Protein–RNA interactions for Protein: Q7Z7N9

TMEM179B, Transmembrane protein 179B, humanhuman

Predictions only

Length 219 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMEM179BQ7Z7N9 RBFA-201ENST00000262197 1219 ntTSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
TMEM179BQ7Z7N9 LOR-201ENST00000368742 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
TMEM179BQ7Z7N9 ARL6IP4-208ENST00000439686 796 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.16■□□□□ 0.98
TMEM179BQ7Z7N9 G6PD-202ENST00000393562 2631 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
TMEM179BQ7Z7N9 G6PD-211ENST00000621232 2631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
TMEM179BQ7Z7N9 RALB-201ENST00000272519 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
TMEM179BQ7Z7N9 GUSBP5-202ENST00000510805 1989 ntBASIC21.16■□□□□ 0.98
TMEM179BQ7Z7N9 QKI-207ENST00000453779 5685 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
TMEM179BQ7Z7N9 TDRKH-205ENST00000368827 2318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
TMEM179BQ7Z7N9 P4HA3-202ENST00000427714 2248 ntTSL 2 BASIC21.15■□□□□ 0.98
TMEM179BQ7Z7N9 PARD6A-201ENST00000219255 1248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
TMEM179BQ7Z7N9 VEGFA-202ENST00000324450 954 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
TMEM179BQ7Z7N9 VEGFA-203ENST00000372055 1286 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
TMEM179BQ7Z7N9 VEGFA-208ENST00000417285 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
TMEM179BQ7Z7N9 VIPR2-204ENST00000421760 717 ntTSL 3 BASIC21.15■□□□□ 0.98
TMEM179BQ7Z7N9 VEGFA-213ENST00000482630 1146 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
TMEM179BQ7Z7N9 AC187653.1-201ENST00000506382 702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
TMEM179BQ7Z7N9 RAP2CP1-202ENST00000605179 643 ntBASIC21.15■□□□□ 0.98
TMEM179BQ7Z7N9 VEGFA-227ENST00000615393 984 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
TMEM179BQ7Z7N9 VEGFA-228ENST00000617771 1116 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
TMEM179BQ7Z7N9 VEGFA-229ENST00000621747 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
TMEM179BQ7Z7N9 VEGFA-230ENST00000640482 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
TMEM179BQ7Z7N9 VEGFA-232ENST00000640653 1170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
TMEM179BQ7Z7N9 RNF4-207ENST00000506706 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
TMEM179BQ7Z7N9 ASB6-201ENST00000277458 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
TMEM179BQ7Z7N9 SEPT8-207ENST00000378719 2889 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
TMEM179BQ7Z7N9 RAB20-201ENST00000267328 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
TMEM179BQ7Z7N9 ZNF843-201ENST00000315678 2137 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.14■□□□□ 0.98
TMEM179BQ7Z7N9 ZNF444-201ENST00000337080 2042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
TMEM179BQ7Z7N9 UBTF-213ENST00000533177 3011 ntTSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.98
TMEM179BQ7Z7N9 SHMT1-202ENST00000352886 2437 ntTSL 2 BASIC21.14■□□□□ 0.97
TMEM179BQ7Z7N9 P4HA2-202ENST00000360568 2313 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
TMEM179BQ7Z7N9 USP36-218ENST00000590546 1771 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
TMEM179BQ7Z7N9 PRKACA-201ENST00000308677 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
TMEM179BQ7Z7N9 DENND1B-204ENST00000367396 2177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
TMEM179BQ7Z7N9 LSR-203ENST00000360798 1963 ntTSL 2 BASIC21.14■□□□□ 0.97
TMEM179BQ7Z7N9 NRSN1-204ENST00000378491 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
TMEM179BQ7Z7N9 YY1AP1-212ENST00000404643 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
TMEM179BQ7Z7N9 FPGS-204ENST00000393706 2230 ntTSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
TMEM179BQ7Z7N9 ZYX-201ENST00000322764 2493 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
TMEM179BQ7Z7N9 CENPVL1-201ENST00000602548 1620 ntAPPRIS P1 BASIC21.13■□□□□ 0.97
TMEM179BQ7Z7N9 CENPVL2-201ENST00000634648 1620 ntAPPRIS P1 BASIC21.13■□□□□ 0.97
TMEM179BQ7Z7N9 HNRNPD-203ENST00000353341 1585 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
TMEM179BQ7Z7N9 OLIG1-201ENST00000382348 2277 ntAPPRIS P1 BASIC21.13■□□□□ 0.97
TMEM179BQ7Z7N9 H19-210ENST00000439725 1929 ntTSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
TMEM179BQ7Z7N9 RNF39-201ENST00000244360 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
TMEM179BQ7Z7N9 ZSWIM6-201ENST00000252744 5501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
TMEM179BQ7Z7N9 GAL3ST1-202ENST00000401975 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
TMEM179BQ7Z7N9 SLIT1-203ENST00000371041 1695 ntTSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
