Protein–RNA interactions for Protein: Q71UI9

H2AFV, Histone H2A.V, humanhuman

Predictions only

Length 128 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
H2AFVQ71UI9 RYK-209ENST00000623711 2934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
H2AFVQ71UI9 BFSP1-202ENST00000377873 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
H2AFVQ71UI9 MTMR14-202ENST00000351233 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
H2AFVQ71UI9 AC096541.1-201ENST00000445070 1807 ntTSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
H2AFVQ71UI9 LHX2-201ENST00000373615 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
H2AFVQ71UI9 STOML1-201ENST00000316900 2169 ntTSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
H2AFVQ71UI9 POU2F3-206ENST00000543440 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
H2AFVQ71UI9 SPNS1-207ENST00000565975 1979 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
H2AFVQ71UI9 CRACR2B-202ENST00000525077 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
H2AFVQ71UI9 ECE2-202ENST00000357474 2667 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
H2AFVQ71UI9 DACT1-201ENST00000335867 2571 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
H2AFVQ71UI9 PFDN2-201ENST00000368010 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
H2AFVQ71UI9 AL354928.1-201ENST00000438380 617 ntTSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
H2AFVQ71UI9 AC011551.1-201ENST00000614101 683 ntBASIC24.34■■□□□ 1.49
H2AFVQ71UI9 LYRM1-201ENST00000219168 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
H2AFVQ71UI9 DXO-201ENST00000337523 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
H2AFVQ71UI9 AC004691.2-201ENST00000509504 1531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
H2AFVQ71UI9 SRXN1-201ENST00000381962 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
H2AFVQ71UI9 RBM33-201ENST00000287912 1404 ntTSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
H2AFVQ71UI9 TMEM64-203ENST00000458549 4997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
H2AFVQ71UI9 CDX1-201ENST00000231656 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
H2AFVQ71UI9 MEIOB-202ENST00000397344 1792 ntTSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
H2AFVQ71UI9 TRIM28-202ENST00000341753 2709 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
H2AFVQ71UI9 MYBL1-204ENST00000522677 5192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
H2AFVQ71UI9 KMT2E-AS1-201ENST00000453677 736 ntTSL 3 BASIC24.33■■□□□ 1.49
H2AFVQ71UI9 PTCH1-210ENST00000468211 1254 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
H2AFVQ71UI9 AC139795.1-203ENST00000515045 853 ntTSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.49
H2AFVQ71UI9 AKT1-201ENST00000349310 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
H2AFVQ71UI9 SOX10-201ENST00000360880 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
H2AFVQ71UI9 SOX10-202ENST00000396884 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
H2AFVQ71UI9 SPAG7-205ENST00000573366 1668 ntTSL 3 BASIC24.33■■□□□ 1.49
H2AFVQ71UI9 SPON2-222ENST00000617421 2156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.48
H2AFVQ71UI9 TMEM268-202ENST00000374049 4578 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.48
H2AFVQ71UI9 LRRC34-206ENST00000522526 1899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
H2AFVQ71UI9 USF2-201ENST00000222305 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
H2AFVQ71UI9 DONSON-204ENST00000432378 1618 ntTSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
H2AFVQ71UI9 DMRT2-209ENST00000635183 2190 ntTSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
H2AFVQ71UI9 PKM-201ENST00000319622 2717 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
H2AFVQ71UI9 DNAAF3-203ENST00000524407 2059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
H2AFVQ71UI9 CARMIL1-202ENST00000461945 1290 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
H2AFVQ71UI9 BRD4-212ENST00000630599 726 ntTSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
H2AFVQ71UI9 KLC1-227ENST00000634686 2229 ntTSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
H2AFVQ71UI9 PPP1R1B-201ENST00000254079 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
H2AFVQ71UI9 TMEM185B-201ENST00000426077 2131 ntAPPRIS P1 BASIC24.32■■□□□ 1.48
H2AFVQ71UI9 ST8SIA6-201ENST00000377602 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
H2AFVQ71UI9 CDC16-206ENST00000375310 2156 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
H2AFVQ71UI9 CAMK1-201ENST00000256460 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
H2AFVQ71UI9 FLOT1-201ENST00000376389 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
