Protein–RNA interactions for Protein: Q6PIL6

KCNIP4, Kv channel-interacting protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 250 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KCNIP4Q6PIL6 MFAP2-202ENST00000375535 1260 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
KCNIP4Q6PIL6 HCG18-235ENST00000426882 4862 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
KCNIP4Q6PIL6 KIF12-202ENST00000468460 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
KCNIP4Q6PIL6 AP000911.1-206ENST00000531938 711 ntTSL 3 BASIC17.68■□□□□ 0.42
KCNIP4Q6PIL6 AC044849.2-201ENST00000606596 710 ntBASIC17.68■□□□□ 0.42
KCNIP4Q6PIL6 DUX4L28-201ENST00000623687 678 ntBASIC17.68■□□□□ 0.42
KCNIP4Q6PIL6 TRIP13-201ENST00000166345 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
KCNIP4Q6PIL6 SH2B1-204ENST00000395532 2529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
KCNIP4Q6PIL6 RAPH1-210ENST00000453034 2394 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
KCNIP4Q6PIL6 ZNF205-201ENST00000219091 1947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
KCNIP4Q6PIL6 DUSP8P3-201ENST00000399571 1760 ntBASIC17.68■□□□□ 0.42
KCNIP4Q6PIL6 SLC52A2-208ENST00000527078 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
KCNIP4Q6PIL6 NPAS1-208ENST00000602212 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
KCNIP4Q6PIL6 C18orf8-214ENST00000615148 1958 ntTSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
KCNIP4Q6PIL6 CPNE2-201ENST00000290776 2645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
KCNIP4Q6PIL6 SLC35D2-203ENST00000375259 1361 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
KCNIP4Q6PIL6 SPNS1-203ENST00000334536 2027 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
KCNIP4Q6PIL6 PDZRN4-202ENST00000402685 3347 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
KCNIP4Q6PIL6 ADGRL1-202ENST00000361434 5610 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
KCNIP4Q6PIL6 KMT5B-201ENST00000304363 5837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
KCNIP4Q6PIL6 SUDS3-204ENST00000543473 4897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
KCNIP4Q6PIL6 SP9-201ENST00000394967 2554 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
KCNIP4Q6PIL6 CIB2-204ENST00000557846 934 ntTSL 3 BASIC17.67■□□□□ 0.42
KCNIP4Q6PIL6 RABEP2-203ENST00000544477 1645 ntTSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
KCNIP4Q6PIL6 NELFCD-213ENST00000602795 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
KCNIP4Q6PIL6 POLR2H-208ENST00000456318 1802 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
KCNIP4Q6PIL6 PLEKHB1-201ENST00000227214 2016 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
KCNIP4Q6PIL6 FAM214B-203ENST00000378561 5771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
KCNIP4Q6PIL6 ARHGEF9-204ENST00000374878 2217 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
KCNIP4Q6PIL6 PGR-AS1-202ENST00000632820 1545 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
KCNIP4Q6PIL6 PCSK6-214ENST00000611716 4409 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
KCNIP4Q6PIL6 RBPJL-202ENST00000372741 1636 ntTSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
KCNIP4Q6PIL6 LMLN-210ENST00000482695 2010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
KCNIP4Q6PIL6 PDLIM2-202ENST00000308354 2236 ntTSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
KCNIP4Q6PIL6 ILDR2-206ENST00000528703 2446 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
KCNIP4Q6PIL6 RIMBP3-201ENST00000619918 6105 ntAPPRIS P1 BASIC17.66■□□□□ 0.42
KCNIP4Q6PIL6 CDKN2A-201ENST00000304494 1218 ntTSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
KCNIP4Q6PIL6 NEURL4-203ENST00000570460 4890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
KCNIP4Q6PIL6 ANO8-204ENST00000630631 1905 ntTSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
KCNIP4Q6PIL6 VSTM4-201ENST00000298454 2170 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.66■□□□□ 0.42
KCNIP4Q6PIL6 PMPCA-201ENST00000371717 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
KCNIP4Q6PIL6 POU2F3-206ENST00000543440 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
KCNIP4Q6PIL6 CAPNS1-216ENST00000628306 1389 ntTSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
KCNIP4Q6PIL6 KCTD15-207ENST00000589786 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.65■□□□□ 0.42
KCNIP4Q6PIL6 ULK1-201ENST00000321867 5310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
KCNIP4Q6PIL6 DNAAF3-203ENST00000524407 2059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
KCNIP4Q6PIL6 NOTUM-201ENST00000409678 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
KCNIP4Q6PIL6 MAG-203ENST00000537831 2341 ntTSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
KCNIP4Q6PIL6 IRX4-206ENST00000513692 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
