Protein–RNA interactions for Protein: Q8IZ73

RPUSD2, RNA pseudouridylate synthase domain-containing protein 2, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 545 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RPUSD2Q8IZ73 AC004448.1-201ENST00000458332 883 ntBASIC25.58■■□□□ 1.69
RPUSD2Q8IZ73 FAM222B-208ENST00000581381 556 ntTSL 4 BASIC25.58■■□□□ 1.69
RPUSD2Q8IZ73 GSX2-205ENST00000611459 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
RPUSD2Q8IZ73 CCDC107-205ENST00000421582 1324 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.58■■□□□ 1.69
RPUSD2Q8IZ73 NR6A1-201ENST00000344523 1846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.58■■□□□ 1.68
RPUSD2Q8IZ73 C7orf49-203ENST00000430372 1579 ntTSL 5 BASIC25.57■■□□□ 1.68
RPUSD2Q8IZ73 HSPBP1-201ENST00000255631 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
RPUSD2Q8IZ73 NR2F1-AS1-214ENST00000607831 1963 ntTSL 2 BASIC25.57■■□□□ 1.68
RPUSD2Q8IZ73 METTL23-201ENST00000341249 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
RPUSD2Q8IZ73 FAIM-202ENST00000360570 1157 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC25.57■■□□□ 1.68
RPUSD2Q8IZ73 DPP10-AS1-201ENST00000432658 730 ntTSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
RPUSD2Q8IZ73 AF213884.3-201ENST00000563833 479 ntBASIC25.57■■□□□ 1.68
RPUSD2Q8IZ73 YWHAH-202ENST00000397492 1879 ntTSL 3 BASIC25.57■■□□□ 1.68
RPUSD2Q8IZ73 GLRX3-201ENST00000331244 1302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
RPUSD2Q8IZ73 MFSD7-202ENST00000347950 1599 ntTSL 2 BASIC25.56■■□□□ 1.68
RPUSD2Q8IZ73 ZNF365-206ENST00000395255 1674 ntTSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
RPUSD2Q8IZ73 RBM38-205ENST00000440234 686 ntTSL 2 BASIC25.56■■□□□ 1.68
RPUSD2Q8IZ73 TMEM170A-206ENST00000569276 609 ntTSL 2 BASIC25.56■■□□□ 1.68
RPUSD2Q8IZ73 MIR6821-201ENST00000617625 74 ntBASIC25.56■■□□□ 1.68
RPUSD2Q8IZ73 SF1-220ENST00000626028 704 ntTSL 2 BASIC25.56■■□□□ 1.68
RPUSD2Q8IZ73 EPCAM-201ENST00000263735 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
RPUSD2Q8IZ73 BIN1-206ENST00000352848 2209 ntTSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
RPUSD2Q8IZ73 SRPK3-205ENST00000393786 1900 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
RPUSD2Q8IZ73 PINK1-201ENST00000321556 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
RPUSD2Q8IZ73 LMTK3-201ENST00000270238 4972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
RPUSD2Q8IZ73 MIR939-201ENST00000401314 82 ntBASIC25.55■■□□□ 1.68
RPUSD2Q8IZ73 GATA2-AS1-201ENST00000464242 1163 ntTSL 2 BASIC25.55■■□□□ 1.68
RPUSD2Q8IZ73 ZNF264-206ENST00000600531 774 ntTSL 2 BASIC25.55■■□□□ 1.68
RPUSD2Q8IZ73 PTPMT1-205ENST00000534775 1611 ntTSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
RPUSD2Q8IZ73 PCMT1-201ENST00000367378 1293 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
RPUSD2Q8IZ73 PPM1N-207ENST00000451287 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.54■■□□□ 1.68
RPUSD2Q8IZ73 ATP6V0B-204ENST00000471859 865 ntTSL 5 BASIC25.54■■□□□ 1.68
RPUSD2Q8IZ73 TMEM218-209ENST00000529583 848 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.54■■□□□ 1.68
RPUSD2Q8IZ73 SCARA5-204ENST00000524352 1945 ntTSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
RPUSD2Q8IZ73 KCNMA1-283ENST00000640523 5425 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.54■■□□□ 1.68
RPUSD2Q8IZ73 TMEM104-205ENST00000582773 1740 ntTSL 2 BASIC25.54■■□□□ 1.68
RPUSD2Q8IZ73 LURAP1L-201ENST00000319264 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
RPUSD2Q8IZ73 AC022211.4-201ENST00000625094 2161 ntBASIC25.54■■□□□ 1.68
RPUSD2Q8IZ73 TMIE-201ENST00000326431 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
RPUSD2Q8IZ73 GADD45A-202ENST00000370986 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
RPUSD2Q8IZ73 DACT1-206ENST00000556859 2239 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.53■■□□□ 1.68
RPUSD2Q8IZ73 RRP9-201ENST00000232888 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
RPUSD2Q8IZ73 CADPS-203ENST00000383710 5471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
RPUSD2Q8IZ73 C1QTNF12-201ENST00000330388 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
RPUSD2Q8IZ73 CAMTA1-208ENST00000473578 567 ntTSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
RPUSD2Q8IZ73 AC092171.4-201ENST00000609130 632 ntBASIC25.53■■□□□ 1.68
RPUSD2Q8IZ73 BAG1-212ENST00000641048 1038 ntAPPRIS P3 BASIC25.53■■□□□ 1.68
RPUSD2Q8IZ73 AC097639.1-201ENST00000565519 1891 ntBASIC25.53■■□□□ 1.68
