Protein–RNA interactions for Protein: Q6ULP2

AFTPH, Aftiphilin, humanhuman

Predictions only

Length 937 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
AFTPHQ6ULP2 MADCAM1-207ENST00000619333 1485 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
AFTPHQ6ULP2 MADCAM1-210ENST00000622462 1461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
AFTPHQ6ULP2 TLX1-203ENST00000467928 1838 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
AFTPHQ6ULP2 LSM7-203ENST00000585409 512 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
AFTPHQ6ULP2 MIR663AHG-227ENST00000608084 765 ntTSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
AFTPHQ6ULP2 MMD-201ENST00000262065 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
AFTPHQ6ULP2 LINC00092-201ENST00000412122 1726 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
AFTPHQ6ULP2 ZBTB45-205ENST00000600990 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
AFTPHQ6ULP2 IRF3-227ENST00000600911 1637 ntTSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
AFTPHQ6ULP2 PPP4C-214ENST00000627746 1301 ntTSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
AFTPHQ6ULP2 TBL1X-201ENST00000217964 5871 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
AFTPHQ6ULP2 CACNG6-203ENST00000352529 1635 ntTSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
AFTPHQ6ULP2 PLEKHB1-201ENST00000227214 2016 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
AFTPHQ6ULP2 HORMAD2-201ENST00000336726 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
AFTPHQ6ULP2 STEAP2-207ENST00000402625 1372 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
AFTPHQ6ULP2 MED25-211ENST00000617849 1548 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
AFTPHQ6ULP2 TK2-202ENST00000417693 1046 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
AFTPHQ6ULP2 EIF3J-203ENST00000535391 925 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
AFTPHQ6ULP2 GIT1-210ENST00000579937 2798 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
AFTPHQ6ULP2 NKX2-3-202ENST00000622383 1986 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
AFTPHQ6ULP2 GBX2-201ENST00000306318 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
AFTPHQ6ULP2 ATAD3B-201ENST00000308647 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
AFTPHQ6ULP2 TTC39A-203ENST00000371747 1876 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
AFTPHQ6ULP2 ZFP91-CNTF-201ENST00000389919 2319 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
AFTPHQ6ULP2 DCAF4-206ENST00000509153 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
AFTPHQ6ULP2 BX664725.1-201ENST00000438252 379 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
AFTPHQ6ULP2 AL136090.1-201ENST00000446849 366 ntTSL 3 BASIC22.78■■□□□ 1.24
AFTPHQ6ULP2 LYSMD2-202ENST00000454181 1228 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
AFTPHQ6ULP2 MCRIP1-202ENST00000457257 942 ntTSL 3 BASIC22.78■■□□□ 1.24
AFTPHQ6ULP2 AC092849.1-201ENST00000475250 303 ntTSL 4 BASIC22.78■■□□□ 1.24
AFTPHQ6ULP2 PRR7-204ENST00000510492 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
AFTPHQ6ULP2 CCM2L-201ENST00000262659 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
AFTPHQ6ULP2 TRAP1-202ENST00000538171 2052 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
AFTPHQ6ULP2 MID1IP1-203ENST00000457894 1902 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.78■■□□□ 1.24
AFTPHQ6ULP2 KCTD15-207ENST00000589786 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
AFTPHQ6ULP2 VSTM4-201ENST00000298454 2170 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
AFTPHQ6ULP2 SLC25A29-201ENST00000359232 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
AFTPHQ6ULP2 TMEM170A-202ENST00000561878 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
AFTPHQ6ULP2 AC009163.4-201ENST00000567194 530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
AFTPHQ6ULP2 KLHL26-202ENST00000595182 522 ntTSL 4 BASIC22.77■■□□□ 1.24
AFTPHQ6ULP2 IKBIP-202ENST00000342502 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
AFTPHQ6ULP2 EI24-204ENST00000527235 1625 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
AFTPHQ6ULP2 CAMK2N1-201ENST00000375078 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
AFTPHQ6ULP2 AL160276.1-201ENST00000636672 1312 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
AFTPHQ6ULP2 ACOT1-201ENST00000311148 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.23
AFTPHQ6ULP2 COMMD5-201ENST00000305103 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
AFTPHQ6ULP2 LINC01578-209ENST00000557682 2683 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
AFTPHQ6ULP2 ZFYVE19-201ENST00000299173 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
AFTPHQ6ULP2 HACD3-205ENST00000562901 1797 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
