Protein–RNA interactions for Protein: Q68G74

LHX8, LIM/homeobox protein Lhx8, humanhuman

Predictions only

Length 356 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LHX8Q68G74 DUX4L2-201ENST00000561772 1275 ntBASIC25.75■■□□□ 1.71
LHX8Q68G74 DUX4-206ENST00000616166 1275 ntAPPRIS P2 BASIC25.75■■□□□ 1.71
LHX8Q68G74 DUX4L6-201ENST00000626483 1275 ntBASIC25.75■■□□□ 1.71
LHX8Q68G74 DUX4L1-201ENST00000627662 1275 ntBASIC25.75■■□□□ 1.71
LHX8Q68G74 DUX4L8-201ENST00000629013 1275 ntBASIC25.75■■□□□ 1.71
LHX8Q68G74 DUX4L3-201ENST00000630187 1275 ntBASIC25.75■■□□□ 1.71
LHX8Q68G74 DUX4L7-201ENST00000630678 1275 ntBASIC25.75■■□□□ 1.71
LHX8Q68G74 DUX4L5-201ENST00000630834 1275 ntBASIC25.75■■□□□ 1.71
LHX8Q68G74 SLC35A2-212ENST00000634665 486 ntTSL 4 BASIC25.75■■□□□ 1.71
LHX8Q68G74 RRAGC-201ENST00000373001 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
LHX8Q68G74 SNX3-202ENST00000349379 890 ntTSL 2 BASIC25.74■■□□□ 1.71
LHX8Q68G74 BCAP29-209ENST00000465919 942 ntTSL 2 BASIC25.74■■□□□ 1.71
LHX8Q68G74 TUNAR-203ENST00000554321 767 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC25.74■■□□□ 1.71
LHX8Q68G74 ZDHHC16-207ENST00000393760 2014 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
LHX8Q68G74 ZMYND11-210ENST00000403354 1664 ntTSL 5 BASIC25.74■■□□□ 1.71
LHX8Q68G74 HNRNPAB-201ENST00000355836 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
LHX8Q68G74 LTB4R2-205ENST00000543919 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
LHX8Q68G74 RCN2-202ENST00000394883 1366 ntTSL 5 BASIC25.73■■□□□ 1.71
LHX8Q68G74 CD47-202ENST00000361309 1285 ntTSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
LHX8Q68G74 STK32C-205ENST00000456004 607 ntTSL 2 BASIC25.73■■□□□ 1.71
LHX8Q68G74 AC018413.1-201ENST00000581996 1200 ntTSL 2 BASIC25.73■■□□□ 1.71
LHX8Q68G74 CLK2-203ENST00000368361 2166 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
LHX8Q68G74 WIPI2-204ENST00000404704 1663 ntTSL 5 BASIC25.73■■□□□ 1.71
LHX8Q68G74 PXK-201ENST00000302779 1974 ntTSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
LHX8Q68G74 SPI1-201ENST00000227163 1168 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC25.72■■□□□ 1.71
LHX8Q68G74 PRR25-201ENST00000301698 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
LHX8Q68G74 CENPVL3-201ENST00000417339 864 ntAPPRIS P1 BASIC25.72■■□□□ 1.71
LHX8Q68G74 SUZ12P1-202ENST00000578070 929 ntTSL 5 BASIC25.72■■□□□ 1.71
LHX8Q68G74 AC024267.6-201ENST00000580603 583 ntTSL 3 BASIC25.72■■□□□ 1.71
LHX8Q68G74 TMEM268-201ENST00000288502 2314 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
LHX8Q68G74 RAB3IL1-202ENST00000394836 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
LHX8Q68G74 SERF1A-202ENST00000354833 1889 ntTSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
LHX8Q68G74 SERF1B-201ENST00000380750 1889 ntTSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
LHX8Q68G74 PSMG1-201ENST00000331573 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
LHX8Q68G74 GNAL-201ENST00000269162 1722 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.71■■□□□ 1.71
LHX8Q68G74 CCND3-223ENST00000616010 2047 ntTSL 5 BASIC25.71■■□□□ 1.71
LHX8Q68G74 SCARA5-204ENST00000524352 1945 ntTSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
LHX8Q68G74 FAM149A-201ENST00000227065 2708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
LHX8Q68G74 LINC01167-201ENST00000423232 604 ntTSL 3 BASIC25.71■■□□□ 1.71
LHX8Q68G74 AC010336.5-201ENST00000594308 317 ntTSL 3 BASIC25.71■■□□□ 1.71
LHX8Q68G74 EVX1-201ENST00000222761 1500 ntTSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
LHX8Q68G74 LDHB-203ENST00000396076 1538 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.71■■□□□ 1.71
LHX8Q68G74 PLEKHF1-201ENST00000436066 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
LHX8Q68G74 TLX3-201ENST00000296921 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
LHX8Q68G74 CBWD2-203ENST00000416503 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
LHX8Q68G74 ANKS3-204ENST00000585773 1946 ntTSL 2 BASIC25.71■■□□□ 1.71
LHX8Q68G74 HDGFL1-201ENST00000510882 2174 ntAPPRIS P1 BASIC25.71■■□□□ 1.71
LHX8Q68G74 PQLC1-203ENST00000397778 2555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.71
LHX8Q68G74 AC004691.2-201ENST00000509504 1531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.7■■□□□ 1.7
LHX8Q68G74 CBWD3-213ENST00000618217 1611 ntTSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
