Protein–RNA interactions for Protein: Q8N474

SFRP1, Secreted frizzled-related protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 314 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SFRP1Q8N474 P3H3-201ENST00000290510 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
SFRP1Q8N474 GRIN2D-201ENST00000263269 5093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
SFRP1Q8N474 ID2-201ENST00000234091 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
SFRP1Q8N474 TMEM165-204ENST00000506198 828 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
SFRP1Q8N474 PLEKHJ1-213ENST00000591099 1092 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
SFRP1Q8N474 MTDHP2-201ENST00000601468 714 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
SFRP1Q8N474 ALDH16A1-203ENST00000540132 2174 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
SFRP1Q8N474 JMJD1C-AS1-201ENST00000609436 1335 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
SFRP1Q8N474 MCUB-201ENST00000394650 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
SFRP1Q8N474 GADD45A-202ENST00000370986 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
SFRP1Q8N474 RPP38-201ENST00000378197 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
SFRP1Q8N474 LTB4R2-205ENST00000543919 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
SFRP1Q8N474 MMD-201ENST00000262065 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
SFRP1Q8N474 LINC00543-201ENST00000567234 1845 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
SFRP1Q8N474 DYRK3-203ENST00000367109 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.23
SFRP1Q8N474 TMEM44-202ENST00000347147 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.23
SFRP1Q8N474 ATP5A1-220ENST00000593152 2258 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
SFRP1Q8N474 BIN1-203ENST00000346226 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
SFRP1Q8N474 FJX1-201ENST00000317811 2450 ntAPPRIS P1 BASIC22.7■■□□□ 1.22
SFRP1Q8N474 NPW-201ENST00000329610 498 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
SFRP1Q8N474 DNAJB11-201ENST00000265028 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
SFRP1Q8N474 NKAIN3-202ENST00000523211 1988 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
SFRP1Q8N474 NOX4-204ENST00000393282 560 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
SFRP1Q8N474 CLTA-204ENST00000433436 1235 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
SFRP1Q8N474 CLTA-209ENST00000538225 1181 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
SFRP1Q8N474 CLTA-210ENST00000540080 989 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
SFRP1Q8N474 TXNRD2-201ENST00000334363 1893 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
SFRP1Q8N474 ZFYVE28-202ENST00000503000 1874 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
SFRP1Q8N474 ARSB-206ENST00000565165 1772 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
SFRP1Q8N474 ST3GAL5-269ENST00000640992 2292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
SFRP1Q8N474 CDKN2B-202ENST00000380142 859 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
SFRP1Q8N474 TSPAN17-204ENST00000503045 1019 ntTSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
SFRP1Q8N474 ZNF419-210ENST00000520540 568 ntTSL 4 BASIC22.68■■□□□ 1.22
SFRP1Q8N474 MPP5-205ENST00000556345 1163 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
SFRP1Q8N474 ERGIC1-202ENST00000393784 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
SFRP1Q8N474 CCND3-223ENST00000616010 2047 ntTSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
SFRP1Q8N474 AP000802.1-201ENST00000500537 1934 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
SFRP1Q8N474 SEPT2-205ENST00000401990 1734 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
SFRP1Q8N474 ST3GAL5-214ENST00000638178 2034 ntTSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
SFRP1Q8N474 ARRDC2-202ENST00000379656 2528 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
SFRP1Q8N474 ANO8-204ENST00000630631 1905 ntTSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
SFRP1Q8N474 R3HDM4-201ENST00000361574 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
SFRP1Q8N474 PEMT-201ENST00000255389 1013 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
SFRP1Q8N474 EXOG-217ENST00000630638 197 ntTSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
SFRP1Q8N474 LDHB-203ENST00000396076 1538 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
SFRP1Q8N474 LSM4-201ENST00000252816 986 ntTSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
SFRP1Q8N474 LBH-205ENST00000407930 756 ntTSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
SFRP1Q8N474 SLC16A10-206ENST00000612036 1231 ntTSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
