Protein–RNA interactions for Protein: Q7RTS5

OTOP3, Otopetrin-3, humanhuman

Predictions only

Length 596 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
OTOP3Q7RTS5 SERGEF-219ENST00000532265 1124 ntTSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
OTOP3Q7RTS5 FAM222B-208ENST00000581381 556 ntTSL 4 BASIC24.23■■□□□ 1.47
OTOP3Q7RTS5 AC092171.4-201ENST00000609130 632 ntBASIC24.23■■□□□ 1.47
OTOP3Q7RTS5 BAG1-212ENST00000641048 1038 ntAPPRIS P3 BASIC24.23■■□□□ 1.47
OTOP3Q7RTS5 SPIRE2-205ENST00000563972 1823 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
OTOP3Q7RTS5 RING1-201ENST00000374656 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
OTOP3Q7RTS5 HOXA4-204ENST00000610970 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
OTOP3Q7RTS5 DPY19L1-209ENST00000638088 5075 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
OTOP3Q7RTS5 GMPPB-202ENST00000308388 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
OTOP3Q7RTS5 CHSY1-201ENST00000254190 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
OTOP3Q7RTS5 C6orf89-201ENST00000355190 1309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
OTOP3Q7RTS5 PRADC1-201ENST00000258083 1083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
OTOP3Q7RTS5 AC091305.1-201ENST00000479476 895 ntBASIC24.22■■□□□ 1.47
OTOP3Q7RTS5 VAMP2-204ENST00000488857 874 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC24.22■■□□□ 1.47
OTOP3Q7RTS5 AP001330.3-201ENST00000520123 633 ntBASIC24.22■■□□□ 1.47
OTOP3Q7RTS5 CCDC189-211ENST00000545825 1046 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
OTOP3Q7RTS5 MIR6821-201ENST00000617625 74 ntBASIC24.22■■□□□ 1.47
OTOP3Q7RTS5 TBC1D10A-201ENST00000215790 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
OTOP3Q7RTS5 FAM118A-205ENST00000441876 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
OTOP3Q7RTS5 AC005703.6-201ENST00000623265 1329 ntBASIC24.21■■□□□ 1.47
OTOP3Q7RTS5 ATP6V0B-204ENST00000471859 865 ntTSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
OTOP3Q7RTS5 PAFAH1B2-205ENST00000529887 1056 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
OTOP3Q7RTS5 ANKRD20A6P-201ENST00000618763 204 ntBASIC24.21■■□□□ 1.47
OTOP3Q7RTS5 BIN1-206ENST00000352848 2209 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.47
OTOP3Q7RTS5 FPGS-221ENST00000630236 2160 ntTSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.47
OTOP3Q7RTS5 IKBKG-211ENST00000615874 1460 ntTSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.47
OTOP3Q7RTS5 IKBKG-215ENST00000619941 1463 ntTSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.47
OTOP3Q7RTS5 C8orf58-201ENST00000289989 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.47
OTOP3Q7RTS5 UBL7-202ENST00000395081 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
OTOP3Q7RTS5 BTBD6-205ENST00000536364 1973 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
OTOP3Q7RTS5 MAZ-203ENST00000545521 2333 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
OTOP3Q7RTS5 PPM1N-207ENST00000451287 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
OTOP3Q7RTS5 MEIS1-AS3-201ENST00000454167 707 ntTSL 4 BASIC24.2■■□□□ 1.46
OTOP3Q7RTS5 NKX2-2-AS1-201ENST00000549659 638 ntTSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
OTOP3Q7RTS5 FAM222B-213ENST00000583522 556 ntTSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
OTOP3Q7RTS5 ZNF365-206ENST00000395255 1674 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
OTOP3Q7RTS5 SYT6-210ENST00000641643 1587 ntBASIC24.2■■□□□ 1.46
OTOP3Q7RTS5 SNX21-204ENST00000372542 1824 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
OTOP3Q7RTS5 MROH6-202ENST00000524906 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.19■■□□□ 1.46
OTOP3Q7RTS5 REST-212ENST00000640343 1352 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
OTOP3Q7RTS5 PCMT1-201ENST00000367378 1293 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
OTOP3Q7RTS5 BAD-203ENST00000394532 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
OTOP3Q7RTS5 ST6GALNAC2-201ENST00000225276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
OTOP3Q7RTS5 AC022211.4-201ENST00000625094 2161 ntBASIC24.19■■□□□ 1.46
OTOP3Q7RTS5 CSNK1E-203ENST00000396832 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
OTOP3Q7RTS5 C7orf25-205ENST00000438029 1743 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
OTOP3Q7RTS5 SRPK3-205ENST00000393786 1900 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
OTOP3Q7RTS5 SAC3D1-201ENST00000398846 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
OTOP3Q7RTS5 AC093249.6-202ENST00000568500 1142 ntTSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
