Protein–RNA interactions for Protein: Q6QAJ8

TMEM220, Transmembrane protein 220, humanhuman

Predictions only

Length 160 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMEM220Q6QAJ8 AL136090.1-201ENST00000446849 366 ntTSL 3 BASIC22.58■■□□□ 1.21
TMEM220Q6QAJ8 CLTA-206ENST00000466396 695 ntTSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
TMEM220Q6QAJ8 AL117209.1-201ENST00000560931 828 ntTSL 3 BASIC22.58■■□□□ 1.21
TMEM220Q6QAJ8 RBFOX1-206ENST00000535565 1599 ntTSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.2
TMEM220Q6QAJ8 ZFYVE28-202ENST00000503000 1874 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
TMEM220Q6QAJ8 B3GNT4-201ENST00000324189 1642 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
TMEM220Q6QAJ8 ZNF444-211ENST00000592949 1906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
TMEM220Q6QAJ8 ZNF767P-202ENST00000472212 2100 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
TMEM220Q6QAJ8 SLC9A3-203ENST00000514375 2504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
TMEM220Q6QAJ8 MXI1-201ENST00000239007 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
TMEM220Q6QAJ8 DRAP1-201ENST00000312515 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
TMEM220Q6QAJ8 CD72-202ENST00000378430 585 ntTSL 3 BASIC22.56■■□□□ 1.2
TMEM220Q6QAJ8 ERRFI1-203ENST00000469499 995 ntTSL 3 BASIC22.56■■□□□ 1.2
TMEM220Q6QAJ8 AP002893.1-201ENST00000528885 684 ntTSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
TMEM220Q6QAJ8 AGBL5-201ENST00000323064 2382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
TMEM220Q6QAJ8 MADCAM1-206ENST00000617201 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
TMEM220Q6QAJ8 MADCAM1-207ENST00000619333 1485 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
TMEM220Q6QAJ8 MADCAM1-210ENST00000622462 1461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
TMEM220Q6QAJ8 SMOX-201ENST00000278795 2164 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
TMEM220Q6QAJ8 NKX6-3-201ENST00000518699 1352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
TMEM220Q6QAJ8 REST-206ENST00000612429 1376 ntTSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
TMEM220Q6QAJ8 REST-207ENST00000616975 1370 ntTSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
TMEM220Q6QAJ8 REST-212ENST00000640343 1352 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
TMEM220Q6QAJ8 TGFBRAP1-202ENST00000393359 5979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
TMEM220Q6QAJ8 LINC00092-201ENST00000412122 1726 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
TMEM220Q6QAJ8 TRIM7-202ENST00000334421 1228 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
TMEM220Q6QAJ8 TRAPPC5-202ENST00000426877 765 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
TMEM220Q6QAJ8 MIR6724-1-201ENST00000616420 92 ntBASIC22.55■■□□□ 1.2
TMEM220Q6QAJ8 MIR6724-2-201ENST00000616483 92 ntBASIC22.55■■□□□ 1.2
TMEM220Q6QAJ8 MIR6724-4-201ENST00000617390 92 ntBASIC22.55■■□□□ 1.2
TMEM220Q6QAJ8 MIR6724-3-201ENST00000622482 92 ntBASIC22.55■■□□□ 1.2
TMEM220Q6QAJ8 SLCO3A1-201ENST00000318445 5115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
TMEM220Q6QAJ8 NRL-202ENST00000396997 1517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
TMEM220Q6QAJ8 SLC10A4-201ENST00000273861 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
TMEM220Q6QAJ8 R3HDM4-203ENST00000587975 1765 ntTSL 3 BASIC22.55■■□□□ 1.2
TMEM220Q6QAJ8 C6orf89-201ENST00000355190 1309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
TMEM220Q6QAJ8 HNRNPAB-208ENST00000515193 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
TMEM220Q6QAJ8 AMZ2P1-201ENST00000397713 2259 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
TMEM220Q6QAJ8 HSPBP1-202ENST00000433386 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
TMEM220Q6QAJ8 SMOX-202ENST00000305958 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
TMEM220Q6QAJ8 MEIS3-201ENST00000331559 2104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
TMEM220Q6QAJ8 SLC16A10-206ENST00000612036 1231 ntTSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
TMEM220Q6QAJ8 CREB3L3-205ENST00000602257 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
TMEM220Q6QAJ8 FKBP8-209ENST00000597960 1781 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
TMEM220Q6QAJ8 AC004812.2-201ENST00000611079 2094 ntBASIC22.53■■□□□ 1.2
TMEM220Q6QAJ8 ZSWIM6-201ENST00000252744 5501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
TMEM220Q6QAJ8 MAGI2-208ENST00000522391 4878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
TMEM220Q6QAJ8 MED25-211ENST00000617849 1548 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
TMEM220Q6QAJ8 SHD-204ENST00000599689 1729 ntTSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
TMEM220Q6QAJ8 MOSPD3-204ENST00000424091 1115 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
