Protein–RNA interactions for Protein: Q6ZR52

ZNF493, Zinc finger protein 493, humanhuman

Predictions only

Length 646 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZNF493Q6ZR52 SLC35D3-201ENST00000331858 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
ZNF493Q6ZR52 NRG2-201ENST00000289409 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
ZNF493Q6ZR52 EFCC1-201ENST00000436022 2691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.33
ZNF493Q6ZR52 TMEM51-205ENST00000434578 1861 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
ZNF493Q6ZR52 HMX2-201ENST00000339992 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
ZNF493Q6ZR52 KCTD15-207ENST00000589786 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
ZNF493Q6ZR52 RHOBTB3-206ENST00000506817 1432 ntTSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
ZNF493Q6ZR52 FGF22-202ENST00000586042 1288 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
ZNF493Q6ZR52 GRM6-202ENST00000517717 2673 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
ZNF493Q6ZR52 KCNIP1-203ENST00000390656 2249 ntTSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
ZNF493Q6ZR52 CORO1A-201ENST00000219150 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
ZNF493Q6ZR52 KCTD8-201ENST00000360029 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
ZNF493Q6ZR52 SOS2-201ENST00000216373 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
ZNF493Q6ZR52 MPST-203ENST00000401419 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
ZNF493Q6ZR52 AC104002.3-202ENST00000557170 1100 ntTSL 3 BASIC17.07■□□□□ 0.32
ZNF493Q6ZR52 MATK-203ENST00000395045 2073 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
ZNF493Q6ZR52 REPIN1-214ENST00000489432 2058 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
ZNF493Q6ZR52 HAR1A-201ENST00000433161 1882 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
ZNF493Q6ZR52 OSCAR-207ENST00000391761 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
ZNF493Q6ZR52 EP400NL-214ENST00000641289 2402 ntBASIC17.07■□□□□ 0.32
ZNF493Q6ZR52 ZBTB46-202ENST00000302995 2335 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
ZNF493Q6ZR52 AC093323.1-201ENST00000307533 2311 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
ZNF493Q6ZR52 KISS1R-201ENST00000234371 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
ZNF493Q6ZR52 VSTM4-201ENST00000298454 2170 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
ZNF493Q6ZR52 RHOF-203ENST00000537171 1485 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
ZNF493Q6ZR52 DONSON-202ENST00000303113 2028 ntTSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
ZNF493Q6ZR52 SCRT2-201ENST00000246104 3577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
ZNF493Q6ZR52 TTC9-201ENST00000256367 5217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
ZNF493Q6ZR52 TTC39A-203ENST00000371747 1876 ntTSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
ZNF493Q6ZR52 PPP1R14A-201ENST00000301242 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
ZNF493Q6ZR52 TDRKH-206ENST00000440583 2296 ntTSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
ZNF493Q6ZR52 EEF1D-256ENST00000618139 2238 ntTSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
ZNF493Q6ZR52 HHEX-201ENST00000282728 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
ZNF493Q6ZR52 NPHS2-202ENST00000367616 1670 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
ZNF493Q6ZR52 KCNQ5-213ENST00000629977 2830 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
ZNF493Q6ZR52 KRT72-203ENST00000537672 1813 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.05■□□□□ 0.32
ZNF493Q6ZR52 CCR10-201ENST00000332438 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
ZNF493Q6ZR52 STK25-234ENST00000535007 2459 ntTSL 2 BASIC17.05■□□□□ 0.32
ZNF493Q6ZR52 SPAG7-205ENST00000573366 1668 ntTSL 3 BASIC17.05■□□□□ 0.32
ZNF493Q6ZR52 AL354928.1-201ENST00000438380 617 ntTSL 2 BASIC17.05■□□□□ 0.32
ZNF493Q6ZR52 LMAN2-208ENST00000515209 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.05■□□□□ 0.32
ZNF493Q6ZR52 ERFE-207ENST00000546354 1065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
ZNF493Q6ZR52 GADD45A-205ENST00000617962 1142 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
ZNF493Q6ZR52 DUSP22-201ENST00000344450 1485 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
ZNF493Q6ZR52 MFSD7-201ENST00000322224 2123 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
ZNF493Q6ZR52 B3GALT6-201ENST00000379198 2777 ntAPPRIS P1 BASIC17.05■□□□□ 0.32
ZNF493Q6ZR52 NEIL1-206ENST00000564784 2019 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.04■□□□□ 0.32
ZNF493Q6ZR52 ACBD4-214ENST00000591859 1998 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
ZNF493Q6ZR52 B3GNT4-201ENST00000324189 1642 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
