Protein–RNA interactions for Protein: Q8IY84

NIM1K, Serine/threonine-protein kinase NIM1, humanhuman

Predictions only

Length 436 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NIM1KQ8IY84 KAT8-206ENST00000543774 1846 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.94■■■□□ 2.06
NIM1KQ8IY84 SLC25A6-201ENST00000381401 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
NIM1KQ8IY84 NME4-201ENST00000219479 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
NIM1KQ8IY84 BHLHA9-201ENST00000391429 902 ntAPPRIS P1 BASIC27.93■■■□□ 2.06
NIM1KQ8IY84 AC080013.1-202ENST00000465477 674 ntTSL 5 BASIC27.93■■■□□ 2.06
NIM1KQ8IY84 AC008443.4-201ENST00000503314 456 ntTSL 4 BASIC27.93■■■□□ 2.06
NIM1KQ8IY84 TMEM218-207ENST00000528724 1117 ntTSL 5 BASIC27.93■■■□□ 2.06
NIM1KQ8IY84 TMEM218-214ENST00000532156 954 ntTSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
NIM1KQ8IY84 AC010999.2-201ENST00000621974 596 ntTSL 2 BASIC27.93■■■□□ 2.06
NIM1KQ8IY84 AC009086.3-201ENST00000623486 1008 ntBASIC27.93■■■□□ 2.06
NIM1KQ8IY84 MEX3D-201ENST00000402693 2850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
NIM1KQ8IY84 PXK-201ENST00000302779 1974 ntTSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
NIM1KQ8IY84 SPOCK2-203ENST00000412663 1284 ntTSL 5 BASIC27.92■■■□□ 2.06
NIM1KQ8IY84 RPLP2-207ENST00000530797 637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
NIM1KQ8IY84 PTH1R-206ENST00000430002 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
NIM1KQ8IY84 SRP68-202ENST00000539137 2386 ntTSL 2 BASIC27.92■■■□□ 2.06
NIM1KQ8IY84 NANOS2-201ENST00000341294 1657 ntAPPRIS P1 BASIC27.91■■■□□ 2.06
NIM1KQ8IY84 SPI1-201ENST00000227163 1168 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC27.91■■■□□ 2.06
NIM1KQ8IY84 NEBL-AS1-202ENST00000439097 661 ntTSL 2 BASIC27.91■■■□□ 2.06
NIM1KQ8IY84 MED14OS-201ENST00000456333 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
NIM1KQ8IY84 ZFPL1-203ENST00000525509 478 ntTSL 2 BASIC27.91■■■□□ 2.06
NIM1KQ8IY84 UBFD1-208ENST00000567264 642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.91■■■□□ 2.06
NIM1KQ8IY84 MIR3181-201ENST00000578512 73 ntBASIC27.91■■■□□ 2.06
NIM1KQ8IY84 AC007448.3-201ENST00000585193 689 ntTSL 2 BASIC27.91■■■□□ 2.06
NIM1KQ8IY84 EVX1-201ENST00000222761 1500 ntTSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
NIM1KQ8IY84 NABP2-202ENST00000341463 1411 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.91■■■□□ 2.06
NIM1KQ8IY84 ACP4-201ENST00000270593 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
NIM1KQ8IY84 EXOC3L4-201ENST00000380069 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
NIM1KQ8IY84 HACD1-201ENST00000326961 773 ntTSL 2 BASIC27.9■■■□□ 2.06
NIM1KQ8IY84 RTCA-202ENST00000370126 538 ntTSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
NIM1KQ8IY84 CCDC28B-201ENST00000373602 1089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
NIM1KQ8IY84 AL137784.2-201ENST00000607332 1000 ntBASIC27.9■■■□□ 2.06
NIM1KQ8IY84 RARA-AS1-201ENST00000581080 1790 ntTSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
NIM1KQ8IY84 BTBD6-201ENST00000327471 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.9■■■□□ 2.06
NIM1KQ8IY84 PHF10-202ENST00000366780 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.9■■■□□ 2.06
NIM1KQ8IY84 SCCPDH-201ENST00000366510 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
NIM1KQ8IY84 AKAP8L-208ENST00000595465 1933 ntTSL 2 BASIC27.89■■■□□ 2.06
NIM1KQ8IY84 AC108002.2-201ENST00000519782 340 ntTSL 4 BASIC27.89■■■□□ 2.06
NIM1KQ8IY84 LCNL1-201ENST00000408973 1839 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.89■■■□□ 2.06
NIM1KQ8IY84 PCP4L1-201ENST00000504449 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
NIM1KQ8IY84 MAD2L2-201ENST00000235310 1860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.89■■■□□ 2.05
NIM1KQ8IY84 TLX3-201ENST00000296921 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.05
NIM1KQ8IY84 AL022069.1-201ENST00000568025 1636 ntBASIC27.89■■■□□ 2.05
NIM1KQ8IY84 ADGRB2-204ENST00000398542 5176 ntTSL 5 BASIC27.88■■■□□ 2.05
NIM1KQ8IY84 RINL-202ENST00000591812 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.88■■■□□ 2.05
NIM1KQ8IY84 KRT18P5-201ENST00000436075 1291 ntBASIC27.88■■■□□ 2.05
NIM1KQ8IY84 BCAP29-209ENST00000465919 942 ntTSL 2 BASIC27.88■■■□□ 2.05
NIM1KQ8IY84 AC012313.1-204ENST00000444227 462 ntTSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
NIM1KQ8IY84 YBX1P1-201ENST00000445822 960 ntBASIC27.87■■■□□ 2.05
