Protein–RNA interactions for Protein: Q6NUT3

MFSD12, Major facilitator superfamily domain-containing protein 12, humanhuman

Predictions only

Length 480 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MFSD12Q6NUT3 ERGIC1-202ENST00000393784 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
MFSD12Q6NUT3 IKBKG-211ENST00000615874 1460 ntTSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
MFSD12Q6NUT3 IKBKG-215ENST00000619941 1463 ntTSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
MFSD12Q6NUT3 RARA-203ENST00000394086 2008 ntTSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
MFSD12Q6NUT3 HMGA2-206ENST00000536545 1788 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
MFSD12Q6NUT3 CCDC96-201ENST00000310085 2091 ntAPPRIS P1 BASIC21.3■■□□□ 1
MFSD12Q6NUT3 EVX1-201ENST00000222761 1500 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
MFSD12Q6NUT3 DACT3-202ENST00000391916 2834 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
MFSD12Q6NUT3 LRRC1-201ENST00000370882 808 ntTSL 3 BASIC21.3■■□□□ 1
MFSD12Q6NUT3 FAHD1-204ENST00000615972 757 ntTSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
MFSD12Q6NUT3 HTRA2-202ENST00000352222 1450 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
MFSD12Q6NUT3 PEBP1-201ENST00000261313 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
MFSD12Q6NUT3 GET4-201ENST00000265857 2090 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
MFSD12Q6NUT3 PTH1R-207ENST00000449590 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
MFSD12Q6NUT3 TRIOBP-203ENST00000403663 2324 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
MFSD12Q6NUT3 VPS53-211ENST00000571805 2356 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
MFSD12Q6NUT3 HACD3-205ENST00000562901 1797 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
MFSD12Q6NUT3 ALDH1A3-203ENST00000557963 1670 ntBASIC21.29■■□□□ 1
MFSD12Q6NUT3 MADCAM1-206ENST00000617201 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
MFSD12Q6NUT3 MADCAM1-207ENST00000619333 1485 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
MFSD12Q6NUT3 MADCAM1-210ENST00000622462 1461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
MFSD12Q6NUT3 NPAS3-201ENST00000346562 5847 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
MFSD12Q6NUT3 FOXA2-201ENST00000377115 2401 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
MFSD12Q6NUT3 CYP2A13-201ENST00000330436 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
MFSD12Q6NUT3 CTBP1-203ENST00000382952 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
MFSD12Q6NUT3 ZKSCAN7-206ENST00000431636 1692 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
MFSD12Q6NUT3 AUH-201ENST00000303617 1490 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
MFSD12Q6NUT3 DHH-201ENST00000266991 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
MFSD12Q6NUT3 OSCAR-206ENST00000391760 629 ntTSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
MFSD12Q6NUT3 AC004448.1-201ENST00000458332 883 ntBASIC21.28■■□□□ 1
MFSD12Q6NUT3 RARRES2P1-201ENST00000474487 481 ntBASIC21.28■■□□□ 1
MFSD12Q6NUT3 LINC00092-201ENST00000412122 1726 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
MFSD12Q6NUT3 DCAF4-206ENST00000509153 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
MFSD12Q6NUT3 ZSWIM6-201ENST00000252744 5501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
MFSD12Q6NUT3 NEUROG3-201ENST00000242462 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
MFSD12Q6NUT3 EI24-204ENST00000527235 1625 ntTSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
MFSD12Q6NUT3 ST3GAL6-AS1-203ENST00000488132 769 ntTSL 3 BASIC21.27■■□□□ 1
MFSD12Q6NUT3 AC137630.3-201ENST00000607245 391 ntBASIC21.27■■□□□ 1
MFSD12Q6NUT3 MED25-211ENST00000617849 1548 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
MFSD12Q6NUT3 TMED4-205ENST00000481238 1755 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
MFSD12Q6NUT3 PPP1R1B-201ENST00000254079 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
MFSD12Q6NUT3 SPHK1-210ENST00000592299 1821 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
MFSD12Q6NUT3 NIPSNAP2-201ENST00000322090 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
MFSD12Q6NUT3 HES6-201ENST00000272937 1454 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
MFSD12Q6NUT3 STEAP2-207ENST00000402625 1372 ntTSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
MFSD12Q6NUT3 NKX2-8-201ENST00000258829 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
MFSD12Q6NUT3 MYL12B-203ENST00000581193 1249 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.26■□□□□ 0.99
MFSD12Q6NUT3 AC005551.1-201ENST00000641816 493 ntAPPRIS P1 BASIC21.26■□□□□ 0.99
MFSD12Q6NUT3 BOD1-202ENST00000311086 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
MFSD12Q6NUT3 ACOT1-201ENST00000311148 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
