Protein–RNA interactions for Protein: Q6SZW1

SARM1, Sterile alpha and TIR motif-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 724 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SARM1Q6SZW1 HNRNPD-203ENST00000353341 1585 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
SARM1Q6SZW1 PCSK6-220ENST00000622483 3132 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
SARM1Q6SZW1 ZNF263-204ENST00000573578 1636 ntTSL 5 BASIC25.31■■□□□ 1.64
SARM1Q6SZW1 LIMS2-202ENST00000355119 2045 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
SARM1Q6SZW1 RGS6-209ENST00000553525 2005 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC25.31■■□□□ 1.64
SARM1Q6SZW1 AKT2-234ENST00000579047 2029 ntTSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
SARM1Q6SZW1 VIPR2-204ENST00000421760 717 ntTSL 3 BASIC25.31■■□□□ 1.64
SARM1Q6SZW1 BANF1-208ENST00000533166 1135 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.31■■□□□ 1.64
SARM1Q6SZW1 AC016575.1-201ENST00000607026 382 ntBASIC25.31■■□□□ 1.64
SARM1Q6SZW1 WRNIP1-203ENST00000380771 2595 ntTSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
SARM1Q6SZW1 AF117829.1-207ENST00000504145 1572 ntTSL 3 BASIC25.31■■□□□ 1.64
SARM1Q6SZW1 LTB4R-201ENST00000345363 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
SARM1Q6SZW1 MAGI2-215ENST00000628980 6212 ntTSL 5 BASIC25.3■■□□□ 1.64
SARM1Q6SZW1 HTRA2-201ENST00000258080 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
SARM1Q6SZW1 EPS8L1-202ENST00000245618 2198 ntTSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
SARM1Q6SZW1 SHMT1-202ENST00000352886 2437 ntTSL 2 BASIC25.3■■□□□ 1.64
SARM1Q6SZW1 LOR-201ENST00000368742 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
SARM1Q6SZW1 SAP25-204ENST00000622764 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.3■■□□□ 1.64
SARM1Q6SZW1 LRRC14B-201ENST00000328278 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
SARM1Q6SZW1 NHLH1-201ENST00000302101 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
SARM1Q6SZW1 CRTC2-203ENST00000368633 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
SARM1Q6SZW1 FRAT1-201ENST00000371021 2649 ntAPPRIS P1 BASIC25.3■■□□□ 1.64
SARM1Q6SZW1 DEXI-202ENST00000469379 1393 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.3■■□□□ 1.64
SARM1Q6SZW1 FIZ1-201ENST00000221665 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
SARM1Q6SZW1 GRK4-206ENST00000504933 1971 ntTSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
SARM1Q6SZW1 DPH1-203ENST00000570477 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.29■■□□□ 1.64
SARM1Q6SZW1 SARDH-203ENST00000371868 2266 ntTSL 2 BASIC25.29■■□□□ 1.64
SARM1Q6SZW1 P2RX4-211ENST00000543171 1777 ntTSL 5 BASIC25.29■■□□□ 1.64
SARM1Q6SZW1 LRRC75A-201ENST00000409083 2656 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.29■■□□□ 1.64
SARM1Q6SZW1 RAP2CP1-202ENST00000605179 643 ntBASIC25.29■■□□□ 1.64
SARM1Q6SZW1 ST3GAL5-231ENST00000639119 2131 ntTSL 5 BASIC25.29■■□□□ 1.64
SARM1Q6SZW1 FPGS-204ENST00000393706 2230 ntTSL 2 BASIC25.29■■□□□ 1.64
SARM1Q6SZW1 CACNB3-205ENST00000547392 2237 ntTSL 5 BASIC25.29■■□□□ 1.64
SARM1Q6SZW1 CLEC11A-201ENST00000250340 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
SARM1Q6SZW1 TPST2-203ENST00000403880 2084 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.28■■□□□ 1.64
SARM1Q6SZW1 ASB6-201ENST00000277458 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
SARM1Q6SZW1 GPR161-203ENST00000367836 1983 ntTSL 2 BASIC25.28■■□□□ 1.64
SARM1Q6SZW1 FLVCR1-AS1-203ENST00000426161 892 ntTSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
SARM1Q6SZW1 U2AF2-206ENST00000590551 1104 ntTSL 3 BASIC25.28■■□□□ 1.64
SARM1Q6SZW1 ROGDI-201ENST00000322048 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
SARM1Q6SZW1 MRPL10-202ENST00000351111 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
SARM1Q6SZW1 IFNGR2-202ENST00000381995 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.28■■□□□ 1.64
SARM1Q6SZW1 DPEP2-204ENST00000572888 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
SARM1Q6SZW1 WRNIP1-204ENST00000380773 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
SARM1Q6SZW1 TANGO2-207ENST00000420290 1859 ntTSL 2 BASIC25.28■■□□□ 1.64
SARM1Q6SZW1 H19-210ENST00000439725 1929 ntTSL 2 BASIC25.27■■□□□ 1.64
SARM1Q6SZW1 MATK-204ENST00000585778 1994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
SARM1Q6SZW1 RBFOX1-206ENST00000535565 1599 ntTSL 2 BASIC25.27■■□□□ 1.64
SARM1Q6SZW1 IRX4-201ENST00000231357 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
SARM1Q6SZW1 SH2D3A-201ENST00000245908 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
