Protein–RNA interactions for Protein: Q5VXD3

SAMD13, Sterile alpha motif domain-containing protein 13, humanhuman

Predictions only

Length 122 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SAMD13Q5VXD3 AC064853.2-201ENST00000641246 144 ntAPPRIS P1 BASIC17.36■□□□□ 0.37
SAMD13Q5VXD3 CNN3-202ENST00000394202 1974 ntTSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
SAMD13Q5VXD3 TMED2-201ENST00000262225 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
SAMD13Q5VXD3 GRAMD1A-201ENST00000317991 2695 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
SAMD13Q5VXD3 LINC01970-201ENST00000581489 1810 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
SAMD13Q5VXD3 U2AF2-202ENST00000450554 3022 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
SAMD13Q5VXD3 SDK1-201ENST00000389531 7606 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
SAMD13Q5VXD3 GAK-223ENST00000628912 497 ntTSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
SAMD13Q5VXD3 EGFL8-220ENST00000395512 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
SAMD13Q5VXD3 STMN4-204ENST00000519997 1623 ntTSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
SAMD13Q5VXD3 LETM1-201ENST00000302787 5462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
SAMD13Q5VXD3 LSR-201ENST00000347609 1880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
SAMD13Q5VXD3 LSR-213ENST00000605618 1885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
SAMD13Q5VXD3 ZDHHC1-201ENST00000348579 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
SAMD13Q5VXD3 SLC35A2-201ENST00000247138 1672 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
SAMD13Q5VXD3 HHEX-201ENST00000282728 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
SAMD13Q5VXD3 MTERF3-201ENST00000287025 1409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
SAMD13Q5VXD3 TNFRSF12A-201ENST00000326577 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
SAMD13Q5VXD3 SCAMP3-202ENST00000355379 1537 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
SAMD13Q5VXD3 SLIT1-203ENST00000371041 1695 ntTSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
SAMD13Q5VXD3 IDNK-201ENST00000376417 511 ntTSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
SAMD13Q5VXD3 IDNK-202ENST00000376419 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
SAMD13Q5VXD3 SKI-201ENST00000378536 5613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
SAMD13Q5VXD3 CPSF4-204ENST00000436336 1738 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
SAMD13Q5VXD3 FAM21EP-202ENST00000456967 2177 ntTSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
SAMD13Q5VXD3 RBFOX1-206ENST00000535565 1599 ntTSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
SAMD13Q5VXD3 DUX4L18-201ENST00000553347 1267 ntBASIC17.34■□□□□ 0.37
SAMD13Q5VXD3 TMEM202-AS1-202ENST00000565181 2325 ntBASIC17.34■□□□□ 0.37
SAMD13Q5VXD3 HOMER3-207ENST00000594794 903 ntTSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
SAMD13Q5VXD3 BSPRY-201ENST00000374183 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
SAMD13Q5VXD3 PXK-201ENST00000302779 1974 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
SAMD13Q5VXD3 PSIP1-202ENST00000380716 1889 ntTSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.37
SAMD13Q5VXD3 KISS1R-201ENST00000234371 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
SAMD13Q5VXD3 ZFAND2B-201ENST00000289528 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
SAMD13Q5VXD3 CST6-201ENST00000312134 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
SAMD13Q5VXD3 AQP1-202ENST00000409611 1140 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
SAMD13Q5VXD3 H2AFY-204ENST00000423969 924 ntTSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.36
SAMD13Q5VXD3 RAB4B-203ENST00000594800 1173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
SAMD13Q5VXD3 LOXL1-201ENST00000261921 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
SAMD13Q5VXD3 GFOD1-204ENST00000603223 2388 ntTSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.36
SAMD13Q5VXD3 TMEM44-202ENST00000347147 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
SAMD13Q5VXD3 RAX2-202ENST00000555978 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
SAMD13Q5VXD3 GNB1-209ENST00000610897 3145 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
SAMD13Q5VXD3 BTBD6-201ENST00000327471 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.36
SAMD13Q5VXD3 MEGF6-202ENST00000356575 5455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
SAMD13Q5VXD3 BIN1-202ENST00000316724 2693 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
SAMD13Q5VXD3 LRRC75A-201ENST00000409083 2656 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.36
SAMD13Q5VXD3 STIM2-204ENST00000467087 5154 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
