Protein–RNA interactions for Protein: Q6EEV6

SUMO4, Small ubiquitin-related modifier 4, humanhuman

Predictions only

Length 95 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SUMO4Q6EEV6 ARL4D-201ENST00000320033 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
SUMO4Q6EEV6 STMN4-204ENST00000519997 1623 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
SUMO4Q6EEV6 DONSON-202ENST00000303113 2028 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
SUMO4Q6EEV6 MTCL1-201ENST00000306329 5718 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
SUMO4Q6EEV6 RIPPLY2-202ENST00000369689 664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
SUMO4Q6EEV6 PLEKHJ1-204ENST00000586608 935 ntTSL 3 BASIC16.45■□□□□ 0.22
SUMO4Q6EEV6 FCGRT-217ENST00000599988 660 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
SUMO4Q6EEV6 RHOF-203ENST00000537171 1485 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
SUMO4Q6EEV6 SMARCB1-201ENST00000263121 1690 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
SUMO4Q6EEV6 ADSSL1-201ENST00000330877 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
SUMO4Q6EEV6 CCDC9-201ENST00000221922 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
SUMO4Q6EEV6 OBSL1-214ENST00000603926 5520 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
SUMO4Q6EEV6 PELI3-201ENST00000320740 2740 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
SUMO4Q6EEV6 KIF2A-202ENST00000401507 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
SUMO4Q6EEV6 CCSAP-201ENST00000284617 5121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
SUMO4Q6EEV6 KCNAB3-201ENST00000303790 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
SUMO4Q6EEV6 AKT2-210ENST00000424901 5170 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
SUMO4Q6EEV6 ACSF2-207ENST00000504392 1881 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
SUMO4Q6EEV6 P2RX5-201ENST00000225328 2309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
SUMO4Q6EEV6 UPF3A-209ENST00000492270 494 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
SUMO4Q6EEV6 CAPNS1-207ENST00000589146 578 ntTSL 3 BASIC16.44■□□□□ 0.22
SUMO4Q6EEV6 AC233723.2-201ENST00000623798 2106 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
SUMO4Q6EEV6 PDSS1-201ENST00000376215 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
SUMO4Q6EEV6 ITM2C-202ENST00000326427 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
SUMO4Q6EEV6 MAPK12-211ENST00000622558 1779 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
SUMO4Q6EEV6 SH3D19-211ENST00000604030 5228 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
SUMO4Q6EEV6 ST3GAL5-231ENST00000639119 2131 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
SUMO4Q6EEV6 AKT1S1-204ENST00000391832 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
SUMO4Q6EEV6 ARL6IP4-210ENST00000453766 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
SUMO4Q6EEV6 NTHL1-201ENST00000219066 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
SUMO4Q6EEV6 C1orf122-201ENST00000373042 973 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
SUMO4Q6EEV6 MIR639-201ENST00000384974 98 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
SUMO4Q6EEV6 BLOC1S3-202ENST00000587722 732 ntAPPRIS P1 BASIC16.43■□□□□ 0.22
SUMO4Q6EEV6 DONSON-204ENST00000432378 1618 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
SUMO4Q6EEV6 ZBTB22-208ENST00000431845 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
SUMO4Q6EEV6 NAT14-201ENST00000205194 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
SUMO4Q6EEV6 TMEM185B-201ENST00000426077 2131 ntAPPRIS P1 BASIC16.43■□□□□ 0.22
SUMO4Q6EEV6 KLC3-201ENST00000391946 1780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
SUMO4Q6EEV6 CAPN12-212ENST00000601953 2381 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
SUMO4Q6EEV6 YAP1-210ENST00000615667 5398 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
SUMO4Q6EEV6 TRIM72-202ENST00000613872 1573 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
SUMO4Q6EEV6 ARHGAP27-207ENST00000528273 2319 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
SUMO4Q6EEV6 NIPSNAP1-201ENST00000216121 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
SUMO4Q6EEV6 NKX2-4-201ENST00000351817 2238 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
SUMO4Q6EEV6 SLC25A29-202ENST00000392908 2242 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
SUMO4Q6EEV6 LYRM1-201ENST00000219168 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
SUMO4Q6EEV6 POLDIP2-201ENST00000540200 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
SUMO4Q6EEV6 RILP-201ENST00000301336 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
SUMO4Q6EEV6 SDF2L1-201ENST00000248958 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
