Protein–RNA interactions for Protein: Q6UVM3

KCNT2, Potassium channel subfamily T member 2, humanhuman

Predictions only

Length 1,135 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KCNT2Q6UVM3 PRELID1-203ENST00000503216 1171 ntTSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
KCNT2Q6UVM3 SNHG12-212ENST00000531126 719 ntTSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
KCNT2Q6UVM3 ARHGDIA-217ENST00000584461 886 ntTSL 2 BASIC24.76■■□□□ 1.55
KCNT2Q6UVM3 TANGO2-204ENST00000401833 1920 ntTSL 5 BASIC24.76■■□□□ 1.55
KCNT2Q6UVM3 EIF6-201ENST00000374436 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
KCNT2Q6UVM3 AC026271.2-201ENST00000428091 497 ntBASIC24.75■■□□□ 1.55
KCNT2Q6UVM3 GRAMD4P4-201ENST00000613563 1115 ntBASIC24.75■■□□□ 1.55
KCNT2Q6UVM3 AL136967.2-201ENST00000623968 743 ntBASIC24.75■■□□□ 1.55
KCNT2Q6UVM3 ATG16L2-201ENST00000321297 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
KCNT2Q6UVM3 OSCAR-203ENST00000356532 1355 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
KCNT2Q6UVM3 OSCAR-204ENST00000358375 1389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
KCNT2Q6UVM3 OSCAR-210ENST00000616447 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
KCNT2Q6UVM3 HES6-201ENST00000272937 1454 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
KCNT2Q6UVM3 CHSY1-201ENST00000254190 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
KCNT2Q6UVM3 RRAS2-201ENST00000256196 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
KCNT2Q6UVM3 GTF2IP1-204ENST00000616377 2632 ntTSL 2 BASIC24.75■■□□□ 1.55
KCNT2Q6UVM3 RARA-AS1-201ENST00000581080 1790 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
KCNT2Q6UVM3 OTUD5-201ENST00000156084 2740 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
KCNT2Q6UVM3 AP2S1-201ENST00000263270 935 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
KCNT2Q6UVM3 SDHAP1-204ENST00000427415 559 ntTSL 4 BASIC24.74■■□□□ 1.55
KCNT2Q6UVM3 ACBD4-216ENST00000619916 1276 ntTSL 5 BASIC24.74■■□□□ 1.55
KCNT2Q6UVM3 SF1-220ENST00000626028 704 ntTSL 2 BASIC24.74■■□□□ 1.55
KCNT2Q6UVM3 CCDC107-205ENST00000421582 1324 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.74■■□□□ 1.55
KCNT2Q6UVM3 RRP9-201ENST00000232888 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
KCNT2Q6UVM3 MBOAT7-201ENST00000245615 2529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
KCNT2Q6UVM3 EZH2-206ENST00000478654 2522 ntTSL 5 BASIC24.74■■□□□ 1.55
KCNT2Q6UVM3 PTPMT1-205ENST00000534775 1611 ntTSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
KCNT2Q6UVM3 SDSL-201ENST00000345635 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
KCNT2Q6UVM3 PRADC1-201ENST00000258083 1083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
KCNT2Q6UVM3 FAIM-203ENST00000393034 927 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.73■■□□□ 1.55
KCNT2Q6UVM3 SERGEF-219ENST00000532265 1124 ntTSL 2 BASIC24.73■■□□□ 1.55
KCNT2Q6UVM3 AF213884.3-201ENST00000563833 479 ntBASIC24.73■■□□□ 1.55
KCNT2Q6UVM3 PORCN-203ENST00000359882 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
KCNT2Q6UVM3 SYT6-210ENST00000641643 1587 ntBASIC24.72■■□□□ 1.55
KCNT2Q6UVM3 CLPSL2-202ENST00000403376 405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
KCNT2Q6UVM3 AC105265.2-201ENST00000467189 838 ntBASIC24.72■■□□□ 1.55
KCNT2Q6UVM3 BAG1-212ENST00000641048 1038 ntAPPRIS P3 BASIC24.72■■□□□ 1.55
KCNT2Q6UVM3 ZNF598-202ENST00000562103 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
KCNT2Q6UVM3 SLC6A10P-202ENST00000431994 2058 ntBASIC24.71■■□□□ 1.55
KCNT2Q6UVM3 CDK9-201ENST00000373264 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
KCNT2Q6UVM3 APOE-201ENST00000252486 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
KCNT2Q6UVM3 CROT-202ENST00000412227 1213 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
KCNT2Q6UVM3 STK32C-205ENST00000456004 607 ntTSL 2 BASIC24.71■■□□□ 1.55
KCNT2Q6UVM3 ZNF264-206ENST00000600531 774 ntTSL 2 BASIC24.71■■□□□ 1.55
KCNT2Q6UVM3 AC092171.4-201ENST00000609130 632 ntBASIC24.71■■□□□ 1.55
KCNT2Q6UVM3 CNN3-202ENST00000394202 1974 ntTSL 2 BASIC24.71■■□□□ 1.55
KCNT2Q6UVM3 ARL6IP4-210ENST00000453766 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.55
KCNT2Q6UVM3 ARHGEF35-201ENST00000378115 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
KCNT2Q6UVM3 MIR939-201ENST00000401314 82 ntBASIC24.7■■□□□ 1.54
KCNT2Q6UVM3 GJD3-201ENST00000578689 885 ntAPPRIS P1 BASIC24.7■■□□□ 1.54