SARM1Q6SZW1 SRPK3-203ENST00000370104 1753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
SARM1Q6SZW1 CELF5-201ENST00000292672 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
SARM1Q6SZW1 MATK-202ENST00000395040 1907 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
SARM1Q6SZW1 DDN-AS1-202ENST00000547866 2114 ntTSL 3 BASIC25.27■■□□□ 1.64
SARM1Q6SZW1 TDRKH-205ENST00000368827 2318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
SARM1Q6SZW1 FOXJ1-201ENST00000322957 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
SARM1Q6SZW1 BCS1L-210ENST00000431802 2015 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.26■■□□□ 1.63
SARM1Q6SZW1 FAAP20-202ENST00000378546 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
SARM1Q6SZW1 MSRB1-206ENST00000622125 1363 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.26■■□□□ 1.63
SARM1Q6SZW1 P4HA2-202ENST00000360568 2313 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
SARM1Q6SZW1 RASL10A-201ENST00000216101 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
SARM1Q6SZW1 UBXN2A-202ENST00000404924 1557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.26■■□□□ 1.63
SARM1Q6SZW1 ZNF74-204ENST00000405993 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.26■■□□□ 1.63
SARM1Q6SZW1 BTBD6-201ENST00000327471 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.25■■□□□ 1.63
SARM1Q6SZW1 ZNF354A-201ENST00000335815 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
SARM1Q6SZW1 GFER-205ENST00000569451 517 ntTSL 5 BASIC25.25■■□□□ 1.63
SARM1Q6SZW1 WBP1-202ENST00000393972 1325 ntTSL 2 BASIC25.25■■□□□ 1.63
SARM1Q6SZW1 BCKDHB-202ENST00000356489 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
SARM1Q6SZW1 MSANTD3-207ENST00000622639 1748 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.25■■□□□ 1.63
SARM1Q6SZW1 H2AFY2-201ENST00000373255 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
SARM1Q6SZW1 VGLL2-201ENST00000326274 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
SARM1Q6SZW1 OLIG1-201ENST00000382348 2277 ntAPPRIS P1 BASIC25.25■■□□□ 1.63
SARM1Q6SZW1 TMEM200B-202ENST00000521452 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
SARM1Q6SZW1 PPP5C-201ENST00000012443 2109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
SARM1Q6SZW1 SRI-201ENST00000265729 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
SARM1Q6SZW1 SMAD1-201ENST00000302085 1966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
SARM1Q6SZW1 PSIP1-202ENST00000380716 1889 ntTSL 5 BASIC25.24■■□□□ 1.63
SARM1Q6SZW1 LRRC24-202ENST00000533758 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.24■■□□□ 1.63
SARM1Q6SZW1 AC026202.3-201ENST00000600805 1127 ntBASIC25.24■■□□□ 1.63
SARM1Q6SZW1 NFIX-203ENST00000397661 3143 ntTSL 5 BASIC25.24■■□□□ 1.63
SARM1Q6SZW1 MROH6-202ENST00000524906 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.23■■□□□ 1.63
SARM1Q6SZW1 FHL2-203ENST00000358129 1578 ntTSL 5 BASIC25.23■■□□□ 1.63
SARM1Q6SZW1 NXNL1-201ENST00000301944 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
SARM1Q6SZW1 VEGFA-202ENST00000324450 954 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
SARM1Q6SZW1 VEGFA-203ENST00000372055 1286 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
SARM1Q6SZW1 VEGFA-208ENST00000417285 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
SARM1Q6SZW1 VEGFA-213ENST00000482630 1146 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
SARM1Q6SZW1 AC007029.1-201ENST00000604183 313 ntBASIC25.23■■□□□ 1.63
SARM1Q6SZW1 VEGFA-227ENST00000615393 984 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
SARM1Q6SZW1 VEGFA-228ENST00000617771 1116 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
SARM1Q6SZW1 VEGFA-229ENST00000621747 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
SARM1Q6SZW1 VEGFA-230ENST00000640482 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
SARM1Q6SZW1 VEGFA-232ENST00000640653 1170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
SARM1Q6SZW1 KCNQ4-204ENST00000509682 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.23■■□□□ 1.63
SARM1Q6SZW1 ZYX-201ENST00000322764 2493 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
SARM1Q6SZW1 CPSF4-204ENST00000436336 1738 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
SARM1Q6SZW1 FARP2-223ENST00000627550 2122 ntTSL 2 BASIC25.22■■□□□ 1.63
SARM1Q6SZW1 PGF-206ENST00000555567 1927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
SARM1Q6SZW1 NELFCD-213ENST00000602795 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
SARM1Q6SZW1 AC090877.2-201ENST00000558441 1738 ntBASIC25.22■■□□□ 1.63
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.3 ms