Protein–RNA interactions for Protein: Q6ZT12

UBR3, E3 ubiquitin-protein ligase UBR3, humanhuman

Predictions only

Length 1,888 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UBR3Q6ZT12 SRM-201ENST00000376957 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.28■■■□□ 2.28
UBR3Q6ZT12 NMRAL1-202ENST00000404295 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.28■■■□□ 2.28
UBR3Q6ZT12 TSEN15-207ENST00000533373 618 ntTSL 2 BASIC29.28■■■□□ 2.28
UBR3Q6ZT12 AC010501.1-201ENST00000606270 1962 ntBASIC29.28■■■□□ 2.28
UBR3Q6ZT12 CDC16-211ENST00000628084 2058 ntTSL 5 BASIC29.28■■■□□ 2.28
UBR3Q6ZT12 PHF10-202ENST00000366780 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.27■■■□□ 2.28
UBR3Q6ZT12 TESK1-206ENST00000620767 2438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.27■■■□□ 2.28
UBR3Q6ZT12 UHRF2-202ENST00000381373 802 ntTSL 3 BASIC29.27■■■□□ 2.28
UBR3Q6ZT12 RPLP2-207ENST00000530797 637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.27■■■□□ 2.28
UBR3Q6ZT12 RAB43-208ENST00000615093 783 ntTSL 5 BASIC29.27■■■□□ 2.28
UBR3Q6ZT12 EVX1-201ENST00000222761 1500 ntTSL 1 (best) BASIC29.27■■■□□ 2.28
UBR3Q6ZT12 C14orf80-206ENST00000392527 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.27■■■□□ 2.28
UBR3Q6ZT12 ZNF302-209ENST00000507959 854 ntTSL 2 BASIC29.27■■■□□ 2.28
UBR3Q6ZT12 PCP4L1-201ENST00000504449 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.27■■■□□ 2.28
UBR3Q6ZT12 CBWD3-213ENST00000618217 1611 ntTSL 1 (best) BASIC29.26■■■□□ 2.28
UBR3Q6ZT12 MYBL1-201ENST00000517885 1714 ntTSL 5 BASIC29.26■■■□□ 2.27
UBR3Q6ZT12 GP9-201ENST00000307395 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.26■■■□□ 2.27
UBR3Q6ZT12 EIF6-203ENST00000374450 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.26■■■□□ 2.27
UBR3Q6ZT12 SNAI3-AS1-201ENST00000563261 998 ntTSL 1 (best) BASIC29.26■■■□□ 2.27
UBR3Q6ZT12 NKILA-201ENST00000613231 537 ntTSL 4 BASIC29.26■■■□□ 2.27
UBR3Q6ZT12 ACP4-201ENST00000270593 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.26■■■□□ 2.27
UBR3Q6ZT12 TP53I3-201ENST00000238721 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.25■■■□□ 2.27
UBR3Q6ZT12 STK32C-205ENST00000456004 607 ntTSL 2 BASIC29.25■■■□□ 2.27
UBR3Q6ZT12 ANKS3-204ENST00000585773 1946 ntTSL 2 BASIC29.25■■■□□ 2.27
UBR3Q6ZT12 KAT8-206ENST00000543774 1846 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.25■■■□□ 2.27
UBR3Q6ZT12 PXK-201ENST00000302779 1974 ntTSL 1 (best) BASIC29.25■■■□□ 2.27
UBR3Q6ZT12 TRAF4-205ENST00000444415 1456 ntTSL 5 BASIC29.25■■■□□ 2.27
UBR3Q6ZT12 KRTAP5-2-201ENST00000412090 1118 ntAPPRIS P1 BASIC29.25■■■□□ 2.27
UBR3Q6ZT12 AC018413.1-201ENST00000581996 1200 ntTSL 2 BASIC29.25■■■□□ 2.27
UBR3Q6ZT12 EMID1-203ENST00000404820 2118 ntTSL 5 BASIC29.25■■■□□ 2.27
UBR3Q6ZT12 SCARA5-204ENST00000524352 1945 ntTSL 1 (best) BASIC29.24■■■□□ 2.27
UBR3Q6ZT12 EFEMP2-201ENST00000307998 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.24■■■□□ 2.27
UBR3Q6ZT12 GRAMD4P2-201ENST00000423297 1097 ntBASIC29.24■■■□□ 2.27
