Protein–RNA interactions for Protein: Q86WR0

CCDC25, Coiled-coil domain-containing protein 25, humanhuman

Predictions only

Length 208 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC25Q86WR0 SPON2-222ENST00000617421 2156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
CCDC25Q86WR0 C1orf122-201ENST00000373042 973 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
CCDC25Q86WR0 CMPK2-202ENST00000404168 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
CCDC25Q86WR0 UPF3A-201ENST00000351487 2235 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
CCDC25Q86WR0 C8orf82-202ENST00000524821 2476 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
CCDC25Q86WR0 NAT14-201ENST00000205194 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
CCDC25Q86WR0 AL117328.2-201ENST00000624617 1940 ntBASIC23.53■■□□□ 1.36
CCDC25Q86WR0 HSPBP1-202ENST00000433386 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
CCDC25Q86WR0 ADSSL1-201ENST00000330877 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
CCDC25Q86WR0 NAAA-204ENST00000507187 1750 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
CCDC25Q86WR0 NEK6-214ENST00000545174 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
CCDC25Q86WR0 MYBL2-201ENST00000217026 2639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
CCDC25Q86WR0 ANOS2P-203ENST00000472227 1816 ntBASIC23.52■■□□□ 1.36
CCDC25Q86WR0 B3GNT6-202ENST00000622824 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
CCDC25Q86WR0 RHOF-203ENST00000537171 1485 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
CCDC25Q86WR0 LIMD2-205ENST00000578402 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
CCDC25Q86WR0 REEP5-202ENST00000379638 3326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
CCDC25Q86WR0 TANGO2-201ENST00000327374 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
CCDC25Q86WR0 CCDC9-201ENST00000221922 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.35
CCDC25Q86WR0 IGF2-AS-201ENST00000381361 2063 ntTSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.35
CCDC25Q86WR0 H2AFY-217ENST00000511689 2789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.35
CCDC25Q86WR0 C5orf49-201ENST00000399810 2385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
CCDC25Q86WR0 CAPN12-212ENST00000601953 2381 ntTSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
CCDC25Q86WR0 NRG3-201ENST00000372141 2158 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
CCDC25Q86WR0 CYP2A13-201ENST00000330436 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
CCDC25Q86WR0 FNDC11-204ENST00000615526 2954 ntAPPRIS P1 BASIC23.51■■□□□ 1.35
CCDC25Q86WR0 APBB3-204ENST00000358580 2020 ntTSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
CCDC25Q86WR0 POLDIP2-201ENST00000540200 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
CCDC25Q86WR0 AC233723.2-201ENST00000623798 2106 ntBASIC23.51■■□□□ 1.35
CCDC25Q86WR0 RAB20-201ENST00000267328 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
CCDC25Q86WR0 ACOT12-204ENST00000513751 612 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
CCDC25Q86WR0 PDSS1-201ENST00000376215 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
CCDC25Q86WR0 SPAG7-205ENST00000573366 1668 ntTSL 3 BASIC23.5■■□□□ 1.35
CCDC25Q86WR0 NRXN2-203ENST00000377551 6373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
CCDC25Q86WR0 PON2-202ENST00000433091 1726 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
CCDC25Q86WR0 ITM2C-202ENST00000326427 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
CCDC25Q86WR0 KCNQ5-213ENST00000629977 2830 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
CCDC25Q86WR0 FLOT1-201ENST00000376389 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
CCDC25Q86WR0 TPRN-202ENST00000409012 2718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
CCDC25Q86WR0 LRP5-201ENST00000294304 5159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
CCDC25Q86WR0 ARL4D-201ENST00000320033 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
CCDC25Q86WR0 AKT2-206ENST00000392038 5300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
CCDC25Q86WR0 RASSF10-201ENST00000529419 2530 ntAPPRIS P1 BASIC23.49■■□□□ 1.35
CCDC25Q86WR0 NTHL1-201ENST00000219066 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
CCDC25Q86WR0 U2AF1-201ENST00000291552 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
CCDC25Q86WR0 PSMG4-206ENST00000438998 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
CCDC25Q86WR0 RILP-201ENST00000301336 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
CCDC25Q86WR0 MEIOB-202ENST00000397344 1792 ntTSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
CCDC25Q86WR0 NIPSNAP1-201ENST00000216121 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
