Protein–RNA interactions for Protein: Q8N0S2

SYCE1, Synaptonemal complex central element protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 351 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SYCE1Q8N0S2 ARRDC1-AS1-203ENST00000623970 2210 ntTSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
SYCE1Q8N0S2 LYRM1-201ENST00000219168 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
SYCE1Q8N0S2 BIN1-207ENST00000357970 2497 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
SYCE1Q8N0S2 UBXN2A-202ENST00000404924 1557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
SYCE1Q8N0S2 AC107214.1-201ENST00000457303 559 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
SYCE1Q8N0S2 SPCS2P3-201ENST00000500401 656 ntBASIC24.18■■□□□ 1.46
SYCE1Q8N0S2 SLC52A2-211ENST00000532887 2147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
SYCE1Q8N0S2 AC096541.1-201ENST00000445070 1807 ntTSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
SYCE1Q8N0S2 ABHD6-201ENST00000295962 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
SYCE1Q8N0S2 WFDC1-201ENST00000219454 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
SYCE1Q8N0S2 TNFRSF10B-202ENST00000347739 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
SYCE1Q8N0S2 MATK-202ENST00000395040 1907 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
SYCE1Q8N0S2 ASF1B-201ENST00000263382 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
SYCE1Q8N0S2 AF117829.1-207ENST00000504145 1572 ntTSL 3 BASIC24.17■■□□□ 1.46
SYCE1Q8N0S2 PKM-201ENST00000319622 2717 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
SYCE1Q8N0S2 LYPD6B-204ENST00000409876 1248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
SYCE1Q8N0S2 HERC2P9-201ENST00000507787 1023 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
SYCE1Q8N0S2 MIR6765-201ENST00000614092 87 ntBASIC24.17■■□□□ 1.46
SYCE1Q8N0S2 KCTD8-201ENST00000360029 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
SYCE1Q8N0S2 SERINC5-203ENST00000509193 1441 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
SYCE1Q8N0S2 RBFOX2-209ENST00000438146 1356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
SYCE1Q8N0S2 WT1-204ENST00000448076 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
SYCE1Q8N0S2 NFU1-203ENST00000410022 1467 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
SYCE1Q8N0S2 KMT2E-AS1-201ENST00000453677 736 ntTSL 3 BASIC24.16■■□□□ 1.46
SYCE1Q8N0S2 HTATSF1-201ENST00000218364 2775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
SYCE1Q8N0S2 TMEM185B-201ENST00000426077 2131 ntAPPRIS P1 BASIC24.16■■□□□ 1.46
SYCE1Q8N0S2 ZMYND19-201ENST00000298585 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
SYCE1Q8N0S2 LRRC34-206ENST00000522526 1899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
SYCE1Q8N0S2 RYK-209ENST00000623711 2934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
SYCE1Q8N0S2 APBB3-204ENST00000358580 2020 ntTSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
SYCE1Q8N0S2 CDC16-206ENST00000375310 2156 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
SYCE1Q8N0S2 PFKFB3-201ENST00000317350 1999 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
SYCE1Q8N0S2 LINC01233-202ENST00000598832 568 ntTSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
SYCE1Q8N0S2 AKT1-201ENST00000349310 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
SYCE1Q8N0S2 TMUB1-203ENST00000462940 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
SYCE1Q8N0S2 C6orf201-202ENST00000380175 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
SYCE1Q8N0S2 AL022069.1-201ENST00000568025 1636 ntBASIC24.14■■□□□ 1.46
SYCE1Q8N0S2 ABHD17AP3-201ENST00000503096 1137 ntBASIC24.14■■□□□ 1.45
SYCE1Q8N0S2 SPON2-222ENST00000617421 2156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.45
SYCE1Q8N0S2 POLDIP2-201ENST00000540200 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
SYCE1Q8N0S2 DUSP8P3-201ENST00000399571 1760 ntBASIC24.14■■□□□ 1.45
SYCE1Q8N0S2 CUEDC1-202ENST00000407144 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
SYCE1Q8N0S2 SEPT2-205ENST00000401990 1734 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
SYCE1Q8N0S2 C1QL3-201ENST00000298943 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
SYCE1Q8N0S2 SLC4A3-203ENST00000358055 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
SYCE1Q8N0S2 FLOT1-201ENST00000376389 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
SYCE1Q8N0S2 HIRA-202ENST00000340170 3395 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
SYCE1Q8N0S2 USP36-218ENST00000590546 1771 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
SYCE1Q8N0S2 C1orf122-202ENST00000373043 2229 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
SYCE1Q8N0S2 STRBP-202ENST00000360998 2990 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