TMEM179BQ7Z7N9 PPP1R1B-201ENST00000254079 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
TMEM179BQ7Z7N9 BTBD6-201ENST00000327471 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
TMEM179BQ7Z7N9 PLK5-202ENST00000454744 1930 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
TMEM179BQ7Z7N9 IQCJ-SCHIP1-202ENST00000460298 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
TMEM179BQ7Z7N9 NR6A1-201ENST00000344523 1846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
TMEM179BQ7Z7N9 SPSB3-208ENST00000566339 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
TMEM179BQ7Z7N9 MXD3-208ENST00000513063 861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
TMEM179BQ7Z7N9 AC026202.3-201ENST00000600805 1127 ntBASIC21.11■□□□□ 0.97
TMEM179BQ7Z7N9 AC007029.1-201ENST00000604183 313 ntBASIC21.11■□□□□ 0.97
TMEM179BQ7Z7N9 RASL10A-201ENST00000216101 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
TMEM179BQ7Z7N9 DPEP2-204ENST00000572888 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
TMEM179BQ7Z7N9 ARL4D-201ENST00000320033 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
TMEM179BQ7Z7N9 TRIM3-201ENST00000345851 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
TMEM179BQ7Z7N9 IRX4-201ENST00000231357 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
TMEM179BQ7Z7N9 CBWD5-202ENST00000377384 1347 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
TMEM179BQ7Z7N9 ZGPAT-201ENST00000328969 1945 ntTSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
TMEM179BQ7Z7N9 TSPAN17-207ENST00000508164 2457 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
TMEM179BQ7Z7N9 DIXDC1-205ENST00000529225 1945 ntTSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
TMEM179BQ7Z7N9 CNPY3-201ENST00000372836 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
TMEM179BQ7Z7N9 WDR86-201ENST00000334493 2023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
TMEM179BQ7Z7N9 ZNF74-204ENST00000405993 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
TMEM179BQ7Z7N9 TPT1-202ENST00000379055 948 ntTSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
TMEM179BQ7Z7N9 U2AF1L5-202ENST00000619610 813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
TMEM179BQ7Z7N9 IRX2-202ENST00000382611 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
TMEM179BQ7Z7N9 HNRNPM-202ENST00000348943 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
TMEM179BQ7Z7N9 UBXN2A-202ENST00000404924 1557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
TMEM179BQ7Z7N9 TANGO2-207ENST00000420290 1859 ntTSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
TMEM179BQ7Z7N9 TPM4-201ENST00000300933 2666 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
TMEM179BQ7Z7N9 GUSB-201ENST00000304895 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
TMEM179BQ7Z7N9 C6orf201-202ENST00000380175 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
TMEM179BQ7Z7N9 FARP2-223ENST00000627550 2122 ntTSL 2 BASIC21.08■□□□□ 0.97
TMEM179BQ7Z7N9 PRPSAP2-201ENST00000268835 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
TMEM179BQ7Z7N9 SRI-201ENST00000265729 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
TMEM179BQ7Z7N9 IFNGR2-202ENST00000381995 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.97
TMEM179BQ7Z7N9 MRGPRF-203ENST00000441623 2282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.08■□□□□ 0.96
TMEM179BQ7Z7N9 SMAD1-201ENST00000302085 1966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
TMEM179BQ7Z7N9 FAM136A-201ENST00000037869 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
TMEM179BQ7Z7N9 NAT14-201ENST00000205194 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
TMEM179BQ7Z7N9 BCKDHB-202ENST00000356489 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
TMEM179BQ7Z7N9 RCN2-201ENST00000320963 1750 ntTSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.96
TMEM179BQ7Z7N9 MYCN-201ENST00000281043 2602 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.96
TMEM179BQ7Z7N9 FOXJ1-201ENST00000322957 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
TMEM179BQ7Z7N9 EPS8L1-202ENST00000245618 2198 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
TMEM179BQ7Z7N9 LIMS2-202ENST00000355119 2045 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
TMEM179BQ7Z7N9 PPP1CC-206ENST00000550991 1882 ntTSL 2 BASIC21.07■□□□□ 0.96
TMEM179BQ7Z7N9 ECEL1P1-201ENST00000373592 1742 ntBASIC21.07■□□□□ 0.96
TMEM179BQ7Z7N9 SH2D3A-201ENST00000245908 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
TMEM179BQ7Z7N9 PKIG-207ENST00000372894 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
TMEM179BQ7Z7N9 KRT18P10-201ENST00000388836 1287 ntBASIC21.07■□□□□ 0.96
TMEM179BQ7Z7N9 AC022413.1-201ENST00000624602 984 ntBASIC21.07■□□□□ 0.96
TMEM179BQ7Z7N9 TSR3-201ENST00000007390 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.9 ms