CCDC25Q86WR0 PDLIM2-202ENST00000308354 2236 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
CCDC25Q86WR0 NKX2-4-201ENST00000351817 2238 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
CCDC25Q86WR0 SLC25A29-202ENST00000392908 2242 ntTSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
CCDC25Q86WR0 ZNF668-205ENST00000426488 2282 ntTSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
CCDC25Q86WR0 PKD1P6-201ENST00000343738 4769 ntBASIC23.49■■□□□ 1.35
CCDC25Q86WR0 TMEM120A-214ENST00000493111 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
CCDC25Q86WR0 JMJD8-201ENST00000412368 2038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
CCDC25Q86WR0 SMARCB1-201ENST00000263121 1690 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
CCDC25Q86WR0 NR6A1-201ENST00000344523 1846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
CCDC25Q86WR0 AC004980.1-201ENST00000418663 2667 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
CCDC25Q86WR0 ANKRD9-204ENST00000559651 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
CCDC25Q86WR0 U2AF2-202ENST00000450554 3022 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
CCDC25Q86WR0 LYRM1-201ENST00000219168 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
CCDC25Q86WR0 ERMP1-202ENST00000339450 5376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
CCDC25Q86WR0 TMEM8B-203ENST00000377996 2473 ntTSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
CCDC25Q86WR0 AGO3-204ENST00000397828 1035 ntTSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
CCDC25Q86WR0 FGF13-AS1-202ENST00000446383 584 ntTSL 3 BASIC23.47■■□□□ 1.35
CCDC25Q86WR0 TRIM72-202ENST00000613872 1573 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
CCDC25Q86WR0 CACNG8-201ENST00000270458 8747 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
CCDC25Q86WR0 BTBD6-201ENST00000327471 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
CCDC25Q86WR0 AKT1S1-204ENST00000391832 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
CCDC25Q86WR0 CLDN5-201ENST00000403084 2357 ntBASIC23.46■■□□□ 1.35
CCDC25Q86WR0 ZNF74-204ENST00000405993 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
CCDC25Q86WR0 PTPA-210ENST00000414510 1153 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
CCDC25Q86WR0 ARL6IP4-210ENST00000453766 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
CCDC25Q86WR0 STMN4-204ENST00000519997 1623 ntTSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
CCDC25Q86WR0 PPP1CC-206ENST00000550991 1882 ntTSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.35
CCDC25Q86WR0 DUSP22-201ENST00000344450 1485 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
CCDC25Q86WR0 SDF2L1-201ENST00000248958 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
CCDC25Q86WR0 RAB6B-203ENST00000469959 500 ntTSL 3 BASIC23.45■■□□□ 1.34
CCDC25Q86WR0 PRODH-203ENST00000357068 2462 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
CCDC25Q86WR0 PDLIM2-203ENST00000339162 2226 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
CCDC25Q86WR0 ACTL10-201ENST00000330271 2028 ntAPPRIS P1 BASIC23.45■■□□□ 1.34
CCDC25Q86WR0 ACSF2-207ENST00000504392 1881 ntTSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
CCDC25Q86WR0 TLX1-203ENST00000467928 1838 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
CCDC25Q86WR0 EP400NL-214ENST00000641289 2402 ntBASIC23.44■■□□□ 1.34
CCDC25Q86WR0 CDIPT-201ENST00000219789 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
CCDC25Q86WR0 FHL2-203ENST00000358129 1578 ntTSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
CCDC25Q86WR0 MAPK3-203ENST00000395199 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
CCDC25Q86WR0 MAPK3-205ENST00000395202 1008 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
CCDC25Q86WR0 HES4-204ENST00000484667 667 ntTSL 3 BASIC23.44■■□□□ 1.34
CCDC25Q86WR0 STK25-234ENST00000535007 2459 ntTSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
CCDC25Q86WR0 KLC3-201ENST00000391946 1780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
CCDC25Q86WR0 GAS1-201ENST00000298743 2827 ntAPPRIS P1 BASIC23.44■■□□□ 1.34
CCDC25Q86WR0 CNN3-201ENST00000370206 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
CCDC25Q86WR0 PPP4C-201ENST00000279387 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
CCDC25Q86WR0 ELL3-201ENST00000319359 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
CCDC25Q86WR0 MRPL38-201ENST00000309352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
CCDC25Q86WR0 ZNF213-208ENST00000576416 2240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
CCDC25Q86WR0 MAPK12-211ENST00000622558 1779 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
CCDC25Q86WR0 SLC39A14-202ENST00000289952 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.3 ms