Protein–RNA interactions for Protein: Q8N2E2

VWDE, von Willebrand factor D and EGF domain-containing protein, humanhuman

Predictions only

Length 1,590 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VWDEQ8N2E2 AC006455.2-201ENST00000429931 906 ntBASIC33.86■■■■□ 3.01
VWDEQ8N2E2 SYF2-201ENST00000236273 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.86■■■■□ 3.01
VWDEQ8N2E2 CENPH-201ENST00000283006 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.86■■■■□ 3.01
VWDEQ8N2E2 C1QTNF1-207ENST00000580454 1396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.86■■■■□ 3.01
VWDEQ8N2E2 SPEF1-201ENST00000379756 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.86■■■■□ 3.01
VWDEQ8N2E2 USF2-201ENST00000222305 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.86■■■■□ 3.01
VWDEQ8N2E2 C20orf27-202ENST00000379772 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.86■■■■□ 3.01
VWDEQ8N2E2 UBXN2A-202ENST00000404924 1557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.85■■■■□ 3.01
VWDEQ8N2E2 KBTBD13-201ENST00000432196 1377 ntAPPRIS P1 BASIC33.85■■■■□ 3.01
VWDEQ8N2E2 MYDGF-203ENST00000599630 713 ntTSL 2 BASIC33.85■■■■□ 3.01
VWDEQ8N2E2 SYNGR3-206ENST00000618464 1213 ntTSL 1 (best) BASIC33.85■■■■□ 3.01
VWDEQ8N2E2 IMPA2-212ENST00000625802 500 ntTSL 2 BASIC33.85■■■■□ 3.01
VWDEQ8N2E2 LEFTY1-201ENST00000272134 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.85■■■■□ 3.01
VWDEQ8N2E2 LKAAEAR1-201ENST00000302096 761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC33.85■■■■□ 3.01
VWDEQ8N2E2 LKAAEAR1-202ENST00000308906 868 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.85■■■■□ 3.01
VWDEQ8N2E2 C7orf25-206ENST00000447342 1823 ntTSL 2 BASIC33.84■■■■□ 3.01
VWDEQ8N2E2 ST6GALNAC6-205ENST00000373146 2460 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.84■■■■□ 3.01
VWDEQ8N2E2 PPM1N-207ENST00000451287 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.84■■■■□ 3.01
VWDEQ8N2E2 TMEM218-207ENST00000528724 1117 ntTSL 5 BASIC33.84■■■■□ 3.01
VWDEQ8N2E2 TMEM218-214ENST00000532156 954 ntTSL 1 (best) BASIC33.84■■■■□ 3.01
VWDEQ8N2E2 YWHAH-202ENST00000397492 1879 ntTSL 3 BASIC33.83■■■■□ 3.01
VWDEQ8N2E2 MYBL1-201ENST00000517885 1714 ntTSL 5 BASIC33.82■■■■□ 3.01
VWDEQ8N2E2 FBXL8-201ENST00000258200 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.82■■■■□ 3.01
VWDEQ8N2E2 TSEN54-201ENST00000333213 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.82■■■■□ 3
VWDEQ8N2E2 PLPP5-201ENST00000419686 794 ntTSL 2 BASIC33.82■■■■□ 3
VWDEQ8N2E2 C15orf61-202ENST00000557807 769 ntTSL 2 BASIC33.82■■■■□ 3
VWDEQ8N2E2 SLC35A3-216ENST00000639221 1032 ntTSL 5 BASIC33.82■■■■□ 3
VWDEQ8N2E2 TMCO6-201ENST00000252100 1834 ntTSL 1 (best) BASIC33.82■■■■□ 3
VWDEQ8N2E2 C14orf80-206ENST00000392527 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.82■■■■□ 3
VWDEQ8N2E2 CCDC106-205ENST00000588740 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.82■■■■□ 3
