Protein–RNA interactions for Protein: Q8N4P6

LRRC71, Leucine-rich repeat-containing protein 71, humanhuman

Predictions only

Length 559 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LRRC71Q8N4P6 DPY19L1-209ENST00000638088 5075 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.38■■□□□ 1.65
LRRC71Q8N4P6 CDK9-201ENST00000373264 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
LRRC71Q8N4P6 CPSF4-204ENST00000436336 1738 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
LRRC71Q8N4P6 SNTA1-201ENST00000217381 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
LRRC71Q8N4P6 HDGFL2-210ENST00000621835 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
LRRC71Q8N4P6 SYNGR3-201ENST00000248121 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
LRRC71Q8N4P6 FAM181A-204ENST00000557000 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
LRRC71Q8N4P6 PCGF3-202ENST00000400151 1175 ntTSL 2 BASIC25.37■■□□□ 1.65
LRRC71Q8N4P6 MED17-227ENST00000640521 2047 ntTSL 5 BASIC25.37■■□□□ 1.65
LRRC71Q8N4P6 GFRA4-201ENST00000290417 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
LRRC71Q8N4P6 THAP4-204ENST00000407315 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
LRRC71Q8N4P6 CBWD2-201ENST00000259199 1812 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
LRRC71Q8N4P6 HES4-201ENST00000304952 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
LRRC71Q8N4P6 DCTPP1-201ENST00000319285 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
LRRC71Q8N4P6 SHISA9-205ENST00000639941 1135 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.36■■□□□ 1.65
LRRC71Q8N4P6 SEPT5-201ENST00000383045 1588 ntTSL 5 BASIC25.35■■□□□ 1.65
LRRC71Q8N4P6 TMEM202-AS1-202ENST00000565181 2325 ntBASIC25.35■■□□□ 1.65
LRRC71Q8N4P6 SLC25A1-201ENST00000215882 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
LRRC71Q8N4P6 APOE-201ENST00000252486 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
LRRC71Q8N4P6 MIR638-201ENST00000385237 100 ntBASIC25.35■■□□□ 1.65
LRRC71Q8N4P6 EPDR1-202ENST00000423717 638 ntTSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
LRRC71Q8N4P6 AP003733.4-201ENST00000623785 1697 ntBASIC25.35■■□□□ 1.65
LRRC71Q8N4P6 KRT72-203ENST00000537672 1813 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.35■■□□□ 1.65
LRRC71Q8N4P6 SH3GL1-201ENST00000269886 2516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
LRRC71Q8N4P6 OSCAR-203ENST00000356532 1355 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
LRRC71Q8N4P6 OSCAR-204ENST00000358375 1389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
LRRC71Q8N4P6 OSCAR-210ENST00000616447 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.34■■□□□ 1.65
LRRC71Q8N4P6 CDIPT-207ENST00000566113 1671 ntTSL 2 BASIC25.34■■□□□ 1.65
LRRC71Q8N4P6 CNPY3-202ENST00000394142 954 ntTSL 5 BASIC25.34■■□□□ 1.65
LRRC71Q8N4P6 RALB-208ENST00000631312 311 ntTSL 5 BASIC25.34■■□□□ 1.65
LRRC71Q8N4P6 C8orf58-206ENST00000614574 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.34■■□□□ 1.65
LRRC71Q8N4P6 CD37-213ENST00000598095 1598 ntTSL 2 BASIC25.34■■□□□ 1.65
LRRC71Q8N4P6 TANGO2-207ENST00000420290 1859 ntTSL 2 BASIC25.34■■□□□ 1.65
LRRC71Q8N4P6 TNIP2-206ENST00000510267 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.34■■□□□ 1.65
LRRC71Q8N4P6 RPP38-207ENST00000616640 1537 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.33■■□□□ 1.65
LRRC71Q8N4P6 AC142381.3-201ENST00000568208 1670 ntBASIC25.33■■□□□ 1.65
LRRC71Q8N4P6 ADAD2-202ENST00000315906 1995 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
LRRC71Q8N4P6 UBALD1-201ENST00000283474 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
LRRC71Q8N4P6 ZNF584-205ENST00000596281 575 ntTSL 2 BASIC25.33■■□□□ 1.65
LRRC71Q8N4P6 SPG21-201ENST00000204566 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.64
LRRC71Q8N4P6 BBC3-203ENST00000439096 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.64
LRRC71Q8N4P6 SAMD13-205ENST00000370673 1567 ntTSL 2 BASIC25.32■■□□□ 1.64
LRRC71Q8N4P6 MYCL-201ENST00000372815 1944 ntTSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
LRRC71Q8N4P6 PABPN1-202ENST00000397276 2768 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
LRRC71Q8N4P6 POLR2F-211ENST00000488684 564 ntTSL 2 BASIC25.32■■□□□ 1.64
LRRC71Q8N4P6 RCE1-202ENST00000524506 1379 ntTSL 5 BASIC25.31■■□□□ 1.64
LRRC71Q8N4P6 DNPH1-201ENST00000230431 657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
LRRC71Q8N4P6 TNFRSF6B-201ENST00000369996 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
LRRC71Q8N4P6 SRD5A1P1-201ENST00000442297 786 ntBASIC25.31■■□□□ 1.64
LRRC71Q8N4P6 SRR-201ENST00000344595 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