SFRP1Q8N474 MIR6724-1-201ENST00000616420 92 ntBASIC22.66■■□□□ 1.22
SFRP1Q8N474 MIR6724-2-201ENST00000616483 92 ntBASIC22.66■■□□□ 1.22
SFRP1Q8N474 MIR6089-201ENST00000616698 64 ntBASIC22.66■■□□□ 1.22
SFRP1Q8N474 MIR6724-4-201ENST00000617390 92 ntBASIC22.66■■□□□ 1.22
SFRP1Q8N474 MIR6724-3-201ENST00000622482 92 ntBASIC22.66■■□□□ 1.22
SFRP1Q8N474 AC119427.1-201ENST00000633182 556 ntTSL 4 BASIC22.66■■□□□ 1.22
SFRP1Q8N474 LSR-205ENST00000427250 1606 ntTSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
SFRP1Q8N474 CADPS-203ENST00000383710 5471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
SFRP1Q8N474 HNRNPAB-208ENST00000515193 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
SFRP1Q8N474 WFDC1-201ENST00000219454 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
SFRP1Q8N474 TAZ-216ENST00000613002 1485 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
SFRP1Q8N474 INPP5J-206ENST00000404453 1613 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
SFRP1Q8N474 ATAD3A-203ENST00000378756 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
SFRP1Q8N474 GRK4-204ENST00000503518 2136 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
SFRP1Q8N474 C5orf58-204ENST00000521850 2113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
SFRP1Q8N474 SNX5-217ENST00000606557 1087 ntBASIC22.65■■□□□ 1.22
SFRP1Q8N474 GOLGA7-201ENST00000357743 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
SFRP1Q8N474 C21orf2-202ENST00000339818 2233 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
SFRP1Q8N474 CUEDC1-202ENST00000407144 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
SFRP1Q8N474 FGF22-201ENST00000215530 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
SFRP1Q8N474 ARPC4-208ENST00000498623 942 ntTSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
SFRP1Q8N474 PCMT1-202ENST00000367380 1628 ntTSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
SFRP1Q8N474 PCMT1-211ENST00000544496 1628 ntTSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
SFRP1Q8N474 FAM193A-211ENST00000637812 4885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
SFRP1Q8N474 ZDHHC1-201ENST00000348579 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
SFRP1Q8N474 RARA-AS1-201ENST00000581080 1790 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
SFRP1Q8N474 AEBP2-204ENST00000398864 5099 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
SFRP1Q8N474 CDKN2A-207ENST00000497750 565 ntTSL 4 BASIC22.63■■□□□ 1.21
SFRP1Q8N474 CDKN2A-212ENST00000578845 678 ntTSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
SFRP1Q8N474 LRRC24-201ENST00000529415 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
SFRP1Q8N474 LINC01578-209ENST00000557682 2683 ntTSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
SFRP1Q8N474 AC008406.3-201ENST00000620001 1374 ntBASIC22.63■■□□□ 1.21
SFRP1Q8N474 HEXDC-202ENST00000337014 2285 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
SFRP1Q8N474 ADAM22-209ENST00000439864 2576 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
SFRP1Q8N474 ARG2-201ENST00000261783 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
SFRP1Q8N474 ROR1-202ENST00000371080 2305 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
SFRP1Q8N474 TRIM7-202ENST00000334421 1228 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
SFRP1Q8N474 AL117332.1-201ENST00000622628 974 ntBASIC22.62■■□□□ 1.21
SFRP1Q8N474 ESR2-202ENST00000341099 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
SFRP1Q8N474 DLK2-202ENST00000372485 1572 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
SFRP1Q8N474 AC141586.4-201ENST00000624558 1573 ntBASIC22.62■■□□□ 1.21
SFRP1Q8N474 C7orf25-205ENST00000438029 1743 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
SFRP1Q8N474 MAGI2-208ENST00000522391 4878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
SFRP1Q8N474 PGF-203ENST00000553716 1699 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
SFRP1Q8N474 SNX10-207ENST00000446848 2613 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
SFRP1Q8N474 FRMD8-203ENST00000416776 1818 ntTSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
SFRP1Q8N474 DOK3-205ENST00000501403 1872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
SFRP1Q8N474 SERINC5-203ENST00000509193 1441 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
SFRP1Q8N474 DUSP22-214ENST00000605315 867 ntTSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
SFRP1Q8N474 MIR663AHG-233ENST00000609248 830 ntTSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
SFRP1Q8N474 TMEM150C-201ENST00000449862 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
SFRP1Q8N474 MATK-204ENST00000585778 1994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14.1 ms