Protein–RNA interactions for Protein: Q5VW32

BROX, BRO1 domain-containing protein BROX, humanhuman

Predictions only

Length 411 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BROXQ5VW32 AC135279.3-201ENST00000610945 1311 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
BROXQ5VW32 AC022211.4-201ENST00000625094 2161 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
BROXQ5VW32 BRD3-202ENST00000371834 2529 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
BROXQ5VW32 RPP38-201ENST00000378197 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
BROXQ5VW32 HOMER3-201ENST00000221222 1384 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
BROXQ5VW32 MIR17HG-201ENST00000400282 931 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
BROXQ5VW32 SSR2-210ENST00000480567 895 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
BROXQ5VW32 CEBPB-AS1-201ENST00000613921 2648 ntTSL 3 BASIC22.3■■□□□ 1.16
BROXQ5VW32 PFN2-210ENST00000481767 1620 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
BROXQ5VW32 TMEM121-202ENST00000431372 1519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
BROXQ5VW32 PSKH1-202ENST00000570631 1509 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
BROXQ5VW32 MRPL4-207ENST00000590669 1423 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
BROXQ5VW32 DGAT2-201ENST00000228027 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
BROXQ5VW32 AC010501.1-201ENST00000606270 1962 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
BROXQ5VW32 CASP9-202ENST00000348549 1621 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
BROXQ5VW32 CTBP1-203ENST00000382952 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
BROXQ5VW32 CD72-202ENST00000378430 585 ntTSL 3 BASIC22.29■■□□□ 1.16
BROXQ5VW32 KRTAP5-4-201ENST00000399682 1181 ntAPPRIS P5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
BROXQ5VW32 AC026271.2-201ENST00000428091 497 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
BROXQ5VW32 CLTA-204ENST00000433436 1235 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
BROXQ5VW32 CLTA-209ENST00000538225 1181 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
BROXQ5VW32 EPHA10-211ENST00000540011 720 ntTSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
BROXQ5VW32 CLTA-210ENST00000540080 989 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
BROXQ5VW32 NRL-205ENST00000560550 788 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
BROXQ5VW32 U2AF1-204ENST00000459639 1675 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
BROXQ5VW32 U2AF1L5-204ENST00000623375 1675 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
BROXQ5VW32 RAX-201ENST00000256852 2935 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
BROXQ5VW32 CPOX-201ENST00000264193 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
BROXQ5VW32 MYH7B-209ENST00000618182 6197 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
BROXQ5VW32 NRM-201ENST00000259953 1755 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
BROXQ5VW32 TRIM7-202ENST00000334421 1228 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
BROXQ5VW32 ERRFI1-204ENST00000474874 479 ntTSL 3 BASIC22.28■■□□□ 1.16
BROXQ5VW32 GPX4-213ENST00000622390 1002 ntTSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
BROXQ5VW32 RABL6-204ENST00000371671 1580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
BROXQ5VW32 PANK2-201ENST00000316562 2280 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
BROXQ5VW32 MCUB-201ENST00000394650 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
BROXQ5VW32 HADH-203ENST00000505878 1719 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
BROXQ5VW32 KCTD5-201ENST00000301738 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
BROXQ5VW32 PHC2-202ENST00000373418 2550 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
BROXQ5VW32 CARD19-201ENST00000375464 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
BROXQ5VW32 TFPT-201ENST00000391757 774 ntTSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
BROXQ5VW32 TFPT-202ENST00000391758 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
BROXQ5VW32 ZNRF1-205ENST00000566250 1069 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
BROXQ5VW32 ZNRF1-206ENST00000567962 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
BROXQ5VW32 HMX2-201ENST00000339992 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
BROXQ5VW32 TMEM8B-203ENST00000377996 2473 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
BROXQ5VW32 CTDSPL-206ENST00000443503 4640 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
BROXQ5VW32 AKT1S1-201ENST00000344175 1760 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.26■■□□□ 1.15
BROXQ5VW32 ST7L-206ENST00000369666 1815 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
