Protein–RNA interactions for Protein: Q6DN14

MCTP1, Multiple C2 and transmembrane domain-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 999 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MCTP1Q6DN14 BCKDHB-202ENST00000356489 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
MCTP1Q6DN14 DTNB-206ENST00000404103 2384 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.93■■□□□ 1.9
MCTP1Q6DN14 CKB-201ENST00000348956 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
MCTP1Q6DN14 ITM2C-202ENST00000326427 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
MCTP1Q6DN14 ZNF74-204ENST00000405993 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.93■■□□□ 1.9
MCTP1Q6DN14 DLK2-202ENST00000372485 1572 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.92■■□□□ 1.9
MCTP1Q6DN14 TSEN54-201ENST00000333213 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
MCTP1Q6DN14 ACTL10-201ENST00000330271 2028 ntAPPRIS P1 BASIC26.92■■□□□ 1.9
MCTP1Q6DN14 B3GALNT2-202ENST00000366600 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
MCTP1Q6DN14 FGF22-202ENST00000586042 1288 ntTSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
MCTP1Q6DN14 AL117328.2-201ENST00000624617 1940 ntBASIC26.92■■□□□ 1.9
MCTP1Q6DN14 PTRH1-205ENST00000423807 1570 ntTSL 2 BASIC26.92■■□□□ 1.9
MCTP1Q6DN14 UPF3A-201ENST00000351487 2235 ntTSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
MCTP1Q6DN14 POU2F3-206ENST00000543440 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
MCTP1Q6DN14 ARL4D-201ENST00000320033 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
MCTP1Q6DN14 PTCH1-210ENST00000468211 1254 ntTSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
MCTP1Q6DN14 ASF1B-201ENST00000263382 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
MCTP1Q6DN14 SLC12A2-201ENST00000262461 6885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
MCTP1Q6DN14 TCEA1-211ENST00000522635 1432 ntTSL 2 BASIC26.9■■□□□ 1.9
MCTP1Q6DN14 TMEM268-202ENST00000374049 4578 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.9■■□□□ 1.9
MCTP1Q6DN14 KCNQ5-213ENST00000629977 2830 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
MCTP1Q6DN14 ARRDC1-AS1-203ENST00000623970 2210 ntTSL 5 BASIC26.9■■□□□ 1.9
MCTP1Q6DN14 DENND5A-201ENST00000328194 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
MCTP1Q6DN14 RAD21L1-202ENST00000402452 1707 ntTSL 5 BASIC26.9■■□□□ 1.9
MCTP1Q6DN14 FKBP1A-211ENST00000618612 1518 ntTSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
MCTP1Q6DN14 C8orf82-202ENST00000524821 2476 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
MCTP1Q6DN14 CNN3-202ENST00000394202 1974 ntTSL 2 BASIC26.89■■□□□ 1.9
MCTP1Q6DN14 ELL3-201ENST00000319359 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
MCTP1Q6DN14 NR6A1-201ENST00000344523 1846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.89■■□□□ 1.9
MCTP1Q6DN14 LINC02043-201ENST00000419745 1832 ntTSL 2 BASIC26.89■■□□□ 1.9
MCTP1Q6DN14 HERC2P9-201ENST00000507787 1023 ntTSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
MCTP1Q6DN14 LMAN2-208ENST00000515209 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC26.89■■□□□ 1.9
MCTP1Q6DN14 OXLD1-203ENST00000571503 803 ntTSL 2 BASIC26.89■■□□□ 1.9
MCTP1Q6DN14 ABHD17AP5-201ENST00000580133 923 ntBASIC26.89■■□□□ 1.9
MCTP1Q6DN14 KISS1R-201ENST00000234371 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
MCTP1Q6DN14 TMEM259-201ENST00000333175 2581 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.89
MCTP1Q6DN14 NEK6-214ENST00000545174 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.89
MCTP1Q6DN14 DONSON-202ENST00000303113 2028 ntTSL 5 BASIC26.89■■□□□ 1.89
MCTP1Q6DN14 NIPSNAP1-201ENST00000216121 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
MCTP1Q6DN14 FBXO7-206ENST00000452138 1535 ntTSL 2 BASIC26.88■■□□□ 1.89
MCTP1Q6DN14 APBB3-204ENST00000358580 2020 ntTSL 5 BASIC26.88■■□□□ 1.89
MCTP1Q6DN14 C19orf68-201ENST00000328759 2277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
MCTP1Q6DN14 LYPLA1-201ENST00000316963 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
MCTP1Q6DN14 FHL2-203ENST00000358129 1578 ntTSL 5 BASIC26.88■■□□□ 1.89
MCTP1Q6DN14 NKX2-4-201ENST00000351817 2238 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.88■■□□□ 1.89
MCTP1Q6DN14 TMEM102-202ENST00000396568 1962 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.88■■□□□ 1.89
MCTP1Q6DN14 PPM1J-201ENST00000309276 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
MCTP1Q6DN14 SLC19A1-202ENST00000380010 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
MCTP1Q6DN14 RSPO4-202ENST00000400634 722 ntTSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
