Protein–RNA interactions for Protein: Q6JVE6

LCN10, Epididymal-specific lipocalin-10, humanhuman

Predictions only

Length 187 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LCN10Q6JVE6 AC133561.4-201ENST00000566112 224 ntBASIC21.62■■□□□ 1.05
LCN10Q6JVE6 RCAN1-201ENST00000313806 2490 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
LCN10Q6JVE6 CCDC166-201ENST00000542437 1320 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
LCN10Q6JVE6 EVX1-201ENST00000222761 1500 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
LCN10Q6JVE6 ANO8-204ENST00000630631 1905 ntTSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
LCN10Q6JVE6 GDF1-201ENST00000247005 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
LCN10Q6JVE6 CERS1-204ENST00000623882 2517 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
LCN10Q6JVE6 OSCAR-205ENST00000359649 1892 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
LCN10Q6JVE6 MYO10-205ENST00000507288 1677 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
LCN10Q6JVE6 RFC2-201ENST00000055077 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
LCN10Q6JVE6 SMARCA5-AS1-201ENST00000500800 945 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
LCN10Q6JVE6 NRL-205ENST00000560550 788 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
LCN10Q6JVE6 AL136162.1-201ENST00000607711 1078 ntBASIC21.61■■□□□ 1.05
LCN10Q6JVE6 BIN1-206ENST00000352848 2209 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
LCN10Q6JVE6 PCYT2-202ENST00000538721 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
LCN10Q6JVE6 ARHGEF9-210ENST00000623517 2143 ntTSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
LCN10Q6JVE6 SLC19A1-202ENST00000380010 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
LCN10Q6JVE6 CARD19-201ENST00000375464 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
LCN10Q6JVE6 LIN7B-202ENST00000391864 582 ntTSL 3 BASIC21.6■■□□□ 1.05
LCN10Q6JVE6 TYROBP-203ENST00000544690 522 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
LCN10Q6JVE6 CCDC189-211ENST00000545825 1046 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
LCN10Q6JVE6 HABP4-202ENST00000375251 2304 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
LCN10Q6JVE6 TTBK2-207ENST00000567840 1961 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
LCN10Q6JVE6 HES6-201ENST00000272937 1454 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
LCN10Q6JVE6 SLC25A1-201ENST00000215882 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
LCN10Q6JVE6 APOE-201ENST00000252486 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
LCN10Q6JVE6 C8orf58-201ENST00000289989 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
LCN10Q6JVE6 NDUFS3-206ENST00000528192 561 ntTSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
LCN10Q6JVE6 ATP13A2-215ENST00000617114 1723 ntTSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
LCN10Q6JVE6 RPP38-207ENST00000616640 1537 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
LCN10Q6JVE6 AP2M1-202ENST00000382456 2091 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
LCN10Q6JVE6 PFKFB4-202ENST00000383734 1491 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
LCN10Q6JVE6 SEPT5-201ENST00000383045 1588 ntTSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
LCN10Q6JVE6 DGCR6-208ENST00000608842 1837 ntTSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.05
LCN10Q6JVE6 CCDC107-203ENST00000378407 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.05
LCN10Q6JVE6 SMIM29-205ENST00000468145 903 ntTSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.05
LCN10Q6JVE6 SMIM29-207ENST00000481533 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
LCN10Q6JVE6 AC024257.2-201ENST00000549699 147 ntBASIC21.58■■□□□ 1.05
LCN10Q6JVE6 AL031432.3-201ENST00000607698 485 ntBASIC21.58■■□□□ 1.05
LCN10Q6JVE6 DNAJB11-201ENST00000265028 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
LCN10Q6JVE6 AMZ2-219ENST00000612294 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
LCN10Q6JVE6 LRRC24-202ENST00000533758 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.04
LCN10Q6JVE6 HNRNPL-201ENST00000221419 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
LCN10Q6JVE6 TRIM72-202ENST00000613872 1573 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
LCN10Q6JVE6 AC022211.4-201ENST00000625094 2161 ntBASIC21.57■■□□□ 1.04
LCN10Q6JVE6 SLC35A2-201ENST00000247138 1672 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
LCN10Q6JVE6 CAPZB-203ENST00000375142 1686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
LCN10Q6JVE6 AL359317.1-201ENST00000556316 578 ntTSL 4 BASIC21.57■■□□□ 1.04
