Protein–RNA interactions for Protein: Q86YI8

PHF13, PHD finger protein 13, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 300 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PHF13Q86YI8 MADCAM1-206ENST00000617201 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
PHF13Q86YI8 MADCAM1-207ENST00000619333 1485 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
PHF13Q86YI8 IKBKG-215ENST00000619941 1463 ntTSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
PHF13Q86YI8 MADCAM1-210ENST00000622462 1461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
PHF13Q86YI8 ERGIC1-202ENST00000393784 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
PHF13Q86YI8 EI24-204ENST00000527235 1625 ntTSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
PHF13Q86YI8 METTL24-201ENST00000338882 1119 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
PHF13Q86YI8 PTRH1-208ENST00000543175 814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
PHF13Q86YI8 TK2-216ENST00000564917 1156 ntTSL 3 BASIC24.18■■□□□ 1.46
PHF13Q86YI8 DCAF4-206ENST00000509153 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
PHF13Q86YI8 HES6-201ENST00000272937 1454 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
PHF13Q86YI8 ALDH1A3-203ENST00000557963 1670 ntBASIC24.18■■□□□ 1.46
PHF13Q86YI8 PPP1R1B-201ENST00000254079 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
PHF13Q86YI8 BRI3-201ENST00000297290 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
PHF13Q86YI8 SNAI3-AS1-203ENST00000565633 829 ntTSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
PHF13Q86YI8 RAD21L1-202ENST00000402452 1707 ntTSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
PHF13Q86YI8 LINC00092-201ENST00000412122 1726 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
PHF13Q86YI8 RBPMS2-201ENST00000300069 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
PHF13Q86YI8 SEPT4-205ENST00000426861 1906 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
PHF13Q86YI8 LRRC1-201ENST00000370882 808 ntTSL 3 BASIC24.16■■□□□ 1.46
PHF13Q86YI8 AC004448.1-201ENST00000458332 883 ntBASIC24.16■■□□□ 1.46
PHF13Q86YI8 AL031848.2-201ENST00000607670 837 ntBASIC24.16■■□□□ 1.46
PHF13Q86YI8 ATAD3A-203ENST00000378756 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
PHF13Q86YI8 MED25-211ENST00000617849 1548 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
PHF13Q86YI8 ZKSCAN7-206ENST00000431636 1692 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
PHF13Q86YI8 AUH-201ENST00000303617 1490 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
PHF13Q86YI8 CTDSP2-203ENST00000547701 988 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
PHF13Q86YI8 IFNGR2-202ENST00000381995 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
PHF13Q86YI8 DAZAP1-201ENST00000233078 2160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
PHF13Q86YI8 SPHK1-210ENST00000592299 1821 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
PHF13Q86YI8 TMEM102-201ENST00000323206 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
PHF13Q86YI8 TMEM102-202ENST00000396568 1962 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.46
PHF13Q86YI8 AARD-201ENST00000378279 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
PHF13Q86YI8 HTRA2-202ENST00000352222 1450 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
PHF13Q86YI8 BIN1-205ENST00000351659 2365 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
PHF13Q86YI8 CCDC47-204ENST00000582252 1719 ntTSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.45
PHF13Q86YI8 AC137630.3-201ENST00000607245 391 ntBASIC24.14■■□□□ 1.45
PHF13Q86YI8 FAHD1-204ENST00000615972 757 ntTSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.45
PHF13Q86YI8 OSCAR-209ENST00000616215 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.45
PHF13Q86YI8 PCYT2-203ENST00000538936 5147 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
PHF13Q86YI8 ADARB2-202ENST00000381310 1810 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
PHF13Q86YI8 STEAP2-207ENST00000402625 1372 ntTSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.45
PHF13Q86YI8 C21orf2-202ENST00000339818 2233 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
PHF13Q86YI8 ACOT1-201ENST00000311148 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
PHF13Q86YI8 ZFAND4-205ENST00000374371 2283 ntTSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
PHF13Q86YI8 HRH3-202ENST00000340177 2659 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
PHF13Q86YI8 ZFYVE19-201ENST00000299173 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
PHF13Q86YI8 CASK-201ENST00000378154 2494 ntTSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
PHF13Q86YI8 ARSB-202ENST00000396151 2316 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
