Protein–RNA interactions for Protein: Q7Z3Z2

RD3, Protein RD3, humanhuman

Predictions only

Length 195 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RD3Q7Z3Z2 OSCAR-205ENST00000359649 1892 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
RD3Q7Z3Z2 AC019163.1-201ENST00000512634 610 ntTSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
RD3Q7Z3Z2 RPRD1A-207ENST00000588737 1264 ntTSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
RD3Q7Z3Z2 ZNF584-205ENST00000596281 575 ntTSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
RD3Q7Z3Z2 C4orf19-202ENST00000381980 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
RD3Q7Z3Z2 ARL6IP4-210ENST00000453766 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
RD3Q7Z3Z2 TAZ-216ENST00000613002 1485 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
RD3Q7Z3Z2 PTRH1-205ENST00000423807 1570 ntTSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.2
RD3Q7Z3Z2 AP2M1-202ENST00000382456 2091 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
RD3Q7Z3Z2 USF2-201ENST00000222305 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
RD3Q7Z3Z2 SNX21-204ENST00000372542 1824 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
RD3Q7Z3Z2 ANO8-204ENST00000630631 1905 ntTSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
RD3Q7Z3Z2 ZNF837-201ENST00000427624 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
RD3Q7Z3Z2 KCNG1-201ENST00000371571 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
RD3Q7Z3Z2 DCTPP1-201ENST00000319285 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
RD3Q7Z3Z2 SRD5A1P1-201ENST00000442297 786 ntBASIC22.57■■□□□ 1.2
RD3Q7Z3Z2 E2F5-203ENST00000418930 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
RD3Q7Z3Z2 PPP1R14C-201ENST00000361131 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
RD3Q7Z3Z2 FAM193A-211ENST00000637812 4885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
RD3Q7Z3Z2 AC135731.1-201ENST00000569415 2548 ntBASIC22.57■■□□□ 1.2
RD3Q7Z3Z2 OSCAR-207ENST00000391761 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
RD3Q7Z3Z2 TMEM64-203ENST00000458549 4997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
RD3Q7Z3Z2 PSKH1-202ENST00000570631 1509 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
RD3Q7Z3Z2 UBL7-202ENST00000395081 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
RD3Q7Z3Z2 GMPPB-202ENST00000308388 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
RD3Q7Z3Z2 ECEL1-202ENST00000409941 2322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
RD3Q7Z3Z2 AL136090.1-201ENST00000446849 366 ntTSL 3 BASIC22.56■■□□□ 1.2
RD3Q7Z3Z2 POLR2F-211ENST00000488684 564 ntTSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
RD3Q7Z3Z2 UBXN2A-202ENST00000404924 1557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
RD3Q7Z3Z2 TMEM185A-207ENST00000600449 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
RD3Q7Z3Z2 CAMK1-201ENST00000256460 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
RD3Q7Z3Z2 ADGRA2-202ENST00000412232 5651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
RD3Q7Z3Z2 KRTAP5-4-201ENST00000399682 1181 ntAPPRIS P5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
RD3Q7Z3Z2 SLC22A18-201ENST00000312221 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
RD3Q7Z3Z2 IRF3-227ENST00000600911 1637 ntTSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
RD3Q7Z3Z2 DEDD-212ENST00000545495 2329 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.55■■□□□ 1.2
RD3Q7Z3Z2 SLC19A1-202ENST00000380010 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
RD3Q7Z3Z2 KRT72-201ENST00000293745 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
RD3Q7Z3Z2 EEF1D-201ENST00000317198 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
RD3Q7Z3Z2 RPP38-207ENST00000616640 1537 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
RD3Q7Z3Z2 APOE-201ENST00000252486 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
RD3Q7Z3Z2 PYCARD-202ENST00000350605 696 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
RD3Q7Z3Z2 SRPK3-205ENST00000393786 1900 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
RD3Q7Z3Z2 SEPT5-201ENST00000383045 1588 ntTSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
RD3Q7Z3Z2 KLC1-203ENST00000347839 2271 ntTSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
RD3Q7Z3Z2 OSCAR-203ENST00000356532 1355 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
RD3Q7Z3Z2 OSCAR-204ENST00000358375 1389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
RD3Q7Z3Z2 RCE1-202ENST00000524506 1379 ntTSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
RD3Q7Z3Z2 OSCAR-210ENST00000616447 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
