Protein–RNA interactions for Protein: Q5VXU3

CHIC1, Cysteine-rich hydrophobic domain-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 224 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHIC1Q5VXU3 ACBD4-214ENST00000591859 1998 ntTSL 1 (best) BASIC39.03■■■■□ 3.84
CHIC1Q5VXU3 NECTIN2-202ENST00000252485 2112 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC39.03■■■■□ 3.84
CHIC1Q5VXU3 EVA1B-201ENST00000270824 1054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC39.03■■■■□ 3.84
CHIC1Q5VXU3 IFNA2-201ENST00000380206 1135 ntAPPRIS P1 BASIC39.03■■■■□ 3.84
CHIC1Q5VXU3 NOX4-204ENST00000393282 560 ntTSL 1 (best) BASIC39.03■■■■□ 3.84
CHIC1Q5VXU3 FZD9-201ENST00000344575 2338 ntAPPRIS P1 BASIC39.03■■■■□ 3.84
CHIC1Q5VXU3 NKX2-8-201ENST00000258829 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.02■■■■□ 3.84
CHIC1Q5VXU3 EBPL-205ENST00000378284 967 ntTSL 1 (best) BASIC39.02■■■■□ 3.84
CHIC1Q5VXU3 TMEM170A-202ENST00000561878 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.02■■■■□ 3.84
CHIC1Q5VXU3 AC009163.4-201ENST00000567194 530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC39.02■■■■□ 3.84
CHIC1Q5VXU3 B3GNT4-201ENST00000324189 1642 ntTSL 1 (best) BASIC39.02■■■■□ 3.84
CHIC1Q5VXU3 C6orf201-202ENST00000380175 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.02■■■■□ 3.84
CHIC1Q5VXU3 KCNIP1-203ENST00000390656 2249 ntTSL 5 BASIC39.02■■■■□ 3.84
CHIC1Q5VXU3 RABGGTA-202ENST00000399409 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.01■■■■□ 3.84
CHIC1Q5VXU3 PKIG-206ENST00000372892 1338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC39.01■■■■□ 3.84
CHIC1Q5VXU3 LRRC1-201ENST00000370882 808 ntTSL 3 BASIC39.01■■■■□ 3.84
CHIC1Q5VXU3 RNF146-205ENST00000477776 762 ntTSL 3 BASIC39.01■■■■□ 3.84
CHIC1Q5VXU3 MIR3908-201ENST00000579798 126 ntBASIC39.01■■■■□ 3.84
CHIC1Q5VXU3 KCNQ3-202ENST00000519445 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC39.01■■■■□ 3.84
CHIC1Q5VXU3 NAGLU-201ENST00000225927 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.01■■■■□ 3.83
CHIC1Q5VXU3 PTH1R-201ENST00000313049 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.01■■■■□ 3.83
CHIC1Q5VXU3 IKBKG-211ENST00000615874 1460 ntTSL 5 BASIC39■■■■□ 3.83
CHIC1Q5VXU3 IKBKG-215ENST00000619941 1463 ntTSL 5 BASIC39■■■■□ 3.83
CHIC1Q5VXU3 ARMC10-204ENST00000425331 2443 ntTSL 2 BASIC39■■■■□ 3.83
CHIC1Q5VXU3 FAM173A-207ENST00000569529 1052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC39■■■■□ 3.83
CHIC1Q5VXU3 RAB11FIP1-203ENST00000522727 1866 ntTSL 1 (best) BASIC39■■■■□ 3.83
CHIC1Q5VXU3 TRIOBP-203ENST00000403663 2324 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC39■■■■□ 3.83
CHIC1Q5VXU3 AL022069.1-201ENST00000568025 1636 ntBASIC39■■■■□ 3.83
CHIC1Q5VXU3 GIT1-210ENST00000579937 2798 ntTSL 2 BASIC38.99■■■■□ 3.83
CHIC1Q5VXU3 PPP2R2C-203ENST00000382599 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.99■■■■□ 3.83
CHIC1Q5VXU3 C1QL2-201ENST00000272520 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.99■■■■□ 3.83
CHIC1Q5VXU3 GATA4-207ENST00000532059 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC38.98■■■■□ 3.83