H2AFVQ71UI9 HAS1-201ENST00000222115 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
H2AFVQ71UI9 DPF1-206ENST00000420980 2227 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
H2AFVQ71UI9 CLEC2L-201ENST00000422142 1359 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC24.31■■□□□ 1.48
H2AFVQ71UI9 PPP1R14A-201ENST00000301242 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
H2AFVQ71UI9 RBM4B-203ENST00000525754 2339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
H2AFVQ71UI9 ABHD17AP5-201ENST00000580133 923 ntBASIC24.31■■□□□ 1.48
H2AFVQ71UI9 AC019171.1-201ENST00000601251 1056 ntBASIC24.31■■□□□ 1.48
H2AFVQ71UI9 AEBP2-204ENST00000398864 5099 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
H2AFVQ71UI9 SLC10A4-201ENST00000273861 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
H2AFVQ71UI9 EGFL8-219ENST00000333845 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
H2AFVQ71UI9 KCTD8-201ENST00000360029 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
H2AFVQ71UI9 HIRA-202ENST00000340170 3395 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
H2AFVQ71UI9 GALR2-201ENST00000329003 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
H2AFVQ71UI9 C5orf49-201ENST00000399810 2385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
H2AFVQ71UI9 LINGO3-201ENST00000585527 2241 ntAPPRIS P1 BASIC24.3■■□□□ 1.48
H2AFVQ71UI9 MDK-206ENST00000407067 1026 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
H2AFVQ71UI9 MRPL38-201ENST00000309352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
H2AFVQ71UI9 AC098864.1-205ENST00000315302 2260 ntTSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
H2AFVQ71UI9 PTGES2-202ENST00000338961 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
H2AFVQ71UI9 FAM162B-201ENST00000368557 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
H2AFVQ71UI9 AL121899.1-202ENST00000411839 536 ntTSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
H2AFVQ71UI9 ERFE-207ENST00000546354 1065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
H2AFVQ71UI9 TNFRSF10B-202ENST00000347739 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
H2AFVQ71UI9 IFNGR2-202ENST00000381995 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
H2AFVQ71UI9 SLC39A4-202ENST00000301305 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
H2AFVQ71UI9 HOMER3-205ENST00000542541 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
H2AFVQ71UI9 MTERF3-201ENST00000287025 1409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
H2AFVQ71UI9 POLDIP2-201ENST00000540200 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
H2AFVQ71UI9 CEBPB-AS1-201ENST00000613921 2648 ntTSL 3 BASIC24.28■■□□□ 1.48
H2AFVQ71UI9 MAGED2-206ENST00000375068 2189 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
H2AFVQ71UI9 AC092068.2-201ENST00000590491 1708 ntBASIC24.28■■□□□ 1.48
H2AFVQ71UI9 LY6H-201ENST00000342752 951 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
H2AFVQ71UI9 OXLD1-201ENST00000374741 620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
H2AFVQ71UI9 LY6H-202ENST00000414417 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
H2AFVQ71UI9 LY6H-203ENST00000430474 925 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC24.28■■□□□ 1.48
H2AFVQ71UI9 MTX2-204ENST00000443241 799 ntTSL 3 BASIC24.28■■□□□ 1.48
H2AFVQ71UI9 AC139795.1-202ENST00000500444 432 ntBASIC24.28■■□□□ 1.48
H2AFVQ71UI9 AC022616.5-201ENST00000518796 181 ntBASIC24.28■■□□□ 1.48
H2AFVQ71UI9 EME2-205ENST00000568449 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
H2AFVQ71UI9 NTF6A-201ENST00000591175 560 ntBASIC24.28■■□□□ 1.48
H2AFVQ71UI9 SPHK1-210ENST00000592299 1821 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
H2AFVQ71UI9 FAM107B-211ENST00000468747 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
H2AFVQ71UI9 AC012123.1-201ENST00000426194 1661 ntTSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
H2AFVQ71UI9 HES6-201ENST00000272937 1454 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
H2AFVQ71UI9 DENND5A-201ENST00000328194 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
H2AFVQ71UI9 AC131274.2-201ENST00000580697 1507 ntBASIC24.27■■□□□ 1.48
H2AFVQ71UI9 GRAMD1A-201ENST00000317991 2695 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
H2AFVQ71UI9 DUX4L18-201ENST00000553347 1267 ntBASIC24.27■■□□□ 1.48
H2AFVQ71UI9 NKX2-1-201ENST00000354822 2191 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
H2AFVQ71UI9 SLC2A8-203ENST00000373371 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
H2AFVQ71UI9 NRL-202ENST00000396997 1517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
H2AFVQ71UI9 ARRDC1-AS1-203ENST00000623970 2210 ntTSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 49.5 ms