Protein–RNA interactions for Protein: Q8IVM8

SLC22A9, Solute carrier family 22 member 9, humanhuman

Predictions only

Length 553 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC22A9Q8IVM8 PCK2-201ENST00000216780 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
SLC22A9Q8IVM8 ZDHHC14-204ENST00000414563 3134 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
SLC22A9Q8IVM8 GNB1-210ENST00000615252 3048 ntTSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
SLC22A9Q8IVM8 DPF1-206ENST00000420980 2227 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
SLC22A9Q8IVM8 DMRT2-209ENST00000635183 2190 ntTSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
SLC22A9Q8IVM8 HAS1-201ENST00000222115 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
SLC22A9Q8IVM8 DNAAF3-203ENST00000524407 2059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
SLC22A9Q8IVM8 CARNMT1-201ENST00000376830 1012 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
SLC22A9Q8IVM8 HYI-210ENST00000486909 905 ntTSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
SLC22A9Q8IVM8 U85056.1-201ENST00000616429 682 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
SLC22A9Q8IVM8 AC129492.7-201ENST00000622992 756 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
SLC22A9Q8IVM8 CDX1-201ENST00000231656 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
SLC22A9Q8IVM8 PTGES2-202ENST00000338961 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
SLC22A9Q8IVM8 ELOA-201ENST00000418390 5154 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
SLC22A9Q8IVM8 AC092068.2-201ENST00000590491 1708 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
SLC22A9Q8IVM8 CAMK1-201ENST00000256460 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
SLC22A9Q8IVM8 CADPS-219ENST00000612439 5455 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
SLC22A9Q8IVM8 LINGO3-201ENST00000585527 2241 ntAPPRIS P1 BASIC22.41■■□□□ 1.18
SLC22A9Q8IVM8 KLC3-201ENST00000391946 1780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
SLC22A9Q8IVM8 RAB11FIP3-201ENST00000262305 4831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
SLC22A9Q8IVM8 FP236240.1-201ENST00000619537 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
SLC22A9Q8IVM8 TCEA1-213ENST00000640041 1171 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
SLC22A9Q8IVM8 SLAIN1-213ENST00000466548 2637 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
SLC22A9Q8IVM8 LRRC34-206ENST00000522526 1899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
SLC22A9Q8IVM8 DACT1-201ENST00000335867 2571 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
SLC22A9Q8IVM8 LHX2-201ENST00000373615 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
SLC22A9Q8IVM8 C9orf163-202ENST00000624034 2573 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
SLC22A9Q8IVM8 NKX2-1-201ENST00000354822 2191 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
SLC22A9Q8IVM8 SLC10A4-201ENST00000273861 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
SLC22A9Q8IVM8 TNFRSF10B-202ENST00000347739 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
SLC22A9Q8IVM8 POU2F3-206ENST00000543440 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
SLC22A9Q8IVM8 AC104002.3-202ENST00000557170 1100 ntTSL 3 BASIC22.4■■□□□ 1.18
SLC22A9Q8IVM8 FXYD7-204ENST00000588265 636 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
SLC22A9Q8IVM8 C11orf96-203ENST00000617612 1294 ntAPPRIS P1 BASIC22.4■■□□□ 1.18
SLC22A9Q8IVM8 SLC12A2-201ENST00000262461 6885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
SLC22A9Q8IVM8 EIF5A-211ENST00000576930 1439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
SLC22A9Q8IVM8 RAX-201ENST00000256852 2935 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
SLC22A9Q8IVM8 PPP1R1B-201ENST00000254079 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
SLC22A9Q8IVM8 NRL-202ENST00000396997 1517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
SLC22A9Q8IVM8 POU2F2-215ENST00000560398 1788 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
SLC22A9Q8IVM8 BFSP1-202ENST00000377873 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
SLC22A9Q8IVM8 NAPRT-204ENST00000449291 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
SLC22A9Q8IVM8 RBM33-201ENST00000287912 1404 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
SLC22A9Q8IVM8 TMEM185B-201ENST00000426077 2131 ntAPPRIS P1 BASIC22.39■■□□□ 1.17
SLC22A9Q8IVM8 IQCD-203ENST00000546692 1872 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
SLC22A9Q8IVM8 USF2-201ENST00000222305 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
SLC22A9Q8IVM8 HOMER3-205ENST00000542541 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
SLC22A9Q8IVM8 SOX10-201ENST00000360880 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
SLC22A9Q8IVM8 SOX10-202ENST00000396884 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