CHIC1Q5VXU3 EI24-213ENST00000618552 1747 ntTSL 5 BASIC38.98■■■■□ 3.83
CHIC1Q5VXU3 LRP11-202ENST00000367368 1042 ntTSL 2 BASIC38.98■■■■□ 3.83
CHIC1Q5VXU3 TK2-202ENST00000417693 1046 ntTSL 2 BASIC38.98■■■■□ 3.83
CHIC1Q5VXU3 ATP11B-209ENST00000493826 963 ntTSL 1 (best) BASIC38.98■■■■□ 3.83
CHIC1Q5VXU3 SNX5-217ENST00000606557 1087 ntBASIC38.98■■■■□ 3.83
CHIC1Q5VXU3 AC119427.1-201ENST00000633182 556 ntTSL 4 BASIC38.98■■■■□ 3.83
CHIC1Q5VXU3 EVX1-201ENST00000222761 1500 ntTSL 1 (best) BASIC38.98■■■■□ 3.83
CHIC1Q5VXU3 ZFP91-CNTF-201ENST00000389919 2319 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC38.97■■■■□ 3.83
CHIC1Q5VXU3 FAM21EP-202ENST00000456967 2177 ntTSL 2 BASIC38.97■■■■□ 3.83
CHIC1Q5VXU3 AC004448.1-201ENST00000458332 883 ntBASIC38.97■■■■□ 3.83
CHIC1Q5VXU3 AC010326.4-201ENST00000604665 891 ntBASIC38.97■■■■□ 3.83
CHIC1Q5VXU3 SLC10A4-201ENST00000273861 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.97■■■■□ 3.83
CHIC1Q5VXU3 RILP-201ENST00000301336 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.97■■■■□ 3.83
CHIC1Q5VXU3 RUNDC3A-202ENST00000426726 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.97■■■■□ 3.83
CHIC1Q5VXU3 AL161729.1-201ENST00000604104 1402 ntBASIC38.97■■■■□ 3.83
CHIC1Q5VXU3 PON2-217ENST00000633192 1876 ntTSL 1 (best) BASIC38.96■■■■□ 3.83
CHIC1Q5VXU3 NKX2-3-201ENST00000344586 2097 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC38.96■■■■□ 3.83
CHIC1Q5VXU3 LIMD2-205ENST00000578402 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.96■■■■□ 3.83
CHIC1Q5VXU3 CENPX-202ENST00000392359 805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC38.96■■■■□ 3.83
CHIC1Q5VXU3 KLHL26-202ENST00000595182 522 ntTSL 4 BASIC38.96■■■■□ 3.83
CHIC1Q5VXU3 DYRK3-203ENST00000367109 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.96■■■■□ 3.83
CHIC1Q5VXU3 PTX3-201ENST00000295927 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.96■■■■□ 3.83
CHIC1Q5VXU3 COMMD5-201ENST00000305103 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.95■■■■□ 3.83
CHIC1Q5VXU3 HSPBP1-202ENST00000433386 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.95■■■■□ 3.83
CHIC1Q5VXU3 ARMC10-208ENST00000441711 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.95■■■■□ 3.83
CHIC1Q5VXU3 AC092849.1-201ENST00000475250 303 ntTSL 4 BASIC38.95■■■■□ 3.83
CHIC1Q5VXU3 LINC01578-209ENST00000557682 2683 ntTSL 2 BASIC38.94■■■■□ 3.82
CHIC1Q5VXU3 TMEM41B-205ENST00000533723 723 ntTSL 2 BASIC38.94■■■■□ 3.82
CHIC1Q5VXU3 AL035685.1-201ENST00000636663 812 ntBASIC38.94■■■■□ 3.82
CHIC1Q5VXU3 CTSF-201ENST00000310325 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.94■■■■□ 3.82
CHIC1Q5VXU3 KISS1R-201ENST00000234371 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.93■■■■□ 3.82
CHIC1Q5VXU3 NAAA-204ENST00000507187 1750 ntTSL 1 (best) BASIC38.93■■■■□ 3.82
CHIC1Q5VXU3 IGFBP3-202ENST00000381083 1050 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC38.93■■■■□ 3.82
CHIC1Q5VXU3 AC108359.1-201ENST00000616451 1211 ntBASIC38.93■■■■□ 3.82
