Protein–RNA interactions for Protein: Q6UWJ1

TMCO3, Transmembrane and coiled-coil domain-containing protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 677 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMCO3Q6UWJ1 PTPRJ-201ENST00000418331 5122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
TMCO3Q6UWJ1 RNF39-201ENST00000244360 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
TMCO3Q6UWJ1 RABEP2-201ENST00000357573 2175 ntTSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
TMCO3Q6UWJ1 EGR4-202ENST00000545030 2372 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
TMCO3Q6UWJ1 DNAJB11-201ENST00000265028 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
TMCO3Q6UWJ1 NEK6-214ENST00000545174 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
TMCO3Q6UWJ1 MEIS3-204ENST00000558555 1715 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.62■■□□□ 1.53
TMCO3Q6UWJ1 AC016910.1-201ENST00000422799 1046 ntTSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
TMCO3Q6UWJ1 RASGEF1B-211ENST00000514050 537 ntTSL 2 BASIC24.62■■□□□ 1.53
TMCO3Q6UWJ1 WNT11-201ENST00000322563 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
TMCO3Q6UWJ1 TMEM259-201ENST00000333175 2581 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
TMCO3Q6UWJ1 DNM2-205ENST00000585892 2774 ntTSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
TMCO3Q6UWJ1 B3GNT6-202ENST00000622824 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
TMCO3Q6UWJ1 TMEM200B-201ENST00000420504 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
TMCO3Q6UWJ1 CCR10-203ENST00000591765 1942 ntTSL 3 BASIC24.61■■□□□ 1.53
TMCO3Q6UWJ1 DDN-AS1-202ENST00000547866 2114 ntTSL 3 BASIC24.61■■□□□ 1.53
TMCO3Q6UWJ1 AQP10-201ENST00000324978 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
TMCO3Q6UWJ1 DONSON-202ENST00000303113 2028 ntTSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
TMCO3Q6UWJ1 GSN-204ENST00000373818 2657 ntTSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
TMCO3Q6UWJ1 FAM72A-202ENST00000367128 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
TMCO3Q6UWJ1 FAM72D-201ENST00000400889 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
TMCO3Q6UWJ1 ARRDC1-AS1-203ENST00000623970 2210 ntTSL 5 BASIC24.6■■□□□ 1.53
TMCO3Q6UWJ1 NKX6-2-201ENST00000368592 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
TMCO3Q6UWJ1 CCDC47-204ENST00000582252 1719 ntTSL 2 BASIC24.6■■□□□ 1.53
TMCO3Q6UWJ1 DPF1-217ENST00000614244 2356 ntTSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
TMCO3Q6UWJ1 SLC22A17-201ENST00000206544 2284 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
TMCO3Q6UWJ1 TSEN15-201ENST00000361641 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
TMCO3Q6UWJ1 RNF40-201ENST00000324685 5634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
TMCO3Q6UWJ1 IL15RA-214ENST00000525219 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
TMCO3Q6UWJ1 PKD1P6-201ENST00000343738 4769 ntBASIC24.59■■□□□ 1.53
TMCO3Q6UWJ1 FAM83D-201ENST00000619304 2475 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
TMCO3Q6UWJ1 DLEU2-208ENST00000621282 3068 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
TMCO3Q6UWJ1 MPC1-201ENST00000341756 976 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
TMCO3Q6UWJ1 MPC1-206ENST00000621630 977 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
TMCO3Q6UWJ1 MPC1-207ENST00000621685 1192 ntTSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
TMCO3Q6UWJ1 GNAS-AS1_1.1-201ENST00000621898 103 ntBASIC24.59■■□□□ 1.53
TMCO3Q6UWJ1 HAR1A-201ENST00000433161 1882 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
TMCO3Q6UWJ1 SARDH-203ENST00000371868 2266 ntTSL 2 BASIC24.59■■□□□ 1.53
TMCO3Q6UWJ1 SHD-204ENST00000599689 1729 ntTSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.53
TMCO3Q6UWJ1 HTRA2-201ENST00000258080 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
TMCO3Q6UWJ1 SYT7-202ENST00000535826 1621 ntTSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.53
TMCO3Q6UWJ1 KRT18P10-201ENST00000388836 1287 ntBASIC24.58■■□□□ 1.53
TMCO3Q6UWJ1 SOCS2-202ENST00000536696 1065 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.58■■□□□ 1.53
TMCO3Q6UWJ1 UBE2E3-213ENST00000602959 909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.53
TMCO3Q6UWJ1 AKT1S1-204ENST00000391832 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
TMCO3Q6UWJ1 ALDH16A1-202ENST00000455361 2470 ntTSL 2 BASIC24.58■■□□□ 1.53
TMCO3Q6UWJ1 VGLL2-201ENST00000326274 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.52
TMCO3Q6UWJ1 ADD1-202ENST00000355842 4743 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
TMCO3Q6UWJ1 TSEN54-201ENST00000333213 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