MCTP1Q6DN14 YPEL1-202ENST00000403503 466 ntTSL 3 BASIC26.87■■□□□ 1.89
MCTP1Q6DN14 TCEA1-213ENST00000640041 1171 ntTSL 5 BASIC26.87■■□□□ 1.89
MCTP1Q6DN14 HMG20B-202ENST00000333651 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
MCTP1Q6DN14 PPP1CC-206ENST00000550991 1882 ntTSL 2 BASIC26.87■■□□□ 1.89
MCTP1Q6DN14 ADGRB1-202ENST00000517894 6241 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.87■■□□□ 1.89
MCTP1Q6DN14 CDC16-206ENST00000375310 2156 ntTSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
MCTP1Q6DN14 KCTD15-207ENST00000589786 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.87■■□□□ 1.89
MCTP1Q6DN14 NPTXR-201ENST00000333039 5784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
MCTP1Q6DN14 OSCAR-207ENST00000391761 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
MCTP1Q6DN14 MED22-201ENST00000343730 1437 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
MCTP1Q6DN14 OXLD1-201ENST00000374741 620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
MCTP1Q6DN14 C17orf49-201ENST00000439424 850 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
MCTP1Q6DN14 PHLPP1-201ENST00000262719 6390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
MCTP1Q6DN14 ST3GAL5-231ENST00000639119 2131 ntTSL 5 BASIC26.86■■□□□ 1.89
MCTP1Q6DN14 POLR2H-208ENST00000456318 1802 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.86■■□□□ 1.89
MCTP1Q6DN14 AC004980.1-201ENST00000418663 2667 ntTSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
MCTP1Q6DN14 FKBP8-209ENST00000597960 1781 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC26.85■■□□□ 1.89
MCTP1Q6DN14 DUX4L18-201ENST00000553347 1267 ntBASIC26.85■■□□□ 1.89
MCTP1Q6DN14 NIPSNAP2-201ENST00000322090 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
MCTP1Q6DN14 OSCAR-209ENST00000616215 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.85■■□□□ 1.89
MCTP1Q6DN14 ABHD17B-202ENST00000377041 1312 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
MCTP1Q6DN14 SCAMP3-202ENST00000355379 1537 ntTSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
MCTP1Q6DN14 SNHG7-201ENST00000414282 2357 ntTSL 2 BASIC26.84■■□□□ 1.89
MCTP1Q6DN14 B3GNT6-202ENST00000622824 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
MCTP1Q6DN14 ZNF837-202ENST00000597582 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.84■■□□□ 1.89
MCTP1Q6DN14 EP400NL-214ENST00000641289 2402 ntBASIC26.84■■□□□ 1.89
MCTP1Q6DN14 HOMER3-201ENST00000221222 1384 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.84■■□□□ 1.89
MCTP1Q6DN14 LSR-202ENST00000354900 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
MCTP1Q6DN14 AC233723.2-201ENST00000623798 2106 ntBASIC26.83■■□□□ 1.89
MCTP1Q6DN14 C20orf24-203ENST00000373852 1059 ntTSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
MCTP1Q6DN14 AL592295.1-201ENST00000400984 884 ntBASIC26.83■■□□□ 1.89
MCTP1Q6DN14 NTF6A-201ENST00000591175 560 ntBASIC26.83■■□□□ 1.89
MCTP1Q6DN14 TMUB1-203ENST00000462940 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
MCTP1Q6DN14 TPRN-202ENST00000409012 2718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
MCTP1Q6DN14 RUNDC3A-202ENST00000426726 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
MCTP1Q6DN14 CHST6-202ENST00000390664 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
MCTP1Q6DN14 SRSF11-203ENST00000370951 2385 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.88
MCTP1Q6DN14 STEAP2-204ENST00000394626 2456 ntTSL 2 BASIC26.82■■□□□ 1.88
MCTP1Q6DN14 STK25-234ENST00000535007 2459 ntTSL 2 BASIC26.82■■□□□ 1.88
MCTP1Q6DN14 GAS1-201ENST00000298743 2827 ntAPPRIS P1 BASIC26.82■■□□□ 1.88
MCTP1Q6DN14 HOMER3-207ENST00000594794 903 ntTSL 5 BASIC26.82■■□□□ 1.88
MCTP1Q6DN14 MYH7B-209ENST00000618182 6197 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.82■■□□□ 1.88
MCTP1Q6DN14 PTX3-201ENST00000295927 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
MCTP1Q6DN14 PFKFB3-201ENST00000317350 1999 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.82■■□□□ 1.88
MCTP1Q6DN14 AC090877.2-201ENST00000558441 1738 ntBASIC26.82■■□□□ 1.88
MCTP1Q6DN14 TANGO2-201ENST00000327374 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
MCTP1Q6DN14 POU4F1-201ENST00000377208 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
MCTP1Q6DN14 SLC10A3-201ENST00000263512 2161 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26.81■■□□□ 1.88
MCTP1Q6DN14 MOGS-202ENST00000409065 2668 ntTSL 5 BASIC26.81■■□□□ 1.88
MCTP1Q6DN14 ZNF668-205ENST00000426488 2282 ntTSL 5 BASIC26.81■■□□□ 1.88
MCTP1Q6DN14 DHH-201ENST00000266991 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14.3 ms