CHIC1Q5VXU3 SNX18-201ENST00000326277 2063 ntTSL 2 BASIC38.93■■■■□ 3.82
CHIC1Q5VXU3 BTBD2-201ENST00000255608 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.93■■■■□ 3.82
CHIC1Q5VXU3 NPAS1-208ENST00000602212 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.92■■■■□ 3.82
CHIC1Q5VXU3 LSM7-204ENST00000587502 575 ntTSL 1 (best) BASIC38.92■■■■□ 3.82
CHIC1Q5VXU3 BCL2L12-212ENST00000616144 1854 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC38.92■■■■□ 3.82
CHIC1Q5VXU3 SLC25A29-201ENST00000359232 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.92■■■■□ 3.82
CHIC1Q5VXU3 AUH-201ENST00000303617 1490 ntTSL 1 (best) BASIC38.92■■■■□ 3.82
CHIC1Q5VXU3 MMD-201ENST00000262065 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.91■■■■□ 3.82
CHIC1Q5VXU3 RBFOX1-206ENST00000535565 1599 ntTSL 2 BASIC38.91■■■■□ 3.82
CHIC1Q5VXU3 FKBP8-209ENST00000597960 1781 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC38.91■■■■□ 3.82
CHIC1Q5VXU3 Z92544.1-202ENST00000571933 1220 ntBASIC38.91■■■■□ 3.82
CHIC1Q5VXU3 FAR2P4-203ENST00000560285 1739 ntTSL 2 BASIC38.91■■■■□ 3.82
CHIC1Q5VXU3 TMSB15B-202ENST00000436583 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.91■■■■□ 3.82
CHIC1Q5VXU3 RAX2-202ENST00000555978 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.9■■■■□ 3.82
CHIC1Q5VXU3 CRLF1-201ENST00000392386 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.9■■■■□ 3.82
CHIC1Q5VXU3 SCAMP3-202ENST00000355379 1537 ntTSL 1 (best) BASIC38.9■■■■□ 3.82
CHIC1Q5VXU3 HSF4-225ENST00000584272 1549 ntTSL 1 (best) BASIC38.9■■■■□ 3.82
CHIC1Q5VXU3 FOSL1-202ENST00000448083 1427 ntTSL 2 BASIC38.89■■■■□ 3.82
CHIC1Q5VXU3 CNPY3-202ENST00000394142 954 ntTSL 5 BASIC38.89■■■■□ 3.82
CHIC1Q5VXU3 BX664725.1-201ENST00000438252 379 ntBASIC38.89■■■■□ 3.82
CHIC1Q5VXU3 AC239859.2-201ENST00000444165 318 ntBASIC38.89■■■■□ 3.82
CHIC1Q5VXU3 ZKSCAN7-206ENST00000431636 1692 ntTSL 1 (best) BASIC38.89■■■■□ 3.82
CHIC1Q5VXU3 EI24-204ENST00000527235 1625 ntTSL 5 BASIC38.89■■■■□ 3.82
CHIC1Q5VXU3 RILPL1-205ENST00000636882 2258 ntTSL 5 BASIC38.88■■■■□ 3.82
CHIC1Q5VXU3 HOXC-AS1-201ENST00000505700 548 ntTSL 2 BASIC38.88■■■■□ 3.81
CHIC1Q5VXU3 FAM107A-203ENST00000447756 1432 ntTSL 1 (best) BASIC38.88■■■■□ 3.81
CHIC1Q5VXU3 P3H3-201ENST00000290510 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.87■■■■□ 3.81
CHIC1Q5VXU3 HMX3-201ENST00000357878 1173 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC38.87■■■■□ 3.81
CHIC1Q5VXU3 ZNF180-205ENST00000587047 525 ntTSL 4 BASIC38.87■■■■□ 3.81
CHIC1Q5VXU3 AC243829.1-202ENST00000618848 486 ntTSL 3 BASIC38.87■■■■□ 3.81
CHIC1Q5VXU3 SNF8-202ENST00000502492 2319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC38.87■■■■□ 3.81
CHIC1Q5VXU3 MADCAM1-206ENST00000617201 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC38.86■■■■□ 3.81
CHIC1Q5VXU3 MADCAM1-207ENST00000619333 1485 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC38.86■■■■□ 3.81
CHIC1Q5VXU3 MADCAM1-210ENST00000622462 1461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC38.86■■■■□ 3.81
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14.6 ms