PHF13Q86YI8 OSCAR-211ENST00000617140 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
PHF13Q86YI8 DTNB-206ENST00000404103 2384 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
PHF13Q86YI8 NAB1-202ENST00000409581 2360 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
PHF13Q86YI8 VSTM2L-201ENST00000373459 831 ntTSL 3 BASIC24.12■■□□□ 1.45
PHF13Q86YI8 OSCAR-206ENST00000391760 629 ntTSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
PHF13Q86YI8 AC005551.1-201ENST00000641816 493 ntAPPRIS P1 BASIC24.12■■□□□ 1.45
PHF13Q86YI8 AC096541.1-201ENST00000445070 1807 ntTSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
PHF13Q86YI8 GFOD1-204ENST00000603223 2388 ntTSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
PHF13Q86YI8 B3GALNT2-202ENST00000366600 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
PHF13Q86YI8 SPANXA2-OT1-201ENST00000622372 1686 ntTSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
PHF13Q86YI8 ERF-201ENST00000222329 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
PHF13Q86YI8 ZNF837-202ENST00000597582 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
PHF13Q86YI8 ARRDC2-202ENST00000379656 2528 ntTSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
PHF13Q86YI8 IQCJ-SCHIP1-201ENST00000412423 2067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
PHF13Q86YI8 NKX2-8-201ENST00000258829 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
PHF13Q86YI8 AL136090.1-201ENST00000446849 366 ntTSL 3 BASIC24.11■■□□□ 1.45
PHF13Q86YI8 DUSP8P5-201ENST00000422884 1815 ntBASIC24.11■■□□□ 1.45
PHF13Q86YI8 NEUROG3-201ENST00000242462 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
PHF13Q86YI8 MAP6D1-201ENST00000318631 2111 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
PHF13Q86YI8 LRRC34-206ENST00000522526 1899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
PHF13Q86YI8 IRX5-201ENST00000320990 2061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
PHF13Q86YI8 HOXA10-206ENST00000613671 2175 ntTSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
PHF13Q86YI8 EEF1D-256ENST00000618139 2238 ntTSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
PHF13Q86YI8 TMEM238-201ENST00000444469 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
PHF13Q86YI8 ST3GAL6-AS1-203ENST00000488132 769 ntTSL 3 BASIC24.1■■□□□ 1.45
PHF13Q86YI8 ADORA2B-201ENST00000304222 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
PHF13Q86YI8 STARD3NL-201ENST00000009041 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
PHF13Q86YI8 IKBIP-202ENST00000342502 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
PHF13Q86YI8 ZNF428-201ENST00000300811 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
PHF13Q86YI8 KLC1-201ENST00000246489 2294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
PHF13Q86YI8 KLC1-224ENST00000557450 2265 ntTSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
PHF13Q86YI8 PON2-218ENST00000633531 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
PHF13Q86YI8 MCRIP1-202ENST00000457257 942 ntTSL 3 BASIC24.09■■□□□ 1.45
PHF13Q86YI8 FBXW4-201ENST00000331272 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
PHF13Q86YI8 KCNS1-202ENST00000537075 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
PHF13Q86YI8 BOD1-202ENST00000311086 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
PHF13Q86YI8 COMMD5-201ENST00000305103 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
PHF13Q86YI8 ST20-MTHFS-201ENST00000479961 859 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.08■■□□□ 1.45
PHF13Q86YI8 MYL12B-203ENST00000581193 1249 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.08■■□□□ 1.45
PHF13Q86YI8 MIR663AHG-227ENST00000608084 765 ntTSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.45
PHF13Q86YI8 B3GAT3-201ENST00000265471 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
PHF13Q86YI8 DXO-201ENST00000337523 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
PHF13Q86YI8 CACNG6-203ENST00000352529 1635 ntTSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.45
PHF13Q86YI8 RNF19B-203ENST00000373456 2560 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
PHF13Q86YI8 LHPP-201ENST00000368839 1522 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
PHF13Q86YI8 PCYT2-201ENST00000331285 2147 ntTSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.45
PHF13Q86YI8 ANKRD54-201ENST00000215941 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
PHF13Q86YI8 UNC50-204ENST00000409975 2172 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
PHF13Q86YI8 TPI1-210ENST00000613953 1460 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
PHF13Q86YI8 PEX5-205ENST00000420616 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
PHF13Q86YI8 ABHD17C-201ENST00000258884 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.3 ms