SYCE1Q8N0S2 PPP1R1B-201ENST00000254079 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
SYCE1Q8N0S2 MOB4-204ENST00000409360 1447 ntTSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
SYCE1Q8N0S2 SLC25A1-202ENST00000451283 1514 ntTSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
SYCE1Q8N0S2 AC004691.2-201ENST00000509504 1531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
SYCE1Q8N0S2 LMAN2-208ENST00000515209 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.12■■□□□ 1.45
SYCE1Q8N0S2 ADD1-202ENST00000355842 4743 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
SYCE1Q8N0S2 LINC01970-201ENST00000581489 1810 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
SYCE1Q8N0S2 TMEM98-202ENST00000394642 1683 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
SYCE1Q8N0S2 HYI-213ENST00000583037 1322 ntTSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
SYCE1Q8N0S2 AFDN-AS1-201ENST00000359760 2238 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
SYCE1Q8N0S2 ZNF213-208ENST00000576416 2240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
SYCE1Q8N0S2 PPP4R4-202ENST00000328839 876 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
SYCE1Q8N0S2 C5orf49-201ENST00000399810 2385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
SYCE1Q8N0S2 BEST2-204ENST00000553030 2000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
SYCE1Q8N0S2 GALC-202ENST00000393568 2054 ntTSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
SYCE1Q8N0S2 SLC30A2-201ENST00000374276 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
SYCE1Q8N0S2 DONSON-210ENST00000453626 2332 ntTSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
SYCE1Q8N0S2 SLC10A4-201ENST00000273861 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
SYCE1Q8N0S2 IL17RE-201ENST00000383814 2704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
SYCE1Q8N0S2 KCNK13-201ENST00000282146 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
SYCE1Q8N0S2 UPF3A-201ENST00000351487 2235 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
SYCE1Q8N0S2 HADH-209ENST00000603302 2032 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
SYCE1Q8N0S2 SOS2-201ENST00000216373 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
SYCE1Q8N0S2 CNPY3-201ENST00000372836 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
SYCE1Q8N0S2 SLC9A3-AS1-207ENST00000607286 1357 ntTSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
SYCE1Q8N0S2 DUX4L9-201ENST00000449051 1259 ntBASIC24.09■■□□□ 1.45
SYCE1Q8N0S2 PDE10A-205ENST00000616273 2118 ntTSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
SYCE1Q8N0S2 AL117328.2-201ENST00000624617 1940 ntBASIC24.09■■□□□ 1.45
SYCE1Q8N0S2 IFNGR2-202ENST00000381995 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
SYCE1Q8N0S2 NRG2-201ENST00000289409 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
SYCE1Q8N0S2 ADSS-201ENST00000366535 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
SYCE1Q8N0S2 CRACR2B-202ENST00000525077 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
SYCE1Q8N0S2 DTNB-210ENST00000407186 2275 ntTSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.45
SYCE1Q8N0S2 ACOT1-201ENST00000311148 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
SYCE1Q8N0S2 IGF2-AS-201ENST00000381361 2063 ntTSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.45
SYCE1Q8N0S2 CFAP77-202ENST00000393215 901 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.45
SYCE1Q8N0S2 LONRF2P2-201ENST00000439212 571 ntBASIC24.08■■□□□ 1.45
SYCE1Q8N0S2 SHISA8-202ENST00000621082 1405 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.44
SYCE1Q8N0S2 ASRGL1-202ENST00000415229 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
SYCE1Q8N0S2 AKT1S1-204ENST00000391832 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
SYCE1Q8N0S2 NKIRAS2-206ENST00000393885 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
SYCE1Q8N0S2 CAMK1-201ENST00000256460 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
SYCE1Q8N0S2 USF2-201ENST00000222305 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
SYCE1Q8N0S2 ACSF2-207ENST00000504392 1881 ntTSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
SYCE1Q8N0S2 MAPK12-211ENST00000622558 1779 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
SYCE1Q8N0S2 NRL-202ENST00000396997 1517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
SYCE1Q8N0S2 NME2-205ENST00000512737 826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
SYCE1Q8N0S2 ARHGAP27-207ENST00000528273 2319 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
SYCE1Q8N0S2 SPHK1-210ENST00000592299 1821 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
SYCE1Q8N0S2 HAUS3-202ENST00000443786 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 45 ms