRACR2B-202ENST00000525077 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
CSGALNACT2Q8N6G5 OSCAR-207ENST00000391761 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
CSGALNACT2Q8N6G5 GRK4-204ENST00000503518 2136 ntTSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
CSGALNACT2Q8N6G5 AC009299.2-201ENST00000482477 511 ntBASIC25.29■■□□□ 1.64
CSGALNACT2Q8N6G5 LRRC14B-201ENST00000328278 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
CSGALNACT2Q8N6G5 STMN4-204ENST00000519997 1623 ntTSL 2 BASIC25.29■■□□□ 1.64
CSGALNACT2Q8N6G5 KCTD15-207ENST00000589786 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.29■■□□□ 1.64
CSGALNACT2Q8N6G5 DACT3-201ENST00000300875 2526 ntTSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
CSGALNACT2Q8N6G5 CPSF4-204ENST00000436336 1738 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
CSGALNACT2Q8N6G5 C16orf72-201ENST00000327827 5953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
CSGALNACT2Q8N6G5 ERO1A-211ENST00000629528 998 ntTSL 5 BASIC25.28■■□□□ 1.64
CSGALNACT2Q8N6G5 PON2-202ENST00000433091 1726 ntTSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
CSGALNACT2Q8N6G5 EPS8L1-205ENST00000586329 2130 ntTSL 5 BASIC25.28■■□□□ 1.64
CSGALNACT2Q8N6G5 RILP-201ENST00000301336 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
CSGALNACT2Q8N6G5 SIN3B-209ENST00000596802 2556 ntTSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
CSGALNACT2Q8N6G5 CIRBP-216ENST00000588090 1459 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC25.28■■□□□ 1.64
CSGALNACT2Q8N6G5 HYAL2-207ENST00000442581 2318 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.28■■□□□ 1.64
CSGALNACT2Q8N6G5 ZSCAN18-212ENST00000600404 1934 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.27■■□□□ 1.64
CSGALNACT2Q8N6G5 HACD3-205ENST00000562901 1797 ntTSL 5 BASIC25.27■■□□□ 1.64
CSGALNACT2Q8N6G5 ATP11B-209ENST00000493826 963 ntTSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
CSGALNACT2Q8N6G5 GAK-223ENST00000628912 497 ntTSL 5 BASIC25.27■■□□□ 1.64
CSGALNACT2Q8N6G5 NIPSNAP2-201ENST00000322090 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
CSGALNACT2Q8N6G5 RBFOX1-206ENST00000535565 1599 ntTSL 2 BASIC25.27■■□□□ 1.64
CSGALNACT2Q8N6G5 EEF1D-256ENST00000618139 2238 ntTSL 5 BASIC25.27■■□□□ 1.64
CSGALNACT2Q8N6G5 AC133561.1-201ENST00000568600 2415 ntBASIC25.26■■□□□ 1.63
CSGALNACT2Q8N6G5 DHH-201ENST00000266991 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
CSGALNACT2Q8N6G5 GBX1-201ENST00000297537 1092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
CSGALNACT2Q8N6G5 TMEM170A-202ENST00000561878 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
CSGALNACT2Q8N6G5 SNAI3-AS1-203ENST00000565633 829 ntTSL 5 BASIC25.26■■□□□ 1.63
CSGALNACT2Q8N6G5 AC009163.4-201ENST00000567194 530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.26■■□□□ 1.63
CSGALNACT2Q8N6G5 AL035685.1-201ENST00000636663 812 ntBASIC25.26■■□□□ 1.63
CSGALNACT2Q8N6G5 DTNB-206ENST00000404103 2384 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.26■■□□□ 1.63
CSGALNACT2Q8N6G5 RANBP10-206ENST00000602677 2374 ntTSL 5 BASIC25.26■■□□□ 1.63
CSGALNACT2Q8N6G5 AL022069.1-201ENST00000568025 1636 ntBASIC25.26■■□□□ 1.63
CSGALNACT2Q8N6G5 RAD21L1-202ENST00000402452 1707 ntTSL 5 BASIC25.26■■□□□ 1.63
CSGALNACT2Q8N6G5 CCDC47-204ENST00000582252 1719 ntTSL 2 BASIC25.26■■□□□ 1.63
CSGALNACT2Q8N6G5 CACTIN-AS1-201ENST00000592274 1913 ntTSL 2 BASIC25.25■■□□□ 1.63
CSGALNACT2Q8N6G5 HOXD1-201ENST00000331462 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
CSGALNACT2Q8N6G5 MAP6D1-201ENST00000318631 2111 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
CSGALNACT2Q8N6G5 PCYT2-201ENST00000331285 2147 ntTSL 2 BASIC25.25■■□□□ 1.63
CSGALNACT2Q8N6G5 AC138207.2-201ENST00000583377 492 ntTSL 2 BASIC25.25■■□□□ 1.63
CSGALNACT2Q8N6G5 LAT-217ENST00000630764 610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.25■■□□□ 1.63
CSGALNACT2Q8N6G5 AL160276.1-201ENST00000636672 1312 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.25■■□□□ 1.63
CSGALNACT2Q8N6G5 TMEM102-201ENST00000323206 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
CSGALNACT2Q8N6G5 TMEM102-202ENST00000396568 1962 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.25■■□□□ 1.63
CSGALNACT2Q8N6G5 OSCAR-209ENST00000616215 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.25■■□□□ 1.63
CSGALNACT2Q8N6G5 AL137002.2-201ENST00000639766 2238 ntTSL 5 BASIC25.25■■□□□ 1.63
CSGALNACT2Q8N6G5 AGAP3-201ENST00000335367 2675 ntTSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
CSGALNACT2Q8N6G5 LDB1-201ENST00000361198 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
CSGALNACT2Q8N6G5 CCDC154-201ENST00000389176 2212 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC25.24■■□□□ 1.63
CSGALNACT2Q8N6G5 C11orf95-202ENST00000433688 5716 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.24■■□□□ 1.63
CSGALNACT2Q8N6G5 TMED4-205ENST00000481238 1755 ntTSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
CSGALNACT2Q8N6G5 EI24-213ENST00000618552 1747 ntTSL 5 BASIC25.24■■□□□ 1.63
CSGALNACT2Q8N6G5 AC004691.2-201ENST00000509504 1531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.24■■□□□ 1.63
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.1 ms