Protein–RNA interactions for Protein: Q659A1

ICE2, Little elongation complex subunit 2, humanhuman

Predictions only

Length 982 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ICE2Q659A1 UBE2I-213ENST00000566587 1098 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
ICE2Q659A1 PPP2R2D-201ENST00000455566 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
ICE2Q659A1 CTSF-201ENST00000310325 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
ICE2Q659A1 IRX5-202ENST00000394636 2401 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC23.19■■□□□ 1.3
ICE2Q659A1 CDV3-201ENST00000264993 3307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
ICE2Q659A1 SLC39A2-201ENST00000298681 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
ICE2Q659A1 ZFP64-206ENST00000371523 2234 ntTSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
ICE2Q659A1 AC129492.7-201ENST00000622992 756 ntBASIC23.19■■□□□ 1.3
ICE2Q659A1 AC243965.2-201ENST00000612576 2671 ntTSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
ICE2Q659A1 PDPK1-204ENST00000441549 1729 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
ICE2Q659A1 PAIP1-208ENST00000514514 1603 ntTSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
ICE2Q659A1 CCDC71L-201ENST00000315965 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
ICE2Q659A1 PRKACA-201ENST00000308677 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
ICE2Q659A1 MATK-202ENST00000395040 1907 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
ICE2Q659A1 YRDC-201ENST00000373044 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
ICE2Q659A1 SPCS2P3-201ENST00000500401 656 ntBASIC23.18■■□□□ 1.3
ICE2Q659A1 ATPAF1-213ENST00000574428 1760 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
ICE2Q659A1 DENND1B-204ENST00000367396 2177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
ICE2Q659A1 DOCK5-208ENST00000481100 2166 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
ICE2Q659A1 NSUN2-206ENST00000506139 2619 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
ICE2Q659A1 PHLPP1-201ENST00000262719 6390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
ICE2Q659A1 CPSF4-207ENST00000451876 1644 ntTSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
ICE2Q659A1 RCCD1-206ENST00000556618 1556 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
ICE2Q659A1 ZNF747-203ENST00000568028 1511 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
ICE2Q659A1 TANGO2-201ENST00000327374 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
ICE2Q659A1 KAT5-201ENST00000341318 2296 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
ICE2Q659A1 IRX4-201ENST00000231357 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
ICE2Q659A1 RASGRP1-201ENST00000310803 5023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
ICE2Q659A1 RASGRP1-204ENST00000539159 5021 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
ICE2Q659A1 CHKA-202ENST00000356135 1755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
ICE2Q659A1 LINC01140-202ENST00000467438 2375 ntTSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
ICE2Q659A1 IFI30-201ENST00000407280 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
ICE2Q659A1 GGH-201ENST00000260118 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
ICE2Q659A1 NEU4-202ENST00000391969 2526 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
ICE2Q659A1 GPR162-201ENST00000311268 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
ICE2Q659A1 PTPRM-201ENST00000332175 6095 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
ICE2Q659A1 CDKN3-202ENST00000335183 893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
ICE2Q659A1 DUX4L9-201ENST00000449051 1259 ntBASIC23.16■■□□□ 1.3
ICE2Q659A1 FAM159A-204ENST00000517870 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
ICE2Q659A1 CDKN3-211ENST00000611205 874 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
ICE2Q659A1 TTBK2-205ENST00000567274 1777 ntTSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
ICE2Q659A1 WNT10A-201ENST00000258411 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
ICE2Q659A1 AC096887.2-201ENST00000623443 1957 ntBASIC23.16■■□□□ 1.3
ICE2Q659A1 GLT1D1-204ENST00000442111 2995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
ICE2Q659A1 ZNF365-206ENST00000395255 1674 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
ICE2Q659A1 BSCL2-205ENST00000403550 1693 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
ICE2Q659A1 HAS2-AS1-201ENST00000514180 1656 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
ICE2Q659A1 TRIP6-201ENST00000200457 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
