Protein–RNA interactions for Protein: Q7RTS3

PTF1A, Pancreas transcription factor 1 subunit alpha, humanhuman

Predictions only

Length 328 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTF1AQ7RTS3 PCP4L1-201ENST00000504449 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.97■■■□□ 2.39
PTF1AQ7RTS3 ERN1-208ENST00000606895 2068 ntBASIC29.97■■■□□ 2.39
PTF1AQ7RTS3 YRDC-201ENST00000373044 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.97■■■□□ 2.39
PTF1AQ7RTS3 PRKAR1B-203ENST00000403562 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.97■■■□□ 2.39
PTF1AQ7RTS3 MATK-201ENST00000310132 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.97■■■□□ 2.39
PTF1AQ7RTS3 SNX3-202ENST00000349379 890 ntTSL 2 BASIC29.97■■■□□ 2.39
PTF1AQ7RTS3 HLA-L-209ENST00000420110 1011 ntBASIC29.97■■■□□ 2.39
PTF1AQ7RTS3 AC010336.5-201ENST00000594308 317 ntTSL 3 BASIC29.97■■■□□ 2.39
PTF1AQ7RTS3 ANKS3-203ENST00000450067 2272 ntTSL 5 BASIC29.96■■■□□ 2.39
PTF1AQ7RTS3 NDUFAF8-201ENST00000431388 615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.96■■■□□ 2.39
PTF1AQ7RTS3 ATE1-AS1-201ENST00000437593 951 ntTSL 2 BASIC29.96■■■□□ 2.39
PTF1AQ7RTS3 ATP6V0A2-209ENST00000613625 1620 ntTSL 1 (best) BASIC29.96■■■□□ 2.39
PTF1AQ7RTS3 ZNF503-AS2-202ENST00000466942 1430 ntTSL 2 BASIC29.96■■■□□ 2.39
PTF1AQ7RTS3 WT1-AS-205ENST00000494911 1320 ntTSL 4 BASIC29.96■■■□□ 2.39
PTF1AQ7RTS3 ST3GAL5-231ENST00000639119 2131 ntTSL 5 BASIC29.95■■■□□ 2.39
PTF1AQ7RTS3 MATK-202ENST00000395040 1907 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.95■■■□□ 2.39
PTF1AQ7RTS3 SDS-201ENST00000257549 1606 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.95■■■□□ 2.38
PTF1AQ7RTS3 FAM66E-202ENST00000533615 2087 ntTSL 2 BASIC29.95■■■□□ 2.38
PTF1AQ7RTS3 AC097639.1-201ENST00000565519 1891 ntBASIC29.95■■■□□ 2.38
PTF1AQ7RTS3 POMZP3-202ENST00000310842 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.94■■■□□ 2.38
PTF1AQ7RTS3 GADD45G-202ENST00000375769 977 ntTSL 2 BASIC29.94■■■□□ 2.38
PTF1AQ7RTS3 SRM-201ENST00000376957 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.94■■■□□ 2.38
PTF1AQ7RTS3 IGHV3-20-201ENST00000390606 415 ntAPPRIS P1 BASIC29.94■■■□□ 2.38
PTF1AQ7RTS3 AC010203.1-202ENST00000550096 695 ntTSL 3 BASIC29.94■■■□□ 2.38
PTF1AQ7RTS3 AP001005.4-202ENST00000575325 560 ntTSL 4 BASIC29.94■■■□□ 2.38
PTF1AQ7RTS3 HADH-203ENST00000505878 1719 ntTSL 1 (best) BASIC29.93■■■□□ 2.38
PTF1AQ7RTS3 TRAF4-205ENST00000444415 1456 ntTSL 5 BASIC29.93■■■□□ 2.38
PTF1AQ7RTS3 SOCS1-201ENST00000332029 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.93■■■□□ 2.38
PTF1AQ7RTS3 JARID2-AS1-201ENST00000441978 455 ntTSL 1 (best) BASIC29.93■■■□□ 2.38
PTF1AQ7RTS3 AC005775.1-201ENST00000592413 850 ntTSL 5 BASIC29.93■■■□□ 2.38
PTF1AQ7RTS3 VIM-AS1-202ENST00000605833 918 ntTSL 3 BASIC29.93■■■□□ 2.38
PTF1AQ7RTS3 MIR6084-201ENST00000622012 110 ntBASIC29.93■■■□□ 2.38
PTF1AQ7RTS3 CCDC92-209ENST00000545891 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.92■■■□□ 2.38