ZNF493Q6ZR52 RABL6-204ENST00000371671 1580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
ZNF493Q6ZR52 LTB4R2-205ENST00000543919 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
ZNF493Q6ZR52 YPEL1-202ENST00000403503 466 ntTSL 3 BASIC17.04■□□□□ 0.32
ZNF493Q6ZR52 AC139795.1-203ENST00000515045 853 ntTSL 2 BASIC17.04■□□□□ 0.32
ZNF493Q6ZR52 SNX5-219ENST00000606602 885 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
ZNF493Q6ZR52 MOGS-202ENST00000409065 2668 ntTSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
ZNF493Q6ZR52 ONECUT3-201ENST00000382349 8318 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
ZNF493Q6ZR52 CDC16-203ENST00000356221 2203 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
ZNF493Q6ZR52 FOXO3B-201ENST00000395675 1928 ntBASIC17.04■□□□□ 0.32
ZNF493Q6ZR52 HLA-L-211ENST00000482052 1765 ntBASIC17.03■□□□□ 0.32
ZNF493Q6ZR52 LTK-202ENST00000355166 2940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
ZNF493Q6ZR52 PFKFB3-201ENST00000317350 1999 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
ZNF493Q6ZR52 LY6H-201ENST00000342752 951 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
ZNF493Q6ZR52 AL121899.1-202ENST00000411839 536 ntTSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
ZNF493Q6ZR52 LY6H-202ENST00000414417 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
ZNF493Q6ZR52 LY6H-203ENST00000430474 925 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC17.03■□□□□ 0.32
ZNF493Q6ZR52 AC139795.1-202ENST00000500444 432 ntBASIC17.03■□□□□ 0.32
ZNF493Q6ZR52 OXLD1-203ENST00000571503 803 ntTSL 2 BASIC17.03■□□□□ 0.32
ZNF493Q6ZR52 AC074183.2-201ENST00000623112 922 ntBASIC17.03■□□□□ 0.32
ZNF493Q6ZR52 PCSK6-220ENST00000622483 3132 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
ZNF493Q6ZR52 DHH-201ENST00000266991 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
ZNF493Q6ZR52 ELL3-201ENST00000319359 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
ZNF493Q6ZR52 H2AFY-217ENST00000511689 2789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
ZNF493Q6ZR52 SHISA8-202ENST00000621082 1405 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
ZNF493Q6ZR52 CIDEB-201ENST00000258807 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
ZNF493Q6ZR52 LRRC75A-201ENST00000409083 2656 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.03■□□□□ 0.32
ZNF493Q6ZR52 FKBP8-209ENST00000597960 1781 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
ZNF493Q6ZR52 EGR4-202ENST00000545030 2372 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
ZNF493Q6ZR52 ABHD17B-202ENST00000377041 1312 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
ZNF493Q6ZR52 FKBP1A-211ENST00000618612 1518 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
ZNF493Q6ZR52 TSEN54-201ENST00000333213 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
ZNF493Q6ZR52 MCMBP-202ENST00000369077 2465 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
ZNF493Q6ZR52 C8orf82-202ENST00000524821 2476 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
ZNF493Q6ZR52 MYO10-205ENST00000507288 1677 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
ZNF493Q6ZR52 SMKR1-201ENST00000462322 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
ZNF493Q6ZR52 C16orf95-206ENST00000618367 974 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.32
ZNF493Q6ZR52 RNF39-201ENST00000244360 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
ZNF493Q6ZR52 PRPSAP2-201ENST00000268835 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
ZNF493Q6ZR52 TPRN-202ENST00000409012 2718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
ZNF493Q6ZR52 NIPSNAP2-201ENST00000322090 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
ZNF493Q6ZR52 DOK1-203ENST00000409429 1955 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
ZNF493Q6ZR52 GAS1-201ENST00000298743 2827 ntAPPRIS P1 BASIC17.01■□□□□ 0.31
ZNF493Q6ZR52 FAM83D-201ENST00000619304 2475 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
ZNF493Q6ZR52 CDKN3-202ENST00000335183 893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
ZNF493Q6ZR52 TSPY13P-201ENST00000338964 914 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
ZNF493Q6ZR52 PFDN2-201ENST00000368010 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
ZNF493Q6ZR52 AL592295.1-201ENST00000400984 884 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
ZNF493Q6ZR52 ATP5G2P3-201ENST00000429083 425 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
ZNF493Q6ZR52 MTX2-204ENST00000443241 799 ntTSL 3 BASIC17.01■□□□□ 0.31
ZNF493Q6ZR52 AC019171.1-201ENST00000601251 1056 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
ZNF493Q6ZR52 CDKN3-211ENST00000611205 874 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.9 ms