Protein–RNA interactions for Protein: Q8IVJ1

SLC41A1, Solute carrier family 41 member 1, humanhuman

Predictions only

Length 513 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC41A1Q8IVJ1 TANGO2-204ENST00000401833 1920 ntTSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
SLC41A1Q8IVJ1 NKX2-3-201ENST00000344586 2097 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
SLC41A1Q8IVJ1 FEZ2-203ENST00000379245 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
SLC41A1Q8IVJ1 NKX2-8-201ENST00000258829 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
SLC41A1Q8IVJ1 CD72-202ENST00000378430 585 ntTSL 3 BASIC23.47■■□□□ 1.35
SLC41A1Q8IVJ1 EPHA10-211ENST00000540011 720 ntTSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
SLC41A1Q8IVJ1 RASSF1-AS1-201ENST00000629828 790 ntBASIC23.47■■□□□ 1.35
SLC41A1Q8IVJ1 EEF1D-203ENST00000419152 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
SLC41A1Q8IVJ1 SLC22A18-201ENST00000312221 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
SLC41A1Q8IVJ1 ARHGEF9-210ENST00000623517 2143 ntTSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
SLC41A1Q8IVJ1 PLEKHA8-202ENST00000396257 1907 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
SLC41A1Q8IVJ1 KDELR3-202ENST00000409006 931 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
SLC41A1Q8IVJ1 PTH1R-206ENST00000430002 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
SLC41A1Q8IVJ1 DGCR6-208ENST00000608842 1837 ntTSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
SLC41A1Q8IVJ1 GIT1-210ENST00000579937 2798 ntTSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
SLC41A1Q8IVJ1 TRIM7-202ENST00000334421 1228 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
SLC41A1Q8IVJ1 BSPRY-201ENST00000374183 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
SLC41A1Q8IVJ1 MSX2-201ENST00000239243 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
SLC41A1Q8IVJ1 ABHD8-201ENST00000247706 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
SLC41A1Q8IVJ1 UXS1-201ENST00000283148 2099 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
SLC41A1Q8IVJ1 PTPN2-202ENST00000327283 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
SLC41A1Q8IVJ1 CBARP-202ENST00000382477 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
SLC41A1Q8IVJ1 NOCT-201ENST00000280614 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
SLC41A1Q8IVJ1 SPAG16-201ENST00000272898 1059 ntTSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
SLC41A1Q8IVJ1 SRRM2-231ENST00000630499 1207 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
SLC41A1Q8IVJ1 AC119427.1-201ENST00000633182 556 ntTSL 4 BASIC23.44■■□□□ 1.34
SLC41A1Q8IVJ1 TMEM202-AS1-202ENST00000565181 2325 ntBASIC23.44■■□□□ 1.34
SLC41A1Q8IVJ1 P4HA3-201ENST00000331597 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
SLC41A1Q8IVJ1 DNAJB11-201ENST00000265028 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
SLC41A1Q8IVJ1 FHL2-203ENST00000358129 1578 ntTSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
SLC41A1Q8IVJ1 AP2M1-202ENST00000382456 2091 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
SLC41A1Q8IVJ1 FOXO3B-201ENST00000395675 1928 ntBASIC23.43■■□□□ 1.34
SLC41A1Q8IVJ1 FZD9-201ENST00000344575 2338 ntAPPRIS P1 BASIC23.43■■□□□ 1.34
SLC41A1Q8IVJ1 ZNF641-205ENST00000547026 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
SLC41A1Q8IVJ1 TMED2-201ENST00000262225 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
SLC41A1Q8IVJ1 ZNF584-205ENST00000596281 575 ntTSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
SLC41A1Q8IVJ1 RCC2-201ENST00000375433 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
SLC41A1Q8IVJ1 MAP3K5-201ENST00000359015 5197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
SLC41A1Q8IVJ1 SLC22A31-206ENST00000614943 1860 ntTSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
SLC41A1Q8IVJ1 AFDN-201ENST00000344191 5249 ntTSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
SLC41A1Q8IVJ1 MEIS3-201ENST00000331559 2104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
SLC41A1Q8IVJ1 RAB40B-201ENST00000269347 2189 ntTSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
SLC41A1Q8IVJ1 AGTR1-203ENST00000404754 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
SLC41A1Q8IVJ1 GP1BB-201ENST00000366425 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
SLC41A1Q8IVJ1 DCTPP1-201ENST00000319285 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
SLC41A1Q8IVJ1 TMEM80-207ENST00000608174 800 ntTSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
SLC41A1Q8IVJ1 RABGGTA-202ENST00000399409 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
SLC41A1Q8IVJ1 ATAD3B-201ENST00000308647 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
SLC41A1Q8IVJ1 MIR17HG-201ENST00000400282 931 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