UBR3Q6ZT12 NEDD4L-225ENST00000589054 1033 ntTSL 3 BASIC29.24■■■□□ 2.27
UBR3Q6ZT12 CCDC92-209ENST00000545891 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.24■■■□□ 2.27
UBR3Q6ZT12 RPL8-201ENST00000262584 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.23■■■□□ 2.27
UBR3Q6ZT12 HES3-201ENST00000377898 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.23■■■□□ 2.27
UBR3Q6ZT12 AP003419.1-201ENST00000535922 470 ntTSL 3 BASIC29.23■■■□□ 2.27
UBR3Q6ZT12 ZNF846-212ENST00000592859 1206 ntTSL 2 BASIC29.23■■■□□ 2.27
UBR3Q6ZT12 WISP2-203ENST00000372868 1600 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC29.23■■■□□ 2.27
UBR3Q6ZT12 CAMK1-201ENST00000256460 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.23■■■□□ 2.27
UBR3Q6ZT12 ZNHIT2-201ENST00000310597 1306 ntAPPRIS P1 BASIC29.23■■■□□ 2.27
UBR3Q6ZT12 TMEM104-205ENST00000582773 1740 ntTSL 2 BASIC29.23■■■□□ 2.27
UBR3Q6ZT12 RCN2-202ENST00000394883 1366 ntTSL 5 BASIC29.23■■■□□ 2.27
UBR3Q6ZT12 CHST13-201ENST00000319340 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.22■■■□□ 2.27
UBR3Q6ZT12 BMP7-204ENST00000450594 1857 ntTSL 2 BASIC29.22■■■□□ 2.27
UBR3Q6ZT12 PYY-201ENST00000360085 1053 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.22■■■□□ 2.27
UBR3Q6ZT12 PPA1-202ENST00000373232 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.22■■■□□ 2.27
UBR3Q6ZT12 AC008443.4-201ENST00000503314 456 ntTSL 4 BASIC29.22■■■□□ 2.27
UBR3Q6ZT12 C1QTNF1-207ENST00000580454 1396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.22■■■□□ 2.27
UBR3Q6ZT12 MAD2L2-201ENST00000235310 1860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.22■■■□□ 2.27
UBR3Q6ZT12 CLK2-203ENST00000368361 2166 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.22■■■□□ 2.27
UBR3Q6ZT12 GNAL-201ENST00000269162 1722 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.22■■■□□ 2.27
UBR3Q6ZT12 HDGFL1-201ENST00000510882 2174 ntAPPRIS P1 BASIC29.21■■■□□ 2.27
UBR3Q6ZT12 DLK2-202ENST00000372485 1572 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC29.21■■■□□ 2.27
UBR3Q6ZT12 C5orf38-201ENST00000334000 890 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.21■■■□□ 2.27
UBR3Q6ZT12 AL161908.1-203ENST00000425370 506 ntTSL 2 BASIC29.21■■■□□ 2.27
UBR3Q6ZT12 AC012414.1-201ENST00000556676 535 ntBASIC29.21■■■□□ 2.27
UBR3Q6ZT12 ZDHHC16-207ENST00000393760 2014 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC29.21■■■□□ 2.27
UBR3Q6ZT12 PSMG1-201ENST00000331573 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.21■■■□□ 2.27
UBR3Q6ZT12 FXYD3-201ENST00000344013 1404 ntTSL 5 BASIC29.21■■■□□ 2.27
UBR3Q6ZT12 ID1-201ENST00000376105 1233 ntBASIC29.21■■■□□ 2.27
UBR3Q6ZT12 FAM219A-202ENST00000379078 770 ntTSL 3 BASIC29.21■■■□□ 2.27
UBR3Q6ZT12 FAM219A-205ENST00000379084 893 ntTSL 5 BASIC29.21■■■□□ 2.27
UBR3Q6ZT12 SPOCK2-203ENST00000412663 1284 ntTSL 5 BASIC29.21■■■□□ 2.27
UBR3Q6ZT12 AC080013.1-202ENST00000465477 674 ntTSL 5 BASIC29.21■■■□□ 2.27