SLC22A9Q8IVM8 AL354928.1-201ENST00000438380 617 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
SLC22A9Q8IVM8 PSMG4-207ENST00000451246 824 ntTSL 3 BASIC22.38■■□□□ 1.17
SLC22A9Q8IVM8 LIME1-206ENST00000487026 805 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
SLC22A9Q8IVM8 DONSON-201ENST00000303071 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
SLC22A9Q8IVM8 SPON2-222ENST00000617421 2156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
SLC22A9Q8IVM8 FLOT1-201ENST00000376389 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
SLC22A9Q8IVM8 IFNGR2-202ENST00000381995 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
SLC22A9Q8IVM8 ECE2-202ENST00000357474 2667 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
SLC22A9Q8IVM8 ABHD17B-202ENST00000377041 1312 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
SLC22A9Q8IVM8 KLC1-227ENST00000634686 2229 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
SLC22A9Q8IVM8 STK32C-205ENST00000456004 607 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
SLC22A9Q8IVM8 AC022616.5-201ENST00000518796 181 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
SLC22A9Q8IVM8 ADD1-202ENST00000355842 4743 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
SLC22A9Q8IVM8 FZD8-201ENST00000374694 4030 ntAPPRIS P1 BASIC22.37■■□□□ 1.17
SLC22A9Q8IVM8 ACOT1-201ENST00000311148 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
SLC22A9Q8IVM8 ARRDC1-AS1-203ENST00000623970 2210 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
SLC22A9Q8IVM8 CCZ1B-201ENST00000316731 2885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
SLC22A9Q8IVM8 AC012123.1-201ENST00000426194 1661 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
SLC22A9Q8IVM8 RBM4B-203ENST00000525754 2339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
SLC22A9Q8IVM8 SPHK1-210ENST00000592299 1821 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
SLC22A9Q8IVM8 AC098864.1-205ENST00000315302 2260 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
SLC22A9Q8IVM8 DUSP8P3-201ENST00000399571 1760 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
SLC22A9Q8IVM8 USP36-218ENST00000590546 1771 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
SLC22A9Q8IVM8 C3orf80-201ENST00000326474 2718 ntAPPRIS P1 BASIC22.36■■□□□ 1.17
SLC22A9Q8IVM8 PFDN2-201ENST00000368010 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
SLC22A9Q8IVM8 IFI30-201ENST00000407280 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
SLC22A9Q8IVM8 SMKR1-201ENST00000462322 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
SLC22A9Q8IVM8 HSD17B1P1-201ENST00000590052 955 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
SLC22A9Q8IVM8 AC019171.1-201ENST00000601251 1056 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
SLC22A9Q8IVM8 EXOSC6-201ENST00000435634 5153 ntAPPRIS P1 BASIC22.36■■□□□ 1.17
SLC22A9Q8IVM8 CDC16-206ENST00000375310 2156 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
SLC22A9Q8IVM8 USF3-203ENST00000491165 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
SLC22A9Q8IVM8 POLDIP2-201ENST00000540200 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
SLC22A9Q8IVM8 ASF1B-201ENST00000263382 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
SLC22A9Q8IVM8 AC079834.2-201ENST00000609776 1949 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
SLC22A9Q8IVM8 HES6-201ENST00000272937 1454 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
SLC22A9Q8IVM8 KCTD8-201ENST00000360029 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
SLC22A9Q8IVM8 ST8SIA6-201ENST00000377602 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
SLC22A9Q8IVM8 KRT18P60-201ENST00000312876 1297 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
SLC22A9Q8IVM8 C17orf49-201ENST00000439424 850 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
SLC22A9Q8IVM8 CARMIL1-202ENST00000461945 1290 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
SLC22A9Q8IVM8 C5orf49-201ENST00000399810 2385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
SLC22A9Q8IVM8 ZNF213-208ENST00000576416 2240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
SLC22A9Q8IVM8 CNPY3-201ENST00000372836 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
SLC22A9Q8IVM8 PFKFB3-201ENST00000317350 1999 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
SLC22A9Q8IVM8 PKM-201ENST00000319622 2717 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
SLC22A9Q8IVM8 MRPL4-207ENST00000590669 1423 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
SLC22A9Q8IVM8 SLC2A8-203ENST00000373371 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
SLC22A9Q8IVM8 FAM162B-201ENST00000368557 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
SLC22A9Q8IVM8 AL590677.1-201ENST00000438431 380 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
SLC22A9Q8IVM8 AC139795.1-203ENST00000515045 853 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.5 ms