Protein–RNA interactions for Protein: Q6Q0C0

TRAF7, E3 ubiquitin-protein ligase TRAF7, humanhuman

Predictions only

Length 670 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRAF7Q6Q0C0 AC087623.3-201ENST00000607047 1098 ntBASIC25.17■■□□□ 1.62
TRAF7Q6Q0C0 PKMYT1-211ENST00000573944 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.17■■□□□ 1.62
TRAF7Q6Q0C0 ALKAL2-204ENST00000403610 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
TRAF7Q6Q0C0 SNHG7-204ENST00000447221 2157 ntTSL 2 BASIC25.17■■□□□ 1.62
TRAF7Q6Q0C0 MTMR1-202ENST00000370390 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
TRAF7Q6Q0C0 SYF2-201ENST00000236273 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
TRAF7Q6Q0C0 CCDC24-201ENST00000372318 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
TRAF7Q6Q0C0 FXYD7-201ENST00000270310 712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
TRAF7Q6Q0C0 ATP5C1-202ENST00000356708 1163 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
TRAF7Q6Q0C0 AC027682.1-201ENST00000562846 899 ntBASIC25.16■■□□□ 1.62
TRAF7Q6Q0C0 AC104564.5-201ENST00000584986 278 ntTSL 3 BASIC25.16■■□□□ 1.62
TRAF7Q6Q0C0 C14orf80-206ENST00000392527 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
TRAF7Q6Q0C0 RPUSD3-206ENST00000433535 1178 ntTSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
TRAF7Q6Q0C0 AC116614.1-201ENST00000456949 539 ntTSL 2 BASIC25.15■■□□□ 1.62
TRAF7Q6Q0C0 PRSS22-203ENST00000571228 1037 ntTSL 2 BASIC25.15■■□□□ 1.62
TRAF7Q6Q0C0 CBWD3-213ENST00000618217 1611 ntTSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
TRAF7Q6Q0C0 HSPBP1-202ENST00000433386 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
TRAF7Q6Q0C0 TBX1-203ENST00000359500 1538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
TRAF7Q6Q0C0 AC068580.1-201ENST00000446489 252 ntTSL 3 BASIC25.14■■□□□ 1.62
TRAF7Q6Q0C0 DLX2-202ENST00000466293 1852 ntTSL 2 BASIC25.14■■□□□ 1.61
TRAF7Q6Q0C0 DHRS13-202ENST00000394901 2037 ntTSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
TRAF7Q6Q0C0 YWHAH-202ENST00000397492 1879 ntTSL 3 BASIC25.13■■□□□ 1.61
TRAF7Q6Q0C0 CYC1-201ENST00000318911 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
TRAF7Q6Q0C0 METTL23-201ENST00000341249 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
TRAF7Q6Q0C0 STOX1-202ENST00000399162 935 ntTSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
TRAF7Q6Q0C0 STOX1-203ENST00000399165 1135 ntTSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
TRAF7Q6Q0C0 AC006455.2-201ENST00000429931 906 ntBASIC25.13■■□□□ 1.61
TRAF7Q6Q0C0 AIPL1-206ENST00000571740 1202 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
TRAF7Q6Q0C0 SAP25-203ENST00000614631 987 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.13■■□□□ 1.61
TRAF7Q6Q0C0 TSEN54-201ENST00000333213 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
TRAF7Q6Q0C0 LEFTY1-201ENST00000272134 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
TRAF7Q6Q0C0 LSR-205ENST00000427250 1606 ntTSL 2 BASIC25.12■■□□□ 1.61
TRAF7Q6Q0C0 AL022069.1-201ENST00000568025 1636 ntBASIC25.12■■□□□ 1.61
TRAF7Q6Q0C0 MRPL10-202ENST00000351111 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
TRAF7Q6Q0C0 LKAAEAR1-201ENST00000302096 761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.12■■□□□ 1.61
TRAF7Q6Q0C0 LKAAEAR1-202ENST00000308906 868 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
TRAF7Q6Q0C0 CTAG2-202ENST00000369585 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
TRAF7Q6Q0C0 PLPP5-201ENST00000419686 794 ntTSL 2 BASIC25.12■■□□□ 1.61
TRAF7Q6Q0C0 PLD4-205ENST00000553861 667 ntTSL 2 BASIC25.12■■□□□ 1.61
TRAF7Q6Q0C0 AC008764.7-201ENST00000593779 1081 ntBASIC25.12■■□□□ 1.61
TRAF7Q6Q0C0 CBWD3-212ENST00000616550 721 ntTSL 2 BASIC25.12■■□□□ 1.61
TRAF7Q6Q0C0 CBWD6-216ENST00000617933 721 ntTSL 3 BASIC25.12■■□□□ 1.61
TRAF7Q6Q0C0 LRRC75A-203ENST00000470794 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
TRAF7Q6Q0C0 DUSP8P4-201ENST00000399538 1761 ntBASIC25.12■■□□□ 1.61
TRAF7Q6Q0C0 C7orf25-206ENST00000447342 1823 ntTSL 2 BASIC25.12■■□□□ 1.61
TRAF7Q6Q0C0 AC099791.1-201ENST00000416440 715 ntBASIC25.11■■□□□ 1.61
TRAF7Q6Q0C0 HRH3-203ENST00000611492 900 ntTSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
TRAF7Q6Q0C0 AC136469.2-201ENST00000623944 1028 ntBASIC25.11■■□□□ 1.61
TRAF7Q6Q0C0 MYBL1-201ENST00000517885 1714 ntTSL 5 BASIC25.11■■□□□ 1.61
TRAF7Q6Q0C0 PNLIPRP2-205ENST00000611850 1407 ntTSL 5 BASIC25.11■■□□□ 1.61
