Protein–RNA interactions for Protein: Q6JVE5

LCN12, Epididymal-specific lipocalin-12, humanhuman

Predictions only

Length 192 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LCN12Q6JVE5 HYAL2-207ENST00000442581 2318 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
LCN12Q6JVE5 ADAMTS13-203ENST00000371910 1074 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
LCN12Q6JVE5 CFAP77-202ENST00000393215 901 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
LCN12Q6JVE5 RAB20-201ENST00000267328 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
LCN12Q6JVE5 AP000802.1-201ENST00000500537 1934 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
LCN12Q6JVE5 TMED2-201ENST00000262225 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
LCN12Q6JVE5 C16orf87-201ENST00000285697 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
LCN12Q6JVE5 TANGO2-204ENST00000401833 1920 ntTSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
LCN12Q6JVE5 PTH1R-206ENST00000430002 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
LCN12Q6JVE5 BRI3-201ENST00000297290 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
LCN12Q6JVE5 OSCAR-206ENST00000391760 629 ntTSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
LCN12Q6JVE5 HES6-204ENST00000409182 863 ntTSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
LCN12Q6JVE5 BX664725.1-201ENST00000438252 379 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
LCN12Q6JVE5 KRT125P-201ENST00000546827 989 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
LCN12Q6JVE5 Z92544.1-202ENST00000571933 1220 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
LCN12Q6JVE5 AC011551.1-201ENST00000614101 683 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
LCN12Q6JVE5 LAT-217ENST00000630764 610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
LCN12Q6JVE5 TAZ-216ENST00000613002 1485 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
LCN12Q6JVE5 CLPTM1-201ENST00000337392 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
LCN12Q6JVE5 B3GALT6-201ENST00000379198 2777 ntAPPRIS P1 BASIC17.79■□□□□ 0.44
LCN12Q6JVE5 ALDH16A1-203ENST00000540132 2174 ntTSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
LCN12Q6JVE5 INPPL1-201ENST00000298229 4733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
LCN12Q6JVE5 AC141586.4-201ENST00000624558 1573 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
LCN12Q6JVE5 ACTL10-201ENST00000330271 2028 ntAPPRIS P1 BASIC17.78■□□□□ 0.44
LCN12Q6JVE5 RANBP10-206ENST00000602677 2374 ntTSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
LCN12Q6JVE5 DGCR6-208ENST00000608842 1837 ntTSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
LCN12Q6JVE5 SDHAF1-201ENST00000378887 1117 ntAPPRIS P1 BASIC17.78■□□□□ 0.44
LCN12Q6JVE5 AC055876.1-201ENST00000430589 895 ntTSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
LCN12Q6JVE5 KMT2E-AS1-201ENST00000453677 736 ntTSL 3 BASIC17.78■□□□□ 0.44
LCN12Q6JVE5 AC120024.1-201ENST00000562672 995 ntBASIC17.78■□□□□ 0.44
LCN12Q6JVE5 SSSCA1-AS1-201ENST00000567594 614 ntBASIC17.78■□□□□ 0.44
LCN12Q6JVE5 LSM7-204ENST00000587502 575 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
LCN12Q6JVE5 PCMT1-202ENST00000367380 1628 ntTSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
LCN12Q6JVE5 PCMT1-211ENST00000544496 1628 ntTSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
LCN12Q6JVE5 RBM33-201ENST00000287912 1404 ntTSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
LCN12Q6JVE5 SLC30A2-201ENST00000374276 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
LCN12Q6JVE5 C19orf68-201ENST00000328759 2277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
LCN12Q6JVE5 LTK-202ENST00000355166 2940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
LCN12Q6JVE5 SLC35D3-201ENST00000331858 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
LCN12Q6JVE5 BCKDHB-202ENST00000356489 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
LCN12Q6JVE5 NPHS2-202ENST00000367616 1670 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
LCN12Q6JVE5 R3HDM4-201ENST00000361574 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
LCN12Q6JVE5 AC091230.1-202ENST00000564823 5356 ntTSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
LCN12Q6JVE5 INPP5J-206ENST00000404453 1613 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
LCN12Q6JVE5 WNT11-201ENST00000322563 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
LCN12Q6JVE5 FOXO3B-201ENST00000395675 1928 ntBASIC17.77■□□□□ 0.44
LCN12Q6JVE5 ZSCAN18-212ENST00000600404 1934 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
LCN12Q6JVE5 PNMT-201ENST00000269582 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
LCN12Q6JVE5 EVA1B-201ENST00000270824 1054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
LCN12Q6JVE5 PRELID1-201ENST00000303204 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