LCN10Q6JVE6 ARHGDIA-217ENST00000584461 886 ntTSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
LCN10Q6JVE6 C20orf27-202ENST00000379772 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
LCN10Q6JVE6 AKT1S1-203ENST00000391831 2025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
LCN10Q6JVE6 PLBD2-202ENST00000545182 2321 ntTSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
LCN10Q6JVE6 SPTSSA-201ENST00000298130 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
LCN10Q6JVE6 SDF4-202ENST00000360001 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
LCN10Q6JVE6 EZH2-206ENST00000478654 2522 ntTSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
LCN10Q6JVE6 NAA38-201ENST00000333775 999 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
LCN10Q6JVE6 C19orf60-201ENST00000358607 839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
LCN10Q6JVE6 BAD-203ENST00000394532 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
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LCN10Q6JVE6 C19orf60-202ENST00000450195 702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
LCN10Q6JVE6 MEIS1-AS3-201ENST00000454167 707 ntTSL 4 BASIC21.56■■□□□ 1.04
LCN10Q6JVE6 CDKN2A-206ENST00000494262 989 ntTSL 3 BASIC21.56■■□□□ 1.04
LCN10Q6JVE6 AC009097.2-201ENST00000562763 465 ntTSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
LCN10Q6JVE6 SAMD13-205ENST00000370673 1567 ntTSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
LCN10Q6JVE6 FEZ2-203ENST00000379245 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
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LCN10Q6JVE6 CPSF4-204ENST00000436336 1738 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
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LCN10Q6JVE6 NAA30-202ENST00000554703 795 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
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LCN10Q6JVE6 RAP2A-201ENST00000245304 5487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
LCN10Q6JVE6 TRIM54-201ENST00000296098 2027 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
LCN10Q6JVE6 CBWD2-201ENST00000259199 1812 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
LCN10Q6JVE6 HSD11B1L-203ENST00000342970 1620 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
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LCN10Q6JVE6 AC135731.1-201ENST00000569415 2548 ntBASIC21.54■■□□□ 1.04
LCN10Q6JVE6 ECEL1-202ENST00000409941 2322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
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LCN10Q6JVE6 LYPD2-201ENST00000359228 594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
LCN10Q6JVE6 POU2F2-208ENST00000529952 1716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
LCN10Q6JVE6 SLC22A18-201ENST00000312221 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
LCN10Q6JVE6 SOX1-201ENST00000330949 2842 ntAPPRIS P1 BASIC21.54■■□□□ 1.04
LCN10Q6JVE6 SYNGR3-201ENST00000248121 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
LCN10Q6JVE6 ZNF503-AS2-202ENST00000466942 1430 ntTSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
LCN10Q6JVE6 GTPBP3-203ENST00000361619 1894 ntTSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
LCN10Q6JVE6 KCNG1-201ENST00000371571 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
LCN10Q6JVE6 NPAS3-201ENST00000346562 5847 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
LCN10Q6JVE6 SRPK3-205ENST00000393786 1900 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
LCN10Q6JVE6 PPP1R14C-201ENST00000361131 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
LCN10Q6JVE6 PRSS22-201ENST00000161006 1386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
LCN10Q6JVE6 ST6GALNAC6-204ENST00000373144 2406 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
LCN10Q6JVE6 AL355987.3-201ENST00000456614 735 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC21.53■■□□□ 1.04
LCN10Q6JVE6 TANGO2-207ENST00000420290 1859 ntTSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
LCN10Q6JVE6 TMEM64-201ENST00000418210 4663 ntTSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
LCN10Q6JVE6 SLC30A5-201ENST00000380860 1317 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
LCN10Q6JVE6 TSNARE1-208ENST00000524325 1963 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
LCN10Q6JVE6 ATG16L2-201ENST00000321297 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
LCN10Q6JVE6 CDC16-204ENST00000360383 2211 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
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