Protein–RNA interactions for Protein: Q8IU80

TMPRSS6, Transmembrane protease serine 6, humanhuman

Predictions only

Length 811 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMPRSS6Q8IU80 EIF4EBP1-201ENST00000338825 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
TMPRSS6Q8IU80 KRTAP5-1-201ENST00000382171 942 ntAPPRIS P1 BASIC23.56■■□□□ 1.36
TMPRSS6Q8IU80 MIR638-201ENST00000385237 100 ntBASIC23.56■■□□□ 1.36
TMPRSS6Q8IU80 SERTAD4-AS1-202ENST00000475406 591 ntTSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
TMPRSS6Q8IU80 AC093762.1-201ENST00000641981 837 ntAPPRIS P1 BASIC23.56■■□□□ 1.36
TMPRSS6Q8IU80 KCTD5-201ENST00000301738 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
TMPRSS6Q8IU80 TMIE-201ENST00000326431 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
TMPRSS6Q8IU80 ZNF767P-202ENST00000472212 2100 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
TMPRSS6Q8IU80 HSPBP1-201ENST00000255631 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
TMPRSS6Q8IU80 DPF1-206ENST00000420980 2227 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
TMPRSS6Q8IU80 GFOD1-204ENST00000603223 2388 ntTSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
TMPRSS6Q8IU80 SPAG16-201ENST00000272898 1059 ntTSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
TMPRSS6Q8IU80 PCGF3-202ENST00000400151 1175 ntTSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
TMPRSS6Q8IU80 DUSP22-214ENST00000605315 867 ntTSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
TMPRSS6Q8IU80 RALB-208ENST00000631312 311 ntTSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
TMPRSS6Q8IU80 HADH-203ENST00000505878 1719 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
TMPRSS6Q8IU80 SCTR-201ENST00000019103 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
TMPRSS6Q8IU80 ANO1-202ENST00000355303 4790 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
TMPRSS6Q8IU80 FGF22-201ENST00000215530 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
TMPRSS6Q8IU80 EEF1D-203ENST00000419152 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
TMPRSS6Q8IU80 WRNIP1-205ENST00000618555 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
TMPRSS6Q8IU80 HMCES-204ENST00000502878 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
TMPRSS6Q8IU80 NPHS2-202ENST00000367616 1670 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
TMPRSS6Q8IU80 ADIPOR1-201ENST00000340990 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
TMPRSS6Q8IU80 NAB1-202ENST00000409581 2360 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
TMPRSS6Q8IU80 NOX4-204ENST00000393282 560 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
TMPRSS6Q8IU80 MIR4466-201ENST00000606121 54 ntBASIC23.54■■□□□ 1.36
TMPRSS6Q8IU80 SNX5-217ENST00000606557 1087 ntBASIC23.54■■□□□ 1.36
TMPRSS6Q8IU80 ZNF837-201ENST00000427624 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
TMPRSS6Q8IU80 SOX10-201ENST00000360880 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
TMPRSS6Q8IU80 SOX10-202ENST00000396884 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
TMPRSS6Q8IU80 BIN1-207ENST00000357970 2497 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
TMPRSS6Q8IU80 ROR1-202ENST00000371080 2305 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
TMPRSS6Q8IU80 SDS-201ENST00000257549 1606 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
TMPRSS6Q8IU80 SUSD3-202ENST00000375472 1195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
TMPRSS6Q8IU80 TFPT-201ENST00000391757 774 ntTSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
TMPRSS6Q8IU80 TFPT-202ENST00000391758 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
TMPRSS6Q8IU80 CALM1-203ENST00000544280 1064 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
TMPRSS6Q8IU80 TNIP2-206ENST00000510267 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
TMPRSS6Q8IU80 ZNF365-206ENST00000395255 1674 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
TMPRSS6Q8IU80 CCDC151-202ENST00000586836 1867 ntTSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
TMPRSS6Q8IU80 SCARA5-204ENST00000524352 1945 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
TMPRSS6Q8IU80 CCDC106-202ENST00000586790 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
TMPRSS6Q8IU80 DACT1-201ENST00000335867 2571 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
TMPRSS6Q8IU80 UBALD1-201ENST00000283474 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
TMPRSS6Q8IU80 FEZ2-203ENST00000379245 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
TMPRSS6Q8IU80 SLIT1-203ENST00000371041 1695 ntTSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
TMPRSS6Q8IU80 TMEM80-201ENST00000397510 1094 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