SAMD13Q5VXD3 ZDHHC14-203ENST00000359775 7380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
SAMD13Q5VXD3 SMURF1-202ENST00000361368 5581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
SAMD13Q5VXD3 HORMAD2-201ENST00000336726 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
SAMD13Q5VXD3 CITED4-201ENST00000372638 1316 ntAPPRIS P1 BASIC17.32■□□□□ 0.36
SAMD13Q5VXD3 KRT18P24-201ENST00000344739 1156 ntBASIC17.32■□□□□ 0.36
SAMD13Q5VXD3 AC004987.1-201ENST00000428627 508 ntBASIC17.32■□□□□ 0.36
SAMD13Q5VXD3 PLA2G10-201ENST00000438167 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
SAMD13Q5VXD3 AC009531.1-201ENST00000442323 580 ntTSL 4 BASIC17.32■□□□□ 0.36
SAMD13Q5VXD3 MPP5-205ENST00000556345 1163 ntTSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
SAMD13Q5VXD3 THA1P-201ENST00000590384 1145 ntBASIC17.32■□□□□ 0.36
SAMD13Q5VXD3 AC012354.3-201ENST00000623734 483 ntBASIC17.32■□□□□ 0.36
SAMD13Q5VXD3 CBWD2-201ENST00000259199 1812 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
SAMD13Q5VXD3 DGKQ-201ENST00000273814 4636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
SAMD13Q5VXD3 AC012123.1-201ENST00000426194 1661 ntTSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
SAMD13Q5VXD3 FUT11-201ENST00000372841 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
SAMD13Q5VXD3 C1QL2-201ENST00000272520 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
SAMD13Q5VXD3 R3HCC1-202ENST00000411463 1467 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
SAMD13Q5VXD3 RAX-201ENST00000256852 2935 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
SAMD13Q5VXD3 AC079834.2-201ENST00000609776 1949 ntBASIC17.31■□□□□ 0.36
SAMD13Q5VXD3 TRIM28-202ENST00000341753 2709 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
SAMD13Q5VXD3 COPRS-201ENST00000302362 968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
SAMD13Q5VXD3 FKBP1B-202ENST00000380991 1010 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
SAMD13Q5VXD3 ZSCAN1-202ENST00000391700 952 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
SAMD13Q5VXD3 NOX4-204ENST00000393282 560 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
SAMD13Q5VXD3 PYY2-202ENST00000441253 1076 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
SAMD13Q5VXD3 GUCD1-207ENST00000447813 895 ntTSL 3 BASIC17.31■□□□□ 0.36
SAMD13Q5VXD3 NDEL1-219ENST00000585098 454 ntTSL 3 BASIC17.31■□□□□ 0.36
SAMD13Q5VXD3 ERO1A-211ENST00000629528 998 ntTSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
SAMD13Q5VXD3 AC004812.2-201ENST00000611079 2094 ntBASIC17.31■□□□□ 0.36
SAMD13Q5VXD3 NRL-202ENST00000396997 1517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
SAMD13Q5VXD3 BAZ1A-202ENST00000360310 6010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
SAMD13Q5VXD3 TCF7L1-201ENST00000282111 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
SAMD13Q5VXD3 C21orf2-202ENST00000339818 2233 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
SAMD13Q5VXD3 HNRNPUL2-201ENST00000301785 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
SAMD13Q5VXD3 GALNT12-201ENST00000375011 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
SAMD13Q5VXD3 CTSF-201ENST00000310325 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
SAMD13Q5VXD3 AC012676.1-201ENST00000574705 1949 ntBASIC17.3■□□□□ 0.36
SAMD13Q5VXD3 ATXN3-252ENST00000620536 1044 ntTSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
SAMD13Q5VXD3 ATXN3-253ENST00000621269 936 ntTSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
SAMD13Q5VXD3 LRRC14B-201ENST00000328278 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
SAMD13Q5VXD3 KLC3-201ENST00000391946 1780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
SAMD13Q5VXD3 TMEM256-PLSCR3-204ENST00000573331 2557 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
SAMD13Q5VXD3 ATAD3A-203ENST00000378756 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
SAMD13Q5VXD3 FAM83F-202ENST00000473717 1917 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
SAMD13Q5VXD3 TANGO2-207ENST00000420290 1859 ntTSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
SAMD13Q5VXD3 CDKN3-202ENST00000335183 893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
SAMD13Q5VXD3 CT47A7-201ENST00000434883 1288 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
SAMD13Q5VXD3 PKNOX2-AS1-201ENST00000532316 586 ntTSL 3 BASIC17.29■□□□□ 0.36
SAMD13Q5VXD3 AC148477.1-201ENST00000537720 476 ntTSL 3 BASIC17.29■□□□□ 0.36
SAMD13Q5VXD3 CDKN3-211ENST00000611205 874 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
SAMD13Q5VXD3 GADD45A-205ENST00000617962 1142 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
SAMD13Q5VXD3 ZFYVE9-201ENST00000287727 5194 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14.1 ms