Protein–RNA interactions for Protein: Q6IC98

GRAMD4, GRAM domain-containing protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 578 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GRAMD4Q6IC98 REST-207ENST00000616975 1370 ntTSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
GRAMD4Q6IC98 REST-212ENST00000640343 1352 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
GRAMD4Q6IC98 SMOX-203ENST00000339123 2074 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
GRAMD4Q6IC98 AC079305.3-201ENST00000455416 218 ntTSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
GRAMD4Q6IC98 PPP1R14A-204ENST00000591291 433 ntTSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
GRAMD4Q6IC98 PDIA6-201ENST00000272227 2338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
GRAMD4Q6IC98 AC004691.2-201ENST00000509504 1531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
GRAMD4Q6IC98 UBL7-202ENST00000395081 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
GRAMD4Q6IC98 BTBD6-201ENST00000327471 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
GRAMD4Q6IC98 IQANK1-201ENST00000527139 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
GRAMD4Q6IC98 PXK-201ENST00000302779 1974 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
GRAMD4Q6IC98 SNCB-201ENST00000310112 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
GRAMD4Q6IC98 PSKH1-202ENST00000570631 1509 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
GRAMD4Q6IC98 YTHDF1-201ENST00000370334 747 ntTSL 3 BASIC23.56■■□□□ 1.36
GRAMD4Q6IC98 LINC01632-201ENST00000615763 496 ntTSL 3 BASIC23.56■■□□□ 1.36
GRAMD4Q6IC98 AC020928.2-201ENST00000588717 2197 ntBASIC23.56■■□□□ 1.36
GRAMD4Q6IC98 FNDC4-201ENST00000264703 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
GRAMD4Q6IC98 GFRA4-201ENST00000290417 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
GRAMD4Q6IC98 NR2F1-AS1-214ENST00000607831 1963 ntTSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
GRAMD4Q6IC98 GTPBP3-203ENST00000361619 1894 ntTSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
GRAMD4Q6IC98 AC112229.4-201ENST00000488671 1528 ntTSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
GRAMD4Q6IC98 SNX21-204ENST00000372542 1824 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
GRAMD4Q6IC98 MIR935-201ENST00000401179 91 ntBASIC23.55■■□□□ 1.36
GRAMD4Q6IC98 PPP1R14A-205ENST00000591585 949 ntTSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
GRAMD4Q6IC98 AC005837.3-201ENST00000612163 286 ntBASIC23.55■■□□□ 1.36
GRAMD4Q6IC98 ZDHHC14-204ENST00000414563 3134 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
GRAMD4Q6IC98 C1orf35-201ENST00000272139 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
GRAMD4Q6IC98 FAM193A-211ENST00000637812 4885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
GRAMD4Q6IC98 CUEDC1-202ENST00000407144 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
GRAMD4Q6IC98 CREB3L3-205ENST00000602257 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
GRAMD4Q6IC98 MFSD5-201ENST00000329548 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
GRAMD4Q6IC98 WIPI2-202ENST00000382384 1948 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
GRAMD4Q6IC98 KLF3-AS1-202ENST00000440181 2368 ntTSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
GRAMD4Q6IC98 TMEM121-202ENST00000431372 1519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
GRAMD4Q6IC98 MAP3K3-210ENST00000584573 2480 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
GRAMD4Q6IC98 HOXA4-204ENST00000610970 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
GRAMD4Q6IC98 CSNK1G3-207ENST00000512718 1569 ntTSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
GRAMD4Q6IC98 SHISA9-205ENST00000639941 1135 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
GRAMD4Q6IC98 LSR-205ENST00000427250 1606 ntTSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
GRAMD4Q6IC98 CCDC24-201ENST00000372318 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
GRAMD4Q6IC98 PRR35-201ENST00000409413 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
GRAMD4Q6IC98 PLEKHA8-201ENST00000258679 2293 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
GRAMD4Q6IC98 ATP5G2-208ENST00000552242 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
GRAMD4Q6IC98 PCMT1-202ENST00000367380 1628 ntTSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
GRAMD4Q6IC98 PCMT1-211ENST00000544496 1628 ntTSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
GRAMD4Q6IC98 AL022069.1-201ENST00000568025 1636 ntBASIC23.53■■□□□ 1.36
GRAMD4Q6IC98 AL136090.1-201ENST00000446849 366 ntTSL 3 BASIC23.53■■□□□ 1.36
GRAMD4Q6IC98 AC133561.4-201ENST00000566112 224 ntBASIC23.53■■□□□ 1.36
GRAMD4Q6IC98 EEF1D-201ENST00000317198 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
