Protein–RNA interactions for Protein: Q7L1I2

SV2B, Synaptic vesicle glycoprotein 2B, humanhuman

Predictions only

Length 683 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SV2BQ7L1I2 CDYL-203ENST00000397588 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
SV2BQ7L1I2 TMEM150C-201ENST00000449862 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
SV2BQ7L1I2 TLX1-203ENST00000467928 1838 ntTSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
SV2BQ7L1I2 PARP9-207ENST00000492382 1837 ntTSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
SV2BQ7L1I2 TRAP1-202ENST00000538171 2052 ntTSL 2 BASIC25.56■■□□□ 1.68
SV2BQ7L1I2 ZKSCAN7-206ENST00000431636 1692 ntTSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
SV2BQ7L1I2 AUH-201ENST00000303617 1490 ntTSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
SV2BQ7L1I2 PLEKHB1-201ENST00000227214 2016 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
SV2BQ7L1I2 AC004448.1-201ENST00000458332 883 ntBASIC25.55■■□□□ 1.68
SV2BQ7L1I2 CAPNS1-207ENST00000589146 578 ntTSL 3 BASIC25.55■■□□□ 1.68
SV2BQ7L1I2 MIR663AHG-227ENST00000608084 765 ntTSL 5 BASIC25.55■■□□□ 1.68
SV2BQ7L1I2 CAMK2N1-201ENST00000375078 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
SV2BQ7L1I2 TTC39A-203ENST00000371747 1876 ntTSL 2 BASIC25.55■■□□□ 1.68
SV2BQ7L1I2 VSTM4-201ENST00000298454 2170 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.55■■□□□ 1.68
SV2BQ7L1I2 HORMAD2-201ENST00000336726 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
SV2BQ7L1I2 MADCAM1-206ENST00000617201 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.54■■□□□ 1.68
SV2BQ7L1I2 MADCAM1-207ENST00000619333 1485 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.54■■□□□ 1.68
SV2BQ7L1I2 MADCAM1-210ENST00000622462 1461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.54■■□□□ 1.68
SV2BQ7L1I2 RAB6B-203ENST00000469959 500 ntTSL 3 BASIC25.54■■□□□ 1.68
SV2BQ7L1I2 LINC01925-201ENST00000579492 500 ntTSL 5 BASIC25.54■■□□□ 1.68
SV2BQ7L1I2 CACNG6-203ENST00000352529 1635 ntTSL 5 BASIC25.54■■□□□ 1.68
SV2BQ7L1I2 LINC00092-201ENST00000412122 1726 ntTSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
SV2BQ7L1I2 ANO1-202ENST00000355303 4790 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
SV2BQ7L1I2 MID1IP1-203ENST00000457894 1902 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.53■■□□□ 1.68
SV2BQ7L1I2 FAM57A-202ENST00000308278 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
SV2BQ7L1I2 ALDH1A3-203ENST00000557963 1670 ntBASIC25.53■■□□□ 1.68
SV2BQ7L1I2 NKX2-8-201ENST00000258829 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
SV2BQ7L1I2 TK2-202ENST00000417693 1046 ntTSL 2 BASIC25.53■■□□□ 1.68
SV2BQ7L1I2 LYSMD2-202ENST00000454181 1228 ntTSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
SV2BQ7L1I2 PRR7-204ENST00000510492 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
SV2BQ7L1I2 ATMIN-201ENST00000299575 4884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
SV2BQ7L1I2 ROR1-202ENST00000371080 2305 ntTSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
SV2BQ7L1I2 CAPN10-208ENST00000404753 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.52■■□□□ 1.68
SV2BQ7L1I2 PRSS56-201ENST00000449534 2157 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.52■■□□□ 1.68
SV2BQ7L1I2 PRSS56-203ENST00000617714 2158 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.52■■□□□ 1.68
SV2BQ7L1I2 CLEC14A-201ENST00000342213 2267 ntAPPRIS P1 BASIC25.52■■□□□ 1.68
SV2BQ7L1I2 TRIOBP-203ENST00000403663 2324 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
SV2BQ7L1I2 HACD3-205ENST00000562901 1797 ntTSL 5 BASIC25.52■■□□□ 1.68
SV2BQ7L1I2 AC005551.1-201ENST00000641816 493 ntAPPRIS P1 BASIC25.52■■□□□ 1.68
SV2BQ7L1I2 EI24-204ENST00000527235 1625 ntTSL 5 BASIC25.52■■□□□ 1.68
SV2BQ7L1I2 FJX1-201ENST00000317811 2450 ntAPPRIS P1 BASIC25.52■■□□□ 1.68
SV2BQ7L1I2 DACT3-202ENST00000391916 2834 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.51■■□□□ 1.67
SV2BQ7L1I2 GRK4-202ENST00000398051 2068 ntTSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
SV2BQ7L1I2 LSM7-203ENST00000585409 512 ntTSL 2 BASIC25.51■■□□□ 1.67
SV2BQ7L1I2 AL160276.1-201ENST00000636672 1312 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.51■■□□□ 1.67
SV2BQ7L1I2 COMMD5-201ENST00000305103 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
SV2BQ7L1I2 MED25-211ENST00000617849 1548 ntTSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
SV2BQ7L1I2 SPHK1-210ENST00000592299 1821 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
SV2BQ7L1I2 CPLX1-201ENST00000304062 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