RPUSD2Q8IZ73 AQP10-201ENST00000324978 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
RPUSD2Q8IZ73 PRADC1-201ENST00000258083 1083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
RPUSD2Q8IZ73 AC091305.1-201ENST00000479476 895 ntBASIC25.52■■□□□ 1.68
RPUSD2Q8IZ73 PAFAH1B2-205ENST00000529887 1056 ntTSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
RPUSD2Q8IZ73 SERGEF-219ENST00000532265 1124 ntTSL 2 BASIC25.52■■□□□ 1.68
RPUSD2Q8IZ73 ANKRD20A6P-201ENST00000618763 204 ntBASIC25.52■■□□□ 1.68
RPUSD2Q8IZ73 KRT72-201ENST00000293745 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
RPUSD2Q8IZ73 MAZ-203ENST00000545521 2333 ntTSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
RPUSD2Q8IZ73 AC142381.3-201ENST00000568208 1670 ntBASIC25.52■■□□□ 1.68
RPUSD2Q8IZ73 MED17-227ENST00000640521 2047 ntTSL 5 BASIC25.51■■□□□ 1.67
RPUSD2Q8IZ73 CCND3-202ENST00000372988 2133 ntTSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
RPUSD2Q8IZ73 FPGS-221ENST00000630236 2160 ntTSL 5 BASIC25.51■■□□□ 1.67
RPUSD2Q8IZ73 CRIM1-201ENST00000280527 5912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
RPUSD2Q8IZ73 ATP5C1-202ENST00000356708 1163 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
RPUSD2Q8IZ73 AC097381.1-201ENST00000429019 1296 ntBASIC25.51■■□□□ 1.67
RPUSD2Q8IZ73 NKX2-2-AS1-201ENST00000549659 638 ntTSL 5 BASIC25.51■■□□□ 1.67
RPUSD2Q8IZ73 FAM222B-213ENST00000583522 556 ntTSL 2 BASIC25.51■■□□□ 1.67
RPUSD2Q8IZ73 TSPAN4-202ENST00000397396 1332 ntTSL 5 BASIC25.51■■□□□ 1.67
RPUSD2Q8IZ73 STEAP2-207ENST00000402625 1372 ntTSL 5 BASIC25.51■■□□□ 1.67
RPUSD2Q8IZ73 GMPPB-202ENST00000308388 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
RPUSD2Q8IZ73 SCTR-201ENST00000019103 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
RPUSD2Q8IZ73 E2F5-203ENST00000418930 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
RPUSD2Q8IZ73 STMN4-201ENST00000265770 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
RPUSD2Q8IZ73 FXYD7-201ENST00000270310 712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
RPUSD2Q8IZ73 MEIS1-AS3-201ENST00000454167 707 ntTSL 4 BASIC25.5■■□□□ 1.67
RPUSD2Q8IZ73 VAMP2-204ENST00000488857 874 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC25.5■■□□□ 1.67
RPUSD2Q8IZ73 AP001330.3-201ENST00000520123 633 ntBASIC25.5■■□□□ 1.67
RPUSD2Q8IZ73 TMEM179-204ENST00000556573 1430 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.5■■□□□ 1.67
RPUSD2Q8IZ73 CACNA1H-201ENST00000348261 8208 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
RPUSD2Q8IZ73 RAP2A-201ENST00000245304 5487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
RPUSD2Q8IZ73 TNFRSF6B-201ENST00000369996 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
RPUSD2Q8IZ73 H1FX-AS1-204ENST00000511998 917 ntTSL 5 BASIC25.49■■□□□ 1.67
RPUSD2Q8IZ73 CCDC189-211ENST00000545825 1046 ntTSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
RPUSD2Q8IZ73 PPP1R26-201ENST00000356818 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
RPUSD2Q8IZ73 CEND1-201ENST00000330106 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
RPUSD2Q8IZ73 GNB2-203ENST00000393926 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.48■■□□□ 1.67
RPUSD2Q8IZ73 SYT6-210ENST00000641643 1587 ntBASIC25.48■■□□□ 1.67
RPUSD2Q8IZ73 UBL7-202ENST00000395081 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
RPUSD2Q8IZ73 C6orf89-201ENST00000355190 1309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
RPUSD2Q8IZ73 NRG1-210ENST00000520407 1955 ntTSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
RPUSD2Q8IZ73 NFKBIE-201ENST00000275015 2581 ntTSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
RPUSD2Q8IZ73 BAD-203ENST00000394532 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
RPUSD2Q8IZ73 AC093249.6-202ENST00000568500 1142 ntTSL 2 BASIC25.48■■□□□ 1.67
RPUSD2Q8IZ73 TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
RPUSD2Q8IZ73 AC138932.3-201ENST00000567634 1902 ntBASIC25.47■■□□□ 1.67
RPUSD2Q8IZ73 PIP5K1C-203ENST00000539785 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.47■■□□□ 1.67
RPUSD2Q8IZ73 GATA3-AS1-201ENST00000355358 2214 ntTSL 2 BASIC25.47■■□□□ 1.67
RPUSD2Q8IZ73 CCR10-201ENST00000332438 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
RPUSD2Q8IZ73 AC005703.6-201ENST00000623265 1329 ntBASIC25.47■■□□□ 1.67
RPUSD2Q8IZ73 SLC35A3-216ENST00000639221 1032 ntTSL 5 BASIC25.47■■□□□ 1.67
RPUSD2Q8IZ73 KHSRP-201ENST00000398148 2993 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
RPUSD2Q8IZ73 DYRK2-203ENST00000393555 2209 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.9 ms