Protein–RNA interactions for Protein: Q6UWZ7

ABRAXAS1, BRCA1-A complex subunit Abraxas 1, humanhuman

Predictions only

Length 409 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ABRAXAS1Q6UWZ7 DRAP1-201ENST00000312515 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
ABRAXAS1Q6UWZ7 P2RX2-205ENST00000352418 1200 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
ABRAXAS1Q6UWZ7 BIN1-207ENST00000357970 2497 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
ABRAXAS1Q6UWZ7 MOSPD3-204ENST00000424091 1115 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
ABRAXAS1Q6UWZ7 TRAF7-203ENST00000565383 799 ntTSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
ABRAXAS1Q6UWZ7 MTDHP2-201ENST00000601468 714 ntBASIC22.61■■□□□ 1.21
ABRAXAS1Q6UWZ7 EML2-209ENST00000587152 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
ABRAXAS1Q6UWZ7 LSM7-203ENST00000585409 512 ntTSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
ABRAXAS1Q6UWZ7 MMD-201ENST00000262065 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
ABRAXAS1Q6UWZ7 SRPK3-205ENST00000393786 1900 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
ABRAXAS1Q6UWZ7 PXK-201ENST00000302779 1974 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
ABRAXAS1Q6UWZ7 PFKFB4-204ENST00000416568 1575 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
ABRAXAS1Q6UWZ7 DACT1-201ENST00000335867 2571 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
ABRAXAS1Q6UWZ7 SLC30A3-201ENST00000233535 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
ABRAXAS1Q6UWZ7 TMEM218-215ENST00000532407 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
ABRAXAS1Q6UWZ7 DUSP22-214ENST00000605315 867 ntTSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
ABRAXAS1Q6UWZ7 MIR6722-201ENST00000617286 78 ntBASIC22.59■■□□□ 1.21
ABRAXAS1Q6UWZ7 EXOG-217ENST00000630638 197 ntTSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
ABRAXAS1Q6UWZ7 BIN1-206ENST00000352848 2209 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
ABRAXAS1Q6UWZ7 IKBKG-211ENST00000615874 1460 ntTSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
ABRAXAS1Q6UWZ7 IKBKG-215ENST00000619941 1463 ntTSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
ABRAXAS1Q6UWZ7 DYRK3-203ENST00000367109 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
ABRAXAS1Q6UWZ7 GFOD1-204ENST00000603223 2388 ntTSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
ABRAXAS1Q6UWZ7 SH2D3A-202ENST00000437152 2013 ntTSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
ABRAXAS1Q6UWZ7 MEIS3-201ENST00000331559 2104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
ABRAXAS1Q6UWZ7 IRF2BP1-201ENST00000302165 2564 ntAPPRIS P1 BASIC22.58■■□□□ 1.21
ABRAXAS1Q6UWZ7 SLBP-206ENST00000489418 1977 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
ABRAXAS1Q6UWZ7 SUSD3-202ENST00000375472 1195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
ABRAXAS1Q6UWZ7 AC004448.1-201ENST00000458332 883 ntBASIC22.58■■□□□ 1.21
ABRAXAS1Q6UWZ7 CSNK1G3-207ENST00000512718 1569 ntTSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.2
ABRAXAS1Q6UWZ7 CRLF1-201ENST00000392386 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
ABRAXAS1Q6UWZ7 TMEM51-205ENST00000434578 1861 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
ABRAXAS1Q6UWZ7 PYCR1-203ENST00000402252 1346 ntTSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
ABRAXAS1Q6UWZ7 SRXN1-201ENST00000381962 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
ABRAXAS1Q6UWZ7 AL357033.1-201ENST00000370520 1933 ntTSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
ABRAXAS1Q6UWZ7 KRT72-201ENST00000293745 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
ABRAXAS1Q6UWZ7 ARHGEF9-210ENST00000623517 2143 ntTSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
ABRAXAS1Q6UWZ7 LSM4-201ENST00000252816 986 ntTSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
ABRAXAS1Q6UWZ7 PCMTD2-202ENST00000299468 1049 ntTSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
ABRAXAS1Q6UWZ7 MIR6724-1-201ENST00000616420 92 ntBASIC22.57■■□□□ 1.2
ABRAXAS1Q6UWZ7 MIR6724-2-201ENST00000616483 92 ntBASIC22.57■■□□□ 1.2
ABRAXAS1Q6UWZ7 MIR6724-4-201ENST00000617390 92 ntBASIC22.57■■□□□ 1.2
ABRAXAS1Q6UWZ7 MIR6724-3-201ENST00000622482 92 ntBASIC22.57■■□□□ 1.2
ABRAXAS1Q6UWZ7 NBPF26-209ENST00000624419 1133 ntTSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
ABRAXAS1Q6UWZ7 TMEM240-203ENST00000624426 796 ntTSL 3 BASIC22.57■■□□□ 1.2
ABRAXAS1Q6UWZ7 COMMD5-201ENST00000305103 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
ABRAXAS1Q6UWZ7 STEAP2-207ENST00000402625 1372 ntTSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
ABRAXAS1Q6UWZ7 RFC2-201ENST00000055077 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
ABRAXAS1Q6UWZ7 CCZ1B-201ENST00000316731 2885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
ABRAXAS1Q6UWZ7 LRIG1-202ENST00000383703 5283 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