UBR3Q6ZT12 C17orf49-202ENST00000546495 996 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC29.21■■■□□ 2.27
UBR3Q6ZT12 AC010203.1-202ENST00000550096 695 ntTSL 3 BASIC29.21■■■□□ 2.27
UBR3Q6ZT12 PEX11G-203ENST00000593942 1345 ntTSL 5 BASIC29.2■■■□□ 2.27
UBR3Q6ZT12 NDEL1-202ENST00000380025 2181 ntTSL 5 BASIC29.2■■■□□ 2.27
UBR3Q6ZT12 GADD45G-202ENST00000375769 977 ntTSL 2 BASIC29.2■■■□□ 2.26
UBR3Q6ZT12 PRR25-201ENST00000301698 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.19■■■□□ 2.26
UBR3Q6ZT12 SLC25A45-206ENST00000526432 894 ntTSL 1 (best) BASIC29.19■■■□□ 2.26
UBR3Q6ZT12 MIR3181-201ENST00000578512 73 ntBASIC29.19■■■□□ 2.26
UBR3Q6ZT12 AC009086.3-201ENST00000623486 1008 ntBASIC29.19■■■□□ 2.26
UBR3Q6ZT12 HSPBP1-206ENST00000587922 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.19■■■□□ 2.26
UBR3Q6ZT12 ME3-201ENST00000323418 1068 ntTSL 5 BASIC29.19■■■□□ 2.26
UBR3Q6ZT12 CCDC24-201ENST00000372318 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.18■■■□□ 2.26
UBR3Q6ZT12 ELOC-206ENST00000520242 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.18■■■□□ 2.26
UBR3Q6ZT12 IGHV3-20-201ENST00000390606 415 ntAPPRIS P1 BASIC29.18■■■□□ 2.26
UBR3Q6ZT12 JARID2-AS1-201ENST00000441978 455 ntTSL 1 (best) BASIC29.17■■■□□ 2.26
UBR3Q6ZT12 AC024267.6-201ENST00000580603 583 ntTSL 3 BASIC29.17■■■□□ 2.26
UBR3Q6ZT12 BTBD6-201ENST00000327471 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.17■■■□□ 2.26
UBR3Q6ZT12 TSPY26P-201ENST00000476365 1326 ntBASIC29.17■■■□□ 2.26
UBR3Q6ZT12 CBX4-201ENST00000269397 2664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.17■■■□□ 2.26
UBR3Q6ZT12 CSNK1G3-207ENST00000512718 1569 ntTSL 2 BASIC29.17■■■□□ 2.26
UBR3Q6ZT12 RABEP2-203ENST00000544477 1645 ntTSL 2 BASIC29.17■■■□□ 2.26
UBR3Q6ZT12 TRIR-201ENST00000242784 970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.17■■■□□ 2.26
UBR3Q6ZT12 C20orf144-201ENST00000375222 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.17■■■□□ 2.26
UBR3Q6ZT12 DISC1-224ENST00000639374 1071 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.17■■■□□ 2.26
UBR3Q6ZT12 LINC00454-202ENST00000430978 1327 ntTSL 5 BASIC29.16■■■□□ 2.26
UBR3Q6ZT12 CDIPT-210ENST00000570016 1346 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.16■■■□□ 2.26
UBR3Q6ZT12 SERF1A-202ENST00000354833 1889 ntTSL 1 (best) BASIC29.16■■■□□ 2.26
UBR3Q6ZT12 SERF1B-201ENST00000380750 1889 ntTSL 1 (best) BASIC29.16■■■□□ 2.26
UBR3Q6ZT12 TLX3-201ENST00000296921 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.16■■■□□ 2.26
UBR3Q6ZT12 MADCAM1-205ENST00000613880 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.16■■■□□ 2.26
UBR3Q6ZT12 MPC1-202ENST00000360961 962 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC29.16■■■□□ 2.26
UBR3Q6ZT12 YJEFN3-203ENST00000514277 995 ntTSL 1 (best) BASIC29.16■■■□□ 2.26
UBR3Q6ZT12 BIN1-211ENST00000409400 2143 ntTSL 1 (best) BASIC29.16■■■□□ 2.26
UBR3Q6ZT12 USF2-201ENST00000222305 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.15■■■□□ 2.26
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14.4 ms