ICE2Q659A1 RDH14-201ENST00000381249 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
ICE2Q659A1 ZMAT3-203ENST00000432729 2944 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
ICE2Q659A1 USP2-204ENST00000525735 1704 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
ICE2Q659A1 WWC2-AS2-201ENST00000578387 2183 ntBASIC23.15■■□□□ 1.3
ICE2Q659A1 DGAT1-201ENST00000332324 1473 ntTSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
ICE2Q659A1 GUSB-201ENST00000304895 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
ICE2Q659A1 EIF5A-211ENST00000576930 1439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
ICE2Q659A1 UBALD2-201ENST00000327490 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
ICE2Q659A1 SMARCD2-203ENST00000448276 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
ICE2Q659A1 CCDC102A-201ENST00000258214 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
ICE2Q659A1 PEBP1-201ENST00000261313 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
ICE2Q659A1 AC016910.1-201ENST00000422799 1046 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
ICE2Q659A1 AC018755.3-202ENST00000596210 929 ntBASIC23.14■■□□□ 1.29
ICE2Q659A1 SNX5-219ENST00000606602 885 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
ICE2Q659A1 CACYBP-201ENST00000367679 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
ICE2Q659A1 RAPH1-210ENST00000453034 2394 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
ICE2Q659A1 EGR4-202ENST00000545030 2372 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
ICE2Q659A1 TMEM203-201ENST00000343666 1557 ntAPPRIS P1 BASIC23.14■■□□□ 1.29
ICE2Q659A1 C4orf19-202ENST00000381980 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
ICE2Q659A1 GPSM1-206ENST00000616132 2270 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
ICE2Q659A1 GSX2-201ENST00000326902 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
ICE2Q659A1 SHOX2-203ENST00000441443 3038 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
ICE2Q659A1 ZDHHC5-204ENST00000527985 2817 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
ICE2Q659A1 CDK2AP1-201ENST00000261692 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
ICE2Q659A1 IFNL4-201ENST00000606380 1637 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
ICE2Q659A1 PPP1R14A-201ENST00000301242 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
ICE2Q659A1 RSPO4-202ENST00000400634 722 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
ICE2Q659A1 AC005540.1-201ENST00000413911 919 ntTSL 3 BASIC23.13■■□□□ 1.29
ICE2Q659A1 NFKBIB-204ENST00000572515 1929 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
ICE2Q659A1 AC233723.2-201ENST00000623798 2106 ntBASIC23.12■■□□□ 1.29
ICE2Q659A1 LTB4R-202ENST00000396782 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
ICE2Q659A1 MROH6-211ENST00000534459 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
ICE2Q659A1 DISC1-223ENST00000628350 2363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
ICE2Q659A1 NRG2-201ENST00000289409 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
ICE2Q659A1 PARL-202ENST00000317096 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
ICE2Q659A1 PELI3-202ENST00000349459 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
ICE2Q659A1 ARHGEF4-202ENST00000355771 1872 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
ICE2Q659A1 CNN3-201ENST00000370206 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
ICE2Q659A1 OXLD1-201ENST00000374741 620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
ICE2Q659A1 RBPMS-209ENST00000520161 842 ntTSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
ICE2Q659A1 SLC35B2-204ENST00000537814 1715 ntTSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
ICE2Q659A1 GPR27-201ENST00000304411 2447 ntAPPRIS P1 BASIC23.12■■□□□ 1.29
ICE2Q659A1 PTPRM-211ENST00000580170 5941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
ICE2Q659A1 AP000662.2-202ENST00000530595 2790 ntTSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
ICE2Q659A1 AL137060.1-201ENST00000618151 2648 ntBASIC23.12■■□□□ 1.29
ICE2Q659A1 RBM42-205ENST00000589871 1487 ntTSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
ICE2Q659A1 SYT7-206ENST00000540677 2013 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
ICE2Q659A1 SHISA8-202ENST00000621082 1405 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
ICE2Q659A1 MTMR9LP-204ENST00000441044 2624 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
ICE2Q659A1 MIR6765-201ENST00000614092 87 ntBASIC23.11■■□□□ 1.29
ICE2Q659A1 SNX18-201ENST00000326277 2063 ntTSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
ICE2Q659A1 JAKMIP1-201ENST00000282924 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.4 ms