Protein–RNA interactions for Protein: Q6AI14

SLC9A4, Sodium/hydrogen exchanger 4, humanhuman

Predictions only

Length 798 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC9A4Q6AI14 RBPMS-209ENST00000520161 842 ntTSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
SLC9A4Q6AI14 DAZAP1-201ENST00000233078 2160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
SLC9A4Q6AI14 DHRS11-215ENST00000618403 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
SLC9A4Q6AI14 HRH3-202ENST00000340177 2659 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
SLC9A4Q6AI14 ZFAND4-205ENST00000374371 2283 ntTSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
SLC9A4Q6AI14 PPP1R1B-201ENST00000254079 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
SLC9A4Q6AI14 SEPT4-205ENST00000426861 1906 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
SLC9A4Q6AI14 HES6-201ENST00000272937 1454 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
SLC9A4Q6AI14 ARSB-202ENST00000396151 2316 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
SLC9A4Q6AI14 TMEM102-201ENST00000323206 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
SLC9A4Q6AI14 TMEM102-202ENST00000396568 1962 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
SLC9A4Q6AI14 DCAF4-206ENST00000509153 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
SLC9A4Q6AI14 ERF-201ENST00000222329 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
SLC9A4Q6AI14 EI24-204ENST00000527235 1625 ntTSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
SLC9A4Q6AI14 SNHG12-212ENST00000531126 719 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
SLC9A4Q6AI14 MADCAM1-206ENST00000617201 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
SLC9A4Q6AI14 MADCAM1-207ENST00000619333 1485 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
SLC9A4Q6AI14 MADCAM1-210ENST00000622462 1461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
SLC9A4Q6AI14 ALDH1A3-203ENST00000557963 1670 ntBASIC23.59■■□□□ 1.37
SLC9A4Q6AI14 RNF19B-203ENST00000373456 2560 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
SLC9A4Q6AI14 RAD21L1-202ENST00000402452 1707 ntTSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
SLC9A4Q6AI14 DTNB-206ENST00000404103 2384 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.37
SLC9A4Q6AI14 GFOD1-204ENST00000603223 2388 ntTSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.37
SLC9A4Q6AI14 IKBKG-211ENST00000615874 1460 ntTSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.37
SLC9A4Q6AI14 IKBKG-215ENST00000619941 1463 ntTSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.37
SLC9A4Q6AI14 AL590094.1-201ENST00000635581 706 ntTSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.37
SLC9A4Q6AI14 OSCAR-209ENST00000616215 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.37
SLC9A4Q6AI14 ADARB2-202ENST00000381310 1810 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
SLC9A4Q6AI14 LINC00092-201ENST00000412122 1726 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
SLC9A4Q6AI14 ABHD17C-201ENST00000258884 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
SLC9A4Q6AI14 ARMC10-202ENST00000323716 2635 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
SLC9A4Q6AI14 B3GALNT2-202ENST00000366600 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
SLC9A4Q6AI14 IFNGR2-202ENST00000381995 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
SLC9A4Q6AI14 CCDC47-204ENST00000582252 1719 ntTSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
SLC9A4Q6AI14 IRX5-201ENST00000320990 2061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
SLC9A4Q6AI14 IQCJ-SCHIP1-201ENST00000412423 2067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
SLC9A4Q6AI14 EPM2A-202ENST00000435470 1278 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
SLC9A4Q6AI14 AL355490.1-201ENST00000445808 805 ntTSL 3 BASIC23.57■■□□□ 1.36
SLC9A4Q6AI14 MED25-211ENST00000617849 1548 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
SLC9A4Q6AI14 KLC1-201ENST00000246489 2294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
SLC9A4Q6AI14 KLC1-224ENST00000557450 2265 ntTSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
SLC9A4Q6AI14 DUSP8P5-201ENST00000422884 1815 ntBASIC23.56■■□□□ 1.36
SLC9A4Q6AI14 SPHK1-210ENST00000592299 1821 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
SLC9A4Q6AI14 FBXW4-201ENST00000331272 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
SLC9A4Q6AI14 PTRH1-208ENST00000543175 814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
SLC9A4Q6AI14 HOXA10-206ENST00000613671 2175 ntTSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
SLC9A4Q6AI14 ZKSCAN7-206ENST00000431636 1692 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
SLC9A4Q6AI14 PEX5-205ENST00000420616 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