PTF1AQ7RTS3 MT2A-201ENST00000245185 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.92■■■□□ 2.38
PTF1AQ7RTS3 ZEB1-AS1-201ENST00000423714 456 ntTSL 3 BASIC29.92■■■□□ 2.38
PTF1AQ7RTS3 CDCP1-202ENST00000425231 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.92■■■□□ 2.38
PTF1AQ7RTS3 AC093817.1-201ENST00000507296 812 ntTSL 3 BASIC29.92■■■□□ 2.38
PTF1AQ7RTS3 HNRNPAB-201ENST00000355836 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.92■■■□□ 2.38
PTF1AQ7RTS3 P2RX4-203ENST00000359949 1836 ntTSL 5 BASIC29.92■■■□□ 2.38
PTF1AQ7RTS3 APOE-201ENST00000252486 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.91■■■□□ 2.38
PTF1AQ7RTS3 AC007009.1-201ENST00000458624 429 ntTSL 2 BASIC29.91■■■□□ 2.38
PTF1AQ7RTS3 EVA1C-201ENST00000300255 1998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.91■■■□□ 2.38
PTF1AQ7RTS3 SPOCK3-221ENST00000512648 1456 ntTSL 1 (best) BASIC29.91■■■□□ 2.38
PTF1AQ7RTS3 TSPY26P-201ENST00000476365 1326 ntBASIC29.91■■■□□ 2.38
PTF1AQ7RTS3 SHF-208ENST00000560734 1731 ntTSL 3 BASIC29.91■■■□□ 2.38
PTF1AQ7RTS3 PHF23-212ENST00000576955 1944 ntTSL 2 BASIC29.9■■■□□ 2.38
PTF1AQ7RTS3 BTBD6-204ENST00000463376 2195 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.9■■■□□ 2.38
PTF1AQ7RTS3 LRRC10B-201ENST00000378075 2219 ntAPPRIS P1 BASIC29.9■■■□□ 2.38
PTF1AQ7RTS3 ARFIP2-205ENST00000525235 852 ntTSL 2 BASIC29.9■■■□□ 2.38
PTF1AQ7RTS3 PEX26-202ENST00000399744 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.9■■■□□ 2.38
PTF1AQ7RTS3 PQLC1-203ENST00000397778 2555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.9■■■□□ 2.38
PTF1AQ7RTS3 CBWD2-203ENST00000416503 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.89■■■□□ 2.38
PTF1AQ7RTS3 MYBL1-201ENST00000517885 1714 ntTSL 5 BASIC29.89■■■□□ 2.38
PTF1AQ7RTS3 NME4-202ENST00000382940 766 ntTSL 3 BASIC29.89■■■□□ 2.38
PTF1AQ7RTS3 MPV17L-202ENST00000396385 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.89■■■□□ 2.38
PTF1AQ7RTS3 MELTF-AS1-202ENST00000415244 951 ntTSL 1 (best) BASIC29.89■■■□□ 2.38
PTF1AQ7RTS3 NME4-211ENST00000620944 1193 ntTSL 2 BASIC29.89■■■□□ 2.38
PTF1AQ7RTS3 ZNHIT2-201ENST00000310597 1306 ntAPPRIS P1 BASIC29.89■■■□□ 2.38
PTF1AQ7RTS3 LINC00454-202ENST00000430978 1327 ntTSL 5 BASIC29.89■■■□□ 2.38
PTF1AQ7RTS3 RCN2-202ENST00000394883 1366 ntTSL 5 BASIC29.89■■■□□ 2.37
PTF1AQ7RTS3 ANKRD53-204ENST00000457410 1671 ntTSL 5 BASIC29.88■■■□□ 2.37
PTF1AQ7RTS3 TMIE-201ENST00000326431 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.88■■■□□ 2.37
PTF1AQ7RTS3 HIST2H2AC-201ENST00000331380 390 ntAPPRIS P1 BASIC29.88■■■□□ 2.37
PTF1AQ7RTS3 CDIPT-210ENST00000570016 1346 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.88■■■□□ 2.37
PTF1AQ7RTS3 SPATA22-214ENST00000575375 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.88■■■□□ 2.37
PTF1AQ7RTS3 SLC25A1-201ENST00000215882 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.87■■■□□ 2.37
