Protein–RNA interactions for Protein: Q8N300

SVBP, Small vasohibin-binding protein, humanhuman

Predictions only

Length 66 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SVBPQ8N300 CERKL-205ENST00000409440 2425 ntTSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
SVBPQ8N300 CDC16-206ENST00000375310 2156 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
SVBPQ8N300 PAIP1-208ENST00000514514 1603 ntTSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
SVBPQ8N300 CYP2A7-201ENST00000291764 2128 ntTSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
SVBPQ8N300 OBSL1-204ENST00000404537 5841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
SVBPQ8N300 ZNF510-203ENST00000375231 5616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
SVBPQ8N300 DOK3-201ENST00000312943 2292 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
SVBPQ8N300 ZNF444-211ENST00000592949 1906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
SVBPQ8N300 FAM193B-217ENST00000514747 2913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
SVBPQ8N300 PON1-201ENST00000222381 2568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
SVBPQ8N300 B3GALNT2-202ENST00000366600 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
SVBPQ8N300 TMEM250-205ENST00000561457 2804 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
SVBPQ8N300 AOC1-202ENST00000416793 2453 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
SVBPQ8N300 ADCK2-203ENST00000476491 2092 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
SVBPQ8N300 ATP6V1E2-204ENST00000522587 1559 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.28■□□□□ 0.52
SVBPQ8N300 CBLN3-201ENST00000267406 2346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
SVBPQ8N300 ZNF669-201ENST00000343381 1951 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
SVBPQ8N300 PRMT5-201ENST00000216350 2271 ntTSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
SVBPQ8N300 MAPT-203ENST00000340799 5724 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
SVBPQ8N300 FLT1-209ENST00000639477 6337 ntTSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
SVBPQ8N300 FGF2-201ENST00000264498 6775 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
SVBPQ8N300 XYLT1-201ENST00000261381 9891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
SVBPQ8N300 ZNF688-201ENST00000223459 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
SVBPQ8N300 AC135983.2-203ENST00000454486 1613 ntBASIC18.27■□□□□ 0.52
SVBPQ8N300 INPP4A-201ENST00000074304 6752 ntTSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
SVBPQ8N300 SLC1A5-203ENST00000542575 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
SVBPQ8N300 PPP1R3F-201ENST00000055335 3421 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
SVBPQ8N300 LINC01578-201ENST00000553829 732 ntTSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
SVBPQ8N300 TMIE-201ENST00000326431 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
SVBPQ8N300 EPHA6-202ENST00000470610 2058 ntTSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.51
SVBPQ8N300 FYN-204ENST00000368678 2573 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.51
SVBPQ8N300 DCAF4-202ENST00000358377 2024 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
SVBPQ8N300 HNRNPLL-203ENST00000378915 2523 ntTSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
SVBPQ8N300 NRGN-201ENST00000284292 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
SVBPQ8N300 FGFR1-214ENST00000447712 5900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
SVBPQ8N300 PHLDA3-202ENST00000367311 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
SVBPQ8N300 TMED4-201ENST00000289577 2203 ntTSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
SVBPQ8N300 AC242852.2-201ENST00000615738 1807 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
SVBPQ8N300 MAPK8IP1P1-201ENST00000574657 1439 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
SVBPQ8N300 C8orf82-201ENST00000313465 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
SVBPQ8N300 MYO15B-232ENST00000610510 9195 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
SVBPQ8N300 KLC3-201ENST00000391946 1780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
SVBPQ8N300 MEIOB-202ENST00000397344 1792 ntTSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
SVBPQ8N300 TAF6L-201ENST00000294168 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
SVBPQ8N300 BDH1-207ENST00000441275 1605 ntTSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
SVBPQ8N300 PUF60-203ENST00000453551 1842 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
SVBPQ8N300 PICK1-202ENST00000404072 2164 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
SVBPQ8N300 MEF2A-207ENST00000558812 2186 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