KCNT2Q6UVM3 SLC35A3-216ENST00000639221 1032 ntTSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.54
KCNT2Q6UVM3 PXK-201ENST00000302779 1974 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
KCNT2Q6UVM3 PGR-AS1-202ENST00000632820 1545 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
KCNT2Q6UVM3 CEBPA-AS1-201ENST00000592982 2198 ntBASIC24.7■■□□□ 1.54
KCNT2Q6UVM3 PDIA6-201ENST00000272227 2338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
KCNT2Q6UVM3 LLGL2-202ENST00000375227 1374 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
KCNT2Q6UVM3 FAM220A-201ENST00000313324 2214 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
KCNT2Q6UVM3 SKOR2-203ENST00000620245 3048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.69■■□□□ 1.54
KCNT2Q6UVM3 LAMTOR1-201ENST00000278671 1179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
KCNT2Q6UVM3 AL136090.1-201ENST00000446849 366 ntTSL 3 BASIC24.69■■□□□ 1.54
KCNT2Q6UVM3 CAMTA1-208ENST00000473578 567 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
KCNT2Q6UVM3 AP001330.3-201ENST00000520123 633 ntBASIC24.69■■□□□ 1.54
KCNT2Q6UVM3 RPP38-207ENST00000616640 1537 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.69■■□□□ 1.54
KCNT2Q6UVM3 SIRT3-204ENST00000525319 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.69■■□□□ 1.54
KCNT2Q6UVM3 AMZ2-219ENST00000612294 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
KCNT2Q6UVM3 AC004691.2-201ENST00000509504 1531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.68■■□□□ 1.54
KCNT2Q6UVM3 STOML2-201ENST00000356493 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
KCNT2Q6UVM3 ZDHHC16-205ENST00000370846 1280 ntTSL 3 BASIC24.68■■□□□ 1.54
KCNT2Q6UVM3 HSPE1-203ENST00000409729 478 ntTSL 2 BASIC24.68■■□□□ 1.54
KCNT2Q6UVM3 CAPZB-203ENST00000375142 1686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.68■■□□□ 1.54
KCNT2Q6UVM3 ATG16L2-205ENST00000534905 1614 ntTSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
KCNT2Q6UVM3 FAR2P4-203ENST00000560285 1739 ntTSL 2 BASIC24.67■■□□□ 1.54
KCNT2Q6UVM3 PICALM-224ENST00000630913 2261 ntTSL 5 BASIC24.67■■□□□ 1.54
KCNT2Q6UVM3 PKMYT1-211ENST00000573944 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.67■■□□□ 1.54
KCNT2Q6UVM3 YJEFN3-201ENST00000436027 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
KCNT2Q6UVM3 GSX2-205ENST00000611459 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
KCNT2Q6UVM3 AC092666.2-201ENST00000613287 246 ntBASIC24.67■■□□□ 1.54
KCNT2Q6UVM3 FCRLB-205ENST00000367948 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
KCNT2Q6UVM3 CCDC92-209ENST00000545891 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.67■■□□□ 1.54
KCNT2Q6UVM3 BTBD6-201ENST00000327471 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.67■■□□□ 1.54
KCNT2Q6UVM3 ECHDC1-203ENST00000368291 1354 ntTSL 2 BASIC24.67■■□□□ 1.54
KCNT2Q6UVM3 E2F5-202ENST00000416274 1728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
KCNT2Q6UVM3 C20orf27-202ENST00000379772 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
KCNT2Q6UVM3 PFKFB4-202ENST00000383734 1491 ntTSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
KCNT2Q6UVM3 MIR4767-201ENST00000582827 78 ntBASIC24.66■■□□□ 1.54
KCNT2Q6UVM3 TMEM221-201ENST00000341130 1930 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.66■■□□□ 1.54
KCNT2Q6UVM3 ST3GAL5-214ENST00000638178 2034 ntTSL 5 BASIC24.66■■□□□ 1.54
KCNT2Q6UVM3 PLPP2-202ENST00000327790 1397 ntTSL 5 BASIC24.66■■□□□ 1.54
KCNT2Q6UVM3 OAS3-205ENST00000548514 1392 ntTSL 2 BASIC24.66■■□□□ 1.54
KCNT2Q6UVM3 PYGO2-201ENST00000368456 1306 ntTSL 2 BASIC24.65■■□□□ 1.54
KCNT2Q6UVM3 SERBP1P1-201ENST00000396021 1160 ntBASIC24.65■■□□□ 1.54
KCNT2Q6UVM3 AC091305.1-201ENST00000479476 895 ntBASIC24.65■■□□□ 1.54
KCNT2Q6UVM3 AC099791.2-201ENST00000605725 427 ntBASIC24.65■■□□□ 1.54
KCNT2Q6UVM3 HOXA4-204ENST00000610970 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
KCNT2Q6UVM3 MBD3-202ENST00000434436 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
KCNT2Q6UVM3 HAS2-AS1-201ENST00000514180 1656 ntTSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
KCNT2Q6UVM3 ZNF503-AS2-202ENST00000466942 1430 ntTSL 2 BASIC24.64■■□□□ 1.54
KCNT2Q6UVM3 RFNG-201ENST00000310496 1828 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.64■■□□□ 1.54
KCNT2Q6UVM3 SPIRE2-205ENST00000563972 1823 ntTSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
KCNT2Q6UVM3 LBX2-202ENST00000377566 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 68.2 ms