Protein–RNA interactions for Protein: Q86SE9

PCGF5, Polycomb group RING finger protein 5, humanhuman

Predictions only

Length 256 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PCGF5Q86SE9 RAX-201ENST00000256852 2935 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
PCGF5Q86SE9 RARRES2P2-201ENST00000394842 485 ntBASIC23.42■■□□□ 1.34
PCGF5Q86SE9 SLC35B2-201ENST00000393810 1898 ntTSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
PCGF5Q86SE9 AC092068.2-201ENST00000590491 1708 ntBASIC23.42■■□□□ 1.34
PCGF5Q86SE9 C9orf163-202ENST00000624034 2573 ntBASIC23.42■■□□□ 1.34
PCGF5Q86SE9 LYRM1-201ENST00000219168 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
PCGF5Q86SE9 AL022069.1-201ENST00000568025 1636 ntBASIC23.41■■□□□ 1.34
PCGF5Q86SE9 DTNB-206ENST00000404103 2384 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
PCGF5Q86SE9 CCZ1B-201ENST00000316731 2885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
PCGF5Q86SE9 AC096541.1-201ENST00000445070 1807 ntTSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
PCGF5Q86SE9 DUX4L9-201ENST00000449051 1259 ntBASIC23.41■■□□□ 1.34
PCGF5Q86SE9 GNAS-AS1_1.1-201ENST00000621898 103 ntBASIC23.41■■□□□ 1.34
PCGF5Q86SE9 SLC25A1-202ENST00000451283 1514 ntTSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
PCGF5Q86SE9 SEPT2-205ENST00000401990 1734 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
PCGF5Q86SE9 ECE2-202ENST00000357474 2667 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
PCGF5Q86SE9 C6orf201-202ENST00000380175 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
PCGF5Q86SE9 LINC01970-201ENST00000581489 1810 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
PCGF5Q86SE9 KLC3-201ENST00000391946 1780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
PCGF5Q86SE9 POU2F3-206ENST00000543440 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
PCGF5Q86SE9 AC004691.2-201ENST00000509504 1531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
PCGF5Q86SE9 DONSON-201ENST00000303071 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
PCGF5Q86SE9 TNFRSF10B-202ENST00000347739 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
PCGF5Q86SE9 LONRF2P2-201ENST00000439212 571 ntBASIC23.4■■□□□ 1.34
PCGF5Q86SE9 USF3-203ENST00000491165 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
PCGF5Q86SE9 RAD51-210ENST00000557850 1397 ntTSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
PCGF5Q86SE9 LRRC34-206ENST00000522526 1899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
PCGF5Q86SE9 CFAP77-202ENST00000393215 901 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
PCGF5Q86SE9 AC007383.2-202ENST00000435627 482 ntTSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.33
PCGF5Q86SE9 RBM4B-203ENST00000525754 2339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.33
PCGF5Q86SE9 SHISA8-202ENST00000621082 1405 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
PCGF5Q86SE9 ARRDC1-AS1-203ENST00000623970 2210 ntTSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
PCGF5Q86SE9 KLC1-227ENST00000634686 2229 ntTSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
PCGF5Q86SE9 CRACR2B-202ENST00000525077 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
PCGF5Q86SE9 AC098864.1-205ENST00000315302 2260 ntTSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
PCGF5Q86SE9 ST8SIA6-201ENST00000377602 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
PCGF5Q86SE9 PDS5A-202ENST00000503396 2685 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
PCGF5Q86SE9 ASF1B-201ENST00000263382 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
PCGF5Q86SE9 ELOA-201ENST00000418390 5154 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
PCGF5Q86SE9 SLC2A8-203ENST00000373371 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
PCGF5Q86SE9 C3orf80-201ENST00000326474 2718 ntAPPRIS P1 BASIC23.37■■□□□ 1.33
PCGF5Q86SE9 TMEM185B-201ENST00000426077 2131 ntAPPRIS P1 BASIC23.37■■□□□ 1.33
PCGF5Q86SE9 KCNQ5-208ENST00000414165 6236 ntTSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
PCGF5Q86SE9 SLC10A4-201ENST00000273861 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
PCGF5Q86SE9 USP36-218ENST00000590546 1771 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
PCGF5Q86SE9 SLC52A2-211ENST00000532887 2147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
PCGF5Q86SE9 MADCAM1-202ENST00000346144 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
PCGF5Q86SE9 PPP1R1B-201ENST00000254079 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
PCGF5Q86SE9 TRIM28-202ENST00000341753 2709 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
PCGF5Q86SE9 TMEM98-202ENST00000394642 1683 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