TMPRSS6Q8IU80 ERRFI1-204ENST00000474874 479 ntTSL 3 BASIC23.52■■□□□ 1.36
TMPRSS6Q8IU80 SENCR-201ENST00000526269 1298 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
TMPRSS6Q8IU80 ANKS3-204ENST00000585773 1946 ntTSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
TMPRSS6Q8IU80 IRF2BP1-201ENST00000302165 2564 ntAPPRIS P1 BASIC23.52■■□□□ 1.36
TMPRSS6Q8IU80 NUDT18-202ENST00000613958 1754 ntTSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
TMPRSS6Q8IU80 EPS8L1-205ENST00000586329 2130 ntTSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
TMPRSS6Q8IU80 ARRB2-210ENST00000572457 1660 ntTSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
TMPRSS6Q8IU80 LSM8-203ENST00000422760 1920 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
TMPRSS6Q8IU80 MROH6-202ENST00000524906 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.51■■□□□ 1.35
TMPRSS6Q8IU80 LBH-205ENST00000407930 756 ntTSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
TMPRSS6Q8IU80 MPP5-205ENST00000556345 1163 ntTSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
TMPRSS6Q8IU80 MIR6722-201ENST00000617286 78 ntBASIC23.51■■□□□ 1.35
TMPRSS6Q8IU80 LSR-204ENST00000361790 2210 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
TMPRSS6Q8IU80 SURF2-201ENST00000371964 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
TMPRSS6Q8IU80 AL357078.1-201ENST00000448344 310 ntTSL 4 BASIC23.5■■□□□ 1.35
TMPRSS6Q8IU80 QDPR-206ENST00000508623 601 ntTSL 3 BASIC23.5■■□□□ 1.35
TMPRSS6Q8IU80 TMEM240-203ENST00000624426 796 ntTSL 3 BASIC23.5■■□□□ 1.35
TMPRSS6Q8IU80 CTBP1-203ENST00000382952 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
TMPRSS6Q8IU80 BRD3-202ENST00000371834 2529 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
TMPRSS6Q8IU80 MCUB-201ENST00000394650 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
TMPRSS6Q8IU80 SRXN1-201ENST00000381962 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
TMPRSS6Q8IU80 CCZ1B-201ENST00000316731 2885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
TMPRSS6Q8IU80 CLTA-206ENST00000466396 695 ntTSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
TMPRSS6Q8IU80 CDKN2A-208ENST00000498124 880 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
TMPRSS6Q8IU80 AL512631.2-201ENST00000604634 923 ntBASIC23.49■■□□□ 1.35
TMPRSS6Q8IU80 LY6H-205ENST00000615409 980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
TMPRSS6Q8IU80 KLC1-205ENST00000380038 2322 ntTSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
TMPRSS6Q8IU80 YWHAH-202ENST00000397492 1879 ntTSL 3 BASIC23.48■■□□□ 1.35
TMPRSS6Q8IU80 ERRFI1-203ENST00000469499 995 ntTSL 3 BASIC23.48■■□□□ 1.35
TMPRSS6Q8IU80 TOLLIP-208ENST00000527938 549 ntTSL 4 BASIC23.48■■□□□ 1.35
TMPRSS6Q8IU80 TMEM80-207ENST00000608174 800 ntTSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
TMPRSS6Q8IU80 RCC2-201ENST00000375433 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
TMPRSS6Q8IU80 GADD45A-202ENST00000370986 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
TMPRSS6Q8IU80 DVL3-201ENST00000313143 5254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
TMPRSS6Q8IU80 DTNB-211ENST00000407661 2420 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
TMPRSS6Q8IU80 RAB33A-201ENST00000257017 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
TMPRSS6Q8IU80 AC110285.6-201ENST00000617652 491 ntBASIC23.47■■□□□ 1.35
TMPRSS6Q8IU80 RASSF1-AS1-201ENST00000629828 790 ntBASIC23.47■■□□□ 1.35
TMPRSS6Q8IU80 SEPT2-205ENST00000401990 1734 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
TMPRSS6Q8IU80 CRLF1-201ENST00000392386 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
TMPRSS6Q8IU80 TMEM256-PLSCR3-204ENST00000573331 2557 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
TMPRSS6Q8IU80 HES4-201ENST00000304952 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
TMPRSS6Q8IU80 COMMD5-201ENST00000305103 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
TMPRSS6Q8IU80 RARA-204ENST00000394089 2024 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
TMPRSS6Q8IU80 AC096631.2-201ENST00000436136 790 ntBASIC23.46■■□□□ 1.35
TMPRSS6Q8IU80 AC092343.1-201ENST00000500224 729 ntTSL 3 BASIC23.46■■□□□ 1.35
TMPRSS6Q8IU80 LINC01578-209ENST00000557682 2683 ntTSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
TMPRSS6Q8IU80 POU2F2-215ENST00000560398 1788 ntTSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
TMPRSS6Q8IU80 ARMC6-201ENST00000269932 2412 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.35
TMPRSS6Q8IU80 ALG1L9P-201ENST00000508969 2165 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
TMPRSS6Q8IU80 C4orf19-202ENST00000381980 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
TMPRSS6Q8IU80 STEAP2-207ENST00000402625 1372 ntTSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14.5 ms