PTF1AQ7RTS3 ME3-201ENST00000323418 1068 ntTSL 5 BASIC29.87■■■□□ 2.37
PTF1AQ7RTS3 CCDC92B-201ENST00000575506 885 ntBASIC29.87■■■□□ 2.37
PTF1AQ7RTS3 AC126544.1-201ENST00000580842 1059 ntBASIC29.87■■■□□ 2.37
PTF1AQ7RTS3 TRIM2-212ENST00000632856 656 ntTSL 3 BASIC29.87■■■□□ 2.37
PTF1AQ7RTS3 ESRRA-201ENST00000000442 2215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.86■■■□□ 2.37
PTF1AQ7RTS3 AC027612.3-201ENST00000413684 1047 ntBASIC29.86■■■□□ 2.37
PTF1AQ7RTS3 AC241377.3-202ENST00000626088 1088 ntBASIC29.86■■■□□ 2.37
PTF1AQ7RTS3 AC241585.3-202ENST00000628937 1088 ntBASIC29.86■■■□□ 2.37
PTF1AQ7RTS3 AC245100.8-202ENST00000629247 1058 ntBASIC29.86■■■□□ 2.37
PTF1AQ7RTS3 FLT1-202ENST00000539099 1911 ntTSL 1 (best) BASIC29.86■■■□□ 2.37
PTF1AQ7RTS3 IRF3-227ENST00000600911 1637 ntTSL 5 BASIC29.85■■■□□ 2.37
PTF1AQ7RTS3 TWF2-201ENST00000305533 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.85■■■□□ 2.37
PTF1AQ7RTS3 MROH6-211ENST00000534459 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.85■■■□□ 2.37
PTF1AQ7RTS3 IL15RA-201ENST00000379971 588 ntTSL 3 BASIC29.84■■■□□ 2.37
PTF1AQ7RTS3 GXYLT1P2-201ENST00000433312 1230 ntBASIC29.84■■■□□ 2.37
PTF1AQ7RTS3 AC123595.1-201ENST00000440769 1046 ntBASIC29.84■■■□□ 2.37
PTF1AQ7RTS3 LRRC37A17P-202ENST00000570478 572 ntTSL 4 BASIC29.84■■■□□ 2.37
PTF1AQ7RTS3 NTF6G-201ENST00000591094 616 ntBASIC29.84■■■□□ 2.37
PTF1AQ7RTS3 AC009086.3-201ENST00000623486 1008 ntBASIC29.84■■■□□ 2.37
PTF1AQ7RTS3 HSPBP1-206ENST00000587922 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.84■■■□□ 2.37
PTF1AQ7RTS3 ESRRAP2-201ENST00000418437 1549 ntBASIC29.84■■■□□ 2.37
PTF1AQ7RTS3 MADCAM1-205ENST00000613880 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.84■■■□□ 2.37
PTF1AQ7RTS3 LTB4R2-205ENST00000543919 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.84■■■□□ 2.37
PTF1AQ7RTS3 ST7L-221ENST00000490067 1780 ntTSL 1 (best) BASIC29.84■■■□□ 2.37
PTF1AQ7RTS3 TP53I3-201ENST00000238721 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.83■■■□□ 2.37
PTF1AQ7RTS3 C14orf80-204ENST00000392522 1630 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC29.83■■■□□ 2.37
PTF1AQ7RTS3 MAPKAP1-207ENST00000394060 1586 ntTSL 1 (best) BASIC29.83■■■□□ 2.37
PTF1AQ7RTS3 AL391650.1-201ENST00000448923 1468 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.83■■■□□ 2.37
PTF1AQ7RTS3 SESN3-202ENST00000416495 1408 ntTSL 1 (best) BASIC29.83■■■□□ 2.37
PTF1AQ7RTS3 TAF9-201ENST00000217893 1283 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.83■■■□□ 2.37
PTF1AQ7RTS3 SLC35A2-205ENST00000376529 865 ntTSL 3 BASIC29.83■■■□□ 2.37
PTF1AQ7RTS3 PRDX4-202ENST00000379341 1005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.83■■■□□ 2.37
PTF1AQ7RTS3 AL136090.1-201ENST00000446849 366 ntTSL 3 BASIC29.83■■■□□ 2.37
PTF1AQ7RTS3 SNAI3-AS1-201ENST00000563261 998 ntTSL 1 (best) BASIC29.83■■■□□ 2.37
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.1 ms