SV2BQ7L1I2 BX664725.1-201ENST00000438252 379 ntBASIC25.5■■□□□ 1.67
SV2BQ7L1I2 AC092849.1-201ENST00000475250 303 ntTSL 4 BASIC25.5■■□□□ 1.67
SV2BQ7L1I2 EIF3J-203ENST00000535391 925 ntTSL 2 BASIC25.5■■□□□ 1.67
SV2BQ7L1I2 KCTD15-207ENST00000589786 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.5■■□□□ 1.67
SV2BQ7L1I2 KLHL26-202ENST00000595182 522 ntTSL 4 BASIC25.5■■□□□ 1.67
SV2BQ7L1I2 BRD3-202ENST00000371834 2529 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
SV2BQ7L1I2 PPP1R1B-201ENST00000254079 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
SV2BQ7L1I2 SPANXA2-OT1-201ENST00000622372 1686 ntTSL 2 BASIC25.49■■□□□ 1.67
SV2BQ7L1I2 ZFYVE19-201ENST00000299173 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
SV2BQ7L1I2 DCAF4-206ENST00000509153 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.49■■□□□ 1.67
SV2BQ7L1I2 HES6-201ENST00000272937 1454 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
SV2BQ7L1I2 NPAS3-206ENST00000548645 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
SV2BQ7L1I2 SENP5-202ENST00000419026 973 ntTSL 3 BASIC25.49■■□□□ 1.67
SV2BQ7L1I2 AL136090.1-201ENST00000446849 366 ntTSL 3 BASIC25.49■■□□□ 1.67
SV2BQ7L1I2 MCRIP1-202ENST00000457257 942 ntTSL 3 BASIC25.49■■□□□ 1.67
SV2BQ7L1I2 RNF146-205ENST00000477776 762 ntTSL 3 BASIC25.49■■□□□ 1.67
SV2BQ7L1I2 AC011448.1-201ENST00000555938 1100 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.49■■□□□ 1.67
SV2BQ7L1I2 TMEM170A-202ENST00000561878 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
SV2BQ7L1I2 AC009163.4-201ENST00000567194 530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.49■■□□□ 1.67
SV2BQ7L1I2 KREMEN2-204ENST00000572045 2339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
SV2BQ7L1I2 DHH-201ENST00000266991 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
SV2BQ7L1I2 CRLF1-201ENST00000392386 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
SV2BQ7L1I2 TMED4-205ENST00000481238 1755 ntTSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
SV2BQ7L1I2 SLC9A3-201ENST00000264938 2584 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
SV2BQ7L1I2 AC021242.3-201ENST00000607598 1377 ntBASIC25.48■■□□□ 1.67
SV2BQ7L1I2 ZFAND5-202ENST00000343431 1073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.48■■□□□ 1.67
SV2BQ7L1I2 LAT-217ENST00000630764 610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.48■■□□□ 1.67
SV2BQ7L1I2 CYP2A13-201ENST00000330436 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
SV2BQ7L1I2 ACSF2-203ENST00000502667 2098 ntTSL 2 BASIC25.48■■□□□ 1.67
SV2BQ7L1I2 GATA4-207ENST00000532059 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
SV2BQ7L1I2 LRIG1-202ENST00000383703 5283 ntTSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
SV2BQ7L1I2 ACOT1-201ENST00000311148 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
SV2BQ7L1I2 PTH1R-207ENST00000449590 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
SV2BQ7L1I2 ZNF180-205ENST00000587047 525 ntTSL 4 BASIC25.47■■□□□ 1.67
SV2BQ7L1I2 LSM7-204ENST00000587502 575 ntTSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
SV2BQ7L1I2 SNX5-217ENST00000606557 1087 ntBASIC25.47■■□□□ 1.67
SV2BQ7L1I2 RAET1E-AS1-203ENST00000606915 1210 ntTSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
SV2BQ7L1I2 IKBIP-202ENST00000342502 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
SV2BQ7L1I2 NIPSNAP2-201ENST00000322090 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
SV2BQ7L1I2 SOHLH1-202ENST00000425225 1411 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.46■■□□□ 1.67
SV2BQ7L1I2 HMGA2-206ENST00000536545 1788 ntTSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
SV2BQ7L1I2 CCDC96-201ENST00000310085 2091 ntAPPRIS P1 BASIC25.46■■□□□ 1.67
SV2BQ7L1I2 IFNGR2-202ENST00000381995 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.46■■□□□ 1.67
SV2BQ7L1I2 EBPL-205ENST00000378284 967 ntTSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
SV2BQ7L1I2 AC026785.2-201ENST00000511821 867 ntTSL 2 BASIC25.46■■□□□ 1.67
SV2BQ7L1I2 TTLL11-202ENST00000373776 2012 ntTSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
SV2BQ7L1I2 ERGIC1-202ENST00000393784 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
SV2BQ7L1I2 PEBP1-201ENST00000261313 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.67
SV2BQ7L1I2 MARCH2-201ENST00000215555 1376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.45■■□□□ 1.67
SV2BQ7L1I2 CTAG1B-201ENST00000328435 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
SV2BQ7L1I2 TMEM170A-206ENST00000569276 609 ntTSL 2 BASIC25.45■■□□□ 1.66
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 160.7 ms