TMCO3Q6UWJ1 RBFA-201ENST00000262197 1219 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
TMCO3Q6UWJ1 ZNF843-201ENST00000315678 2137 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.57■■□□□ 1.52
TMCO3Q6UWJ1 C20orf24-201ENST00000342422 896 ntTSL 2 BASIC24.57■■□□□ 1.52
TMCO3Q6UWJ1 C20orf24-202ENST00000344795 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
TMCO3Q6UWJ1 AL590677.1-201ENST00000438431 380 ntTSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
TMCO3Q6UWJ1 MLST8-219ENST00000565250 1588 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC24.57■■□□□ 1.52
TMCO3Q6UWJ1 ATP13A2-215ENST00000617114 1723 ntTSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
TMCO3Q6UWJ1 P4HA3-202ENST00000427714 2248 ntTSL 2 BASIC24.57■■□□□ 1.52
TMCO3Q6UWJ1 TEAD1-206ENST00000527636 2544 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
TMCO3Q6UWJ1 ASAP2-201ENST00000281419 5712 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
TMCO3Q6UWJ1 KCNIP2-206ENST00000356640 1989 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
TMCO3Q6UWJ1 SLC35B2-201ENST00000393810 1898 ntTSL 2 BASIC24.56■■□□□ 1.52
TMCO3Q6UWJ1 FAM159A-204ENST00000517870 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
TMCO3Q6UWJ1 FAM222B-205ENST00000577682 549 ntTSL 4 BASIC24.56■■□□□ 1.52
TMCO3Q6UWJ1 SMOX-203ENST00000339123 2074 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
TMCO3Q6UWJ1 FOXK2-201ENST00000335255 5265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
TMCO3Q6UWJ1 KLF9-201ENST00000377126 5175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
TMCO3Q6UWJ1 PNCK-204ENST00000370150 1612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
TMCO3Q6UWJ1 PLEKHA8-208ENST00000622102 2140 ntTSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
TMCO3Q6UWJ1 CORO1A-201ENST00000219150 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
TMCO3Q6UWJ1 MAF-202ENST00000393350 6384 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.56■■□□□ 1.52
TMCO3Q6UWJ1 AKT2-234ENST00000579047 2029 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
TMCO3Q6UWJ1 HRK-201ENST00000257572 5789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
TMCO3Q6UWJ1 ZNF784-202ENST00000591479 1559 ntTSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
TMCO3Q6UWJ1 CDH23-206ENST00000398842 1759 ntTSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
TMCO3Q6UWJ1 NRXN2-205ENST00000409571 6381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
TMCO3Q6UWJ1 CCNJL-201ENST00000257536 1848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.55■■□□□ 1.52
TMCO3Q6UWJ1 CSNK1G2-201ENST00000255641 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
TMCO3Q6UWJ1 SRPK3-204ENST00000370108 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
TMCO3Q6UWJ1 GAS2L1-201ENST00000406549 1803 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
TMCO3Q6UWJ1 PARL-202ENST00000317096 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
TMCO3Q6UWJ1 PRODH-203ENST00000357068 2462 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
TMCO3Q6UWJ1 ANXA8-204ENST00000583911 1874 ntTSL 2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
TMCO3Q6UWJ1 PTCH1-210ENST00000468211 1254 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
TMCO3Q6UWJ1 TRIM52-AS1-202ENST00000507434 672 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
TMCO3Q6UWJ1 AC018755.3-202ENST00000596210 929 ntBASIC24.54■■□□□ 1.52
TMCO3Q6UWJ1 ARSB-201ENST00000264914 5327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
TMCO3Q6UWJ1 EYA2-203ENST00000357410 2465 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
TMCO3Q6UWJ1 CEND1-201ENST00000330106 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
TMCO3Q6UWJ1 ITGB1BP1-203ENST00000359712 2126 ntTSL 2 BASIC24.53■■□□□ 1.52
TMCO3Q6UWJ1 KRT18P60-201ENST00000312876 1297 ntBASIC24.53■■□□□ 1.52
TMCO3Q6UWJ1 SPCS2P3-201ENST00000500401 656 ntBASIC24.53■■□□□ 1.52
TMCO3Q6UWJ1 NTF6A-201ENST00000591175 560 ntBASIC24.53■■□□□ 1.52
TMCO3Q6UWJ1 NHLRC4-202ENST00000540585 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
TMCO3Q6UWJ1 FBXL6-202ENST00000455319 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
TMCO3Q6UWJ1 GNA11-201ENST00000078429 4147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
TMCO3Q6UWJ1 PNMA6A-201ENST00000421798 2209 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
TMCO3Q6UWJ1 LETM1-201ENST00000302787 5462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
TMCO3Q6UWJ1 KDM3B-201ENST00000314358 6813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
TMCO3Q6UWJ1 NAT14-201ENST00000205194 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
TMCO3Q6UWJ1 RRAS2-201ENST00000256196 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.6 ms