RD3Q7Z3Z2 GPR150-201ENST00000380007 2065 ntAPPRIS P1 BASIC22.53■■□□□ 1.2
RD3Q7Z3Z2 SLC35A2-201ENST00000247138 1672 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
RD3Q7Z3Z2 LRRC24-202ENST00000533758 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
RD3Q7Z3Z2 SLC25A1-201ENST00000215882 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
RD3Q7Z3Z2 TMEM221-201ENST00000341130 1930 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
RD3Q7Z3Z2 FEZ2-203ENST00000379245 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
RD3Q7Z3Z2 PKDCC-201ENST00000294964 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
RD3Q7Z3Z2 EVX1-201ENST00000222761 1500 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
RD3Q7Z3Z2 PBX2P1-201ENST00000493219 1291 ntBASIC22.52■■□□□ 1.2
RD3Q7Z3Z2 SHISA9-205ENST00000639941 1135 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
RD3Q7Z3Z2 HES6-201ENST00000272937 1454 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
RD3Q7Z3Z2 CAPN10-204ENST00000354082 1999 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
RD3Q7Z3Z2 BIN1-201ENST00000259238 2338 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
RD3Q7Z3Z2 ANKRD53-201ENST00000272421 2185 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
RD3Q7Z3Z2 TMEM121-202ENST00000431372 1519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.19
RD3Q7Z3Z2 CPSF4-204ENST00000436336 1738 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
RD3Q7Z3Z2 TRIM72-202ENST00000613872 1573 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
RD3Q7Z3Z2 CPNE1-202ENST00000352393 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
RD3Q7Z3Z2 SDF4-202ENST00000360001 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
RD3Q7Z3Z2 LINC01342-201ENST00000416774 1620 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
RD3Q7Z3Z2 UNC93B3-201ENST00000308076 687 ntBASIC22.51■■□□□ 1.19
RD3Q7Z3Z2 YTHDF1-201ENST00000370334 747 ntTSL 3 BASIC22.51■■□□□ 1.19
RD3Q7Z3Z2 LINC01632-201ENST00000615763 496 ntTSL 3 BASIC22.51■■□□□ 1.19
RD3Q7Z3Z2 GRAMD1B-217ENST00000640939 1212 ntTSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
RD3Q7Z3Z2 DGCR6-208ENST00000608842 1837 ntTSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
RD3Q7Z3Z2 CTDSPL-206ENST00000443503 4640 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
RD3Q7Z3Z2 SNX5-201ENST00000377759 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
RD3Q7Z3Z2 HAS1-205ENST00000601714 2086 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
RD3Q7Z3Z2 FEZ1-205ENST00000524435 750 ntTSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
RD3Q7Z3Z2 AC005837.3-201ENST00000612163 286 ntBASIC22.5■■□□□ 1.19
RD3Q7Z3Z2 GATM-206ENST00000558336 1522 ntTSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
RD3Q7Z3Z2 CDC16-204ENST00000360383 2211 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
RD3Q7Z3Z2 TANGO2-207ENST00000420290 1859 ntTSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
RD3Q7Z3Z2 MBD3-202ENST00000434436 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
RD3Q7Z3Z2 CBR3-201ENST00000290354 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
RD3Q7Z3Z2 TNFRSF6B-201ENST00000369996 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
RD3Q7Z3Z2 CCDC107-203ENST00000378407 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
RD3Q7Z3Z2 PRICKLE4-201ENST00000394259 939 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
RD3Q7Z3Z2 SDHAP1-204ENST00000427415 559 ntTSL 4 BASIC22.49■■□□□ 1.19
RD3Q7Z3Z2 SMIM29-205ENST00000468145 903 ntTSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
RD3Q7Z3Z2 SMIM29-207ENST00000481533 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
RD3Q7Z3Z2 MYL5-208ENST00000511290 781 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
RD3Q7Z3Z2 CBWD2-201ENST00000259199 1812 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
RD3Q7Z3Z2 SAMD13-205ENST00000370673 1567 ntTSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
RD3Q7Z3Z2 C20orf27-202ENST00000379772 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
RD3Q7Z3Z2 PRDM13-202ENST00000369215 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
RD3Q7Z3Z2 NREP-202ENST00000379671 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
RD3Q7Z3Z2 LMTK3-201ENST00000270238 4972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
RD3Q7Z3Z2 AMZ2-219ENST00000612294 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
RD3Q7Z3Z2 CCND3-203ENST00000372991 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
RD3Q7Z3Z2 GCLC-209ENST00000514004 2356 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 141.6 ms