SUMO4Q6EEV6 NRG3-201ENST00000372141 2158 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
SUMO4Q6EEV6 SPON2-222ENST00000617421 2156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
SUMO4Q6EEV6 ANKRD9-204ENST00000559651 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
SUMO4Q6EEV6 IGF2-AS-201ENST00000381361 2063 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
SUMO4Q6EEV6 KAT2B-201ENST00000263754 4833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
SUMO4Q6EEV6 INPPL1-201ENST00000298229 4733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
SUMO4Q6EEV6 SH3RF3-201ENST00000309415 5803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
SUMO4Q6EEV6 MRPL38-201ENST00000309352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
SUMO4Q6EEV6 DXO-201ENST00000337523 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
SUMO4Q6EEV6 FAM102B-201ENST00000370035 5600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
SUMO4Q6EEV6 C5orf49-201ENST00000399810 2385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
SUMO4Q6EEV6 MATK-204ENST00000585778 1994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
SUMO4Q6EEV6 MIR7108-201ENST00000614319 87 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
SUMO4Q6EEV6 FHL2-203ENST00000358129 1578 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
SUMO4Q6EEV6 HIRA-201ENST00000263208 4053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
SUMO4Q6EEV6 TMEM120A-214ENST00000493111 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
SUMO4Q6EEV6 FLOT1-201ENST00000376389 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
SUMO4Q6EEV6 DGKQ-201ENST00000273814 4636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
SUMO4Q6EEV6 TANGO2-201ENST00000327374 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
SUMO4Q6EEV6 ZNF74-204ENST00000405993 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
SUMO4Q6EEV6 TLX1-203ENST00000467928 1838 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
SUMO4Q6EEV6 JMJD8-201ENST00000412368 2038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
SUMO4Q6EEV6 TNFRSF10B-202ENST00000347739 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
SUMO4Q6EEV6 PDLIM2-202ENST00000308354 2236 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
SUMO4Q6EEV6 PSMG4-206ENST00000438998 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
SUMO4Q6EEV6 HES4-204ENST00000484667 667 ntTSL 3 BASIC16.4■□□□□ 0.22
SUMO4Q6EEV6 BTBD6-201ENST00000327471 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
SUMO4Q6EEV6 TMEM259-201ENST00000333175 2581 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
SUMO4Q6EEV6 ARHGAP5-203ENST00000396582 5786 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
SUMO4Q6EEV6 NR6A1-201ENST00000344523 1846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
SUMO4Q6EEV6 AC096541.1-201ENST00000445070 1807 ntTSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
SUMO4Q6EEV6 SLIT1-203ENST00000371041 1695 ntTSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
SUMO4Q6EEV6 ACTL10-201ENST00000330271 2028 ntAPPRIS P1 BASIC16.4■□□□□ 0.22
SUMO4Q6EEV6 PHF2-201ENST00000359246 5569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
SUMO4Q6EEV6 BCKDHB-202ENST00000356489 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
SUMO4Q6EEV6 PPP1CC-206ENST00000550991 1882 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.22
SUMO4Q6EEV6 ANXA8-204ENST00000583911 1874 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.22
SUMO4Q6EEV6 AC092068.2-201ENST00000590491 1708 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
SUMO4Q6EEV6 HRK-201ENST00000257572 5789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
SUMO4Q6EEV6 DUSP8P3-201ENST00000399571 1760 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
SUMO4Q6EEV6 B3GNT6-202ENST00000622824 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
SUMO4Q6EEV6 CNN3-201ENST00000370206 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
SUMO4Q6EEV6 NXNL1-201ENST00000301944 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
SUMO4Q6EEV6 MAPK3-203ENST00000395199 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
SUMO4Q6EEV6 MAPK3-205ENST00000395202 1008 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
SUMO4Q6EEV6 RPS2-202ENST00000526522 924 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
SUMO4Q6EEV6 CLDN5-201ENST00000403084 2357 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
SUMO4Q6EEV6 DUSP22-201ENST00000344450 1485 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
SUMO4Q6EEV6 ZNF213-208ENST00000576416 2240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
SUMO4Q6EEV6 AC090877.2-201ENST00000558441 1738 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
SUMO4Q6EEV6 LYPLA1-201ENST00000316963 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.5 ms