SLC9A4Q6AI14 AC096541.1-201ENST00000445070 1807 ntTSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
SLC9A4Q6AI14 EEF1D-256ENST00000618139 2238 ntTSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
SLC9A4Q6AI14 ZNF837-202ENST00000597582 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
SLC9A4Q6AI14 NPEPL1-201ENST00000356091 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
SLC9A4Q6AI14 MAP6D1-201ENST00000318631 2111 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
SLC9A4Q6AI14 KCNS1-202ENST00000537075 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
SLC9A4Q6AI14 ANKRD54-201ENST00000215941 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
SLC9A4Q6AI14 UNC50-204ENST00000409975 2172 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
SLC9A4Q6AI14 TARSL2-207ENST00000615656 2356 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
SLC9A4Q6AI14 BRI3-201ENST00000297290 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
SLC9A4Q6AI14 AC004448.1-201ENST00000458332 883 ntBASIC23.55■■□□□ 1.36
SLC9A4Q6AI14 NEURL1B-203ENST00000522853 1263 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
SLC9A4Q6AI14 TK2-216ENST00000564917 1156 ntTSL 3 BASIC23.55■■□□□ 1.36
SLC9A4Q6AI14 ZFYVE19-201ENST00000299173 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
SLC9A4Q6AI14 ACOT1-201ENST00000311148 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
SLC9A4Q6AI14 AUH-201ENST00000303617 1490 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
SLC9A4Q6AI14 PANK2-201ENST00000316562 2280 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
SLC9A4Q6AI14 OSCAR-211ENST00000617140 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
SLC9A4Q6AI14 METTL24-201ENST00000338882 1119 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
SLC9A4Q6AI14 LRRC1-201ENST00000370882 808 ntTSL 3 BASIC23.54■■□□□ 1.36
SLC9A4Q6AI14 SNAI3-AS1-203ENST00000565633 829 ntTSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
SLC9A4Q6AI14 LRRC34-206ENST00000522526 1899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
SLC9A4Q6AI14 PCYT2-201ENST00000331285 2147 ntTSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
SLC9A4Q6AI14 CTDSP2-203ENST00000547701 988 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
SLC9A4Q6AI14 AL031848.2-201ENST00000607670 837 ntBASIC23.53■■□□□ 1.36
SLC9A4Q6AI14 KLC1-205ENST00000380038 2322 ntTSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
SLC9A4Q6AI14 CPNE2-202ENST00000535318 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
SLC9A4Q6AI14 THRA-201ENST00000264637 2538 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
SLC9A4Q6AI14 STEAP2-207ENST00000402625 1372 ntTSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
SLC9A4Q6AI14 WRNIP1-205ENST00000618555 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
SLC9A4Q6AI14 SPANXA2-OT1-201ENST00000622372 1686 ntTSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
SLC9A4Q6AI14 PON2-218ENST00000633531 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
SLC9A4Q6AI14 HTRA2-202ENST00000352222 1450 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
SLC9A4Q6AI14 AC137630.3-201ENST00000607245 391 ntBASIC23.52■■□□□ 1.36
SLC9A4Q6AI14 AC005551.1-201ENST00000641816 493 ntAPPRIS P1 BASIC23.52■■□□□ 1.36
SLC9A4Q6AI14 ADORA2B-201ENST00000304222 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
SLC9A4Q6AI14 AMZ2-202ENST00000359904 2402 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
SLC9A4Q6AI14 STARD3NL-201ENST00000009041 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
SLC9A4Q6AI14 TSEN15-201ENST00000361641 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
SLC9A4Q6AI14 ABHD6-205ENST00000478253 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
SLC9A4Q6AI14 AL136090.1-201ENST00000446849 366 ntTSL 3 BASIC23.51■■□□□ 1.35
SLC9A4Q6AI14 C18orf65-201ENST00000622985 2076 ntTSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
SLC9A4Q6AI14 DXO-201ENST00000337523 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
SLC9A4Q6AI14 IKBIP-202ENST00000342502 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
SLC9A4Q6AI14 CCDC151-203ENST00000591179 1943 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
SLC9A4Q6AI14 IRX4-202ENST00000505790 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
SLC9A4Q6AI14 SRPK3-204ENST00000370108 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
SLC9A4Q6AI14 NKX2-8-201ENST00000258829 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
SLC9A4Q6AI14 VSTM2L-201ENST00000373459 831 ntTSL 3 BASIC23.5■■□□□ 1.35
SLC9A4Q6AI14 OSCAR-206ENST00000391760 629 ntTSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
SLC9A4Q6AI14 FAHD1-204ENST00000615972 757 ntTSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
SLC9A4Q6AI14 FLOT1-201ENST00000376389 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14.8 ms