TMEM220Q6QAJ8 TSPAN17-204ENST00000503045 1019 ntTSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
TMEM220Q6QAJ8 ZNF205-201ENST00000219091 1947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
TMEM220Q6QAJ8 IKBIP-202ENST00000342502 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
TMEM220Q6QAJ8 NDEL1-201ENST00000334527 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.19
TMEM220Q6QAJ8 HEXDC-202ENST00000337014 2285 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
TMEM220Q6QAJ8 SEPT5-201ENST00000383045 1588 ntTSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
TMEM220Q6QAJ8 ADSSL1-201ENST00000330877 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
TMEM220Q6QAJ8 P2RX2-205ENST00000352418 1200 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
TMEM220Q6QAJ8 TMEM147-203ENST00000392205 767 ntTSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
TMEM220Q6QAJ8 RARA-204ENST00000394089 2024 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
TMEM220Q6QAJ8 SIGMAR1-201ENST00000277010 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
TMEM220Q6QAJ8 ALDH1A3-203ENST00000557963 1670 ntBASIC22.51■■□□□ 1.19
TMEM220Q6QAJ8 ZFYVE19-201ENST00000299173 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
TMEM220Q6QAJ8 SAMD13-205ENST00000370673 1567 ntTSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
TMEM220Q6QAJ8 LRRC24-201ENST00000529415 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
TMEM220Q6QAJ8 SH2D3A-202ENST00000437152 2013 ntTSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
TMEM220Q6QAJ8 SLC25A1-201ENST00000215882 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
TMEM220Q6QAJ8 PSIP1-202ENST00000380716 1889 ntTSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
TMEM220Q6QAJ8 PRMT5-213ENST00000553897 1857 ntTSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
TMEM220Q6QAJ8 SMARCB1-201ENST00000263121 1690 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
TMEM220Q6QAJ8 APOE-201ENST00000252486 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
TMEM220Q6QAJ8 TFPT-201ENST00000391757 774 ntTSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
TMEM220Q6QAJ8 TFPT-202ENST00000391758 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
TMEM220Q6QAJ8 QKI-207ENST00000453779 5685 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
TMEM220Q6QAJ8 CLPTM1-201ENST00000337392 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
TMEM220Q6QAJ8 AC005703.6-201ENST00000623265 1329 ntBASIC22.5■■□□□ 1.19
TMEM220Q6QAJ8 STMN4-204ENST00000519997 1623 ntTSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
TMEM220Q6QAJ8 DVL1-201ENST00000378888 3239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
TMEM220Q6QAJ8 PLEKHA8-201ENST00000258679 2293 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
TMEM220Q6QAJ8 PCMTD2-202ENST00000299468 1049 ntTSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
TMEM220Q6QAJ8 AC131212.1-201ENST00000613771 668 ntBASIC22.49■■□□□ 1.19
TMEM220Q6QAJ8 C6orf201-202ENST00000380175 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
TMEM220Q6QAJ8 KLC3-202ENST00000470402 1820 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
TMEM220Q6QAJ8 EI24-204ENST00000527235 1625 ntTSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
TMEM220Q6QAJ8 LHPP-201ENST00000368839 1522 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
TMEM220Q6QAJ8 LIMD2-205ENST00000578402 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
TMEM220Q6QAJ8 YIF1A-201ENST00000359461 943 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
TMEM220Q6QAJ8 YIF1A-203ENST00000376901 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
TMEM220Q6QAJ8 CHKB-AS1-201ENST00000380711 578 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
TMEM220Q6QAJ8 CHAC1-201ENST00000444189 1204 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
TMEM220Q6QAJ8 TCEA1-214ENST00000640382 1234 ntTSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
TMEM220Q6QAJ8 AC112229.4-201ENST00000488671 1528 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
TMEM220Q6QAJ8 AF117829.1-207ENST00000504145 1572 ntTSL 3 BASIC22.47■■□□□ 1.19
TMEM220Q6QAJ8 RUNDC3A-202ENST00000426726 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
TMEM220Q6QAJ8 DEAF1-201ENST00000382409 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
TMEM220Q6QAJ8 TMEM218-215ENST00000532407 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
TMEM220Q6QAJ8 SLC25A39-203ENST00000537904 1274 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
TMEM220Q6QAJ8 NAAA-204ENST00000507187 1750 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
TMEM220Q6QAJ8 AKT1-203ENST00000407796 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
TMEM220Q6QAJ8 ARFIP2-202ENST00000396777 1868 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41.6 ms