OTOP3Q7RTS5 ARHGDIA-217ENST00000584461 886 ntTSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
OTOP3Q7RTS5 SLC35A3-216ENST00000639221 1032 ntTSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
OTOP3Q7RTS5 SLC6A10P-202ENST00000431994 2058 ntBASIC24.18■■□□□ 1.46
OTOP3Q7RTS5 NREP-202ENST00000379671 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
OTOP3Q7RTS5 FBXL6-202ENST00000455319 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
OTOP3Q7RTS5 FXYD7-201ENST00000270310 712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
OTOP3Q7RTS5 ATP5C1-202ENST00000356708 1163 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
OTOP3Q7RTS5 AC097381.1-201ENST00000429019 1296 ntBASIC24.17■■□□□ 1.46
OTOP3Q7RTS5 PRELID1-203ENST00000503216 1171 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
OTOP3Q7RTS5 IL17RE-203ENST00000421412 2158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
OTOP3Q7RTS5 FNDC4-201ENST00000264703 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
OTOP3Q7RTS5 DYRK2-203ENST00000393555 2209 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
OTOP3Q7RTS5 WFDC1-201ENST00000219454 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
OTOP3Q7RTS5 STOX2-205ENST00000513034 807 ntTSL 3 BASIC24.16■■□□□ 1.46
OTOP3Q7RTS5 FAM124A-201ENST00000280057 2104 ntTSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
OTOP3Q7RTS5 LLGL2-202ENST00000375227 1374 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
OTOP3Q7RTS5 PACS2-201ENST00000325438 3708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
OTOP3Q7RTS5 SLIT1-203ENST00000371041 1695 ntTSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
OTOP3Q7RTS5 PIM3-201ENST00000360612 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
OTOP3Q7RTS5 H1FX-AS1-204ENST00000511998 917 ntTSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
OTOP3Q7RTS5 SCTR-201ENST00000019103 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
OTOP3Q7RTS5 KRT72-201ENST00000293745 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
OTOP3Q7RTS5 CENPH-201ENST00000283006 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
OTOP3Q7RTS5 MFSD5-201ENST00000329548 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
OTOP3Q7RTS5 TRIM14-203ENST00000375098 1792 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.46
OTOP3Q7RTS5 WIPI2-202ENST00000382384 1948 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
OTOP3Q7RTS5 CKB-201ENST00000348956 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
OTOP3Q7RTS5 MIR4767-201ENST00000582827 78 ntBASIC24.14■■□□□ 1.45
OTOP3Q7RTS5 FBXW5-201ENST00000325285 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
OTOP3Q7RTS5 HMCES-204ENST00000502878 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
OTOP3Q7RTS5 SDS-201ENST00000257549 1606 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
OTOP3Q7RTS5 MED17-227ENST00000640521 2047 ntTSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
OTOP3Q7RTS5 CCDC160-201ENST00000370809 1299 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
OTOP3Q7RTS5 MOSPD3-203ENST00000393950 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
OTOP3Q7RTS5 PRSS22-203ENST00000571228 1037 ntTSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
OTOP3Q7RTS5 RASA4CP-201ENST00000424092 1398 ntBASIC24.13■■□□□ 1.45
OTOP3Q7RTS5 ARHGAP29-202ENST00000370217 2043 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
OTOP3Q7RTS5 ZNF837-201ENST00000427624 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
OTOP3Q7RTS5 CDC16-204ENST00000360383 2211 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
OTOP3Q7RTS5 MORF4L1-202ENST00000379535 2274 ntTSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
OTOP3Q7RTS5 CLPSL2-202ENST00000403376 405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
OTOP3Q7RTS5 PTMA-205ENST00000410064 814 ntTSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
OTOP3Q7RTS5 SDHAP1-204ENST00000427415 559 ntTSL 4 BASIC24.12■■□□□ 1.45
OTOP3Q7RTS5 CA15P2-201ENST00000611168 834 ntBASIC24.12■■□□□ 1.45
OTOP3Q7RTS5 FAM220A-206ENST00000616824 2211 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
OTOP3Q7RTS5 E2F5-202ENST00000416274 1728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
OTOP3Q7RTS5 FNTA-201ENST00000302279 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
OTOP3Q7RTS5 NAGS-201ENST00000293404 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
OTOP3Q7RTS5 PINK1-201ENST00000321556 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
OTOP3Q7RTS5 GLI3-203ENST00000437480 451 ntTSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
OTOP3Q7RTS5 HES6-201ENST00000272937 1454 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.6 ms