Protein–RNA interactions for Protein: Q6UWD8

C16orf54, Transmembrane protein C16orf54, humanhuman

Predictions only

Length 224 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C16orf54Q6UWD8 KLC1-201ENST00000246489 2294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
C16orf54Q6UWD8 KLC1-224ENST00000557450 2265 ntTSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
C16orf54Q6UWD8 SLC9A3-203ENST00000514375 2504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
C16orf54Q6UWD8 CDKN3-202ENST00000335183 893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
C16orf54Q6UWD8 TSPY13P-201ENST00000338964 914 ntBASIC17.6■□□□□ 0.41
C16orf54Q6UWD8 FKBP1B-202ENST00000380991 1010 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
C16orf54Q6UWD8 PYY2-202ENST00000441253 1076 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
C16orf54Q6UWD8 CDKN3-211ENST00000611205 874 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
C16orf54Q6UWD8 EGFL8-219ENST00000333845 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
C16orf54Q6UWD8 ARL6IP4-210ENST00000453766 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
C16orf54Q6UWD8 MAGI2-208ENST00000522391 4878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
C16orf54Q6UWD8 FKBP8-209ENST00000597960 1781 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
C16orf54Q6UWD8 ARFIP2-202ENST00000396777 1868 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
C16orf54Q6UWD8 ZNF205-201ENST00000219091 1947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
C16orf54Q6UWD8 MAP6D1-201ENST00000318631 2111 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
C16orf54Q6UWD8 ZFP91-CNTF-201ENST00000389919 2319 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
C16orf54Q6UWD8 ME2-208ENST00000638937 2471 ntTSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
C16orf54Q6UWD8 AMZ2P1-201ENST00000397713 2259 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
C16orf54Q6UWD8 USF3-203ENST00000491165 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
C16orf54Q6UWD8 DOHH-201ENST00000427575 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
C16orf54Q6UWD8 WFDC1-201ENST00000219454 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
C16orf54Q6UWD8 MRPL4-207ENST00000590669 1423 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
C16orf54Q6UWD8 FAM162B-201ENST00000368557 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
C16orf54Q6UWD8 TBX2-AS1-203ENST00000590421 861 ntTSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
C16orf54Q6UWD8 SSX2IP-209ENST00000603677 1149 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
C16orf54Q6UWD8 PPP2R2D-201ENST00000455566 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
C16orf54Q6UWD8 SYNDIG1-201ENST00000376862 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
C16orf54Q6UWD8 PNKP-201ENST00000322344 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
C16orf54Q6UWD8 CDIPT-207ENST00000566113 1671 ntTSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.41
C16orf54Q6UWD8 C14orf80-204ENST00000392522 1630 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.41
C16orf54Q6UWD8 ZNF174-202ENST00000344823 1557 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
C16orf54Q6UWD8 CLEC2L-201ENST00000422142 1359 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC17.58■□□□□ 0.4
C16orf54Q6UWD8 STRBP-202ENST00000360998 2990 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
C16orf54Q6UWD8 IDNK-201ENST00000376417 511 ntTSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.4
C16orf54Q6UWD8 IDNK-202ENST00000376419 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
C16orf54Q6UWD8 CD63-202ENST00000420846 981 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.4
C16orf54Q6UWD8 GPRC5B-202ENST00000535671 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
C16orf54Q6UWD8 PXK-201ENST00000302779 1974 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
C16orf54Q6UWD8 OSCAR-205ENST00000359649 1892 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.4
C16orf54Q6UWD8 CDK11B-201ENST00000340677 2534 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
C16orf54Q6UWD8 SLC35A2-201ENST00000247138 1672 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
C16orf54Q6UWD8 ANO1-202ENST00000355303 4790 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
C16orf54Q6UWD8 HSPBP1-202ENST00000433386 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
C16orf54Q6UWD8 HSD11B1L-206ENST00000423665 1525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
C16orf54Q6UWD8 PCYT2-201ENST00000331285 2147 ntTSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
C16orf54Q6UWD8 KMT5B-203ENST00000401547 2666 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
C16orf54Q6UWD8 SERINC5-203ENST00000509193 1441 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
C16orf54Q6UWD8 INPP1-201ENST00000322522 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