TRAF7Q6Q0C0 CBWD2-203ENST00000416503 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
TRAF7Q6Q0C0 PPM1N-207ENST00000451287 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.1■■□□□ 1.61
TRAF7Q6Q0C0 AL162430.1-201ENST00000480705 870 ntBASIC25.1■■□□□ 1.61
TRAF7Q6Q0C0 SLC12A5-217ENST00000626937 1224 ntTSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
TRAF7Q6Q0C0 MYCBPAP-202ENST00000419930 1640 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
TRAF7Q6Q0C0 GNPTAB-201ENST00000299314 5701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
TRAF7Q6Q0C0 HECA-201ENST00000367658 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
TRAF7Q6Q0C0 SNUPN-207ENST00000567134 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.09■■□□□ 1.61
TRAF7Q6Q0C0 C1QTNF1-207ENST00000580454 1396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.09■■□□□ 1.61
TRAF7Q6Q0C0 HES6-206ENST00000409574 738 ntTSL 2 BASIC25.09■■□□□ 1.61
TRAF7Q6Q0C0 HERC2P4-206ENST00000568097 1062 ntTSL 5 BASIC25.09■■□□□ 1.61
TRAF7Q6Q0C0 MYDGF-203ENST00000599630 713 ntTSL 2 BASIC25.09■■□□□ 1.61
TRAF7Q6Q0C0 AC091982.4-201ENST00000623943 726 ntTSL 2 BASIC25.09■■□□□ 1.61
TRAF7Q6Q0C0 TMEM98-202ENST00000394642 1683 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.09■■□□□ 1.61
TRAF7Q6Q0C0 UBXN2A-202ENST00000404924 1557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.09■■□□□ 1.61
TRAF7Q6Q0C0 ROM1-201ENST00000278833 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
TRAF7Q6Q0C0 USF2-201ENST00000222305 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
TRAF7Q6Q0C0 RAB40C-204ENST00000538492 2569 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.08■■□□□ 1.61
TRAF7Q6Q0C0 ADGRB2-204ENST00000398542 5176 ntTSL 5 BASIC25.08■■□□□ 1.61
TRAF7Q6Q0C0 UBFD1-208ENST00000567264 642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.08■■□□□ 1.61
TRAF7Q6Q0C0 PCP4L1-201ENST00000504449 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
TRAF7Q6Q0C0 SLC52A2-202ENST00000402965 1777 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.08■■□□□ 1.6
TRAF7Q6Q0C0 FAM118A-205ENST00000441876 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.6
TRAF7Q6Q0C0 ZNF692-201ENST00000306601 1931 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.6
TRAF7Q6Q0C0 HOXB3-201ENST00000311626 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
TRAF7Q6Q0C0 C9orf40-201ENST00000376854 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
TRAF7Q6Q0C0 SAMD13-205ENST00000370673 1567 ntTSL 2 BASIC25.07■■□□□ 1.6
TRAF7Q6Q0C0 CREB3L2-203ENST00000452463 1105 ntTSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
TRAF7Q6Q0C0 ARFIP2-205ENST00000525235 852 ntTSL 2 BASIC25.07■■□□□ 1.6
TRAF7Q6Q0C0 RHOF-204ENST00000537265 699 ntTSL 2 BASIC25.07■■□□□ 1.6
TRAF7Q6Q0C0 ORAI3-202ENST00000562699 628 ntTSL 2 BASIC25.07■■□□□ 1.6
TRAF7Q6Q0C0 AC241377.3-202ENST00000626088 1088 ntBASIC25.07■■□□□ 1.6
TRAF7Q6Q0C0 AC241585.3-202ENST00000628937 1088 ntBASIC25.07■■□□□ 1.6
TRAF7Q6Q0C0 AC245100.8-202ENST00000629247 1058 ntBASIC25.07■■□□□ 1.6
TRAF7Q6Q0C0 TMCO6-201ENST00000252100 1834 ntTSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
TRAF7Q6Q0C0 HDGF-201ENST00000357325 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
TRAF7Q6Q0C0 RFLNA-205ENST00000546355 2354 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
TRAF7Q6Q0C0 LINC01116-201ENST00000295549 1407 ntTSL 2 BASIC25.06■■□□□ 1.6
TRAF7Q6Q0C0 WTAP-201ENST00000337387 1622 ntTSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
TRAF7Q6Q0C0 NPDC1-201ENST00000371600 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
TRAF7Q6Q0C0 IRS3P-201ENST00000223076 1006 ntBASIC25.06■■□□□ 1.6
TRAF7Q6Q0C0 JTB-203ENST00000368589 1216 ntTSL 2 BASIC25.06■■□□□ 1.6
TRAF7Q6Q0C0 CDC37L1-202ENST00000381858 1244 ntTSL 5 BASIC25.06■■□□□ 1.6
TRAF7Q6Q0C0 PARL-206ENST00000435888 1098 ntTSL 5 BASIC25.06■■□□□ 1.6
TRAF7Q6Q0C0 C15orf61-202ENST00000557807 769 ntTSL 2 BASIC25.06■■□□□ 1.6
TRAF7Q6Q0C0 ZNF503-AS2-201ENST00000425916 2026 ntTSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
TRAF7Q6Q0C0 UBAP1L-203ENST00000559089 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
TRAF7Q6Q0C0 NXPH3-201ENST00000328741 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
TRAF7Q6Q0C0 NGEF-203ENST00000409079 1022 ntTSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
TRAF7Q6Q0C0 MATK-202ENST00000395040 1907 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.6 ms