LCN12Q6JVE5 ANAPC13-201ENST00000354910 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
LCN12Q6JVE5 ST3GAL6-AS1-203ENST00000488132 769 ntTSL 3 BASIC17.77■□□□□ 0.44
LCN12Q6JVE5 TTC9-201ENST00000256367 5217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
LCN12Q6JVE5 TSPAN4-203ENST00000397397 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
LCN12Q6JVE5 SLC35A2-209ENST00000452555 1563 ntTSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
LCN12Q6JVE5 NRG3-201ENST00000372141 2158 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
LCN12Q6JVE5 STEAP2-204ENST00000394626 2456 ntTSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.43
LCN12Q6JVE5 PKIB-205ENST00000368452 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
LCN12Q6JVE5 NFIX-203ENST00000397661 3143 ntTSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
LCN12Q6JVE5 PKIG-206ENST00000372892 1338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
LCN12Q6JVE5 TSPAN4-202ENST00000397396 1332 ntTSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
LCN12Q6JVE5 MOB4-204ENST00000409360 1447 ntTSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
LCN12Q6JVE5 RAB32-201ENST00000367495 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
LCN12Q6JVE5 IGFBP3-202ENST00000381083 1050 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
LCN12Q6JVE5 PLEKHO1-202ENST00000369126 1809 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
LCN12Q6JVE5 CBARP-202ENST00000382477 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
LCN12Q6JVE5 CCR10-201ENST00000332438 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
LCN12Q6JVE5 LY6K-201ENST00000292430 2671 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
LCN12Q6JVE5 PPP4C-214ENST00000627746 1301 ntTSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
LCN12Q6JVE5 NAPRT-204ENST00000449291 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
LCN12Q6JVE5 SLC39A4-202ENST00000301305 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
LCN12Q6JVE5 HSPE1-201ENST00000233893 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
LCN12Q6JVE5 ST20-MTHFS-201ENST00000479961 859 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.75■□□□□ 0.43
LCN12Q6JVE5 HOXC-AS1-201ENST00000505700 548 ntTSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
LCN12Q6JVE5 GRM6-202ENST00000517717 2673 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
LCN12Q6JVE5 TMEM268-202ENST00000374049 4578 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
LCN12Q6JVE5 GOLGA7-201ENST00000357743 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
LCN12Q6JVE5 ST3GAL5-269ENST00000640992 2292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
LCN12Q6JVE5 TXNRD2-201ENST00000334363 1893 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
LCN12Q6JVE5 CLEC2L-201ENST00000422142 1359 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC17.75■□□□□ 0.43
LCN12Q6JVE5 IL17RE-201ENST00000383814 2704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
LCN12Q6JVE5 GATA4-207ENST00000532059 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
LCN12Q6JVE5 CIRBP-216ENST00000588090 1459 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC17.75■□□□□ 0.43
LCN12Q6JVE5 YAP1-210ENST00000615667 5398 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
LCN12Q6JVE5 HNRNPD-203ENST00000353341 1585 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
LCN12Q6JVE5 HORMAD2-201ENST00000336726 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
LCN12Q6JVE5 ZDHHC1-201ENST00000348579 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
LCN12Q6JVE5 C5orf58-204ENST00000521850 2113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
LCN12Q6JVE5 C9orf47-202ENST00000375850 859 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.74■□□□□ 0.43
LCN12Q6JVE5 MDK-203ENST00000395566 828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
LCN12Q6JVE5 AC239859.2-201ENST00000444165 318 ntBASIC17.74■□□□□ 0.43
LCN12Q6JVE5 OR2A1-AS1-204ENST00000470435 602 ntBASIC17.74■□□□□ 0.43
LCN12Q6JVE5 MMP25-AS1-209ENST00000576250 779 ntTSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
LCN12Q6JVE5 CCDC96-201ENST00000310085 2091 ntAPPRIS P1 BASIC17.74■□□□□ 0.43
LCN12Q6JVE5 IQCJ-SCHIP1-201ENST00000412423 2067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
LCN12Q6JVE5 ASRGL1-202ENST00000415229 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
LCN12Q6JVE5 AUTS2-203ENST00000406775 5950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
LCN12Q6JVE5 ZEB1-AS1-205ENST00000605946 382 ntTSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
LCN12Q6JVE5 ARHGAP27-207ENST00000528273 2319 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
LCN12Q6JVE5 LRRC14B-201ENST00000328278 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.4 ms