SVBPQ8N300 DISC1-212ENST00000535983 2505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
SVBPQ8N300 UBE2K-201ENST00000261427 5245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
SVBPQ8N300 NES-201ENST00000368223 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
SVBPQ8N300 C19orf12-201ENST00000323670 2464 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
SVBPQ8N300 C19orf35-201ENST00000342063 2574 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
SVBPQ8N300 ZDHHC5-201ENST00000287169 4666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
SVBPQ8N300 UNC93B1-201ENST00000227471 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
SVBPQ8N300 CIB1-201ENST00000328649 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
SVBPQ8N300 CIB1-202ENST00000612800 1096 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
SVBPQ8N300 AP002884.3-203ENST00000419895 1711 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
SVBPQ8N300 KCNK6-201ENST00000263372 5722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
SVBPQ8N300 SPHK1-201ENST00000323374 2138 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
SVBPQ8N300 CRIP1-201ENST00000330233 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
SVBPQ8N300 ATP11C-203ENST00000370557 6924 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
SVBPQ8N300 CDK5R2-201ENST00000302625 2508 ntAPPRIS P1 BASIC18.24■□□□□ 0.51
SVBPQ8N300 SLC9A3R1-201ENST00000262613 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
SVBPQ8N300 TPST2-203ENST00000403880 2084 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
SVBPQ8N300 LTB4R-201ENST00000345363 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
SVBPQ8N300 FBXL19-205ENST00000562319 2462 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
SVBPQ8N300 INPP1-201ENST00000322522 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
SVBPQ8N300 CPNE7-202ENST00000319518 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
SVBPQ8N300 RDH14-201ENST00000381249 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
SVBPQ8N300 ADGRB1-201ENST00000323289 5527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
SVBPQ8N300 ASRGL1-201ENST00000301776 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
SVBPQ8N300 MXD3-201ENST00000423571 1534 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
SVBPQ8N300 IFNL4-201ENST00000606380 1637 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
SVBPQ8N300 KDM2A-202ENST00000398645 6511 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
SVBPQ8N300 FDFT1-201ENST00000220584 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
SVBPQ8N300 P2RX4-211ENST00000543171 1777 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
SVBPQ8N300 LINC01011-201ENST00000445000 2811 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
SVBPQ8N300 C1QTNF1-201ENST00000311661 2624 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
SVBPQ8N300 ANO8-204ENST00000630631 1905 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
SVBPQ8N300 IGF2-AS-201ENST00000381361 2063 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
SVBPQ8N300 RNF4-207ENST00000506706 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
SVBPQ8N300 MAG-201ENST00000361922 2426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
SVBPQ8N300 NUTF2-201ENST00000219169 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
SVBPQ8N300 ZNF784-202ENST00000591479 1559 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
SVBPQ8N300 PALM-208ENST00000592155 2272 ntTSL 4 BASIC18.22■□□□□ 0.51
SVBPQ8N300 ATOH8-201ENST00000306279 2438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
SVBPQ8N300 CD7-207ENST00000584284 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
SVBPQ8N300 CRELD2-203ENST00000404488 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
SVBPQ8N300 USP25-202ENST00000285681 5216 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
SVBPQ8N300 GPRC5B-210ENST00000569847 1830 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
SVBPQ8N300 KAZN-207ENST00000503743 1475 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
SVBPQ8N300 GFI1-201ENST00000294702 2784 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
SVBPQ8N300 DBX2-201ENST00000332700 2806 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
SVBPQ8N300 ORAI3-201ENST00000318663 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
SVBPQ8N300 RRAS2-201ENST00000256196 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
SVBPQ8N300 RCN2-201ENST00000320963 1750 ntTSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
SVBPQ8N300 DMPK-220ENST00000618091 2503 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
SVBPQ8N300 AL391422.3-201ENST00000603791 2761 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
SVBPQ8N300 AC009041.2-204ENST00000568394 3343 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.7 ms