GRAMD4Q6IC98 SIGMAR1-201ENST00000277010 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
GRAMD4Q6IC98 ZNF365-206ENST00000395255 1674 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
GRAMD4Q6IC98 RCE1-202ENST00000524506 1379 ntTSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
GRAMD4Q6IC98 C8orf58-201ENST00000289989 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
GRAMD4Q6IC98 ARHGAP29-202ENST00000370217 2043 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
GRAMD4Q6IC98 DCUN1D2-208ENST00000478244 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
GRAMD4Q6IC98 PBX2P1-201ENST00000493219 1291 ntBASIC23.52■■□□□ 1.36
GRAMD4Q6IC98 HSF1-204ENST00000528838 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
GRAMD4Q6IC98 CADM4-201ENST00000222374 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
GRAMD4Q6IC98 C8orf58-206ENST00000614574 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
GRAMD4Q6IC98 PCSK6-218ENST00000619160 3093 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
GRAMD4Q6IC98 ARMC10-204ENST00000425331 2443 ntTSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
GRAMD4Q6IC98 AKT1S1-203ENST00000391831 2025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
GRAMD4Q6IC98 KLC1-203ENST00000347839 2271 ntTSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
GRAMD4Q6IC98 MBOAT7-201ENST00000245615 2529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.35
GRAMD4Q6IC98 APOE-201ENST00000252486 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
GRAMD4Q6IC98 CBR3-201ENST00000290354 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
GRAMD4Q6IC98 PRICKLE4-201ENST00000394259 939 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
GRAMD4Q6IC98 GMPPB-202ENST00000308388 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
GRAMD4Q6IC98 MEIOB-203ENST00000412554 1884 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
GRAMD4Q6IC98 ARHGEF35-201ENST00000378115 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
GRAMD4Q6IC98 LTK-203ENST00000453182 2412 ntTSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
GRAMD4Q6IC98 HNRNPL-201ENST00000221419 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
GRAMD4Q6IC98 PNLIPRP2-205ENST00000611850 1407 ntTSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
GRAMD4Q6IC98 SLC52A2-202ENST00000402965 1777 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
GRAMD4Q6IC98 GCLC-209ENST00000514004 2356 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
GRAMD4Q6IC98 FNTA-201ENST00000302279 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
GRAMD4Q6IC98 GATM-206ENST00000558336 1522 ntTSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
GRAMD4Q6IC98 UNC93B3-201ENST00000308076 687 ntBASIC23.5■■□□□ 1.35
GRAMD4Q6IC98 CCDC107-203ENST00000378407 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
GRAMD4Q6IC98 EPDR1-202ENST00000423717 638 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
GRAMD4Q6IC98 NELFB-201ENST00000343053 2698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
GRAMD4Q6IC98 LHX3-201ENST00000371746 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
GRAMD4Q6IC98 TMEM218-209ENST00000529583 848 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.49■■□□□ 1.35
GRAMD4Q6IC98 NRL-205ENST00000560550 788 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
GRAMD4Q6IC98 AC106739.1-201ENST00000617035 715 ntBASIC23.49■■□□□ 1.35
GRAMD4Q6IC98 SPG21-201ENST00000204566 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
GRAMD4Q6IC98 OSCAR-203ENST00000356532 1355 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
GRAMD4Q6IC98 OSCAR-204ENST00000358375 1389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
GRAMD4Q6IC98 OSCAR-210ENST00000616447 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
GRAMD4Q6IC98 ST3GAL5-231ENST00000639119 2131 ntTSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
GRAMD4Q6IC98 AC022211.4-201ENST00000625094 2161 ntBASIC23.48■■□□□ 1.35
GRAMD4Q6IC98 KCNG1-201ENST00000371571 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
GRAMD4Q6IC98 DYRK2-203ENST00000393555 2209 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
GRAMD4Q6IC98 RUNX2-210ENST00000576263 2256 ntTSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
GRAMD4Q6IC98 FAR2P4-203ENST00000560285 1739 ntTSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
GRAMD4Q6IC98 CCDC92-209ENST00000545891 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
GRAMD4Q6IC98 SPIRE2-205ENST00000563972 1823 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
GRAMD4Q6IC98 SCTR-201ENST00000019103 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
GRAMD4Q6IC98 LIN7B-202ENST00000391864 582 ntTSL 3 BASIC23.48■■□□□ 1.35
GRAMD4Q6IC98 NDUFS3-206ENST00000528192 561 ntTSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.3 ms