LHX8Q68G74 NANOS2-201ENST00000341294 1657 ntAPPRIS P1 BASIC25.69■■□□□ 1.7
LHX8Q68G74 CAMK1-201ENST00000256460 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
LHX8Q68G74 GP9-201ENST00000307395 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
LHX8Q68G74 MRPL14-201ENST00000372014 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
LHX8Q68G74 KRTAP5-2-201ENST00000412090 1118 ntAPPRIS P1 BASIC25.69■■□□□ 1.7
LHX8Q68G74 AC104986.2-201ENST00000521696 380 ntTSL 2 BASIC25.69■■□□□ 1.7
LHX8Q68G74 PDCD5-204ENST00000586035 601 ntTSL 3 BASIC25.69■■□□□ 1.7
LHX8Q68G74 RAB43-208ENST00000615093 783 ntTSL 5 BASIC25.69■■□□□ 1.7
LHX8Q68G74 DLK2-202ENST00000372485 1572 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.69■■□□□ 1.7
LHX8Q68G74 PTH1R-206ENST00000430002 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
LHX8Q68G74 CNN3-202ENST00000394202 1974 ntTSL 2 BASIC25.68■■□□□ 1.7
LHX8Q68G74 EIF6-203ENST00000374450 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
LHX8Q68G74 FAM219A-202ENST00000379078 770 ntTSL 3 BASIC25.68■■□□□ 1.7
LHX8Q68G74 FAM219A-205ENST00000379084 893 ntTSL 5 BASIC25.68■■□□□ 1.7
LHX8Q68G74 ASPDH-202ENST00000389208 1040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.68■■□□□ 1.7
LHX8Q68G74 NMRAL1-202ENST00000404295 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
LHX8Q68G74 AL161908.1-203ENST00000425370 506 ntTSL 2 BASIC25.68■■□□□ 1.7
LHX8Q68G74 AC009086.3-201ENST00000623486 1008 ntBASIC25.68■■□□□ 1.7
LHX8Q68G74 SHISA5-201ENST00000296444 2369 ntTSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
LHX8Q68G74 BMP7-204ENST00000450594 1857 ntTSL 2 BASIC25.68■■□□□ 1.7
LHX8Q68G74 KAT8-206ENST00000543774 1846 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.67■■□□□ 1.7
LHX8Q68G74 TMEM55B-201ENST00000250489 1961 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
LHX8Q68G74 BIN1-211ENST00000409400 2143 ntTSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
LHX8Q68G74 RASSF5-204ENST00000580449 1932 ntTSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
LHX8Q68G74 MPC1-202ENST00000360961 962 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.67■■□□□ 1.7
LHX8Q68G74 PPA1-202ENST00000373232 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
LHX8Q68G74 MFSD14C-201ENST00000375223 619 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.67■■□□□ 1.7
LHX8Q68G74 NDEL1-202ENST00000380025 2181 ntTSL 5 BASIC25.67■■□□□ 1.7
LHX8Q68G74 UHRF2-202ENST00000381373 802 ntTSL 3 BASIC25.67■■□□□ 1.7
LHX8Q68G74 IGHV3-20-201ENST00000390606 415 ntAPPRIS P1 BASIC25.67■■□□□ 1.7
LHX8Q68G74 MELTF-AS1-202ENST00000415244 951 ntTSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
LHX8Q68G74 YJEFN3-203ENST00000514277 995 ntTSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
LHX8Q68G74 MYBL1-201ENST00000517885 1714 ntTSL 5 BASIC25.67■■□□□ 1.7
LHX8Q68G74 SNAI3-AS1-201ENST00000563261 998 ntTSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
LHX8Q68G74 AC010501.1-201ENST00000606270 1962 ntBASIC25.67■■□□□ 1.7
LHX8Q68G74 RARA-AS1-201ENST00000581080 1790 ntTSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
LHX8Q68G74 PEX11G-203ENST00000593942 1345 ntTSL 5 BASIC25.66■■□□□ 1.7
LHX8Q68G74 MAD2L2-201ENST00000235310 1860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.66■■□□□ 1.7
LHX8Q68G74 GADD45A-201ENST00000370985 803 ntTSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
LHX8Q68G74 ID1-201ENST00000376105 1233 ntBASIC25.66■■□□□ 1.7
LHX8Q68G74 AC004911.1-201ENST00000416316 871 ntBASIC25.66■■□□□ 1.7
LHX8Q68G74 SLC25A6-201ENST00000381401 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
LHX8Q68G74 LINC01116-201ENST00000295549 1407 ntTSL 2 BASIC25.65■■□□□ 1.7
LHX8Q68G74 DLX3-202ENST00000512495 834 ntTSL 2 BASIC25.65■■□□□ 1.7
LHX8Q68G74 C17orf49-202ENST00000546495 996 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC25.65■■□□□ 1.7
LHX8Q68G74 AC010203.1-202ENST00000550096 695 ntTSL 3 BASIC25.65■■□□□ 1.7
LHX8Q68G74 UBFD1-208ENST00000567264 642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.65■■□□□ 1.7
LHX8Q68G74 AC005775.1-201ENST00000592413 850 ntTSL 5 BASIC25.65■■□□□ 1.7
LHX8Q68G74 RABEP2-203ENST00000544477 1645 ntTSL 2 BASIC25.65■■□□□ 1.7
LHX8Q68G74 TMEM104-205ENST00000582773 1740 ntTSL 2 BASIC25.65■■□□□ 1.7
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.2 ms