C16orf54Q6UWD8 BTBD6-201ENST00000327471 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
C16orf54Q6UWD8 EGFL8-220ENST00000395512 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
C16orf54Q6UWD8 CLDN5-201ENST00000403084 2357 ntBASIC17.57■□□□□ 0.4
C16orf54Q6UWD8 CBWD2-201ENST00000259199 1812 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
C16orf54Q6UWD8 CST6-201ENST00000312134 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
C16orf54Q6UWD8 CDCA5-202ENST00000404147 1012 ntTSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
C16orf54Q6UWD8 ELOC-207ENST00000522337 816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
C16orf54Q6UWD8 SEPT2-205ENST00000401990 1734 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
C16orf54Q6UWD8 C1QTNF1-201ENST00000311661 2624 ntTSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
C16orf54Q6UWD8 ATMIN-201ENST00000299575 4884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
C16orf54Q6UWD8 GRK4-202ENST00000398051 2068 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
C16orf54Q6UWD8 CRACR2B-202ENST00000525077 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
C16orf54Q6UWD8 CCDC24-201ENST00000372318 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
C16orf54Q6UWD8 AL161729.1-201ENST00000604104 1402 ntBASIC17.56■□□□□ 0.4
C16orf54Q6UWD8 KLC3-201ENST00000391946 1780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
C16orf54Q6UWD8 AC099805.1-201ENST00000523987 1797 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
C16orf54Q6UWD8 C5orf38-202ENST00000397835 681 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
C16orf54Q6UWD8 AC005540.1-201ENST00000413911 919 ntTSL 3 BASIC17.56■□□□□ 0.4
C16orf54Q6UWD8 H2AFY-204ENST00000423969 924 ntTSL 2 BASIC17.56■□□□□ 0.4
C16orf54Q6UWD8 SPNS1-207ENST00000565975 1979 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
C16orf54Q6UWD8 ABCB10P4-201ENST00000566803 2184 ntBASIC17.56■□□□□ 0.4
C16orf54Q6UWD8 POLR2H-208ENST00000456318 1802 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
C16orf54Q6UWD8 TCF3-203ENST00000395423 2779 ntTSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
C16orf54Q6UWD8 PNLIPRP2-205ENST00000611850 1407 ntTSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
C16orf54Q6UWD8 MRPL10-202ENST00000351111 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
C16orf54Q6UWD8 NDEL1-219ENST00000585098 454 ntTSL 3 BASIC17.55■□□□□ 0.4
C16orf54Q6UWD8 AC012354.3-201ENST00000623734 483 ntBASIC17.55■□□□□ 0.4
C16orf54Q6UWD8 CIRBP-216ENST00000588090 1459 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC17.55■□□□□ 0.4
C16orf54Q6UWD8 ASRGL1-202ENST00000415229 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
C16orf54Q6UWD8 HOXA10-201ENST00000283921 2541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
C16orf54Q6UWD8 AFDN-AS1-201ENST00000359760 2238 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
C16orf54Q6UWD8 TERF2-201ENST00000254942 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
C16orf54Q6UWD8 CCDC151-203ENST00000591179 1943 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
C16orf54Q6UWD8 CAMK2N1-201ENST00000375078 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
C16orf54Q6UWD8 TRIM72-202ENST00000613872 1573 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
C16orf54Q6UWD8 TBL1X-201ENST00000217964 5871 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
C16orf54Q6UWD8 RUNDC3A-202ENST00000426726 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
C16orf54Q6UWD8 LINGO3-201ENST00000585527 2241 ntAPPRIS P1 BASIC17.54■□□□□ 0.4
C16orf54Q6UWD8 NFE2L3P1-201ENST00000588207 1959 ntBASIC17.54■□□□□ 0.4
C16orf54Q6UWD8 GUK1-208ENST00000366728 842 ntTSL 2 BASIC17.54■□□□□ 0.4
C16orf54Q6UWD8 ZSCAN1-202ENST00000391700 952 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
C16orf54Q6UWD8 ATXN3-252ENST00000620536 1044 ntTSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
C16orf54Q6UWD8 ATXN3-253ENST00000621269 936 ntTSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
C16orf54Q6UWD8 LRIG1-202ENST00000383703 5283 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
C16orf54Q6UWD8 NHLH1-201ENST00000302101 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
C16orf54Q6UWD8 DMRT2-209ENST00000635183 2190 ntTSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
C16orf54Q6UWD8 ECE2-202ENST00000357474 2667 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
C16orf54Q6UWD8 R3HCC1-202ENST00000411463 1467 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
C16orf54Q6UWD8 SDHAF1-201ENST00000378887 1117 ntAPPRIS P1 BASIC17.53■□□□□ 0.4
C16orf54Q6UWD8 CT47A7-201ENST00000434883 1288 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.53■□□□□ 0.4
C16orf54Q6UWD8 MMP25-AS1-209ENST00000576250 779 ntTSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
C16orf54Q6UWD8 AC010980.1-201ENST00000587192 1142 ntBASIC17.53■□□□□ 0.4
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14.5 ms