KCNIP4Q6PIL6 ZNF444-211ENST00000592949 1906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
KCNIP4Q6PIL6 PNMA2-204ENST00000522362 4965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
KCNIP4Q6PIL6 POLR1D-201ENST00000302979 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
KCNIP4Q6PIL6 LSR-203ENST00000360798 1963 ntTSL 2 BASIC17.65■□□□□ 0.42
KCNIP4Q6PIL6 FIZ1-201ENST00000221665 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
KCNIP4Q6PIL6 CRACR2B-201ENST00000450448 1663 ntTSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.42
KCNIP4Q6PIL6 DRAM2-201ENST00000286692 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.42
KCNIP4Q6PIL6 SMG7-AS1-201ENST00000421703 2220 ntTSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.42
KCNIP4Q6PIL6 LGI2-201ENST00000382114 6428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.42
KCNIP4Q6PIL6 MXRA8-201ENST00000309212 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
KCNIP4Q6PIL6 ANKRD13D-202ENST00000447274 2881 ntTSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
KCNIP4Q6PIL6 TBX1-202ENST00000332710 2084 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
KCNIP4Q6PIL6 KCNIP1-203ENST00000390656 2249 ntTSL 5 BASIC17.64■□□□□ 0.41
KCNIP4Q6PIL6 KLHL29-203ENST00000486442 5287 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
KCNIP4Q6PIL6 RARA-201ENST00000254066 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
KCNIP4Q6PIL6 TMEM150A-201ENST00000306353 1484 ntTSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
KCNIP4Q6PIL6 CELF5-201ENST00000292672 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
KCNIP4Q6PIL6 TTC39A-203ENST00000371747 1876 ntTSL 2 BASIC17.63■□□□□ 0.41
KCNIP4Q6PIL6 FAM78B-201ENST00000338353 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
KCNIP4Q6PIL6 PLEKHA8-203ENST00000396259 2840 ntTSL 2 BASIC17.63■□□□□ 0.41
KCNIP4Q6PIL6 SMOX-203ENST00000339123 2074 ntTSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
KCNIP4Q6PIL6 SLC39A14-202ENST00000289952 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.63■□□□□ 0.41
KCNIP4Q6PIL6 DTNBP1-202ENST00000344537 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
KCNIP4Q6PIL6 ZNF837-202ENST00000597582 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.62■□□□□ 0.41
KCNIP4Q6PIL6 KIF26A-202ENST00000423312 5649 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
KCNIP4Q6PIL6 MLST8-219ENST00000565250 1588 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC17.62■□□□□ 0.41
KCNIP4Q6PIL6 MYH14-208ENST00000598205 6137 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
KCNIP4Q6PIL6 PPP5C-201ENST00000012443 2109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
KCNIP4Q6PIL6 AL121603.2-201ENST00000557373 2117 ntBASIC17.62■□□□□ 0.41
KCNIP4Q6PIL6 RBM26-202ENST00000438724 5152 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
KCNIP4Q6PIL6 ZFP90-204ENST00000564323 560 ntTSL 4 BASIC17.62■□□□□ 0.41
KCNIP4Q6PIL6 ZFP90-219ENST00000611381 695 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
KCNIP4Q6PIL6 TRAM2-AS1-204ENST00000606714 2453 ntTSL 2 BASIC17.62■□□□□ 0.41
KCNIP4Q6PIL6 DCDC2C-201ENST00000399143 1476 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
KCNIP4Q6PIL6 SLC35A3-204ENST00000427993 2062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
KCNIP4Q6PIL6 MTMR14-202ENST00000351233 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
KCNIP4Q6PIL6 TAZ-201ENST00000369776 1596 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
KCNIP4Q6PIL6 KCNN4-201ENST00000262888 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
KCNIP4Q6PIL6 CEND1-201ENST00000330106 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
KCNIP4Q6PIL6 SLC35F5-203ENST00000409342 2284 ntTSL 2 BASIC17.61■□□□□ 0.41
KCNIP4Q6PIL6 ZNF354A-201ENST00000335815 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
KCNIP4Q6PIL6 PTPN18-202ENST00000347849 2472 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
KCNIP4Q6PIL6 OSCAR-207ENST00000391761 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
KCNIP4Q6PIL6 NPAS3-210ENST00000551492 2817 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
KCNIP4Q6PIL6 FUT11-201ENST00000372841 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
KCNIP4Q6PIL6 RHOBTB2-201ENST00000251822 5451 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
KCNIP4Q6PIL6 AC138932.1-201ENST00000534164 6830 ntBASIC17.61■□□□□ 0.41
KCNIP4Q6PIL6 LINC01140-202ENST00000467438 2375 ntTSL 2 BASIC17.61■□□□□ 0.41
KCNIP4Q6PIL6 SLC29A1-207ENST00000393841 2485 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.61■□□□□ 0.41
KCNIP4Q6PIL6 LRFN4-202ENST00000393952 1550 ntTSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
KCNIP4Q6PIL6 MAP7D1-201ENST00000316156 3456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.3 ms