Protein–RNA interactions for Protein: Q8IW00

VSTM4, V-set and transmembrane domain-containing protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 320 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VSTM4Q8IW00 FRS3-202ENST00000373018 2174 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.07■■□□□ 1.6
VSTM4Q8IW00 TANGO2-207ENST00000420290 1859 ntTSL 2 BASIC25.06■■□□□ 1.6
VSTM4Q8IW00 MRPL10-202ENST00000351111 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
VSTM4Q8IW00 UBXN2A-202ENST00000404924 1557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.06■■□□□ 1.6
VSTM4Q8IW00 AL161729.1-201ENST00000604104 1402 ntBASIC25.06■■□□□ 1.6
VSTM4Q8IW00 FGF13-AS1-202ENST00000446383 584 ntTSL 3 BASIC25.06■■□□□ 1.6
VSTM4Q8IW00 RASGEF1B-211ENST00000514050 537 ntTSL 2 BASIC25.06■■□□□ 1.6
VSTM4Q8IW00 C6orf201-202ENST00000380175 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
VSTM4Q8IW00 PPT2-248ENST00000395523 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.06■■□□□ 1.6
VSTM4Q8IW00 BARHL1-201ENST00000263610 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
VSTM4Q8IW00 KCNIP2-206ENST00000356640 1989 ntTSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
VSTM4Q8IW00 RHOBTB3-206ENST00000506817 1432 ntTSL 2 BASIC25.05■■□□□ 1.6
VSTM4Q8IW00 AC004980.1-201ENST00000418663 2667 ntTSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
VSTM4Q8IW00 PCSK6-215ENST00000611967 3336 ntTSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
VSTM4Q8IW00 C1orf122-201ENST00000373042 973 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
VSTM4Q8IW00 AF117829.1-207ENST00000504145 1572 ntTSL 3 BASIC25.05■■□□□ 1.6
VSTM4Q8IW00 LINC00565-201ENST00000562710 2331 ntBASIC25.04■■□□□ 1.6
VSTM4Q8IW00 TMEM120A-214ENST00000493111 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
VSTM4Q8IW00 CNPY3-201ENST00000372836 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
VSTM4Q8IW00 LRRC24-202ENST00000533758 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.04■■□□□ 1.6
VSTM4Q8IW00 MROH6-202ENST00000524906 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.04■■□□□ 1.6
VSTM4Q8IW00 PTPA-210ENST00000414510 1153 ntTSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
VSTM4Q8IW00 KCNQ5-213ENST00000629977 2830 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
VSTM4Q8IW00 RBFOX1-206ENST00000535565 1599 ntTSL 2 BASIC25.04■■□□□ 1.6
VSTM4Q8IW00 ELL3-201ENST00000319359 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
VSTM4Q8IW00 HAS1-202ENST00000540069 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
VSTM4Q8IW00 YPEL1-202ENST00000403503 466 ntTSL 3 BASIC25.03■■□□□ 1.6
VSTM4Q8IW00 DIXDC1-205ENST00000529225 1945 ntTSL 5 BASIC25.03■■□□□ 1.6
VSTM4Q8IW00 IDI1-201ENST00000381344 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
VSTM4Q8IW00 IFNGR2-202ENST00000381995 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.03■■□□□ 1.6
VSTM4Q8IW00 OSCAR-201ENST00000284648 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
VSTM4Q8IW00 DENND1B-204ENST00000367396 2177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
VSTM4Q8IW00 TERT-206ENST00000508104 2486 ntTSL 5 BASIC25.02■■□□□ 1.6
VSTM4Q8IW00 NXNL1-201ENST00000301944 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
VSTM4Q8IW00 CASTOR2-201ENST00000616305 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
VSTM4Q8IW00 PPP2R3B-202ENST00000390665 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
VSTM4Q8IW00 PNLIPRP2-205ENST00000611850 1407 ntTSL 5 BASIC25.02■■□□□ 1.6
VSTM4Q8IW00 RNF4-207ENST00000506706 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
VSTM4Q8IW00 CPSF4-204ENST00000436336 1738 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
VSTM4Q8IW00 PSMG4-206ENST00000438998 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.01■■□□□ 1.59
VSTM4Q8IW00 HES4-204ENST00000484667 667 ntTSL 3 BASIC25.01■■□□□ 1.59
VSTM4Q8IW00 MIR7108-201ENST00000614319 87 ntBASIC25.01■■□□□ 1.59
VSTM4Q8IW00 OPRD1-202ENST00000621425 1217 ntTSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
VSTM4Q8IW00 H19-210ENST00000439725 1929 ntTSL 2 BASIC25.01■■□□□ 1.59
VSTM4Q8IW00 KLHL36-201ENST00000258157 1974 ntTSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
VSTM4Q8IW00 CREG1-201ENST00000370509 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
VSTM4Q8IW00 U2AF2-202ENST00000450554 3022 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
VSTM4Q8IW00 AC009831.1-201ENST00000580420 1582 ntBASIC25.01■■□□□ 1.59
VSTM4Q8IW00 EYA2-203ENST00000357410 2465 ntTSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
VSTM4Q8IW00 RGS6-209ENST00000553525 2005 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC25■■□□□ 1.59