BROXQ5VW32 ALKAL2-204ENST00000403610 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
BROXQ5VW32 UNC93B3-201ENST00000308076 687 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
BROXQ5VW32 CDKN2D-201ENST00000335766 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
BROXQ5VW32 LINC01632-201ENST00000615763 496 ntTSL 3 BASIC22.25■■□□□ 1.15
BROXQ5VW32 CCDC151-202ENST00000586836 1867 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
BROXQ5VW32 FBXL6-201ENST00000331890 1785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
BROXQ5VW32 C2CD4D-201ENST00000454109 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
BROXQ5VW32 DLK2-201ENST00000357338 2038 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
BROXQ5VW32 TNIP2-206ENST00000510267 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
BROXQ5VW32 DTNB-201ENST00000288642 2464 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
BROXQ5VW32 DTNB-208ENST00000406818 2474 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
BROXQ5VW32 AC068473.5-201ENST00000616428 2072 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
BROXQ5VW32 BCL11B-203ENST00000443726 2599 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
BROXQ5VW32 TM9SF3-201ENST00000371142 6141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
BROXQ5VW32 PARL-206ENST00000435888 1098 ntTSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
BROXQ5VW32 RASGEF1B-208ENST00000510780 539 ntTSL 3 BASIC22.24■■□□□ 1.15
BROXQ5VW32 RASGEF1B-209ENST00000512343 498 ntTSL 3 BASIC22.24■■□□□ 1.15
BROXQ5VW32 AL136162.1-201ENST00000607711 1078 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
BROXQ5VW32 AC092902.2-206ENST00000625484 846 ntTSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
BROXQ5VW32 SLC39A3-201ENST00000269740 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
BROXQ5VW32 MXD3-201ENST00000423571 1534 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
BROXQ5VW32 TRIM28-202ENST00000341753 2709 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
BROXQ5VW32 PORCN-202ENST00000355961 1848 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
BROXQ5VW32 VPS53-211ENST00000571805 2356 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
BROXQ5VW32 CDYL-203ENST00000397588 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
BROXQ5VW32 DGAT1-201ENST00000332324 1473 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
BROXQ5VW32 EEF1D-203ENST00000419152 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
BROXQ5VW32 TTLL11-202ENST00000373776 2012 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
BROXQ5VW32 ZNF837-201ENST00000427624 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
BROXQ5VW32 PLEK2-201ENST00000216446 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
BROXQ5VW32 LINC00543-201ENST00000567234 1845 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
BROXQ5VW32 ACBD4-216ENST00000619916 1276 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
BROXQ5VW32 UBALD2-201ENST00000327490 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
BROXQ5VW32 SCTR-201ENST00000019103 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
BROXQ5VW32 UNC50-204ENST00000409975 2172 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
BROXQ5VW32 MADCAM1-202ENST00000346144 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
BROXQ5VW32 RCC2-201ENST00000375433 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
BROXQ5VW32 TSGA13-204ENST00000456951 2046 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
BROXQ5VW32 GRAMD1A-201ENST00000317991 2695 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
BROXQ5VW32 NUDT18-202ENST00000613958 1754 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
BROXQ5VW32 PPP1R3F-205ENST00000495799 1537 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
BROXQ5VW32 TMEM256-PLSCR3-204ENST00000573331 2557 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
BROXQ5VW32 AQP1-202ENST00000409611 1140 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
BROXQ5VW32 TYROBP-203ENST00000544690 522 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
BROXQ5VW32 ZNF365-206ENST00000395255 1674 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
BROXQ5VW32 MOB4-204ENST00000409360 1447 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
BROXQ5VW32 EEF1D-201ENST00000317198 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
BROXQ5VW32 FOXP4-203ENST00000373060 5948 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
BROXQ5VW32 FOXP4-204ENST00000373063 5910 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
BROXQ5VW32 SNX10-207ENST00000446848 2613 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
BROXQ5VW32 ACTR1B-201ENST00000289228 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14.5 ms