MFSD12Q6NUT3 TPI1-210ENST00000613953 1460 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
MFSD12Q6NUT3 SIAH2-201ENST00000312960 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
MFSD12Q6NUT3 HRH3-202ENST00000340177 2659 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
MFSD12Q6NUT3 ZFYVE19-201ENST00000299173 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
MFSD12Q6NUT3 ZNF428-201ENST00000300811 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
MFSD12Q6NUT3 VSTM2L-201ENST00000373459 831 ntTSL 3 BASIC21.25■□□□□ 0.99
MFSD12Q6NUT3 ATAD3A-203ENST00000378756 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
MFSD12Q6NUT3 CTDSP2-203ENST00000547701 988 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
MFSD12Q6NUT3 ERF-201ENST00000222329 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
MFSD12Q6NUT3 GFOD1-204ENST00000603223 2388 ntTSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
MFSD12Q6NUT3 PRR35-201ENST00000409413 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
MFSD12Q6NUT3 SEPT4-205ENST00000426861 1906 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
MFSD12Q6NUT3 CACNG6-203ENST00000352529 1635 ntTSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
MFSD12Q6NUT3 SPANXA2-OT1-201ENST00000622372 1686 ntTSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
MFSD12Q6NUT3 RBPMS2-201ENST00000300069 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
MFSD12Q6NUT3 OSCAR-209ENST00000616215 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
MFSD12Q6NUT3 IFNGR2-202ENST00000381995 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
MFSD12Q6NUT3 RAD21L1-202ENST00000402452 1707 ntTSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
MFSD12Q6NUT3 AL136090.1-201ENST00000446849 366 ntTSL 3 BASIC21.24■□□□□ 0.99
MFSD12Q6NUT3 ST20-MTHFS-201ENST00000479961 859 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.24■□□□□ 0.99
MFSD12Q6NUT3 IKBIP-202ENST00000342502 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
MFSD12Q6NUT3 TMEM102-201ENST00000323206 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
MFSD12Q6NUT3 TMEM102-202ENST00000396568 1962 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
MFSD12Q6NUT3 FRMD8-203ENST00000416776 1818 ntTSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
MFSD12Q6NUT3 AC113189.4-201ENST00000575331 5553 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
MFSD12Q6NUT3 CCDC47-204ENST00000582252 1719 ntTSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
MFSD12Q6NUT3 COMMD5-201ENST00000305103 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
MFSD12Q6NUT3 CASK-201ENST00000378154 2494 ntTSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
MFSD12Q6NUT3 ARSB-202ENST00000396151 2316 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
MFSD12Q6NUT3 DAZAP1-201ENST00000233078 2160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
MFSD12Q6NUT3 DTNB-206ENST00000404103 2384 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
MFSD12Q6NUT3 PRTG-204ENST00000561292 833 ntTSL 3 BASIC21.23■□□□□ 0.99
MFSD12Q6NUT3 LSM7-203ENST00000585409 512 ntTSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
MFSD12Q6NUT3 MIR663AHG-227ENST00000608084 765 ntTSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
MFSD12Q6NUT3 ZFAND4-205ENST00000374371 2283 ntTSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
MFSD12Q6NUT3 PPP4C-214ENST00000627746 1301 ntTSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
MFSD12Q6NUT3 NAB1-202ENST00000409581 2360 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
MFSD12Q6NUT3 KCNMA1-283ENST00000640523 5425 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
MFSD12Q6NUT3 ADARB2-202ENST00000381310 1810 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
MFSD12Q6NUT3 AARD-201ENST00000378279 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
MFSD12Q6NUT3 ADORA2B-201ENST00000304222 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
MFSD12Q6NUT3 TK2-202ENST00000417693 1046 ntTSL 2 BASIC21.22■□□□□ 0.99
MFSD12Q6NUT3 MCRIP1-202ENST00000457257 942 ntTSL 3 BASIC21.22■□□□□ 0.99
MFSD12Q6NUT3 C21orf2-202ENST00000339818 2233 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
MFSD12Q6NUT3 LRRC34-206ENST00000522526 1899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
MFSD12Q6NUT3 OSCAR-211ENST00000617140 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
MFSD12Q6NUT3 BIN1-205ENST00000351659 2365 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
MFSD12Q6NUT3 SENP5-202ENST00000419026 973 ntTSL 3 BASIC21.21■□□□□ 0.99
MFSD12Q6NUT3 PRR7-204ENST00000510492 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
MFSD12Q6NUT3 EIF3J-203ENST00000535391 925 ntTSL 2 BASIC21.21■□□□□ 0.99
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 12.6 ms