VSTM4Q8IW00 NEIL1-206ENST00000564784 2019 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25■■□□□ 1.59
VSTM4Q8IW00 CCDC24-201ENST00000372318 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
VSTM4Q8IW00 PSIP1-202ENST00000380716 1889 ntTSL 5 BASIC25■■□□□ 1.59
VSTM4Q8IW00 HOMER3-201ENST00000221222 1384 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.99■■□□□ 1.59
VSTM4Q8IW00 RCN2-201ENST00000320963 1750 ntTSL 5 BASIC24.99■■□□□ 1.59
VSTM4Q8IW00 POLR2J2-202ENST00000358438 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
VSTM4Q8IW00 FAM136A-201ENST00000037869 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
VSTM4Q8IW00 TMEM98-202ENST00000394642 1683 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.99■■□□□ 1.59
VSTM4Q8IW00 SEPT2-205ENST00000401990 1734 ntTSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
VSTM4Q8IW00 IKZF1-207ENST00000413698 1808 ntTSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
VSTM4Q8IW00 RPS2P7-201ENST00000447334 885 ntBASIC24.99■■□□□ 1.59
VSTM4Q8IW00 H2AFY-217ENST00000511689 2789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
VSTM4Q8IW00 POLR2J3-220ENST00000613744 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
VSTM4Q8IW00 FAM83D-202ENST00000619850 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
VSTM4Q8IW00 C14orf80-204ENST00000392522 1630 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC24.98■■□□□ 1.59
VSTM4Q8IW00 GRM6-202ENST00000517717 2673 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.98■■□□□ 1.59
VSTM4Q8IW00 CD63-202ENST00000420846 981 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.98■■□□□ 1.59
VSTM4Q8IW00 UBE2D2-205ENST00000505548 1113 ntTSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
VSTM4Q8IW00 ACOT12-204ENST00000513751 612 ntTSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
VSTM4Q8IW00 GUSBP5-202ENST00000510805 1989 ntBASIC24.98■■□□□ 1.59
VSTM4Q8IW00 FPGS-204ENST00000393706 2230 ntTSL 2 BASIC24.97■■□□□ 1.59
VSTM4Q8IW00 CLDND1-202ENST00000394180 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
VSTM4Q8IW00 OSCAR-202ENST00000351806 1375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
VSTM4Q8IW00 NKX6-2-201ENST00000368592 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
VSTM4Q8IW00 ENDOG-201ENST00000372642 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
VSTM4Q8IW00 MAPK3-203ENST00000395199 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
VSTM4Q8IW00 MAPK3-205ENST00000395202 1008 ntTSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
VSTM4Q8IW00 HES4-202ENST00000428771 1040 ntTSL 2 BASIC24.97■■□□□ 1.59
VSTM4Q8IW00 FAM136A-202ENST00000430566 885 ntTSL 3 BASIC24.97■■□□□ 1.59
VSTM4Q8IW00 IQCJ-SCHIP1-202ENST00000460298 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
VSTM4Q8IW00 LINC00526-201ENST00000581067 1875 ntBASIC24.97■■□□□ 1.59
VSTM4Q8IW00 HTRA2-201ENST00000258080 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
VSTM4Q8IW00 RALB-201ENST00000272519 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
VSTM4Q8IW00 ROGDI-201ENST00000322048 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
VSTM4Q8IW00 SKIDA1-201ENST00000444772 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.97■■□□□ 1.59
VSTM4Q8IW00 C6orf136-201ENST00000293604 1978 ntTSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
VSTM4Q8IW00 GPR161-203ENST00000367836 1983 ntTSL 2 BASIC24.96■■□□□ 1.59
VSTM4Q8IW00 HES6-201ENST00000272937 1454 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
VSTM4Q8IW00 PPP4C-201ENST00000279387 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
VSTM4Q8IW00 CIDEB-201ENST00000258807 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
VSTM4Q8IW00 NKX2-5-204ENST00000521848 1027 ntTSL 2 BASIC24.96■■□□□ 1.59
VSTM4Q8IW00 ZYX-201ENST00000322764 2493 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
VSTM4Q8IW00 SRI-201ENST00000265729 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
VSTM4Q8IW00 TMEM235-205ENST00000586400 2272 ntTSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
VSTM4Q8IW00 WBP1-201ENST00000233615 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
VSTM4Q8IW00 AGO3-204ENST00000397828 1035 ntTSL 2 BASIC24.95■■□□□ 1.58
VSTM4Q8IW00 TSPY4-202ENST00000426950 1179 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC24.95■■□□□ 1.58
VSTM4Q8IW00 LRRC14B-201ENST00000328278 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
VSTM4Q8IW00 SNRNP70-206ENST00000598441 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
VSTM4Q8IW00 NFIX-203ENST00000397661 3143 ntTSL 5 BASIC24.95■■□□□ 1.58
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 73.6 ms