SLC41A1Q8IVJ1 RAX2-202ENST00000555978 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
SLC41A1Q8IVJ1 AC133561.4-201ENST00000566112 224 ntBASIC23.4■■□□□ 1.34
SLC41A1Q8IVJ1 ZNRF1-205ENST00000566250 1069 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
SLC41A1Q8IVJ1 ZNRF1-206ENST00000567962 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
SLC41A1Q8IVJ1 RNPEP-202ENST00000367286 2282 ntTSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
SLC41A1Q8IVJ1 ARL4D-201ENST00000320033 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
SLC41A1Q8IVJ1 ALDH16A1-203ENST00000540132 2174 ntTSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
SLC41A1Q8IVJ1 KLC3-201ENST00000391946 1780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
SLC41A1Q8IVJ1 RRAD-201ENST00000299759 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
SLC41A1Q8IVJ1 PHF11-202ENST00000378319 1359 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
SLC41A1Q8IVJ1 NR2F6-201ENST00000291442 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
SLC41A1Q8IVJ1 ST3GAL5-214ENST00000638178 2034 ntTSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.34
SLC41A1Q8IVJ1 TMEM256-PLSCR3-204ENST00000573331 2557 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.34
SLC41A1Q8IVJ1 CBR3-201ENST00000290354 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
SLC41A1Q8IVJ1 YTHDF1-201ENST00000370334 747 ntTSL 3 BASIC23.39■■□□□ 1.33
SLC41A1Q8IVJ1 TFPT-201ENST00000391757 774 ntTSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
SLC41A1Q8IVJ1 TFPT-202ENST00000391758 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
SLC41A1Q8IVJ1 AC092343.1-201ENST00000500224 729 ntTSL 3 BASIC23.39■■□□□ 1.33
SLC41A1Q8IVJ1 PPP1R14A-204ENST00000591291 433 ntTSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
SLC41A1Q8IVJ1 TMEM260-202ENST00000538838 1638 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
SLC41A1Q8IVJ1 FGF22-201ENST00000215530 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
SLC41A1Q8IVJ1 ARSB-206ENST00000565165 1772 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
SLC41A1Q8IVJ1 ANO8-204ENST00000630631 1905 ntTSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
SLC41A1Q8IVJ1 TARBP1-201ENST00000040877 5130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
SLC41A1Q8IVJ1 SSR2-210ENST00000480567 895 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
SLC41A1Q8IVJ1 KCNQ3-202ENST00000519445 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
SLC41A1Q8IVJ1 P3H3-201ENST00000290510 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
SLC41A1Q8IVJ1 CA9-204ENST00000617161 1374 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
SLC41A1Q8IVJ1 GBX2-201ENST00000306318 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
SLC41A1Q8IVJ1 LSR-205ENST00000427250 1606 ntTSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
SLC41A1Q8IVJ1 SUMF1-202ENST00000383843 1447 ntTSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
SLC41A1Q8IVJ1 LIN7B-202ENST00000391864 582 ntTSL 3 BASIC23.37■■□□□ 1.33
SLC41A1Q8IVJ1 CLTA-206ENST00000466396 695 ntTSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
SLC41A1Q8IVJ1 MIR6089-201ENST00000616698 64 ntBASIC23.37■■□□□ 1.33
SLC41A1Q8IVJ1 ID2-201ENST00000234091 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
SLC41A1Q8IVJ1 PPP1CC-206ENST00000550991 1882 ntTSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
SLC41A1Q8IVJ1 MCUB-201ENST00000394650 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
SLC41A1Q8IVJ1 NPAS3-206ENST00000548645 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
SLC41A1Q8IVJ1 LTB4R2-205ENST00000543919 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
SLC41A1Q8IVJ1 PTOV1-220ENST00000601675 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
SLC41A1Q8IVJ1 LINC00543-201ENST00000567234 1845 ntBASIC23.36■■□□□ 1.33
SLC41A1Q8IVJ1 AP000802.1-201ENST00000500537 1934 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
SLC41A1Q8IVJ1 SNX5-217ENST00000606557 1087 ntBASIC23.36■■□□□ 1.33
SLC41A1Q8IVJ1 MMD-201ENST00000262065 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
SLC41A1Q8IVJ1 YWHAH-201ENST00000248975 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
SLC41A1Q8IVJ1 QKI-207ENST00000453779 5685 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
SLC41A1Q8IVJ1 ST3GAL5-269ENST00000640992 2292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
SLC41A1Q8IVJ1 TMEM121-202ENST00000431372 1519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
SLC41A1Q8IVJ1 TXNRD2-201ENST00000334363 1893 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
SLC41A1Q8IVJ1 INPP5J-206ENST00000404453 1613 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
SLC41A1Q8IVJ1 DNPH1-201ENST00000230431 657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 52.1 ms