PCGF5Q86SE9 SPON2-222ENST00000617421 2156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
PCGF5Q86SE9 AC011551.1-201ENST00000614101 683 ntBASIC23.36■■□□□ 1.33
PCGF5Q86SE9 DUSP8P3-201ENST00000399571 1760 ntBASIC23.36■■□□□ 1.33
PCGF5Q86SE9 FZD8-201ENST00000374694 4030 ntAPPRIS P1 BASIC23.36■■□□□ 1.33
PCGF5Q86SE9 ABHD6-201ENST00000295962 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
PCGF5Q86SE9 CEBPB-AS1-201ENST00000613921 2648 ntTSL 3 BASIC23.36■■□□□ 1.33
PCGF5Q86SE9 PFKFB3-201ENST00000317350 1999 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
PCGF5Q86SE9 CAMK1-201ENST00000256460 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
PCGF5Q86SE9 KCTD8-201ENST00000360029 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
PCGF5Q86SE9 FLOT1-201ENST00000376389 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
PCGF5Q86SE9 SSTR4-201ENST00000255008 1427 ntAPPRIS P1 BASIC23.35■■□□□ 1.33
PCGF5Q86SE9 WT1-204ENST00000448076 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
PCGF5Q86SE9 POLDIP2-201ENST00000540200 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
PCGF5Q86SE9 DTNB-201ENST00000288642 2464 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
PCGF5Q86SE9 DTNB-208ENST00000406818 2474 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
PCGF5Q86SE9 MYDGF-201ENST00000262947 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
PCGF5Q86SE9 C20orf24-201ENST00000342422 896 ntTSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
PCGF5Q86SE9 C20orf24-202ENST00000344795 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
PCGF5Q86SE9 UBE2I-213ENST00000566587 1098 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
PCGF5Q86SE9 FAM222B-205ENST00000577682 549 ntTSL 4 BASIC23.35■■□□□ 1.33
PCGF5Q86SE9 CDC16-206ENST00000375310 2156 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
PCGF5Q86SE9 APBB3-204ENST00000358580 2020 ntTSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
PCGF5Q86SE9 NRL-202ENST00000396997 1517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
PCGF5Q86SE9 CNPY3-201ENST00000372836 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
PCGF5Q86SE9 IFNGR2-202ENST00000381995 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
PCGF5Q86SE9 RAB11FIP3-201ENST00000262305 4831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
PCGF5Q86SE9 SRXN1-201ENST00000381962 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
PCGF5Q86SE9 PXMP2-205ENST00000543589 632 ntTSL 3 BASIC23.34■■□□□ 1.33
PCGF5Q86SE9 PKM-201ENST00000319622 2717 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
PCGF5Q86SE9 USF2-201ENST00000222305 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
PCGF5Q86SE9 ACOT1-201ENST00000311148 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
PCGF5Q86SE9 ZNF213-208ENST00000576416 2240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
PCGF5Q86SE9 DGAT2-201ENST00000228027 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
PCGF5Q86SE9 C5orf49-201ENST00000399810 2385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
PCGF5Q86SE9 CARNMT1-201ENST00000376830 1012 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
PCGF5Q86SE9 FAM107B-211ENST00000468747 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
PCGF5Q86SE9 CACNA1H-210ENST00000638323 8048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.32
PCGF5Q86SE9 HOMER3-205ENST00000542541 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
PCGF5Q86SE9 ARMC6-201ENST00000269932 2412 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
PCGF5Q86SE9 HES6-201ENST00000272937 1454 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
PCGF5Q86SE9 SPHK1-210ENST00000592299 1821 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
PCGF5Q86SE9 STK32C-205ENST00000456004 607 ntTSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
PCGF5Q86SE9 HYI-210ENST00000486909 905 ntTSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
PCGF5Q86SE9 HTATSF1-201ENST00000218364 2775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
PCGF5Q86SE9 GRAMD1A-201ENST00000317991 2695 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
PCGF5Q86SE9 NKIRAS2-206ENST00000393885 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
PCGF5Q86SE9 RSPO4-202ENST00000400634 722 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
PCGF5Q86SE9 FP236240.1-201ENST00000619537 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
PCGF5Q86SE9 AC012123.1-201ENST00000426194 1661 ntTSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
PCGF5Q86SE9 DCAF4-206ENST00000509153 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
PCGF5Q86SE9 C11orf96-203ENST00000617612 1294 ntAPPRIS P1 BASIC23.3■■□□□ 1.32
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 48.6 ms