VWDEQ8N2E2 PTRH1-205ENST00000423807 1570 ntTSL 2 BASIC33.82■■■■□ 3
VWDEQ8N2E2 HSPBP1-202ENST00000433386 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.82■■■■□ 3
VWDEQ8N2E2 CYC1-201ENST00000318911 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.81■■■■□ 3
VWDEQ8N2E2 AC007009.1-201ENST00000458624 429 ntTSL 2 BASIC33.81■■■■□ 3
VWDEQ8N2E2 ARFIP2-205ENST00000525235 852 ntTSL 2 BASIC33.81■■■■□ 3
VWDEQ8N2E2 UBAP1L-203ENST00000559089 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.81■■■■□ 3
VWDEQ8N2E2 LINC01678-201ENST00000411694 863 ntTSL 5 BASIC33.81■■■■□ 3
VWDEQ8N2E2 PRSS22-203ENST00000571228 1037 ntTSL 2 BASIC33.81■■■■□ 3
VWDEQ8N2E2 PNLIPRP2-205ENST00000611850 1407 ntTSL 5 BASIC33.8■■■■□ 3
VWDEQ8N2E2 FXYD7-201ENST00000270310 712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.8■■■■□ 3
VWDEQ8N2E2 ACAP1-206ENST00000571471 320 ntTSL 2 BASIC33.8■■■■□ 3
VWDEQ8N2E2 HRH3-203ENST00000611492 900 ntTSL 1 (best) BASIC33.8■■■■□ 3
VWDEQ8N2E2 ST3GAL5-231ENST00000639119 2131 ntTSL 5 BASIC33.8■■■■□ 3
VWDEQ8N2E2 CPSF4-204ENST00000436336 1738 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC33.79■■■■□ 3
VWDEQ8N2E2 AC004707.1-201ENST00000511627 715 ntTSL 3 BASIC33.79■■■■□ 3
VWDEQ8N2E2 ZNF768-201ENST00000380412 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.79■■■■□ 3
VWDEQ8N2E2 LRRC75A-203ENST00000470794 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.79■■■■□ 3
VWDEQ8N2E2 LSR-205ENST00000427250 1606 ntTSL 2 BASIC33.78■■■■□ 3
VWDEQ8N2E2 DHRS13-202ENST00000394901 2037 ntTSL 1 (best) BASIC33.78■■■■□ 3
VWDEQ8N2E2 SNX3-202ENST00000349379 890 ntTSL 2 BASIC33.78■■■■□ 3
VWDEQ8N2E2 RCOR3-202ENST00000367006 2525 ntTSL 1 (best) BASIC33.78■■■■□ 3
VWDEQ8N2E2 SAMD13-205ENST00000370673 1567 ntTSL 2 BASIC33.78■■■■□ 3
VWDEQ8N2E2 AC099791.1-201ENST00000416440 715 ntBASIC33.77■■■■□ 3
VWDEQ8N2E2 PTGDR-202ENST00000553372 1216 ntTSL 3 BASIC33.77■■■■□ 3
VWDEQ8N2E2 AL022069.1-201ENST00000568025 1636 ntBASIC33.77■■■■□ 3
VWDEQ8N2E2 FRMD8-208ENST00000531296 366 ntTSL 1 (best) BASIC33.77■■■■□ 3
VWDEQ8N2E2 ZNF503-AS2-201ENST00000425916 2026 ntTSL 1 (best) BASIC33.76■■■□□ 2.99
VWDEQ8N2E2 DCUN1D2-208ENST00000478244 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.76■■■□□ 2.99
VWDEQ8N2E2 HYI-204ENST00000372432 1066 ntTSL 1 (best) BASIC33.76■■■□□ 2.99
VWDEQ8N2E2 UBFD1-208ENST00000567264 642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC33.76■■■□□ 2.99
VWDEQ8N2E2 NME4-201ENST00000219479 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.75■■■□□ 2.99
VWDEQ8N2E2 AC008105.3-201ENST00000586376 844 ntTSL 3 BASIC33.75■■■□□ 2.99
VWDEQ8N2E2 IKBKGP1-201ENST00000612193 1073 ntBASIC33.75■■■□□ 2.99
VWDEQ8N2E2 WTAP-201ENST00000337387 1622 ntTSL 1 (best) BASIC33.75■■■□□ 2.99
VWDEQ8N2E2 PCP4L1-201ENST00000504449 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.75■■■□□ 2.99
VWDEQ8N2E2 PHF23-205ENST00000571362 1768 ntTSL 2 BASIC33.74■■■□□ 2.99