LRRC71Q8N4P6 HOXA4-204ENST00000610970 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
LRRC71Q8N4P6 PSKH1-202ENST00000570631 1509 ntTSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
LRRC71Q8N4P6 FAHD1-203ENST00000427358 1974 ntAPPRIS P1 BASIC25.31■■□□□ 1.64
LRRC71Q8N4P6 LINC02043-201ENST00000419745 1832 ntTSL 2 BASIC25.3■■□□□ 1.64
LRRC71Q8N4P6 IKBIP-202ENST00000342502 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
LRRC71Q8N4P6 AZIN2-201ENST00000294517 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
LRRC71Q8N4P6 LINC00092-201ENST00000412122 1726 ntTSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
LRRC71Q8N4P6 KRTAP5-4-201ENST00000399682 1181 ntAPPRIS P5 BASIC25.3■■□□□ 1.64
LRRC71Q8N4P6 LINC01632-201ENST00000615763 496 ntTSL 3 BASIC25.3■■□□□ 1.64
LRRC71Q8N4P6 TMEM121-202ENST00000431372 1519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.3■■□□□ 1.64
LRRC71Q8N4P6 BDH1-207ENST00000441275 1605 ntTSL 5 BASIC25.3■■□□□ 1.64
LRRC71Q8N4P6 PTPA-202ENST00000347048 1989 ntTSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
LRRC71Q8N4P6 RPRD1A-207ENST00000588737 1264 ntTSL 2 BASIC25.29■■□□□ 1.64
LRRC71Q8N4P6 INPP5J-206ENST00000404453 1613 ntTSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
LRRC71Q8N4P6 PPP1R26-201ENST00000356818 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
LRRC71Q8N4P6 ARSB-206ENST00000565165 1772 ntTSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
LRRC71Q8N4P6 GATM-206ENST00000558336 1522 ntTSL 2 BASIC25.28■■□□□ 1.64
LRRC71Q8N4P6 PRICKLE4-201ENST00000394259 939 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.28■■□□□ 1.64
LRRC71Q8N4P6 GRAMD1B-217ENST00000640939 1212 ntTSL 5 BASIC25.28■■□□□ 1.64
LRRC71Q8N4P6 AMIGO1-201ENST00000369862 2229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.28■■□□□ 1.64
LRRC71Q8N4P6 ZNF503-AS2-202ENST00000466942 1430 ntTSL 2 BASIC25.28■■□□□ 1.64
LRRC71Q8N4P6 HES6-201ENST00000272937 1454 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
LRRC71Q8N4P6 EEF1D-201ENST00000317198 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.28■■□□□ 1.64
LRRC71Q8N4P6 AMZ2-219ENST00000612294 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
LRRC71Q8N4P6 MADCAM1-206ENST00000617201 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.28■■□□□ 1.64
LRRC71Q8N4P6 MADCAM1-207ENST00000619333 1485 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.28■■□□□ 1.64
LRRC71Q8N4P6 MADCAM1-210ENST00000622462 1461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.28■■□□□ 1.64
LRRC71Q8N4P6 SLBP-206ENST00000489418 1977 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
LRRC71Q8N4P6 TSNARE1-208ENST00000524325 1963 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.27■■□□□ 1.64
LRRC71Q8N4P6 POLR2H-208ENST00000456318 1802 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.27■■□□□ 1.64
LRRC71Q8N4P6 SPIRE2-205ENST00000563972 1823 ntTSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
LRRC71Q8N4P6 NFKBIB-204ENST00000572515 1929 ntTSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
LRRC71Q8N4P6 ZNF174-202ENST00000344823 1557 ntTSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
LRRC71Q8N4P6 SDHAP1-204ENST00000427415 559 ntTSL 4 BASIC25.26■■□□□ 1.63
LRRC71Q8N4P6 USP25-203ENST00000351097 2158 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
LRRC71Q8N4P6 PFKFB4-202ENST00000383734 1491 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
LRRC71Q8N4P6 NELFB-201ENST00000343053 2698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
LRRC71Q8N4P6 ADSSL1-201ENST00000330877 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
LRRC71Q8N4P6 ADSSL1-202ENST00000332972 1969 ntTSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
LRRC71Q8N4P6 PYCARD-202ENST00000350605 696 ntTSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
LRRC71Q8N4P6 MED25-211ENST00000617849 1548 ntTSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
LRRC71Q8N4P6 CDH23-206ENST00000398842 1759 ntTSL 5 BASIC25.25■■□□□ 1.63
LRRC71Q8N4P6 C20orf27-202ENST00000379772 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
LRRC71Q8N4P6 RRNAD1-201ENST00000368216 2254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
LRRC71Q8N4P6 AL161729.1-201ENST00000604104 1402 ntBASIC25.24■■□□□ 1.63
LRRC71Q8N4P6 CBR3-201ENST00000290354 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
LRRC71Q8N4P6 UNC93B3-201ENST00000308076 687 ntBASIC25.24■■□□□ 1.63
LRRC71Q8N4P6 YTHDF1-201ENST00000370334 747 ntTSL 3 BASIC25.24■■□□□ 1.63
LRRC71Q8N4P6 SMARCA5-AS1-201ENST00000500800 945 ntTSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
LRRC71Q8N4P6 NAA30-202ENST00000554703 795 ntTSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.6 ms