ABRAXAS1Q6UWZ7 PNCK-215ENST00000447676 1585 ntTSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
ABRAXAS1Q6UWZ7 CCDC24-201ENST00000372318 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
ABRAXAS1Q6UWZ7 BSPRY-201ENST00000374183 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
ABRAXAS1Q6UWZ7 FZD8-201ENST00000374694 4030 ntAPPRIS P1 BASIC22.56■■□□□ 1.2
ABRAXAS1Q6UWZ7 TSPAN17-204ENST00000503045 1019 ntTSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
ABRAXAS1Q6UWZ7 CCER2-201ENST00000571838 1057 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
ABRAXAS1Q6UWZ7 ZNF503-AS2-201ENST00000425916 2026 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
ABRAXAS1Q6UWZ7 TSEN54-201ENST00000333213 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
ABRAXAS1Q6UWZ7 WRNIP1-205ENST00000618555 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
ABRAXAS1Q6UWZ7 DNAJB11-201ENST00000265028 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
ABRAXAS1Q6UWZ7 AP003733.4-201ENST00000623785 1697 ntBASIC22.55■■□□□ 1.2
ABRAXAS1Q6UWZ7 C7orf49-203ENST00000430372 1579 ntTSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
ABRAXAS1Q6UWZ7 HNRNPAB-208ENST00000515193 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
ABRAXAS1Q6UWZ7 ARMC6-201ENST00000269932 2412 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
ABRAXAS1Q6UWZ7 DNAJC4-202ENST00000321685 1288 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
ABRAXAS1Q6UWZ7 TRIM7-202ENST00000334421 1228 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
ABRAXAS1Q6UWZ7 TMEM170A-206ENST00000569276 609 ntTSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
ABRAXAS1Q6UWZ7 DNAJC4-212ENST00000628077 938 ntTSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
ABRAXAS1Q6UWZ7 LSR-204ENST00000361790 2210 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
ABRAXAS1Q6UWZ7 ZNF837-201ENST00000427624 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
ABRAXAS1Q6UWZ7 AC138932.3-201ENST00000567634 1902 ntBASIC22.55■■□□□ 1.2
ABRAXAS1Q6UWZ7 PTRH1-205ENST00000423807 1570 ntTSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
ABRAXAS1Q6UWZ7 ATMIN-201ENST00000299575 4884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
ABRAXAS1Q6UWZ7 SLC22A18-201ENST00000312221 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
ABRAXAS1Q6UWZ7 NAB1-202ENST00000409581 2360 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
ABRAXAS1Q6UWZ7 AC004691.2-201ENST00000509504 1531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
ABRAXAS1Q6UWZ7 AC131274.2-201ENST00000580697 1507 ntBASIC22.54■■□□□ 1.2
ABRAXAS1Q6UWZ7 SUMF1-205ENST00000458465 1102 ntTSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
ABRAXAS1Q6UWZ7 SLC16A10-206ENST00000612036 1231 ntTSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
ABRAXAS1Q6UWZ7 BTBD6-201ENST00000327471 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
ABRAXAS1Q6UWZ7 FEZ2-203ENST00000379245 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
ABRAXAS1Q6UWZ7 PRDM13-202ENST00000369215 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
ABRAXAS1Q6UWZ7 RARA-204ENST00000394089 2024 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
ABRAXAS1Q6UWZ7 ROR1-202ENST00000371080 2305 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
ABRAXAS1Q6UWZ7 C4orf19-202ENST00000381980 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
ABRAXAS1Q6UWZ7 AC243829.1-202ENST00000618848 486 ntTSL 3 BASIC22.53■■□□□ 1.2
ABRAXAS1Q6UWZ7 POU2F2-215ENST00000560398 1788 ntTSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
ABRAXAS1Q6UWZ7 DGCR6-208ENST00000608842 1837 ntTSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
ABRAXAS1Q6UWZ7 ADIPOR1-201ENST00000340990 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
ABRAXAS1Q6UWZ7 MRPL10-202ENST00000351111 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
ABRAXAS1Q6UWZ7 STK32C-205ENST00000456004 607 ntTSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
ABRAXAS1Q6UWZ7 CLTA-206ENST00000466396 695 ntTSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
ABRAXAS1Q6UWZ7 ERRFI1-203ENST00000469499 995 ntTSL 3 BASIC22.52■■□□□ 1.2
ABRAXAS1Q6UWZ7 ARPC4-208ENST00000498623 942 ntTSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
ABRAXAS1Q6UWZ7 SNHG12-212ENST00000531126 719 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
ABRAXAS1Q6UWZ7 WNT11-201ENST00000322563 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
ABRAXAS1Q6UWZ7 EPS8L1-205ENST00000586329 2130 ntTSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
ABRAXAS1Q6UWZ7 CAMK1-201ENST00000256460 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
ABRAXAS1Q6UWZ7 MYO10-205ENST00000507288 1677 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
ABRAXAS1Q6UWZ7 FAM181A-204ENST00000557000 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.8 ms