VWDEQ8N2E2 AC241377.3-202ENST00000626088 1088 ntBASIC33.74■■■□□ 2.99
VWDEQ8N2E2 AC241585.3-202ENST00000628937 1088 ntBASIC33.74■■■□□ 2.99
VWDEQ8N2E2 AC245100.8-202ENST00000629247 1058 ntBASIC33.74■■■□□ 2.99
VWDEQ8N2E2 CBWD3-212ENST00000616550 721 ntTSL 2 BASIC33.73■■■□□ 2.99
VWDEQ8N2E2 CBWD6-216ENST00000617933 721 ntTSL 3 BASIC33.73■■■□□ 2.99
VWDEQ8N2E2 SLC16A11-202ENST00000447225 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC33.73■■■□□ 2.99
VWDEQ8N2E2 SLC52A2-202ENST00000402965 1777 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.73■■■□□ 2.99
VWDEQ8N2E2 RHOF-204ENST00000537265 699 ntTSL 2 BASIC33.72■■■□□ 2.99
VWDEQ8N2E2 HERC2P4-206ENST00000568097 1062 ntTSL 5 BASIC33.72■■■□□ 2.99
VWDEQ8N2E2 LINC01116-201ENST00000295549 1407 ntTSL 2 BASIC33.72■■■□□ 2.99
VWDEQ8N2E2 LINC00092-201ENST00000412122 1726 ntTSL 1 (best) BASIC33.72■■■□□ 2.99
VWDEQ8N2E2 MFSD5-201ENST00000329548 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.72■■■□□ 2.99
VWDEQ8N2E2 CDC37L1-202ENST00000381858 1244 ntTSL 5 BASIC33.72■■■□□ 2.99
VWDEQ8N2E2 FUT11-202ENST00000394790 2175 ntTSL 1 (best) BASIC33.72■■■□□ 2.99
VWDEQ8N2E2 MYCBPAP-202ENST00000419930 1640 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.71■■■□□ 2.99
VWDEQ8N2E2 C8orf58-201ENST00000289989 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC33.71■■■□□ 2.99
VWDEQ8N2E2 THOC6-202ENST00000326266 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.71■■■□□ 2.99
VWDEQ8N2E2 AC062017.1-203ENST00000413029 455 ntTSL 2 BASIC33.71■■■□□ 2.99
VWDEQ8N2E2 CREB3L2-203ENST00000452463 1105 ntTSL 1 (best) BASIC33.71■■■□□ 2.99
VWDEQ8N2E2 ZNF692-201ENST00000306601 1931 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.7■■■□□ 2.99
VWDEQ8N2E2 MATK-202ENST00000395040 1907 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.7■■■□□ 2.99
VWDEQ8N2E2 SNHG7-204ENST00000447221 2157 ntTSL 2 BASIC33.7■■■□□ 2.99
VWDEQ8N2E2 HES6-206ENST00000409574 738 ntTSL 2 BASIC33.7■■■□□ 2.99
VWDEQ8N2E2 DENND3-207ENST00000518347 850 ntTSL 2 BASIC33.7■■■□□ 2.99
VWDEQ8N2E2 AC007448.3-201ENST00000585193 689 ntTSL 2 BASIC33.7■■■□□ 2.99
VWDEQ8N2E2 IKBIP-202ENST00000342502 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC33.7■■■□□ 2.98
VWDEQ8N2E2 AIDA-202ENST00000355727 1072 ntTSL 5 BASIC33.69■■■□□ 2.98
VWDEQ8N2E2 GDNF-203ENST00000381826 778 ntTSL 1 (best) BASIC33.69■■■□□ 2.98
VWDEQ8N2E2 TSPY4-201ENST00000383008 1143 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC33.69■■■□□ 2.98
VWDEQ8N2E2 GDNF-204ENST00000427982 856 ntTSL 1 (best) BASIC33.69■■■□□ 2.98
VWDEQ8N2E2 PPM1B-202ENST00000345249 1713 ntTSL 1 (best) BASIC33.69■■■□□ 2.98
VWDEQ8N2E2 ADSSL1-201ENST00000330877 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.69■■■□□ 2.98
VWDEQ8N2E2 UHRF2-202ENST00000381373 802 ntTSL 3 BASIC33.68■■■□□ 2.98
VWDEQ8N2E2 AC068580.1-201ENST00000446489 252 ntTSL 3 BASIC33.68■■■□□ 2.98
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.8 ms