NIM1KQ8IY84 TMEM70-203ENST00000517439 617 ntTSL 2 BASIC27.87■■■□□ 2.05
NIM1KQ8IY84 SNAI3-AS1-201ENST00000563261 998 ntTSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
NIM1KQ8IY84 CNN3-202ENST00000394202 1974 ntTSL 2 BASIC27.87■■■□□ 2.05
NIM1KQ8IY84 RNF19B-201ENST00000235150 2334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
NIM1KQ8IY84 CBWD2-203ENST00000416503 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
NIM1KQ8IY84 TANGO2-204ENST00000401833 1920 ntTSL 5 BASIC27.86■■■□□ 2.05
NIM1KQ8IY84 SLC12A2-202ENST00000343225 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
NIM1KQ8IY84 BCL2L12-201ENST00000246784 990 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
NIM1KQ8IY84 HES3-201ENST00000377898 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.86■■■□□ 2.05
NIM1KQ8IY84 SLC25A45-206ENST00000526432 894 ntTSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
NIM1KQ8IY84 AC126544.1-201ENST00000580842 1059 ntBASIC27.86■■■□□ 2.05
NIM1KQ8IY84 AL133516.1-201ENST00000633012 540 ntTSL 5 BASIC27.86■■■□□ 2.05
NIM1KQ8IY84 AL031602.1-201ENST00000633169 911 ntBASIC27.86■■■□□ 2.05
NIM1KQ8IY84 SLC35A2-212ENST00000634665 486 ntTSL 4 BASIC27.86■■■□□ 2.05
NIM1KQ8IY84 CAMK1-201ENST00000256460 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
NIM1KQ8IY84 CCDC24-201ENST00000372318 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
NIM1KQ8IY84 TMEM104-205ENST00000582773 1740 ntTSL 2 BASIC27.86■■■□□ 2.05
NIM1KQ8IY84 ARHGEF7-205ENST00000375739 5375 ntTSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
NIM1KQ8IY84 MT2A-201ENST00000245185 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
NIM1KQ8IY84 SNX3-202ENST00000349379 890 ntTSL 2 BASIC27.85■■■□□ 2.05
NIM1KQ8IY84 CTNNAL1-202ENST00000374593 761 ntTSL 3 BASIC27.85■■■□□ 2.05
NIM1KQ8IY84 LZTS2-201ENST00000370220 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
NIM1KQ8IY84 SHISA5-201ENST00000296444 2369 ntTSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
NIM1KQ8IY84 AL583722.4-201ENST00000555524 716 ntTSL 3 BASIC27.84■■■□□ 2.05
NIM1KQ8IY84 JAG2-201ENST00000331782 5835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
NIM1KQ8IY84 ELOC-206ENST00000520242 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
NIM1KQ8IY84 CBWD3-213ENST00000618217 1611 ntTSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
NIM1KQ8IY84 MADCAM1-205ENST00000613880 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.83■■■□□ 2.05
NIM1KQ8IY84 ZDHHC16-204ENST00000370842 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.83■■■□□ 2.05
NIM1KQ8IY84 AIDA-202ENST00000355727 1072 ntTSL 5 BASIC27.83■■■□□ 2.05
NIM1KQ8IY84 PYY-201ENST00000360085 1053 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
NIM1KQ8IY84 AL161908.1-203ENST00000425370 506 ntTSL 2 BASIC27.83■■■□□ 2.05
NIM1KQ8IY84 AC010336.5-201ENST00000594308 317 ntTSL 3 BASIC27.83■■■□□ 2.05
NIM1KQ8IY84 LINC01116-201ENST00000295549 1407 ntTSL 2 BASIC27.83■■■□□ 2.05
NIM1KQ8IY84 DNAJC25-GNG10-201ENST00000374294 1448 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.83■■■□□ 2.05
NIM1KQ8IY84 RRAS2-201ENST00000256196 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
NIM1KQ8IY84 ATG16L2-205ENST00000534905 1614 ntTSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
NIM1KQ8IY84 MYBL1-201ENST00000517885 1714 ntTSL 5 BASIC27.82■■■□□ 2.04
NIM1KQ8IY84 C20orf144-201ENST00000375222 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
NIM1KQ8IY84 NME4-202ENST00000382940 766 ntTSL 3 BASIC27.82■■■□□ 2.04
NIM1KQ8IY84 SLC47A1P1-202ENST00000449666 945 ntBASIC27.82■■■□□ 2.04
NIM1KQ8IY84 SUZ12P1-202ENST00000578070 929 ntTSL 5 BASIC27.82■■■□□ 2.04
NIM1KQ8IY84 NME4-211ENST00000620944 1193 ntTSL 2 BASIC27.82■■■□□ 2.04
NIM1KQ8IY84 CYB561D2-205ENST00000425346 1319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
NIM1KQ8IY84 RCN2-202ENST00000394883 1366 ntTSL 5 BASIC27.82■■■□□ 2.04
NIM1KQ8IY84 UBAP1L-203ENST00000559089 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
NIM1KQ8IY84 PRR25-201ENST00000301698 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
NIM1KQ8IY84 GUK1-207ENST00000366726 873 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC27.81■■■□□ 2.04
NIM1KQ8IY84 EIF6-203ENST00000374450 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
NIM1KQ8IY84 NMRAL1-202ENST00000404295 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
NIM1KQ8IY84 AC010203.1-202ENST00000550096 695 ntTSL 3 BASIC27.81■■■□□ 2.04
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.2 ms