AFTPHQ6ULP2 CDYL-203ENST00000397588 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
AFTPHQ6ULP2 SPHK1-210ENST00000592299 1821 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
AFTPHQ6ULP2 RNF146-205ENST00000477776 762 ntTSL 3 BASIC22.76■■□□□ 1.23
AFTPHQ6ULP2 LINC01925-201ENST00000579492 500 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
AFTPHQ6ULP2 SNX5-217ENST00000606557 1087 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
AFTPHQ6ULP2 TRIOBP-203ENST00000403663 2324 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
AFTPHQ6ULP2 CYP2A13-201ENST00000330436 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
AFTPHQ6ULP2 SPANXA2-OT1-201ENST00000622372 1686 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
AFTPHQ6ULP2 KCNQ3-202ENST00000519445 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
AFTPHQ6ULP2 HES6-201ENST00000272937 1454 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
AFTPHQ6ULP2 PRSS56-201ENST00000449534 2157 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
AFTPHQ6ULP2 PRSS56-203ENST00000617714 2158 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
AFTPHQ6ULP2 ZFAND5-202ENST00000343431 1073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
AFTPHQ6ULP2 SENP5-202ENST00000419026 973 ntTSL 3 BASIC22.75■■□□□ 1.23
AFTPHQ6ULP2 LSM7-204ENST00000587502 575 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
AFTPHQ6ULP2 RAET1E-AS1-203ENST00000606915 1210 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
AFTPHQ6ULP2 C16orf72-201ENST00000327827 5953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
AFTPHQ6ULP2 HMGA2-206ENST00000536545 1788 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
AFTPHQ6ULP2 PPP1R1B-201ENST00000254079 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
AFTPHQ6ULP2 GRK4-202ENST00000398051 2068 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
AFTPHQ6ULP2 P3H3-201ENST00000290510 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
AFTPHQ6ULP2 AC021242.3-201ENST00000607598 1377 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
AFTPHQ6ULP2 CRLF1-201ENST00000392386 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
AFTPHQ6ULP2 SNX10-207ENST00000446848 2613 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
AFTPHQ6ULP2 EBPL-205ENST00000378284 967 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
AFTPHQ6ULP2 SMUG1-203ENST00000401977 1082 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
AFTPHQ6ULP2 AC026785.2-201ENST00000511821 867 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
AFTPHQ6ULP2 AC011448.1-201ENST00000555938 1100 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
AFTPHQ6ULP2 TMEM170A-206ENST00000569276 609 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
AFTPHQ6ULP2 ZNF180-205ENST00000587047 525 ntTSL 4 BASIC22.74■■□□□ 1.23
AFTPHQ6ULP2 CLEC14A-201ENST00000342213 2267 ntAPPRIS P1 BASIC22.74■■□□□ 1.23
AFTPHQ6ULP2 MARCH2-201ENST00000215555 1376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
AFTPHQ6ULP2 TMED4-205ENST00000481238 1755 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
AFTPHQ6ULP2 GATA4-207ENST00000532059 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
AFTPHQ6ULP2 C7orf49-203ENST00000430372 1579 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
AFTPHQ6ULP2 CTAG1B-201ENST00000328435 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
AFTPHQ6ULP2 CTAG1A-202ENST00000599837 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
AFTPHQ6ULP2 LAT-217ENST00000630764 610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
AFTPHQ6ULP2 PEBP1-201ENST00000261313 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
AFTPHQ6ULP2 C11orf95-202ENST00000433688 5716 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
AFTPHQ6ULP2 CPLX1-201ENST00000304062 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
AFTPHQ6ULP2 ROR1-202ENST00000371080 2305 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
AFTPHQ6ULP2 DHH-201ENST00000266991 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
AFTPHQ6ULP2 LHPP-201ENST00000368839 1522 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
AFTPHQ6ULP2 FAM57A-202ENST00000308278 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
AFTPHQ6ULP2 IFNGR2-202ENST00000381995 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
AFTPHQ6ULP2 RAD21L1-202ENST00000402452 1707 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
AFTPHQ6ULP2 Z92544.1-202ENST00000571933 1220 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
AFTPHQ6ULP2 DUSP22-214ENST00000605315 867 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
AFTPHQ6ULP2 RAP2A-201ENST00000245304 5487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
AFTPHQ6ULP2 NKX6-3-201ENST00000518699 1352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 63.9 ms